Syntaxin-1A
Rattus norvegicus
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白拷贝数一致 | 链 G; UniProt 1–267 链 I; UniProt 1–267 | 未记录 | Alpha-soluble NSF attachment protein × 3 (P54921) Vesicle-fusing ATPase × 6 (P18708) Synaptosomal-associated protein 25 × 1 (P60881) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 4.01 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9PBF | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BR0 THREE DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF SYNTAXIN 1A 提交 1998-08-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
27–146(120 aa)
片段:N-TERMINAL
|
突变:C145S | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.3;305 K;离子强度(mmCIF原始值)60 mM phosphate;压力 1
|
分辨率未提供 |
| 1EZ3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE NEURONAL T-SNARE SYNTAXIN-1A 提交 2000-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
24–150(127 aa)
片段:N-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;296 K;PEG 1500, sodium acetate, DTT, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.0K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.286 |
| 1EZ3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE NEURONAL T-SNARE SYNTAXIN-1A 提交 2000-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
24–150(127 aa)
片段:N-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;296 K;PEG 1500, sodium acetate, DTT, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.0K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.286 |
| 1EZ3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE NEURONAL T-SNARE SYNTAXIN-1A 提交 2000-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
24–150(127 aa)
片段:N-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;296 K;PEG 1500, sodium acetate, DTT, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.0K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.286 |
| 1HVV SELF-ASSOCIATION OF THE H3 REGION OF SYNTAXIN 1A: IMPLICATIONS FOR SNARE COMPLEX ASSEMBLY 提交 2001-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
190–264(75 aa)
片段:RESIDUES 190-264
链 B
190–264(75 aa)
片段:RESIDUES 190-264
链 C
190–264(75 aa)
片段:RESIDUES 190-264
链 D
190–264(75 aa)
片段:RESIDUES 190-264
|
未记录 | TAR D(-)-TARTARIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;sodium potassium tartrate, sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.273 |
| 1JTH Crystal structure and biophysical properties of a complex between the N-terminal region of SNAP25 and the SNARE region of syntaxin 1a 提交 2001-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
191–267(77 aa)
片段:H3, SNARE motif
链 D
191–267(77 aa)
片段:H3, SNARE motif
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;294 K;ammonium sulfate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.289 |
| 1KIL Three-dimensional structure of the complexin/SNARE complex 提交 2001-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 B
192–250(59 aa)
片段:SNARE motif (191-253)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;27%(v/v) Iso-Propanol, 200mM MgCl2, 100mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.305 |
| 1N7S High Resolution Structure of a Truncated Neuronal SNARE Complex 提交 2002-11-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
191–256(66 aa)
片段:SXc
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;277 K;MPD, CaCl2, MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4.0K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.224 |
| 1SFC NEURONAL SYNAPTIC FUSION COMPLEX 提交 1998-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
180–262(83 aa)
片段:PROTEOLYTICALLY PROTECTED FRAGMENT
|
未记录 | SR STRONTIUM ION × 6 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;35% MPD, 5% PEG350(MME), 25MM TRIS PH 7.0,. 70MM SRCL2, 250MM UREA, 7MM SARKOSYL
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.303 |
| 1SFC NEURONAL SYNAPTIC FUSION COMPLEX 提交 1998-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 F
180–262(83 aa)
片段:PROTEOLYTICALLY PROTECTED FRAGMENT
|
未记录 | SR STRONTIUM ION × 5 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;35% MPD, 5% PEG350(MME), 25MM TRIS PH 7.0,. 70MM SRCL2, 250MM UREA, 7MM SARKOSYL
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.303 |
| 1SFC NEURONAL SYNAPTIC FUSION COMPLEX 提交 1998-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 J
180–262(83 aa)
片段:PROTEOLYTICALLY PROTECTED FRAGMENT
|
未记录 | SR STRONTIUM ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;35% MPD, 5% PEG350(MME), 25MM TRIS PH 7.0,. 70MM SRCL2, 250MM UREA, 7MM SARKOSYL
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.303 |
| 1URQ Crystal structure of neuronal Q-SNAREs in complex with R-SNARE motif of Tomosyn 提交 2003-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
188–259(72 aa)
片段:T-SNARE COILED-COIL HOMOLOGY, RESIDUES 188-259
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;30% MPD, 50MM CACL2, 50MM MES PH 6.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.225 |
| 2M8R Pre-Fusion Solution NMR Structure of Neuronal SNARE Syntaxin 1A 提交 2013-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
183–288(106 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.5;313 K;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N; U-2H] syntaxin, 100 mM DPC, 10 mM HEPES, 10 mM MES, 10 mM sodium acetate, 150 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 1 mM EDTA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] syntaxin, 100 mM [U-99% 2H] DPC, 150 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 10 mM sodium phosphate, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N1T Dynamic binding mode of a synaptotagmin-1-SNARE complex in solution 提交 2015-04-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 B
188–259(72 aa)
片段:UNP residues 188-259
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4;298 K;压力 ambient
NMR样品组成
30 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 25 mM Tris-HCl, 125 mM KSCN, 1 mM CaCl2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3C98 Revised structure of the munc18a-syntaxin1 complex 提交 2008-02-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–267(267 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.3;294 K;PEG400, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, EDTA, 2-mercaptoethanol, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.263 |
| 3HD7 HELICAL EXTENSION OF THE NEURONAL SNARE COMPLEX INTO THE MEMBRANE, spacegroup C 1 2 1 提交 2009-05-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
183–288(106 aa)
片段:C-terminal fragment, UNP residues 183-288
|
未记录 | GGG glycylglycylglycine × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;293 K;29% PEG 400, 0.1M HEPES, 0.2M lithium sulfate, 0.1M sodium chloride, 0.03M glycylglycylglycine, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.271 |
| 3HD7 HELICAL EXTENSION OF THE NEURONAL SNARE COMPLEX INTO THE MEMBRANE, spacegroup C 1 2 1 提交 2009-05-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 F
183–288(106 aa)
片段:C-terminal fragment, UNP residues 183-288
|
未记录 | GGG glycylglycylglycine × 1 SO4 SULFATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;293 K;29% PEG 400, 0.1M HEPES, 0.2M lithium sulfate, 0.1M sodium chloride, 0.03M glycylglycylglycine, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.271 |
| 3IPD Helical extension of the neuronal SNARE complex into the membrane, spacegroup I 21 21 21 提交 2009-08-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
183–288(106 aa)
片段:C-terminal fragment, UNP Residues 183-288
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.8;293 K;16% MPD, 0.1M TRIS, 0.05M MAGNESIUM CHLORIDE, 3% SORBITOL, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.80 Å R-free 0.332 |
| 3IPD Helical extension of the neuronal SNARE complex into the membrane, spacegroup I 21 21 21 提交 2009-08-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 F
183–288(106 aa)
片段:C-terminal fragment, UNP Residues 183-288
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.8;293 K;16% MPD, 0.1M TRIS, 0.05M MAGNESIUM CHLORIDE, 3% SORBITOL, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.80 Å R-free 0.332 |
| 3J96 Structure of 20S supercomplex determined by single particle cryoelectron microscopy (State I) 提交 2014-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric |
链 L
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40;pH 8;50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 3.5 seconds before plunging;90 K;冷冻剂 ETHANE;Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
|
分辨率 7.60 Å R-free 0.303 |
| 3J97 Structure of 20S supercomplex determined by single particle cryoelectron microscopy (State II) 提交 2014-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric |
链 L
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40;pH 8;50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 3.5 seconds before plunging;90 K;冷冻剂 ETHANE;Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
|
分辨率 7.80 Å R-free 0.311 |
| 3J98 Structure of 20S supercomplex determined by single particle cryoelectron microscopy (State IIIa) 提交 2014-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric |
链 L
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40;pH 8;50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 3.5 seconds before plunging.;90 K;冷冻剂 ETHANE;Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
|
分辨率 8.40 Å R-free 0.328 |
| 3J99 Structure of 20S supercomplex determined by single particle cryoelectron microscopy (State IIIb) 提交 2014-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric |
链 L
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40;pH 8;50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 3.5 seconds before plunging.;77 K;冷冻剂 ETHANE;Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
|
分辨率 8.20 Å R-free 0.304 |
| 3RK2 Truncated SNARE complex 提交 2011-04-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
191–253(63 aa)
片段:UNP residues 191-253
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;294 K;0.05 M calcium acetate, 27% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5-7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.268 |
| 3RK2 Truncated SNARE complex 提交 2011-04-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 F
191–253(63 aa)
片段:UNP residues 191-253
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;294 K;0.05 M calcium acetate, 27% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5-7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.268 |
| 3RK3 Truncated SNARE complex with complexin 提交 2011-04-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 B
191–253(63 aa)
片段:UNP residues 191-253
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;294 K;13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.316 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 B
191–253(63 aa)
片段:UNP residues 191-253
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;294 K;13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 F
191–253(63 aa)
片段:UNP residues 191-253
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;294 K;13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 J
191–253(63 aa)
片段:UNP residues 191-253
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;294 K;13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 N
191–253(63 aa)
片段:UNP residues 191-253
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;294 K;13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 R
191–253(63 aa)
片段:UNP residues 191-253
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;294 K;13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 V
191–253(63 aa)
片段:UNP residues 191-253
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;294 K;13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 Z
191–253(63 aa)
片段:UNP residues 191-253
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;294 K;13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 d
191–253(63 aa)
片段:UNP residues 191-253
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;294 K;13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 4JEH Crystal Structure of Munc18a and Syntaxin1 lacking N-peptide complex 提交 2013-02-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
24–266(243 aa)
片段:unp residues 24-266
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;27% PEG 400, 10 mM EDTA, 10 mM DTT, 224 mM ammonium acetate, and 100 mM sodium acetate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.223 |
| 4JEH Crystal Structure of Munc18a and Syntaxin1 lacking N-peptide complex 提交 2013-02-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
24–266(243 aa)
片段:unp residues 24-266
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;27% PEG 400, 10 mM EDTA, 10 mM DTT, 224 mM ammonium acetate, and 100 mM sodium acetate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.223 |
| 4JEU Crystal Structure of Munc18a and Syntaxin1 with native N-terminus complex 提交 2013-02-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
2–243(242 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.2;298 K;27% PEG 400, 10 mM EDTA, 10 mM DTT, 224 mM ammonium acetate, and 100 mM sodium acetate , pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.263 |
| 5CCG Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) 提交 2015-07-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 B
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 18 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.352 |
| 5CCG Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) 提交 2015-07-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 H
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.352 |
| 5CCH Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (short unit cell form) 提交 2015-07-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 B
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 11 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.289 |
| 5CCI Structure of the Mg2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (short unit cell form) 提交 2015-07-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 B
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;0.75% v/v PEG3350, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.323 |
| 5KJ7 Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) - from XFEL diffraction 提交 2016-06-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 B
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.329 |
| 5KJ7 Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) - from XFEL diffraction 提交 2016-06-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 H
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.329 |
| 5KJ8 Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) - from synchrotron diffraction 提交 2016-06-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 B
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.297 |
| 5KJ8 Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) - from synchrotron diffraction 提交 2016-06-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 H
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.297 |
| 5W5C Crystal structure of the primed SNARE-Complexin-Synaptotagmin-1 C2AB complex 提交 2017-06-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 B
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;100 mM HEPES, pH7.4, 15-20% PEG3350, 200 mM ammonium formate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.232 |
| 5W5D Crystal structure of the primed SNARE-Complexin-Synaptotagmin-1 C2B complex 提交 2017-06-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 B
191–256(66 aa)
片段:UNP residues 191-256
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;100 mM HEPES, pH7.0, 15-17% PEG3350, 240 mM sodium malonate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.231 |
| 6IP1 alpha-SNAP-SNARE subcomplex in the whole 20S complex 提交 2018-11-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
2–253(252 aa)
片段:UNP residues 2-253
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6MDM The 20S supercomplex engaging the SNAP-25 N-terminus (class 1) 提交 2018-09-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric |
链 I
1–256(256 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 3.5 seconds before plunging.
|
分辨率 4.40 Å |
| 6MDN The 20S supercomplex engaging the SNAP-25 N-terminus (class 2) 提交 2018-09-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric |
链 I
1–256(256 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 3.5 seconds before plunging.
|
分辨率 4.40 Å |
| 6MTI Synaptotagmin-1 C2A, C2B domains and SNARE-pin proteins (5CCI) individually docked into Cryo-EM map of C2AB-SNARE complexes helically organized on lipid nanotube surface in presence of Mg2+ 提交 2018-10-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:30-meric |
链 B
191–256(66 aa)
片段:residues 191-256
链 F
191–256(66 aa)
片段:residues 191-256
链 J
191–256(66 aa)
片段:residues 191-256
链 N
191–256(66 aa)
片段:residues 191-256
链 R
191–256(66 aa)
片段:residues 191-256
链 V
191–256(66 aa)
片段:residues 191-256
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.40 Å |
| 6WVW Crystal structure of the R59P-SNAP25 containing SNARE complex 提交 2020-05-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
191–256(66 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;100 mM MES (pH 6.0), 100 mM CaCl2, 20-25% (v/v)
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.244 |
| 6WVW Crystal structure of the R59P-SNAP25 containing SNARE complex 提交 2020-05-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 F
191–256(66 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;100 mM MES (pH 6.0), 100 mM CaCl2, 20-25% (v/v)
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.244 |
| 7UDB Cryo-EM structure of a synaptobrevin-Munc18-1-syntaxin-1 complex class 2 提交 2022-03-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 B
2–253(252 aa)
|
突变:C145A,L165A,E166A,L205C | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7UDC cryo-EM structures of a synaptobrevin-Munc18-1-syntaxin-1 complex class1 提交 2022-03-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 B
2–253(252 aa)
|
突变:C145A, L165A, E166A, L205C | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7XSJ The structure of the Mint1/Munc18-1/syntaxin-1 complex 提交 2022-05-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 B
25–267(243 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;297 K;0.2M Sodium Malonate, pH 7.0, 20% (v/v) PEG 3350
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.270 |
| 9OJZ 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 5 提交 2025-05-08 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 G
1–267(267 aa)
链 H
1–267(267 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 9OK3 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), 3:2:1 alphaSNAP-syntaxin-1a-SNAP-25 subcomplex local refinement, non-hydrolyzing, class 13 提交 2025-05-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–267(267 aa)
链 B
1–267(267 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.74 Å |
| 9OLO 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 19 提交 2025-05-12 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 G
1–267(267 aa)
链 H
1–267(267 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 10 PO4 PHOSPHATE ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 9OM6 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), 4:2:2 alphaSNAP-syntaxin-1a-SNAP-25 subcomplex local refinement, hydrolyzing, class 23 提交 2025-05-13 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–267(267 aa)
链 B
1–267(267 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.14 Å |
| 9PAF 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 6 提交 2025-06-25 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 G
1–267(267 aa)
链 H
1–267(267 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.82 Å |
| 9PAG 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 7 提交 2025-06-25 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 G
1–267(267 aa)
链 H
1–267(267 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 9PB9 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 8 提交 2025-06-26 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 G
1–267(267 aa)
链 H
1–267(267 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.45 Å |
| 9PBA 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 9 提交 2025-06-26 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 G
1–267(267 aa)
链 H
1–267(267 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 9PBV 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 11 提交 2025-06-26 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 G
1–267(267 aa)
链 L
1–267(267 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å |
| 9PC3 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 12 提交 2025-06-26 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 G
1–267(267 aa)
链 H
1–267(267 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 9PCX 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 14 提交 2025-06-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 G
1–267(267 aa)
链 H
1–267(267 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.03 Å |
| 9PCZ 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 15 提交 2025-06-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 I
1–267(267 aa)
链 J
1–267(267 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 10 PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |
| 9PD1 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 20 提交 2025-06-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 G
1–267(267 aa)
链 H
1–267(267 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 9PD8 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 21 提交 2025-06-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric |
链 G
1–267(267 aa)
链 H
1–267(267 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.23 Å |
| 9PFF Min22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a H3:SNAP-25 SN1), non-hydrolyzing, class 27 提交 2025-07-04 | 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 H
191–267(77 aa)
链 J
191–267(77 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 9PFG Min22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a H3:SNAP-25 SN1), 4:2:2 alphaSNAP-syntaxin-1a H3-SNAP-25 SN1 subcomplex local refinement, non-hydrolyzing, class 28 提交 2025-07-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 B
191–267(77 aa)
链 D
191–267(77 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.58 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | STX1A_RAT |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 G; PDB构建体 1–267; UniProt 1–267 作者链 I; PDB构建体 1–267; UniProt 1–267 |