9pct

Structure of Porcine Trypsin Crystals Grown from PEG Complexed with Crystallization Additives III

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 62.8 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Trypsin

Sus scrofa

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合单体蛋白 × 1 其他聚合物 2 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–231	未记录	beta-D-fructofuranose-(2-1)-alpha-D-glucopyranose × 1 alpha-D-glucopyranose-(1-2)-beta-D-fructofuranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 BEN BENZAMIDINE × 3 FLC CITRATE ANION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 GOL GLYCEROL × 2 PG5 1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE × 5 MLT D-MALATE × 3 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ACT ACETATE ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；Sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates with 0.6 ml reservoirs of 30% PEG 3350 buffered at pH 6.5 with 0.1 M HEPES. Drops 3 ul of reservoir, 2 ul of additive mix ( TACSIMATE, glycerol, sucrose, sorbitol), 3 ul of 40 mg/ml stock protein solution buffered at pH 6.5 with 0.1 M HEPES.	分辨率 1.41 Å R-free 0.170

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9PCT	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AKS CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST ACTIVE AUTOLYSATE FORM OF THE PORCINE ALPHA TRYPSIN 提交 1996-07-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 9–133（125 aa）链 B 134–231（98 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1AN1 LEECH-DERIVED TRYPTASE INHIBITOR/TRYPSIN COMPLEX 提交 1997-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 9–231（223 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% V/V 2-PROPANOL, 0.2M AMMONIUM ACETATE, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.5 ROOM TEMPERATURE 27 MONTHS FOR GROWTH.	分辨率 2.03 Å R-free 0.228
1AVW COMPLEX PORCINE PANCREATIC TRYPSIN/SOYBEAN TRYPSIN INHIBITOR, ORTHORHOMBIC CRYSTAL FORM 提交 1997-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 1.75 Å R-free 0.214
1AVX COMPLEX PORCINE PANCREATIC TRYPSIN/SOYBEAN TRYPSIN INHIBITOR, TETRAGONAL CRYSTAL FORM 提交 1997-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.280
1C9P COMPLEX OF BDELLASTASIN WITH PORCINE TRYPSIN 提交 1999-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 9–231（223 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 10% 2-PROPANOL, 20% PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.227
1EJA STRUCTURE OF PORCINE TRYPSIN COMPLEXED WITH BDELLASTASIN, AN ANTISTASIN-TYPE INHIBITOR 提交 2000-03-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；298 K；4.0 M Na-formate, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.248
1EPT REFINED 1.8 ANGSTROMS RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF PORCINE EPSILON-TRYPSIN 提交 1994-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 9–51（43 aa）链 B 52–133（82 aa）链 C 134–231（98 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1FMG CRYSTAL STRUCTURE OF PORCINE BETA TRYPSIN WITH 0.04% POLYDOCANOL 提交 2000-08-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；pH 6.70, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.234
1FN6 CRYSTAL STRUCTURE OF PORCINE BETA TRYPSIN WITH 0.1% POLYDOCANOL 提交 2000-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 MOH METHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；pH 6.70, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.80 Å R-free 0.242
1FNI CRYSTAL STRUCTURE OF PORCINE BETA TRYPSIN WITH 0.01% POLYDOCANOL 提交 2000-08-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；pH 6.70, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.60 Å R-free 0.233
1H9H COMPLEX OF EETI-II WITH PORCINE TRYPSIN 提交 2001-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.7；pH 6.70	分辨率 1.50 Å R-free 0.276
1H9I COMPLEX OF EETI-II MUTANT WITH PORCINE TRYPSIN 提交 2001-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.7；pH 6.70	分辨率 1.90 Å R-free 0.175
1LDT COMPLEX OF LEECH-DERIVED TRYPTASE INHIBITOR WITH PORCINE TRYPSIN 提交 1997-05-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；10% PEG 6000, 2.3M PHOSPHATE, PH 8.0	分辨率 1.90 Å
1MCT THE REFINED 1.6 ANGSTROMS RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX FORMED BETWEEN PORCINE BETA-TRYPSIN AND MCTI-A, A TRYPSIN INHIBITOR OF SQUASH FAMILY 提交 1992-10-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.60 Å
1QQU CRYSTAL STRUCTURE OF PORCINE BETA TRYPSIN WITH BOUND ACETATE ION 提交 1999-06-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.7；pH 6.70	分辨率 1.63 Å R-free 0.255
1S5S Porcine trypsin complexed with guanidine-3-propanol inhibitor 提交 2004-01-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 PG3 GUANIDINE-3-PROPANOL × 1 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；298 K；1.8M MgSO4, 50mM HEPES, 5mM CaCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 8.00	分辨率 1.40 Å R-free 0.181
1S6F PORCINE TRYPSIN COVALENT COMPLEX WITH BORATE AND GUANIDINE-3 INHIBITOR 提交 2004-01-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 SBP [3-(1,3,2-DIOXABOROLAN-2-YLOXY)PROPYL]GUANIDINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；1.8M MgCl2, 50mM HEPES, 5mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.198
1S6H PORCINE TRYPSIN COMPLEXED WITH GUANIDINE-3-PROPANOL INHIBITOR 提交 2004-01-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 4BZ 4-(HYDROXYMETHYL)BENZAMIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；1.8M MgCl2, 50mM HEPES, 5mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.45 Å R-free 0.179
1S81 PORCINE TRYPSIN WITH NO INHIBITOR BOUND 提交 2004-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；1.8M MgCl2, 50mM HEPES, 5mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.216
1S82 PORCINE TRYPSIN COMPLEXED WITH BORATE AND ETHYLENE GLYCOL 提交 2004-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 SBE 1,3,2-DIOXABOROLAN-2-OL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；1.8M MgCl2, 50mM HEPES, 5mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.85 Å R-free 0.214
1S83 PORCINE TRYPSIN COMPLEXED WITH 4-AMINO PROPANOL 提交 2004-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 4HA 4-HYDROXYBUTAN-1-AMINIUM × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；1.8M MgCl2, 50mM HEPES, 5mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.25 Å R-free 0.178
1S84 PORCINE TRYPSIN COVALENT COMPLEX WITH 4-AMINO BUTANOL, BORATE AND ETHYLENE GLYCOL 提交 2004-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 DYB 4-(1,3,2-DIOXABOROLAN-2-YLOXY)BUTAN-1-AMINIUM × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；1.8M MgCl2, 50mM HEPES, 5mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.85 Å R-free 0.177
1S85 PORCINE TRYPSIN COMPLEXED WITH P-HYDROXYMETHYL BENZAMIDINE AND BORATE 提交 2004-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 SBZ [4-(1,3,2-DIOXABOROLAN-2-YLOXY)METHYL]BENZAMIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；1.8M MgCl2, 50mM HEPES, 5mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.254
1TFX COMPLEX OF THE SECOND KUNITZ DOMAIN OF TISSUE FACTOR PATHWAY INHIBITOR WITH PORCINE TRYPSIN 提交 1997-01-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.0	分辨率 2.60 Å
1TFX COMPLEX OF THE SECOND KUNITZ DOMAIN OF TISSUE FACTOR PATHWAY INHIBITOR WITH PORCINE TRYPSIN 提交 1997-01-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.0	分辨率 2.60 Å
1TX6 trypsin:BBI complex 提交 2004-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 9–231（223 aa）链 B 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.59；291 K；PEG 8000, sodium citrate, DTT, pH 5.59, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.274
1TX6 trypsin:BBI complex 提交 2004-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 9–231（223 aa）链 D 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.59；291 K；PEG 8000, sodium citrate, DTT, pH 5.59, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.274
1UHB Crystal structure of porcine alpha trypsin bound with auto catalyticaly produced native peptide at 2.15 A resolution 提交 2003-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 9–133（125 aa）链 B 134–231（98 aa）链 P 177–185（9 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；1.5M ammonium sulphate, pH 6.70, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.15 Å R-free 0.228
1V6D The crystal structure of the trypsin complex with synthetic heterochiral peptide 提交 2003-11-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 TBF TERT-BUTYL FORMATE × 1 NME METHYLAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；2M ammonium sulphate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.178
1YF4 Crystal Structure of trypsin-vasopressin complex 提交 2004-12-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；acetate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.226
1Z7K Crystal Structure of Trypsin- Ovomucoid turkey egg white inhibitor complex 提交 2005-03-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；293 K；1.5M ammonium sulphate, 10mM zinc acetate, 50mM Acetate buffer, pH 5.30, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.188
2A31 Trypsin in complex with borate 提交 2005-06-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 BO4 BORATE ION × 2 PG3 GUANIDINE-3-PROPANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；300 K；MgSO4, HEPES, CaCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 1.25 Å R-free 0.162
2A32 Trypsin in complex with benzene boronic acid 提交 2005-06-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 PG3 GUANIDINE-3-PROPANOL × 1 PBC PHENYL BORONIC ACID × 2 BO4 BORATE ION × 1 CXS 3-CYCLOHEXYL-1-PROPYLSULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；300 K；MgSO4, HEPES, CaCl2, the crystal while grown at pH 8.0 was soaked in a solution at pH 10.5 before freezing and data collection. pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 1.50 Å R-free 0.188
3MYW The Bowman-Birk type inhibitor from mung bean in ternary complex with porcine trypsin 提交 2010-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 9–231（223 aa）链 B 9–231（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；1.5M ammonium sulfate, 0.2M sodium potassium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å
4AN7 Kunitz type trypsin inhibitor complex with porcine trypsin 提交 2012-03-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–231（231 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2 M AMMONIUM PHOSPHATE, 20% PEG3350	分辨率 2.23 Å R-free 0.246
4DOQ Crystal structure of the complex of Porcine Pancreatic Trypsin with 1/2SLPI 提交 2012-02-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 9–231（223 aa）	未记录	XPE 3,6,9,12,15,18,21,24,27-NONAOXANONACOSANE-1,29-DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；25% PEG4000, 0.1M Na-Citrate, 200mM Ammonium Sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.242
4DOQ Crystal structure of the complex of Porcine Pancreatic Trypsin with 1/2SLPI 提交 2012-02-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 9–231（223 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；25% PEG4000, 0.1M Na-Citrate, 200mM Ammonium Sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.242
4DOQ Crystal structure of the complex of Porcine Pancreatic Trypsin with 1/2SLPI 提交 2012-02-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 9–231（223 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；25% PEG4000, 0.1M Na-Citrate, 200mM Ammonium Sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.242
5XW1 Crystal Structure of Porcine pancreatic trypsin with tripeptide inhibitor, PRN, at pH10 提交 2017-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–133（133 aa）片段：UNP residues 1-133 链 B 134–231（98 aa）片段：UNP residues 134-231	未记录	CA CALCIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；300 K；0.1M CHES PH10, 70% MPD	分辨率 1.90 Å R-free 0.173
5XW8 Crystal Structure of Porcine pancreatic trypsin with tripeptide inhibitor, PRN, at pH 7 提交 2017-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–133（133 aa）片段：UNP residues 1-133 链 B 134–231（98 aa）片段：UNP residues 134-231	未记录	CA CALCIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；300 K；0.1M HEPES pH 7.5, 70% MPD	分辨率 2.00 Å R-free 0.178
5XW9 Crystal Structure of Porcine pancreatic trypsin with tripeptide inhibitor, PRY, at pH 7 提交 2017-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–133（133 aa）片段：UNP residues 1-133 链 B 134–231（98 aa）片段：UNP residues 134-231	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；300 K；0.1M HEPES pH 7.5, 70% MPD	分辨率 2.00 Å R-free 0.194
5XWA Crystal Structure of Porcine pancreatic trypsin with tripeptide inhibitor, PRY, at pH 10 提交 2017-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–133（133 aa）片段：UNP residues 1-133 链 B 134–231（98 aa）片段：UNP residues 134-231	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；300 K；0.1M CHES pH 10, 70% MPD	分辨率 1.90 Å R-free 0.182
5XWJ Crystal Structure of Porcine pancreatic trypsin with tripeptide inhibitor, TRE, at pH 7 提交 2017-06-29	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–231（231 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；300 K；0.1M HEPES pH7.5, 70% MPD	分辨率 1.80 Å R-free 0.182
5XWJ Crystal Structure of Porcine pancreatic trypsin with tripeptide inhibitor, TRE, at pH 7 提交 2017-06-29	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–231（231 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；300 K；0.1M HEPES pH7.5, 70% MPD	分辨率 1.80 Å R-free 0.182
5XWL Crystal Structure of Porcine pancreatic trypsin with tripeptide inhibitor, TRE, at pH 10 提交 2017-06-29	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–231（231 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；300 K；0.1M CHES pH 10, 70% MPD	分辨率 2.10 Å R-free 0.194
5XWL Crystal Structure of Porcine pancreatic trypsin with tripeptide inhibitor, TRE, at pH 10 提交 2017-06-29	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–231（231 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；300 K；0.1M CHES pH 10, 70% MPD	分辨率 2.10 Å R-free 0.194
9CT1 Complex between the porcine trypsin and M271 a Kunitz-STI from Solanum tuberosum 提交 2024-07-24	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–231（231 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 4.6；293 K；0.085 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 0.17 M Ammonium acetate, 25.5% w/v Polyethylene glycol 4,000, 15% v/v Glycerol	分辨率 2.42 Å R-free 0.244
9CT1 Complex between the porcine trypsin and M271 a Kunitz-STI from Solanum tuberosum 提交 2024-07-24	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–231（231 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 4.6；293 K；0.085 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 0.17 M Ammonium acetate, 25.5% w/v Polyethylene glycol 4,000, 15% v/v Glycerol	分辨率 2.42 Å R-free 0.244
9PD9 The Structure of Porcine Trypsin in Complex with Crystallization Additives I 提交 2025-06-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–231（231 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 BEN BENZAMIDINE × 4 PG5 1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 15 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 8 OXL OXALATE ION × 1 A1CHW 4-aminobenzene-1-sulfonic acid × 1 OXM OXAMIC ACID × 6 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates. Reservoirs 30% PEG 3350. Drops 3.0 ul of reservoir, plus 2 ul additives oxalic acid, sulfanilic acid, 4-amino benzoic acid mix, plus 3.0 ul of 40 mg/ml stock protein solution of 0.1 M HEPES at pH 6.5.	分辨率 1.28 Å R-free 0.147
9PDA Structure of Porcine Trypsin Crystals Grown From PEG and Complexed With Crystallization Additives IV 提交 2025-06-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–231（231 aa）	未记录	BEN BENZAMIDINE × 1 PG5 1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE × 3 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 8 CA CALCIUM ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；Sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates with reservoirs of 30% PEG 3350 buffered at pH 6.5 with 0.1 M HEPES. Drops composed of 3 ul reservoir, 2 ul of additive mix (oxalic acid, malic acid, oxaloacetic acid, pyromellitic acid), and 3 ul of a 40 mg/ml protein stock	分辨率 1.18 Å R-free 0.230
9PDA Structure of Porcine Trypsin Crystals Grown From PEG and Complexed With Crystallization Additives IV 提交 2025-06-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–231（231 aa）	未记录	BEN BENZAMIDINE × 3 PG5 1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 18 CA CALCIUM ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 PMA PYROMELLITIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；Sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates with reservoirs of 30% PEG 3350 buffered at pH 6.5 with 0.1 M HEPES. Drops composed of 3 ul reservoir, 2 ul of additive mix (oxalic acid, malic acid, oxaloacetic acid, pyromellitic acid), and 3 ul of a 40 mg/ml protein stock	分辨率 1.18 Å R-free 0.230
9PDA Structure of Porcine Trypsin Crystals Grown From PEG and Complexed With Crystallization Additives IV 提交 2025-06-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–231（231 aa）	未记录	BEN BENZAMIDINE × 3 PG5 1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 15 CA CALCIUM ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 5 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；Sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates with reservoirs of 30% PEG 3350 buffered at pH 6.5 with 0.1 M HEPES. Drops composed of 3 ul reservoir, 2 ul of additive mix (oxalic acid, malic acid, oxaloacetic acid, pyromellitic acid), and 3 ul of a 40 mg/ml protein stock	分辨率 1.18 Å R-free 0.230
9PDA Structure of Porcine Trypsin Crystals Grown From PEG and Complexed With Crystallization Additives IV 提交 2025-06-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–231（231 aa）	未记录	BEN BENZAMIDINE × 3 PG5 1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 20 CA CALCIUM ION × 2 MLI MALONATE ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 6 PMA PYROMELLITIC ACID × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；Sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates with reservoirs of 30% PEG 3350 buffered at pH 6.5 with 0.1 M HEPES. Drops composed of 3 ul reservoir, 2 ul of additive mix (oxalic acid, malic acid, oxaloacetic acid, pyromellitic acid), and 3 ul of a 40 mg/ml protein stock	分辨率 1.18 Å R-free 0.230
9PDC Porcine Trypsin grown from PEG and Complexed with Crystallization Additives II 提交 2025-06-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–231（231 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 28 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 10 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 2 PG5 1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE × 1 BEN BENZAMIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates. Reservoirs 30% PEG 3350 buffered with 0.1 M HEPES at pH 6.5. Drops 3 ul of reservoir, 2 ul of additive mix ( TACSIMATE, PEG 3350), 3 ul of 40 mg/ml stock protein solution buffered with 0.1 M HEPES pH 6.5.	分辨率 1.27 Å R-free 0.154

共 44 个其他 PDB 条目、54 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRYP_PIG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–231； UniProt 1–231

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9pct
沉积日期 deposition_date	2025-06-29
最后修订 last_revision	2025-09-17
结构标题 title	Structure of Porcine Trypsin Crystals Grown from PEG Complexed with Crystallization Additives III
关键词 keywords	sucrose, crystallization, additives, Silver Bullets, organic acids, ligands, PEPTIDE BINDING PROTEIN; PEPTIDE BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	18.95 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	17.90 Å
零角强度 I(0) i0	15769200.00
分子量 molecular_weight	28926.0 kDa
排除体积 excluded_volume	35938 Å³
包络体积 envelope_volume	45050 Å³
水化壳体积 shell_volume	20094 Å³
包络直径 envelope_diameter	63.5 Å
壳层 Rg shell_rg	25.17 Å
包络 Rg envelope_rg	18.99 Å
形状 Rg shape_rg	17.83 Å
总 Rg total_rg	19.21 Å
总原子数 total_atoms	3987
残基数 n_residues	223
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	62.8 Å
Rg (实空间) rg_real	18.85 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.38 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.5770e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.9370e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	18.87 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	15770000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8720
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	23.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.248
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.254
角度范围 angular_range	— – 0.4200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	5853000.0000
实空间数据点数 n_real_points	73
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.796; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.944

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Trypsin
分子量 formula_weight	24428.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4343

FPTDDDDKIVGGYTCAANSIPYQVSLNSGSHFCGGSLINSQWVVSAAHCYKSRIQVRLGEHNIDVLEGNEQFINAAKIITHPNFNGNTLDNDIMLIKLSSPATLNSRVATVSLPRSCAAAGTECLISGWGNTKSSGSSYPSLLQCLKAPVLSDSSCKSSYPGQITGNMICVGFLEGGKDSCQGDSGGPVVCNGQLQGIVSWGYGCAQKNKPGVYTKVCNYVNWIQQTIAAN

来源 Source

来源生物 organism	Sus scrofa
通用名 common_name	pig
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9823
宿主生物 host_organism	Sus scrofa

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	beta-D-fructofuranose-(2-1)-alpha-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	342.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	alpha-D-glucopyranose-(1-2)-beta-D-fructofuranose
分子量 formula_weight	342.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	BENZAMIDINE
分子量 formula_weight	120.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	CITRATE ANION
分子量 formula_weight	189.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	TETRAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	194.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE
分子量 formula_weight	178.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	D-MALATE
分子量 formula_weight	134.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE
分子量 formula_weight	266.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	ACETATE ION
分子量 formula_weight	59.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	D(-)-TARTARIC ACID
分子量 formula_weight	150.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 17 Entity 17 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	154

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	58.820 Å
晶胞边长 b length_b	58.820 Å
晶胞边长 c length_c	135.340 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	tetragonal

分辨率 resolution	1.410 Å
最低分辨率 resolution_low	26.310 Å
R 因子 r_factor	0.1340
R_work r_work	0.1312
R_free r_free	0.1698

fit	/app/data/saxs_computation/pc/9pct/9pct.fit
pddf	/app/data/pr_computation/pc/9pct/9pct.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/pc/9pct/9pct.dat