9pvz

Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a variant apolipoprotein A-I R173P amyloidosis patient

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 91.6 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apolipoprotein A-I

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 25–267 链 B； UniProt 25–267 链 C； UniProt 25–267 链 D； UniProt 25–267 链 E； UniProt 25–267 链 F； UniProt 25–267 链 G； UniProt 25–267 链 H； UniProt 25–267 链 I； UniProt 25–267 链 J； UniProt 25–267	未记录	无其他共同聚合物	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；H2O containing 5 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9PVZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AV1 CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN APOLIPOPROTEIN A-I 提交 1997-09-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 68–267（200 aa）片段：LIPID-BINDING DOMAIN 链 B 68–267（200 aa）片段：LIPID-BINDING DOMAIN 链 C 68–267（200 aa）片段：LIPID-BINDING DOMAIN 链 D 68–267（200 aa）片段：LIPID-BINDING DOMAIN	突变：N-TERMINAL MET, DEL(1-43) 突变：N-TERMINAL MET, DEL(1-43) 突变：N-TERMINAL MET, DEL(1-43) 突变：N-TERMINAL MET, DEL(1-43)	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.2 M NA CITRATE, 100 MM HEPES, PH 7.5 AT 4 DEGREES CELSIUS. CRYSTALS WERE STABILIZED IN 1.4 M NA CITRATE, 100 MM HEPES, PH 7.5., temperature 277K	分辨率 4.00 Å R-free 0.428
1GW3 THE HELIX-HINGE-HELIX STRUCTURAL MOTIF IN HUMAN APOLIPOPROTEIN A-I DETERMINED BY NMR SPECTROSCOPY, 1 STRUCTURE 提交 1997-06-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 166–211（46 aa）片段：RESIDUES 142 - 187	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.9；310 K	分辨率未提供
1GW4 THE HELIX-HINGE-HELIX STRUCTURAL MOTIF IN HUMAN APOLIPOPROTEIN A-I DETERMINED BY NMR SPECTROSCOPY, 1 STRUCTURE 提交 1997-06-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 166–211（46 aa）片段：RESIDUES 142 - 187	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.9；323 K	分辨率未提供
1ODP PEPTIDE OF HUMAN APOA-I RESIDUES 166-185. NMR, 5 STRUCTURES AT PH 6.6, 37 DEGREES CELSIUS AND PEPTIDE:SDS MOLE RATIO OF 1:40 提交 1996-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 190–209（20 aa）片段：RESIDUES 166 - 185	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.6；310 K	分辨率未提供
1ODQ PEPTIDE OF HUMAN APOA-I RESIDUES 166-185. NMR, 5 STRUCTURES AT PH 3.7, 37 DEGREES CELSIUS AND PEPTIDE:SDS MOLE RATIO OF 1:40 提交 1996-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 190–209（20 aa）片段：RESIDUES 166 - 185	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.7；310 K	分辨率未提供
1ODR PEPTIDE OF HUMAN APOA-I RESIDUES 166-185. NMR, 5 STRUCTURES AT PH 6.0, 37 DEGREES CELSIUS AND PEPTIDE:DPC MOLE RATIO OF 1:40 提交 1996-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 190–209（20 aa）片段：RESIDUES 166 - 185	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；310 K	分辨率未提供
2MSC NMR data-driven model of GTPase KRas-GDP tethered to a lipid-bilayer nanodisc 提交 2014-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265 链 C 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265	未记录	PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.105；压力 ambient NMR样品组成 20 mM TRIS-1, 100 mM sodium chloride-2, 2 mM TCEP-3, 5 mM MgCl2-4, 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C K-Ras-5, 0.6 mM membrane scaffold protein-6, 0.6 mM GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE-7, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-8, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-9, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-10, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 20 mM TRIS-11, 100 mM sodium chloride-12, 2 mM TCEP-13, 5 mM Magnesium-14, 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C K-Ras-15, 0.6 mM membrane scaffold protein-16, 0.6 mM GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE-17, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-18, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-19, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-20, 0.65 mM 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-diethylenetriaminepentaacetic acid (gadolinium salt)-21, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2MSD NMR data-driven model of GTPase KRas-GNP tethered to a lipid-bilayer nanodisc 提交 2014-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 68–265（198 aa）片段：UNP RESIDUES 68-265 链 C 68–265（198 aa）片段：UNP RESIDUES 68-265	未记录	PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.105；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C K-Ras-1, 0.6 mM membrane scaffold protein-2, 20 mM TRIS-3, 100 mM sodium chloride-4, 2 mM TCEP-5, 0.6 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-6, 5 mM Magnesium-7, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-8, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-9, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-10, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C K-Ras-11, 0.6 mM membrane scaffold protein-12, 20 mM TRIS-13, 100 mM sodium chloride-14, 5 mM Magnesium-15, 0.6 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-16, 2 mM TCEP-17, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-18, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-19, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-20, 0.65 mM 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-diethylenetriaminepentaacetic acid (gadolinium salt)-21, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2MSE NMR data-driven model of GTPase KRas-GNP:ARafRBD complex tethered to a lipid-bilayer nanodisc 提交 2014-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265 链 C 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265	未记录	PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.105；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C K-Ras-1, 0.6 mM membrane scaffold protein-2, 0.7 mM A-RafRBD-3, 100 mM sodium chloride-4, 5 mM Magnesium-5, 20 mM TRIS-6, 2 mM TCEP-7, 0.6 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-8, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-9, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-10, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-11, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.7 mM K-Ras-12, 0.7 mM membrane scaffold protein-13, 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C A-RafRBD-14, 5 mM Magnesium-15, 20 mM TRIS-16, 100 mM sodium chloride-17, 2 mM TCEP-18, 0.7 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-19, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-20, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-21, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-22, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C K-Ras-23, 0.7 mM A-RafRBD-24, 0.6 mM membrane scaffold protein-25, 20 mM TRIS-26, 100 mM sodium chloride-27, 5 mM Magnesium-28, 2 mM TCEP-29, 0.6 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-30, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-31, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-32, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-33, 0.65 mM 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-diethylenetriaminepentaacetic acid (gadolinium salt)-34, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.7 mM K-Ras-35, 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C A-RafRBD-36, 0.7 mM membrane scaffold protein-37, 20 mM TRIS-38, 100 mM sodium chloride-39, 5 mM Magnesium-40, 2 mM TCEP-41, 0.7 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-42, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-43, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-44, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-45, 0.65 mM 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-diethylenetriaminepentaacetic acid (gadolinium salt)-46, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2N5E The 3D solution structure of discoidal high-density lipoprotein particles 提交 2015-07-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 79–267（189 aa）链 B 79–267（189 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；316 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient NMR样品组成 0.5-1.0 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] H2O, 1 mM stereospecific Methyl-labeling H2O, 1 mM selective unlabeling H2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3K2S Solution structure of double super helix model 提交 2009-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–267（243 aa）链 B 25–267（243 aa）	未记录	POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 200 CLR CHOLESTEROL × 20	SOLUTION SCATTERING mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
3R2P 2.2 Angstrom Crystal Structure of C Terminal Truncated Human Apolipoprotein A-I Reveals the Assembly of HDL by Dimerization. 提交 2011-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–208（184 aa）片段：N-terminal domain (UNP 25-208)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；298 K；0.15M potassium bromide, 30% PEG 2000 MME, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.280
4V6M Structure of the ribosome-SecYE complex in the membrane environment 提交 2011-02-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：60-meric	链 A0 68–267（200 aa）链 A1 68–267（200 aa）	未记录	PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 101 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 32	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM Hepes (pH 7.2), 100 mM KOAc, 10 mM Mg(OAc)2, 1 mM DTT, 250 microg/ml chloramphenicol；pH 7.2；20 mM Hepes (pH 7.2), 100 mM KOAc, 10 mM Mg(OAc)2, 1 mM DTT, 250 microg/ml chloramphenicol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；liquid ethane was used as a cryogen	分辨率 7.10 Å
6CC9 NMR data-driven model of GTPase KRas-GMPPNP:Cmpd2 complex tethered to a nanodisc 提交 2018-02-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265 链 C 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265	未记录	PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EWS (2R,4S)-4-[(5-bromo-1H-indole-3-carbonyl)amino]-2-[(4-chlorophenyl)methyl]piperidin-1-ium × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 0.2 mM U-15N, Ile, Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C GTPase KRas isoform b, 0.4 mM Membrane Scaffold Protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 12 mM DOPC, 3.2 mM DOPS, 0.8 mM PE-MCC, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2 mM U-15N, Ile, Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C GTPase KRas isoform b, 0.4 mM Membrane Scaffold Protein, 1 mM Cmpd2, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 12 mM DOPC, 3.2 mM DOPS, 0.8 mM PE-MCC, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2 mM [U-15N] GTPase KRas isoform b, 1 mM Cmpd2, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6CCH NMR data-driven model of GTPase KRas-GMPPNP tethered to a nanodisc (E3 state) 提交 2018-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265 链 C 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265	未记录	PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）105；压力 1 NMR样品组成 0.2 mM U-15N, Ile, Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C GTPase KRas isoform b, 0.4 mM Membrane Scaffold Protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 12 mM DOPC, 3.2 mM DOPS, 0.8 mM PE-MCC, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2 mM U-15N, Ile, Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C GTPase KRas isoform b, 0.4 mM Membrane Scaffold Protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 12 mM DOPC, 3.2 mM DOPS, 0.8 mM PE-MCC, 0.4 mM PE-DTPA-Gd, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6CCX NMR data-driven model of GTPase KRas-GMPPNP:Cmpd2 complex tethered to a nanodisc 提交 2018-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265 链 C 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265	未记录	PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EWS (2R,4S)-4-[(5-bromo-1H-indole-3-carbonyl)amino]-2-[(4-chlorophenyl)methyl]piperidin-1-ium × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）105；压力 1 NMR样品组成 0.2 mM U-15N, Ile, Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C GTPase KRas isoform b, 0.4 mM Membrane Scaffold Protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 12 mM DOPC, 3.2 mM DOPS, 0.8 mM PE-MCC, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2 mM GTPase KRas isoform b, 0.4 mM Membrane Scaffold Protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 12 mM DOPC, 3.2 mM DOPS, 0.8 mM PE-MCC, 0.4 mM PE-DTPA-Gd, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6CLZ MT1-MMP HPX domain with Blade 4 Loop Bound to Nanodiscs 提交 2018-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 79–267（189 aa）片段：residues 79-267 链 C 79–267（189 aa）片段：residues 79-267	未记录	PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 218 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；303 K；离子强度（mmCIF原始值）300；压力 1 NMR样品组成 20 mM Tris-HCl, 300 mM NaCl, 0.02 % sodium azide, 93 % H2O, 7 % [U-100% 2H] D2O, 90 uM 2H, 13C, 15N MT1-MMP hemopexin-like domain, 180 uM MSP1D1, 14.4 mM PX4, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
6CM1 MT1-MMP HPX Domain with Blade 2 Loop Bound to Nanodiscs 提交 2018-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 79–267（189 aa）片段：residues 79-267 链 C 79–267（189 aa）片段：residues 79-267	未记录	PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 218 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；303 K；离子强度（mmCIF原始值）300；压力 1 NMR样品组成 20 mM Tri-HCl, 300 mM NaCl, 0.02 % sodium azide, 93 % H2O, 7 % [U-100% 2H] D2O, 90 uM 2H, 13C, 15N MT1-MMP hemopexin-like domain, 180 uM MSP1D1, 14.4 mM PX4, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
6PTS NMR data-driven model of KRas-GMPPNP:RBD-CRD complex tethered to a nanodisc (state A) 提交 2019-07-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265 链 C 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265	未记录	PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）450；压力 1 NMR测量条件 pH 5.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1 NMR样品组成 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C KRAS, 0.2 mM U-12C, 14N, 1H RBD-CRD, 0.4 mM U-12C, 14N, 1H MSP, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2 mM U-12C, 14N, 1H KRAS, 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C RBD-CRD, 0.4 mM U-12C, 14N, 1H MSP, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2 mM U-12C, 14N, 1H KRAS, 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2 mM U-12C, 14N, 1H KRAS, 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM U-15N; Ile C-delta-13C, Met methyl-13C KRAS, 0.5 mM Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C, RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 15N]; [U-13C]; RBD, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3 mM [U-99% 15N]; [U-13C]; CRD, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6PTW NMR data-driven model of KRas-GMPPNP:RBD-CRD complex tethered to a nanodisc (state B) 提交 2019-07-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265 链 C 68–265（198 aa）片段：UNP residues 68-265	未记录	PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）450；压力 1 NMR测量条件 pH 5.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1 NMR样品组成 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N; U-2H] KRAS, 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] RBD-CRD, 0.4 mM [U-12C; U-14N; U-1H] MSP, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] KRAS, 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N; U-2H] RBD-CRD, 0.4 mM [U-12C; U-14N; U-1H] MSP, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N] RBD-CRD, 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] KRAS Q43C, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N] RBD-CRD, 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] KRAS N-term C, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-15N; Ile C-delta-13C; Met methyl-13C] KRAS, 0.5 mM [Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C] RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] RBD, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] CRD, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6W4E NMR-driven structure of KRAS4B-GTP homodimer on a lipid bilayer nanodisc 提交 2020-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 68–265（198 aa）链 D 68–265（198 aa）	未记录	PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1 NMR样品组成 80 uM ILV 13C-methyl; Lys 15N-amide KRAS4B, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6W4F NMR-driven structure of KRAS4B-GDP homodimer on a lipid bilayer nanodisc 提交 2020-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 68–265（198 aa）链 D 68–265（198 aa）	未记录	PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1 NMR样品组成 80 uM ILV 13C-methyl; Lys 15N-amide KRAS4B, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
7KJR Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 ORF3a 提交 2020-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 79–267（189 aa）片段：UNP residues 79-267 链 D 79–267（189 aa）片段：UNP residues 79-267	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；1 blot force 5 second wait time 3 second blot time	分辨率 2.08 Å
7RSC NMR-driven structure of the KRAS4B-G12D "alpha-alpha" dimer on a lipid bilayer nanodisc 提交 2021-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 68–265（198 aa）链 E 68–265（198 aa）	未记录	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 7Q9 [(2~{R})-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-2-propanoyloxy-propyl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 128 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 32	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1 NMR样品组成 80 uM ILV 13C-methyl; Lys 15N-amide KRAS4B, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
7RSE NMR-driven structure of the KRAS4B-G12D "alpha-beta" dimer on a lipid bilayer nanodisc 提交 2021-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 68–265（198 aa）链 E 68–265（198 aa）	未记录	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 7Q9 [(2~{R})-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-2-propanoyloxy-propyl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 128 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 32	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1 NMR样品组成 80 uM ILV 13C-methyl; Lys 15N-amide KRAS4B, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
8EQS Structure of SARS-CoV-1 Orf3a in late endosome/lysosome-like environment, MSP1D1 nanodisc 提交 2022-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 79–267（189 aa）链 D 79–267（189 aa）	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8VXJ The crystal structure of human apolipoprotein A-I in complex with Fab 55201 提交 2024-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 25–267（243 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；15% PEG 6000, 0.1 M trisodium citrate-citric acid, pH 5.5, 0.02% NaN3	分辨率 2.70 Å R-free 0.298
8VXJ The crystal structure of human apolipoprotein A-I in complex with Fab 55201 提交 2024-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 25–267（243 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；15% PEG 6000, 0.1 M trisodium citrate-citric acid, pH 5.5, 0.02% NaN3	分辨率 2.70 Å R-free 0.298
9MXZ Lecithin:Cholesterol Acyltransferase Bound to Apolipoprotein A-I dimer in HDL 提交 2025-01-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–267（243 aa）链 E 25–267（243 aa）	未记录	6PL (4S,7R)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 158	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.80 Å
9PVY Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a variant apolipoprotein A-I L90P amyloidosis patient 提交 2025-08-04	结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 25–267（243 aa）链 B 25–267（243 aa）链 C 25–267（243 aa）链 D 25–267（243 aa）链 E 25–267（243 aa）链 F 25–267（243 aa）链 G 25–267（243 aa）链 H 25–267（243 aa）链 I 25–267（243 aa）链 J 25–267（243 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；H2O containing 5 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.15 Å
9PW3 Cryo-EM structure of renal amyloid fibril from a variant apolipoprotein A-I R173P amyloidosis patient 提交 2025-08-04	结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 25–267（243 aa）链 B 25–267（243 aa）链 C 25–267（243 aa）链 D 25–267（243 aa）链 E 25–267（243 aa）链 F 25–267（243 aa）链 G 25–267（243 aa）链 H 25–267（243 aa）链 I 25–267（243 aa）链 J 25–267（243 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；H2O containing 5 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.73 Å

共 30 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	APOA1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–243； UniProt 25–267 作者链 B； PDB构建体 1–243； UniProt 25–267 作者链 C； PDB构建体 1–243； UniProt 25–267 作者链 D； PDB构建体 1–243； UniProt 25–267 作者链 E； PDB构建体 1–243； UniProt 25–267 作者链 F； PDB构建体 1–243； UniProt 25–267 作者链 G； PDB构建体 1–243； UniProt 25–267 作者链 H； PDB构建体 1–243； UniProt 25–267 作者链 I； PDB构建体 1–243； UniProt 25–267 作者链 J； PDB构建体 1–243； UniProt 25–267

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9pvz
沉积日期 deposition_date	2025-08-04
结构标题 title	Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a variant apolipoprotein A-I R173P amyloidosis patient
关键词 keywords	Apolipoprotein A-I, AApoAI, R173P, cardiac, amyloidosis., PROTEIN FIBRIL; PROTEIN FIBRIL
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	27.57 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	27.09 Å
零角强度 I(0) i0	71320200.00
分子量 molecular_weight	67896.0 kDa
排除体积 excluded_volume	85468 Å³
包络体积 envelope_volume	97118 Å³
水化壳体积 shell_volume	30256 Å³
包络直径 envelope_diameter	95.7 Å
壳层 Rg shell_rg	34.41 Å
包络 Rg envelope_rg	27.59 Å
形状 Rg shape_rg	27.14 Å
总 Rg total_rg	27.62 Å
总原子数 total_atoms	4810
残基数 n_residues	600
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	91.6 Å
Rg (实空间) rg_real	27.60 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.65 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.1320e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0940e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	27.59 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	71320000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6859
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	28.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.343
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.428
角度范围 angular_range	— – 0.2900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	19630000.0000
实空间数据点数 n_real_points	59
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.876; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.127; Positv: 1.000; Valcen: 0.975; Smooth: 0.930

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.300 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	165734

描述 description	Apolipoprotein A-I
分子量 formula_weight	28120.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	10

Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a variant apolipoprotein A-I R173P amyloidosis patient

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apolipoprotein A-I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J
原子数 atom_count	4810

fit	/app/data/saxs_computation/pv/9pvz/9pvz.fit
pddf	/app/data/pr_computation/pv/9pvz/9pvz.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/pv/9pvz/9pvz.dat