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9sjw

Serial electron diffraction (SerialED) structure of Y122F mutant Ribonucleotide reductase R2 from E. coli in its oxidised (met) form

Method: ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY Dmax: 87.4 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit beta

Escherichia coli

UniProt P69924

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2–376 链 B； UniProt 2–376 未记录 FE FE (III) ION × 4 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY cryo-EM缓冲液：pH 5.5；Crystallization was performed using 23.5 uL protein solution, 25 mM HEPES-Na pH 7.0, 50 mM NaCl, and 20 uL crystallization buffer with seeds, 25 percent PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5. cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Excess liquid was manually blotted from the backside for approximately 10 seconds, followed by plunge freezing in liquid ethane. 分辨率 1.80 Å R-free 0.234

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9SJW Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1AV8 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2 SUBUNIT FROM E. COLI 提交 1997-09-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–340（340 aa）
链 B 1–340（340 aa）
未记录 FEO MU-OXO-DIIRON × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 80% SATURATED NACL, NEAR PHYSIOLOGICAL PH (PH 7.6)
分辨率 2.80 Å R-free 0.192
1BIQ RIBONUCLEOSIDE-DIPHOSPHATE REDUCTASE 1 BETA CHAIN MUTANT E238A 提交 1998-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa） 片段：BETA CHAIN
链 B 1–375（375 aa） 片段：BETA CHAIN
突变：Y122F, E238A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Y122F, E238A FE2 FE (II) ION × 3 FE FE (III) ION × 1 OH HYDROXIDE ION × 3 HG MERCURY (II) ION × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.05 Å R-free 0.260
1JPR Mn substituted Ribonucleotide reductase R2 from E. coli oxidized by nitric oxide 提交 2001-08-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 4000, sodium chloride, EMTS, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.88 Å R-free 0.213
1JQC Mn substituted Ribonucleotide reductase R2 from E. Coli oxidized by hydrogen peroxide and hydroxylamine 提交 2001-08-06 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；peg 4000, MES, EMTS, sodium chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.61 Å R-free 0.219
1MRR SUBSTITUTION OF MANGANESE FOR IRON IN RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE FROM ESCHERICHIA COLI. SPECTROSCOPIC AND CRYSTALLOGRAPHIC CHARACTERIZATION 提交 1992-07-28 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 13 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1MXR High resolution structure of Ribonucleotide reductase R2 from E. coli in its oxidised (Met) form 提交 2002-10-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 11 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 4000, MES, NaCl, EMTS, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.42 Å R-free 0.185
1PFR RIBONUCLEOSIDE-DIPHOSPHATE REDUCTASE 1 BETA CHAIN 提交 1996-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–340（340 aa）
链 B 1–340（340 aa）
突变：S211A 突变：S211A FE FE (III) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. CRYSTALLISED FROM 20% PEG 4000, 0.2M NACL, 0.1M MES PH 6.0, 1MM ETHYLMERCURY SALICYLATE., vapor diffusion - hanging drop
分辨率 2.20 Å
1PIM DITHIONITE REDUCED E. COLI RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2 SUBUNIT, D84E MUTANT 提交 2003-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
突变：D84E 突变：D84E FE FE (III) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；310 K；20% PEG 4000, 200mM NaCl, 50mM MES, 0.3% dioxane, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 310K
分辨率 2.00 Å R-free 0.246
1PIU OXIDIZED RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-D84E MUTANT CONTAINING OXO-BRIDGED DIFERRIC CLUSTER 提交 2003-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
突变：D84E 突变：D84E FE FE (III) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 10 O OXYGEN ATOM × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；310 K；20% PEG 4000, 200mM NaCl, 50mM MES, 0.3% dioxane, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 310K
分辨率 2.20 Å R-free 0.232
1PIY RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2 SOAKED WITH FERROUS ION AT NEUTRAL PH 提交 2003-05-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；310 K；20% PEG 4000, 200mM NaCl, 50mM MES, 0.3% dioxane, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 310K
分辨率 1.68 Å R-free 0.246
1PIZ RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2 D84E MUTANT SOAKED WITH FERROUS IONS AT NEUTRAL PH 提交 2003-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
突变：D84E 突变：D84E FE FE (III) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；310 K；20% PEG 4000, 200mM NaCl, 50mM MES, 0.3% dioxane, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 310K
分辨率 1.90 Å R-free 0.242
1PJ0 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-D84E/W48F MUTANT SOAKED WITH FERROUS IONS AT NEUTRAL PH 提交 2003-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
突变：D84E, W48F 突变：D84E, W48F FE FE (III) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；310 K；20% PEG 4000, 200mM NaCl, 50mM MES, 0.3% dioxane, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 310K
分辨率 1.90 Å R-free 0.236
1PJ1 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-D84E/W48F SOAKED WITH FERROUS IONS AT PH 5 提交 2003-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
突变：D84E, W48F 突变：D84E, W48F FE FE (III) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；310 K；20% PEG 4000, 200mM NaCl, 50mM MES, 0.3% dioxane, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 310K
分辨率 1.95 Å R-free 0.221
1PM2 CRYSTAL STRUCTURE OF MANGANESE SUBSTITUTED R2-D84E (D84E MUTANT OF THE R2 SUBUNIT OF E. COLI RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE) 提交 2003-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–339（339 aa）
链 B 1–339（339 aa）
突变：D84E 突变：D84E MN MANGANESE (II) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；310 K；PEG 4000, MES, sodium chloride, sodium ethylmercurithiosalicylicate , pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 310K
分辨率 1.80 Å R-free 0.215
1R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN MUTANT Y730F WITH A REDUCED ACTIVE SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 P 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 2.90 Å R-free 0.245
1R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN MUTANT Y730F WITH A REDUCED ACTIVE SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 2.90 Å R-free 0.245
1R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN MUTANT Y730F WITH A REDUCED ACTIVE SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 2.90 Å R-free 0.245
1R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN MUTANT Y730F WITH A REDUCED ACTIVE SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 2.90 Å R-free 0.245
1R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN MUTANT Y730F WITH A REDUCED ACTIVE SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 2.90 Å R-free 0.245
1R65 Crystal structure of ferrous soaked Ribonucleotide Reductase R2 subunit (wildtype) at pH 5 from E. coli 提交 2003-10-14 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa） 片段：Ribonucleotide Reductase R2
链 B 1–375（375 aa） 片段：Ribonucleotide Reductase R2
未记录 FE2 FE (II) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；310 K；PEG4000, sodium chloride, EMTS, MES, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 310K
分辨率 1.95 Å R-free 0.236
1RIB STRUCTURE AND FUNCTION OF THE ESCHERICHIA COLI RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE PROTEIN R2 提交 1993-01-19 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
未记录 FEO MU-OXO-DIIRON × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1RNR AUTOCATALYTIC GENERATION OF DOPA IN THE ENGINEERED PROTEIN R2 F208Y FROM ESCHERICHIA COLI RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE AND CRYSTAL STRUCTURE OF THE DOPA-208 PROTEIN 提交 1993-04-26 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–376（375 aa）
链 B 2–376（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） FE FE (III) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1RSR azide complex of the diferrous F208A mutant R2 subunit of ribonucleotide reductase 提交 2003-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
突变：Y122F, F208A 突变：Y122F, F208A FE2 FE (II) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 12 AZI AZIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；100mM MES, 200mM NaCl, 1mM EMTS (Thimerosal), 16-24% PEG 4000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.289
1RSV azide complex of the diferrous E238A mutant R2 subunit of ribonucleotide reductase 提交 2003-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
突变：Y122F, E238A 突变：Y122F, E238A FE FE (III) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 12 AZI AZIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；100mM MES, 200mM NaCl, 1mM EMTS (Thimerosal), 16-24% PEG 4000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.256
1XIK RIBONUCLEOSIDE-DIPHOSPHATE REDUCTASE 1 BETA CHAIN 提交 1996-08-06 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa） 片段：BETA CHAIN
链 B 1–375（375 aa） 片段：BETA CHAIN
未记录 FE2 FE (II) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION METHOD, 20% PEG 4000, 0.2M NACL, 50MM MES BUFFER PH 6.0, 1MM ETHYLMERCURY SALICYLATE, vapor diffusion - hanging drop
分辨率 1.70 Å R-free 0.280
1YFD Crystal structure of the Y122H mutant of ribonucleotide reductase R2 protein from E. coli 提交 2004-12-31 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
突变：Y122H 突变：Y122H HG MERCURY (II) ION × 13 FEO MU-OXO-DIIRON × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；PEG 4000, 0.1M MES, 0.4M NACL, 1mM EMTS, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.90 Å R-free 0.206
2ALX Ribonucleotide Reductase R2 from Escherichia coli in space group P6(1)22 提交 2005-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 0–339（340 aa） 片段：residues 0-339
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；ammonium sulfate, MES, manganese chloride, magnesium chloride, 4-(2-Hydroxyethyl)-1-piperazinepropanesulfonic acid, ethylmercurithiosalicylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2AV8 Y122F MUTANT OF RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–340（340 aa）
链 B 1–340（340 aa）
突变：Y122F 突变：Y122F FE2 FE (II) ION × 1 FEO MU-OXO-DIIRON × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 80% SATURATED NACL, NEAR PHYSIOLOGICAL PH (PH 7.6)
分辨率 2.46 Å R-free 0.237
2R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH DTTP OCCUPYING THE SPECIFICITY SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 P 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM CDP WAS ALSO INCLUDED IN THE PROTEIN SOLUTION
分辨率 3.00 Å R-free 0.280
2R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH DTTP OCCUPYING THE SPECIFICITY SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM CDP WAS ALSO INCLUDED IN THE PROTEIN SOLUTION
分辨率 3.00 Å R-free 0.280
2R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH DTTP OCCUPYING THE SPECIFICITY SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM CDP WAS ALSO INCLUDED IN THE PROTEIN SOLUTION
分辨率 3.00 Å R-free 0.280
2R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH DTTP OCCUPYING THE SPECIFICITY SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM CDP WAS ALSO INCLUDED IN THE PROTEIN SOLUTION
分辨率 3.00 Å R-free 0.280
2R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH DTTP OCCUPYING THE SPECIFICITY SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM CDP WAS ALSO INCLUDED IN THE PROTEIN SOLUTION
分辨率 3.00 Å R-free 0.280
2R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH DTTP OCCUPYING THE SPECIFICITY SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM CDP WAS ALSO INCLUDED IN THE PROTEIN SOLUTION
分辨率 3.00 Å R-free 0.280
2R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH DTTP OCCUPYING THE SPECIFICITY SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM CDP WAS ALSO INCLUDED IN THE PROTEIN SOLUTION
分辨率 3.00 Å R-free 0.280
2R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH DTTP OCCUPYING THE SPECIFICITY SITE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM CDP WAS ALSO INCLUDED IN THE PROTEIN SOLUTION
分辨率 3.00 Å R-free 0.280
2X0X Ribonucleotide reductase R1 subunit of E. coli to 2.3 A resolution 提交 2009-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE APP 1.5M, SODIUM CITRATE BUFFER PH APP 6.
分辨率 2.30 Å R-free 0.224
2X0X Ribonucleotide reductase R1 subunit of E. coli to 2.3 A resolution 提交 2009-12-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
链 E 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE APP 1.5M, SODIUM CITRATE BUFFER PH APP 6.
分辨率 2.30 Å R-free 0.224
2X0X Ribonucleotide reductase R1 subunit of E. coli to 2.3 A resolution 提交 2009-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE APP 1.5M, SODIUM CITRATE BUFFER PH APP 6.
分辨率 2.30 Å R-free 0.224
2XAK Ribonucleotide reductase Y730NO2Y modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
链 E 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.80 Å R-free 0.241
2XAK Ribonucleotide reductase Y730NO2Y modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.80 Å R-free 0.241
2XAK Ribonucleotide reductase Y730NO2Y modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.80 Å R-free 0.241
2XAP Ribonucleotide reductase Y731NO2Y modified R1 subunit of E. coli to 2. 1 A resolution 提交 2010-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
链 E 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.10 Å R-free 0.230
2XAP Ribonucleotide reductase Y731NO2Y modified R1 subunit of E. coli to 2. 1 A resolution 提交 2010-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.10 Å R-free 0.230
2XAP Ribonucleotide reductase Y731NO2Y modified R1 subunit of E. coli to 2. 1 A resolution 提交 2010-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.10 Å R-free 0.230
2XAV Ribonucleotide reductase Y731NO2Y and Y730F modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
链 E 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.80 Å R-free 0.247
2XAV Ribonucleotide reductase Y731NO2Y and Y730F modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.80 Å R-free 0.247
2XAV Ribonucleotide reductase Y731NO2Y and Y730F modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.80 Å R-free 0.247
2XAW Ribonucleotide reductase Y730NO2Y and Y731F modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 3.10 Å R-free 0.234
2XAW Ribonucleotide reductase Y730NO2Y and Y731F modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
链 E 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 3.10 Å R-free 0.234
2XAW Ribonucleotide reductase Y730NO2Y and Y731F modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 3.10 Å R-free 0.234
2XAX Ribonucleotide reductase Y730NO2Y and Y731A modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.75 Å R-free 0.261
2XAX Ribonucleotide reductase Y730NO2Y and Y731A modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
链 E 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.75 Å R-free 0.261
2XAX Ribonucleotide reductase Y730NO2Y and Y731A modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.75 Å R-free 0.261
2XAY Ribonucleotide reductase Y730NO2Y and C439A modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
链 E 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.65 Å R-free 0.235
2XAY Ribonucleotide reductase Y730NO2Y and C439A modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.65 Å R-free 0.235
2XAY Ribonucleotide reductase Y730NO2Y and C439A modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.65 Å R-free 0.235
2XAZ Ribonucleotide reductase Y730NO2Y and C439S modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
链 E 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.60 Å R-free 0.246
2XAZ Ribonucleotide reductase Y730NO2Y and C439S modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.60 Å R-free 0.246
2XAZ Ribonucleotide reductase Y730NO2Y and C439S modified R1 subunit of E. coli 提交 2010-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.60 Å R-free 0.246
2XO4 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE Y730NH2Y MODIFIED R1 SUBUNIT OF E. COLI 提交 2010-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.50 Å R-free 0.233
2XO4 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE Y730NH2Y MODIFIED R1 SUBUNIT OF E. COLI 提交 2010-08-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
链 E 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.50 Å R-free 0.233
2XO4 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE Y730NH2Y MODIFIED R1 SUBUNIT OF E. COLI 提交 2010-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 357–376（20 aa） 片段：RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-PEPTIDE, RESIDUES 357-376
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.50 Å R-free 0.233
2XO5 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE Y731NH2Y MODIFIED R1 SUBUNIT OF E. COLI 提交 2010-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 357–376（20 aa） 片段：R1 BINDING PEPTIDE
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.70 Å R-free 0.228
2XO5 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE Y731NH2Y MODIFIED R1 SUBUNIT OF E. COLI 提交 2010-08-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 357–376（20 aa） 片段：R1 BINDING PEPTIDE
链 E 357–376（20 aa） 片段：R1 BINDING PEPTIDE
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.70 Å R-free 0.228
2XO5 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE Y731NH2Y MODIFIED R1 SUBUNIT OF E. COLI 提交 2010-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 357–376（20 aa） 片段：R1 BINDING PEPTIDE
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；LITHIUM SULPHATE 1.5M, SODIUM CHLORIDE BUFFER PH 6.
分辨率 2.70 Å R-free 0.228
2XOF Ribonucleotide reductase Y122NO2Y modified R2 subunit of E. coli 提交 2010-08-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–376（375 aa）
链 B 2–376（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） FEO MU-OXO-DIIRON × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.9；VAPOR DIFFUSION USING 90% OF SATURATED NACL, PH 7.9
分辨率 2.20 Å R-free 0.224
3UUS Crystal structure of the dATP inhibited E. coli class Ia ribonucleotide reductase complex 提交 2011-11-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–376（375 aa）
链 F 2–376（375 aa）
链 G 2–376（375 aa）
链 H 2–376（375 aa）
未记录 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 8 FE FE (III) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10.8% PEG 3350, 0.18M magnesium acetate, 0.09M MOPS pH 7.5, 0.01M iron (III) chloride, 4.5% glycerol , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 5.65 Å R-free 0.303
4ERM Crystal structure of the dATP inhibited E. coli class Ia ribonucleotide reductase complex at 4 Angstroms resolution 提交 2012-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–376（375 aa）
链 F 2–376（375 aa）
链 G 2–376（375 aa）
链 H 2–376（375 aa）
未记录 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 8 DAT 2'-DEOXYADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 FEO MU-OXO-DIIRON × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Precipitant conditions: 10% PEG 3350, 0.1 M MOPS pH 7.5, 0.2 M Magnesium Acetate, 0.025 M Magnesium Chloride, 0.006 M n-Nonyl-beta-D-maltopyranoside, and 5% glycerol. Mixed 1:1 with protein., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.95 Å R-free 0.284
4ERP Crystal structure of a gemcitabine-diphosphate inhibited E. coli class Ia ribonucleotide reductase complex 提交 2012-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 2–376（375 aa）
链 H 2–376（375 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 FEO MU-OXO-DIIRON × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Precipitant solution: 25% PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M ammonium acetate, 5% glycerol mixed 2:1 with protein and streak seeded from crystals grown under similar conditions. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.45 Å R-free 0.267
4ERP Crystal structure of a gemcitabine-diphosphate inhibited E. coli class Ia ribonucleotide reductase complex 提交 2012-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–376（375 aa）
链 G 2–376（375 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 FEO MU-OXO-DIIRON × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Precipitant solution: 25% PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M ammonium acetate, 5% glycerol mixed 2:1 with protein and streak seeded from crystals grown under similar conditions. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.45 Å R-free 0.267
4R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH SUBSTRATE, GDP AND EFFECTOR DTTP FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 P 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0. THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM GDP WAS ADDED TO THE PROTEIN SOLUTION 48 H BEFORE FREEZING THE PROTEIN CRYSTALS
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
4R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH SUBSTRATE, GDP AND EFFECTOR DTTP FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0. THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM GDP WAS ADDED TO THE PROTEIN SOLUTION 48 H BEFORE FREEZING THE PROTEIN CRYSTALS
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
4R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH SUBSTRATE, GDP AND EFFECTOR DTTP FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0. THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM GDP WAS ADDED TO THE PROTEIN SOLUTION 48 H BEFORE FREEZING THE PROTEIN CRYSTALS
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
4R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH SUBSTRATE, GDP AND EFFECTOR DTTP FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0. THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM GDP WAS ADDED TO THE PROTEIN SOLUTION 48 H BEFORE FREEZING THE PROTEIN CRYSTALS
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
4R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH SUBSTRATE, GDP AND EFFECTOR DTTP FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 P 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0. THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM GDP WAS ADDED TO THE PROTEIN SOLUTION 48 H BEFORE FREEZING THE PROTEIN CRYSTALS
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
4R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH SUBSTRATE, GDP AND EFFECTOR DTTP FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0. THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM GDP WAS ADDED TO THE PROTEIN SOLUTION 48 H BEFORE FREEZING THE PROTEIN CRYSTALS
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
4R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH SUBSTRATE, GDP AND EFFECTOR DTTP FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 P 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0. THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM GDP WAS ADDED TO THE PROTEIN SOLUTION 48 H BEFORE FREEZING THE PROTEIN CRYSTALS
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
4R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH SUBSTRATE, GDP AND EFFECTOR DTTP FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0. THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM GDP WAS ADDED TO THE PROTEIN SOLUTION 48 H BEFORE FREEZING THE PROTEIN CRYSTALS
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
4R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH SUBSTRATE, GDP AND EFFECTOR DTTP FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0. THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM GDP WAS ADDED TO THE PROTEIN SOLUTION 48 H BEFORE FREEZING THE PROTEIN CRYSTALS
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
4R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN WITH SUBSTRATE, GDP AND EFFECTOR DTTP FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0. THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20-FOLD EXCESS FO A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION. 10 MM DTTP AND 10 MM GDP WAS ADDED TO THE PROTEIN SOLUTION 48 H BEFORE FREEZING THE PROTEIN CRYSTALS
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
5CNS Crystal structure of the dATP inhibited E. coli class Ia ribonucleotide reductase complex bound to CDP and dATP at 2.97 Angstroms resolution 提交 2015-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–376（375 aa）
链 F 2–376（375 aa）
链 G 2–376（375 aa）
链 H 2–376（375 aa）
未记录 CDP CYTIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 DAT 2'-DEOXYADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 FEO MU-OXO-DIIRON × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；9.5% (w/v) PEG 3350, 100 mM MOPS, 250 mM Mg(CH3COO)2, 25 mM 394 MgCl2, 5% (v/v) glycerol
分辨率 2.98 Å R-free 0.214
5CNT Crystal structure of the dATP inhibited E. coli class Ia ribonucleotide reductase complex bound to UDP and dATP at 3.25 Angstroms resolution 提交 2015-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–376（375 aa）
链 F 2–376（375 aa）
链 G 2–376（375 aa）
链 H 2–376（375 aa）
未记录 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 8 FEO MU-OXO-DIIRON × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2% (w/v) PEG 3350, 100 mM MOPS pH 7.5, 300 mM Mg(CH3COO)2, 30 mM MgCl2, and 5% (v/v) glycerol
分辨率 3.25 Å R-free 0.221
5CNU Crystal structure of the dATP inhibited E. coli class Ia ribonucleotide reductase complex bound to ADP and dGTP at 3.40 Angstroms resolution 提交 2015-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–376（375 aa）
链 F 2–376（375 aa）
链 G 2–376（375 aa）
链 H 2–376（375 aa）
未记录 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 DAT 2'-DEOXYADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 FEO MU-OXO-DIIRON × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2% (w/v) PEG 3350, 100 mM MOPS pH 7.5, 300 mM Mg(CH3COO)2, 30 mM MgCl2, and 5% (v/v) glycerol
分辨率 3.40 Å R-free 0.221
5CNV Crystal structure of the dATP inhibited E. coli class Ia ribonucleotide reductase complex bound to GDP and TTP at 3.20 Angstroms resolution 提交 2015-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–376（375 aa）
链 F 2–376（375 aa）
链 G 2–376（375 aa）
链 H 2–376（375 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 DAT 2'-DEOXYADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 FEO MU-OXO-DIIRON × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2% (w/v) PEG 3350, 100 mM MOPS pH 7.5, 300 mM Mg(CH3COO)2, 30 mM MgCl2, and 5% (v/v) glycerol
分辨率 3.20 Å R-free 0.219
5R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441A MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 P 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.227
5R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441A MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.227
5R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441A MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.227
5R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441A MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.227
5R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441A MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.227
5R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441A MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.227
5R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441A MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.227
5R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441A MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.227
5R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441A MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.227
5R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441A MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.227
5R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441A MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.227
6R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441D MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 P 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.240
6R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441D MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.240
6R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441D MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.240
6R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441D MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.240
6R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441D MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.240
6R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441D MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.240
6R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441D MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.240
6R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441D MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.240
6W4X Holocomplex of E. coli class Ia ribonucleotide reductase with GDP and TTP 提交 2020-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–376（376 aa）
链 D 1–376（376 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FEO MU-OXO-DIIRON × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4.5 seconds before plunging
分辨率 3.60 Å
7AI8 Structure of Ribonucleotide reductase R2 from Escherichia coli collected by still serial crystallography on a COC membrane at a synchrotron source 提交 2020-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–376（376 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；34-37 % PAA 2100, 100 mM HEPES 7.0, 250-450 mM NaCl, 200 mM ammonium sulfate [and] 26% PAA 2100, 100 mM HEPES 7.0, 150 NaCl, 100 Malonate
分辨率 2.10 Å R-free 0.219
7AI9 Structure of Ribonucleotide reductase R2 from Escherichia coli collected by rotation serial crystallography on a COC membrane at a synchrotron source 提交 2020-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–376（376 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；34-37 % PAA 2100, 100 mM HEPES 7.0, 250-450 mM NaCl, 200 mM ammonium sulfate [and] 26% PAA 2100, 100 mM HEPES 7.0, 150 NaCl, 100 Malonate
分辨率 2.00 Å R-free 0.191
7BET Structure of Ribonucleotide reductase R2 from Escherichia coli collected by femtosecond serial crystallography on a COC membrane 提交 2020-12-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–376（376 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；34-37 % PAA 2100, 100 mM HEPES 7.0, 250-450 mM NaCl, 200 mM ammonium sulfate [and] 26% PAA 2100, 100 mM HEPES 7.0, 150 NaCl, 100 Malonate
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
7R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441Q MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 P 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.231
7R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441Q MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.231
7R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441Q MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.231
7R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441Q MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.231
7R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441Q MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.231
7R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441Q MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.231
7R1R RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE E441Q MUTANT R1 PROTEIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
链 E 356–375（20 aa） 片段：C-TERMINAL PORTION, 20 RESIDUES
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.7 M LITHIUM SULFATE, AND 10 MM MAGNESIUM SULFATE IN 25 MM CITRATE BUFFER AT PH 6.0 THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 17 MG/ML R1 PROTEIN, 20 FOLD EXCESS OF A 20-RESIDUE PEPTIDE CORRESPONDING TO THE C-TERMINUS OF THE R2 SUBUNIT AND IS ESSENTIAL FOR CRYSTALLIZATION
分辨率 3.10 Å R-free 0.231
8VHU Crystal structure of dATP bound E. coli class Ia ribonucleotide reductase alpha construct fused with the C-terminal tail of E. coli class Ia beta subunit 提交 2024-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 342–376（35 aa）
链 B 342–376（35 aa）
突变：Truncated final 8 residues of alpha,fused C-terminal 35 residues of beta 突变：Truncated final 8 residues of alpha,fused C-terminal 35 residues of beta DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.4M NaCl, 8% (w/vol) PEG 6000
分辨率 2.10 Å R-free 0.192
9DB2 Class Ia ribonucleotide reductase with mechanism-based inhibitor N3CDP 提交 2024-08-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–376（376 aa）
链 D 1–376（376 aa）
未记录 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 UNL UNKNOWN LIGAND × 1 A1A3L 4-amino-1-{(3xi)-3-C-amino-2-deoxy-5-O-[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]-beta-D-threo-pentofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one × 1 FEO MU-OXO-DIIRON × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9SIG XFEL structure of oxidised Ribonucleotide reductase R2a Y122F mutant from E. coli 提交 2025-08-28 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–376（375 aa）
链 B 2–376（375 aa）
突变：Y122F 突变：Y122F FE FE (III) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 5.5；297 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, PEG 3350 25%
分辨率 1.90 Å R-free 0.185
9SIH XFEL structure of Ribonucleotide reductase R2a Y122F mutant from E. coli,reduced form 提交 2025-08-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–376（375 aa）
链 B 2–376（375 aa）
突变：Y122F 突变：Y122F FE2 FE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 5.5；297 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, PEG 3350 25%
分辨率 1.70 Å R-free 0.191
9SJX Serial electron diffraction (SerialED) structure of Y122F mutant Ribonucleotide reductase R2 from E. coli in its oxidised (met) form (re-oxidised) 提交 2025-09-01 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–376（375 aa）
链 B 2–376（375 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 4 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5；Crystallization was performed using 23.5 uL protein solution - 25 mM HEPES-Na pH 7.0, 50 mM NaCl and 50 mM sodium dithionite - and 20 uL crystallization buffer containing seeds, 25 percent PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5 and 2 mM sodium dithioninte. The crystals were then oxidized through repeated wash with oxygen containing buffer of 12% PEG, 0.05 M Bis-Tris at pH 5.5.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.00 Å R-free 0.285
9SJY Serial electron diffraction (SerialED) structure of Ribonucleotide reductase R2 from E. coli in its oxidised (met) form 提交 2025-09-01 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–376（375 aa）
链 B 2–376（375 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 4 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5；Crystallization was performed using 23.5 uL protein solution, 25 mM HEPES-Na pH 7.0, 50 mM NaCl, and 20 uL crystallization buffer with seeds, 25 percent PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Excess liquid was manually blotted from the backside for approximately 10 seconds, followed by plunge freezing in liquid ethane.
分辨率 1.80 Å R-free 0.253
9SJZ Serial electron diffraction (SerialED) structure of Ribonucleotide reductase R2 from E. coli in its oxidised (met) form (re-oxidised) 提交 2025-09-01 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–376（375 aa）
链 B 2–376（375 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 4 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5；Crystallization was performed using 23.5 uL protein solution - 25 mM HEPES-Na pH 7.0, 50 mM NaCl and 50 mM sodium dithionite - and 20 uL crystallization buffer containing seeds, 25 percent PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5 and 2 mM sodium dithioninte. The crystals were then oxidized through repeated wash with oxygen containing buffer of 12% PEG, 0.05 M Bis-Tris at pH 5.5.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 1.70 Å R-free 0.232
9SK1 Serial electron diffraction (SerialED) structure of Y122F mutant Ribonucleotide reductase R2 from E. coli in its reduced (red) form 提交 2025-09-01 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–376（375 aa）
链 B 2–376（375 aa）
未记录 FE2 FE (II) ION × 4 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5；Crystallization was performed using 23.5 uL protein solution - 25 mM HEPES-Na pH 7.0, 50 mM NaCl and 50 mM sodium dithionite - and 20 uL crystallization buffer containing seeds, 25 percent PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5 and 2 mM sodium dithioninte.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Excess liquid was manually blotted from the backside for approximately 10 seconds, followed by plunge freezing in liquid ethane. Sample was prepared in an inert environment within a glove box.
分辨率 1.80 Å R-free 0.222
9SKG Serial electron diffraction (SerialED) structure of Ribonucleotide reductase R2 from E. coli in its reduced (red) form 提交 2025-09-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–376（375 aa）
链 B 2–376（375 aa）
未记录 FE2 FE (II) ION × 4 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5；Crystallization was performed using 23.5 uL protein solution - 25 mM HEPES-Na pH 7.0, 50 mM NaCl and 50 mM sodium dithionite - and 20 uL crystallization buffer containing seeds, 25 percent PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5 and 2 mM sodium dithioninte.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Excess liquid was manually blotted from the backside for approximately 10 seconds, followed by plunge freezing in liquid ethane. Sample was prepared in an inert environment within a glove box.
分辨率 1.80 Å R-free 0.247
9TCD XFEL structure of oxidised Ribonucleotide reductase R2a Y122F mutant from E. coli, hexagonal P6122 form 提交 2025-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–376（375 aa）
突变：Y122F FE FE (III) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；297 K；4M Sodium Formate
分辨率 2.70 Å R-free 0.254
9TCE XFEL structure of Ribonucleotide reductase R2a Y122F mutant from E. coli,reduced form, hexagonal P6122 提交 2025-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–376（375 aa）
突变：Y122F FE2 FE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；297 K；4M Sodium Formate
分辨率 2.70 Å R-free 0.281

共 62 个其他 PDB 条目、126 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RIR2_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–375； UniProt 2–376 作者链 B； PDB构建体 1–375； UniProt 2–376

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9sjw

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9sjw
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9sjw
沉积日期 deposition_date2025-09-01
最后修订 last_revision2026-04-22
结构标题 titleSerial electron diffraction (SerialED) structure of Y122F mutant Ribonucleotide reductase R2 from E. coli in its oxidised (met) form
关键词 keywords;serial electron diffraction, SerialED, microcrystal, metalloenzyme, iron, ribonucleotide reductase, electrostatic potential, OXIDOREDUCTASE ;; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier27.27 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron26.06 Å
零角强度 I(0) i099002200.00
分子量 molecular_weight79338.0 kDa
排除体积 excluded_volume99566 ų
包络体积 envelope_volume114660 ų
水化壳体积 shell_volume35766 ų
包络直径 envelope_diameter88.3 Å
壳层 Rg shell_rg34.59 Å
包络 Rg envelope_rg26.31 Å
形状 Rg shape_rg26.05 Å
总 Rg total_rg26.92 Å
总原子数 total_atoms11052
残基数 n_residues681
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax87.4 Å
Rg (实空间) rg_real27.18 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.48 Å
I(0) (实空间) i0_real9.9000e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.5380e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal27.21 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal99000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8967
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary31.6 Å
偏度 Skewness skewness0.267
峰度 Kurtosis kurtosis-0.416
角度范围 angular_range— – 0.2900 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha30310000.0000
实空间数据点数 n_real_points59
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.895; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.968
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)