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9tds

cryo-EM structure of dephosphorylated mTOR complex 2, overall refinement

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 274.3 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase mTOR

Homo sapiens

UniProt P42345

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–2549 链 B； UniProt 1–2549 未记录 Target of rapamycin complex subunit LST8 × 2 （Q9BVC4） Rapamycin-insensitive companion of mTOR × 2 （Q6R327） Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1 × 2 （Q9BPZ7） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9TDS Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1AUE FKBP-RAPAMYCIN BINDING DOMAIN (FRB) OF THE FKBP-RAPAMYCIN ASSOCIATED PROTEIN 提交 1997-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2015–2114（100 aa） 片段：FKBP-RAPAMYCIN BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；HANGING DROPS AT 4 C, pH 8.0, vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.339
1AUE FKBP-RAPAMYCIN BINDING DOMAIN (FRB) OF THE FKBP-RAPAMYCIN ASSOCIATED PROTEIN 提交 1997-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2015–2114（100 aa） 片段：FKBP-RAPAMYCIN BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；HANGING DROPS AT 4 C, pH 8.0, vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.339
1FAP THE STRUCTURE OF THE IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT FKBP12-RAPAMYCIN COMPLEX INTERACTING WITH HUMAN FRAP 提交 1996-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2018–2112（95 aa） 片段：FRB
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å R-free 0.299
1NSG THE STRUCTURE OF THE IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT FKBP12-RAPAMYCIN COMPLEX INTERACTING WITH HUMAN FRAP 提交 1997-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2019–2112（94 aa）
未记录 RAD C49-METHYL RAPAMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å R-free 0.265
2FAP THE STRUCTURE OF THE IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT FKBP12-(C16)-ETHOXY RAPAMYCIN COMPLEX INTERACTING WITH HUMA 提交 1998-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2019–2112（94 aa） 片段：FRB
未记录 RAD C49-METHYL RAPAMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.266
2GAQ NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE FRB DOMAIN OF mTOR 提交 2006-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2015–2114（100 aa） 片段：FRB DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；283 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM PBS 1 mM DTT；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM FRB U-15N | PBS 10% D2O 90% H2O
NMR样品组成 0.5 mM FRB U-15N | PBS 100%D2O
NMR样品组成 0.6 mM FRB U-15N, U-13C | PBS 10% D2O 90% H2O
分辨率未提供
2NPU The solution structure of the rapamycin-binding domain of mTOR (FRB) 提交 2006-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2015–2114（100 aa） 片段：FRB
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM；压力 ambient
NMR样品组成 0.1 mM FRB domain U-15N,13C; '25mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.1 mM FRB domain U-15N; 25mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.1 mM FRB domain U-15N,13C with unlabelled aromatics; 25mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2RSE NMR structure of FKBP12-mTOR FRB domain-rapamycin complex structure determined based on PCS 提交 2012-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2019–2112（94 aa） 片段：UNP RESIDUES 2019-2112
未记录 TB TERBIUM(III) ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR样品组成 0.3 mM FKBP12-1, 0.3 mM [U-98% 15N] FRB-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3FAP ATOMIC STRUCTURES OF THE RAPAMYCIN ANALOGS IN COMPLEX WITH BOTH HUMAN FKBP12 AND FRB DOMAIN OF FRAP 提交 1999-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2019–2112（94 aa） 片段：FRB
未记录 ARD C15-(R)-METHYLTHIENYL RAPAMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；20% PEG8000, 10% MPD, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, pH 8.00
分辨率 1.85 Å R-free 0.273
3JBZ Crystal structure of mTOR docked into EM map of dimeric ATM kinase 提交 2015-11-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1385–2549（1165 aa） 片段：C-terminal domain (UNP RESIDUES 1385-2020, 2119-2549)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 mM Tris pH 8.0, 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, 10% glycerol；pH 8；25 mM Tris, 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, 10% glycerol
分辨率 28.00 Å
4DRH Co-crystal structure of the PPIase domain of FKBP51, Rapamycin and the FRB fragment of mTOR at low pH 提交 2012-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2025–2114（90 aa） 片段：FRB domain, UNP RESIDUES 2025-2114
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 SO4 SULFATE ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 3.5；293 K；0.1M citric acid 2M (NH4)2SO4, pH 3.5, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
4DRH Co-crystal structure of the PPIase domain of FKBP51, Rapamycin and the FRB fragment of mTOR at low pH 提交 2012-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2025–2114（90 aa） 片段：FRB domain, UNP RESIDUES 2025-2114
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 SO4 SULFATE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 3.5；293 K；0.1M citric acid 2M (NH4)2SO4, pH 3.5, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
4DRI Co-crystal structure of the PPIase domain of FKBP51, Rapamycin and the FRB fragment of mTOR 提交 2012-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2025–2114（90 aa） 片段：FRB domain, UNP residues 2025-2114
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；25% PEG3350, 0.1 M NaCl, 0.1M HEPES-NaOH pH 7.5, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 1.45 Å R-free 0.206
4DRJ o-crystal structure of the PPIase domain of FKBP52, Rapamycin and the FRB fragment of mTOR 提交 2012-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2025–2114（90 aa） 片段：FRB domain, UNP residues 2025-2114
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；0.1M BisTris, 1.95M (NH4)2SO4, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4FAP ATOMIC STRUCTURES OF THE RAPAMYCIN ANALOGS IN COMPLEX WITH BOTH HUMAN FKBP12 AND FRB DOMAIN OF FRAP 提交 1999-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2019–2112（94 aa） 片段：FRB
未记录 ARD C15-(R)-METHYLTHIENYL RAPAMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；20% PEG8000, 10% MPD, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, pH 8.0
分辨率 2.80 Å R-free 0.266
4JSN structure of mTORdeltaN-mLST8 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：FAT FRB KINASE
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris, pH 8.5, 6-8% PEG 8000, 500 mM NaCl, 10 % (v/v) Glycerol, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.256
4JSN structure of mTORdeltaN-mLST8 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：FAT FRB KINASE
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris, pH 8.5, 6-8% PEG 8000, 500 mM NaCl, 10 % (v/v) Glycerol, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.256
4JSP structure of mTORDeltaN-mLST8-ATPgammaS-Mg complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.268
4JSP structure of mTORDeltaN-mLST8-ATPgammaS-Mg complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.268
4JSV mTOR kinase structure, mechanism and regulation. 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.251
4JSV mTOR kinase structure, mechanism and regulation. 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.251
4JSX structure of mTORDeltaN-mLST8-Torin2 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 17G 9-(6-aminopyridin-3-yl)-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.257
4JSX structure of mTORDeltaN-mLST8-Torin2 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 17G 9-(6-aminopyridin-3-yl)-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.257
4JT5 mTORdeltaN-mLST8-pp242 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1376–2549（1174 aa）
未记录 P2X 2-[4-amino-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]-1H-indol-5-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.45 Å R-free 0.271
4JT5 mTORdeltaN-mLST8-pp242 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1376–2549（1174 aa）
未记录 P2X 2-[4-amino-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]-1H-indol-5-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.45 Å R-free 0.271
4JT6 structure of mTORDeltaN-mLST8-PI-103 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.275
4JT6 structure of mTORDeltaN-mLST8-PI-103 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.275
5FLC Architecture of human mTOR Complex 1 - 5.9 Angstrom reconstruction 提交 2015-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 1382–2549（1168 aa） 片段：FAT AND PIKK DOMAINS
链 F 1382–2549（1168 aa） 片段：FAT AND PIKK DOMAINS
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 100 MM NACL, 10 MM NABICINE, 1 MM TCEP；pH 8；100 MM NACL, 10 MM NABICINE, 1 MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK I, METHOD- 4 SECOND BLOTTING,
分辨率 5.90 Å
5GPG Co-crystal structure of the FK506 binding domain of human FKBP25, Rapamycin and the FRB domain of human mTOR 提交 2016-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2021–2112（92 aa） 片段：UNP residues 2021-2112
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；30% polyethyleneglycol 8000, 100mM sodium cacodylate, 200mM sodium acetate, 10mM manganese chloride
分辨率 1.67 Å R-free 0.212
5H64 Cryo-EM structure of mTORC1 提交 2016-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 a 1–2549（2549 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2018–2114（97 aa） 片段：residues 2018-2114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2018–2114（97 aa） 片段：residues 2018-2114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 2018–2114（97 aa） 片段：residues 2018-2114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2018–2114（97 aa） 片段：residues 2018-2114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 2018–2114（97 aa） 片段：residues 2018-2114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBU Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(alpha-helix & beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：residues 1376-2549
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000
分辨率 3.42 Å R-free 0.266
5WBU Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(alpha-helix & beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：residues 1376-2549
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000
分辨率 3.42 Å R-free 0.266
5WBY Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：residues 1376-2549
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 3.10 Å R-free 0.276
5WBY Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：residues 1376-2549
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 3.10 Å R-free 0.276
5ZCS 4.9 Angstrom Cryo-EM structure of human mTOR complex 2 提交 2018-02-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
6BCU Cryo-EM structure of the activated RHEB-mTORC1 refined to 3.4 angstrom 提交 2017-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 579–2549（1971 aa）
链 B 579–2549（1971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6BCX mTORC1 structure refined to 3.0 angstroms 提交 2017-10-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 579–2549（1971 aa）
链 B 579–2549（1971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
6M4U Crystal structure of FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2021–2113（93 aa）
突变：T2098L RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 ZN ZINC ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM cacodylic acid buffer (pH 6.5), 350 mM zinc acetate and 8% (w/v) isopropanol
分辨率 2.20 Å R-free 0.258
6M4U Crystal structure of FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 2021–2113（93 aa）
突变：T2098L RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 ZN ZINC ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM cacodylic acid buffer (pH 6.5), 350 mM zinc acetate and 8% (w/v) isopropanol
分辨率 2.20 Å R-free 0.258
6M4W Crystal structure of MBP fused split FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 2021–2113（93 aa）
突变：T2098L RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0), 200 mM calcium acetate and 20% (w/v) PEG 3000
分辨率 3.11 Å R-free 0.278
6M4W Crystal structure of MBP fused split FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 2021–2113（93 aa）
突变：T2098L RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0), 200 mM calcium acetate and 20% (w/v) PEG 3000
分辨率 3.11 Å R-free 0.278
6M4W Crystal structure of MBP fused split FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 2021–2113（93 aa）
突变：T2098L RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0), 200 mM calcium acetate and 20% (w/v) PEG 3000
分辨率 3.11 Å R-free 0.278
6SB0 cryo-EM structure of mTORC1 bound to PRAS40-fused active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 60–355（296 aa）
链 A 381–2549（2169 aa）
链 B 60–355（296 aa）
链 B 381–2549（2169 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM HEPES pH 7.0, 100mM NaCl, 2mM MgCl2, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6SB2 cryo-EM structure of mTORC1 bound to active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 60–355（296 aa）
链 A 381–2549（2169 aa）
链 B 60–355（296 aa）
链 B 381–2549（2169 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；100mM Tris-HCl pH7.0, 260mM NaCl, 5mM MgCl2, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
6ZWM cryo-EM structure of human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2020-07-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6ZWO cryo-EM structure of human mTOR complex 2, focused on one half 提交 2020-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
7OWG human DEPTOR in a complex with mutant human mTORC1 A1459P 提交 2021-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：Octameric
链 B 1–16（16 aa）
链 B 31–36（6 aa）
链 B 54–355（302 aa）
链 B 379–2549（2171 aa）
突变：A1459P 突变：A1459P 突变：A1459P 突变：A1459P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES, pH 7.5, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, 1 mM MgCl2, 500 uM AMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time of 2 s and a force of -15.
分辨率 4.70 Å
7PE7 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2021-08-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
7PE8 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7PE9 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7PEA cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, overall refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–16（16 aa）
链 A 31–36（6 aa）
链 A 54–355（302 aa）
链 A 381–2549（2169 aa）
链 B 1–16（16 aa）
链 B 31–36（6 aa）
链 B 54–355（302 aa）
链 B 381–2549（2169 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7PEB cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–16（16 aa）
链 A 31–36（6 aa）
链 A 54–355（302 aa）
链 A 381–2549（2169 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.67 Å
7PEC cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–16（16 aa）
链 A 31–36（6 aa）
链 A 54–355（302 aa）
链 A 381–2549（2169 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.24 Å
7TZO The apo structure of human mTORC2 complex 提交 2022-02-16 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
7UXC cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion 提交 2022-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7UXH cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 C 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8ERA RMC-5552 in complex with mTORC1 and FKBP12 提交 2022-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 XZ9 1-[6-{[(3M)-4-amino-3-(2-amino-1,3-benzoxazol-5-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]methyl}-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-3-hydroxypropan-1-one × 1 XYU (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-5,9,27-trihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-10,21-dimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PPZ Co-crystal structure of FKBP12, compound 7 and the FRB fragment of mTOR 提交 2023-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2025–2114（90 aa）
未记录 0AN (1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-5-[(~{E})-2-(2-chlorophenyl)ethenyl]-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 CA CALCIUM ION × 4 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG8000, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M calcium actetate
分辨率 1.85 Å R-free 0.238
8RCH CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, overall refinement 提交 2023-12-06 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RCK CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, Focused on one protomer copy. 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8RCN CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, Focused region of mTOR and RAPTOR on one protomer copy. 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8XI9 Crystal structure of FRB-FKBP fusion protein in complex with rapamycin 提交 2023-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2023–2114（92 aa）
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；4.4M Sodium Acetate
分辨率 1.85 Å R-free 0.218
9DBO Crystal structure of a synthetic Fab (R3E9) in complex with the FRB domain of mTOR 提交 2024-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2021–2113（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.2 M Calcium chloride dihydrate 16% PEG 3350
分辨率 1.55 Å R-free 0.217
9DL0 Crystal structure of a synthetic Fab (R3H8) in complex with the FRB domain of mTOR 提交 2024-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 2021–2113（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5 4% PEG 400 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
9DL0 Crystal structure of a synthetic Fab (R3H8) in complex with the FRB domain of mTOR 提交 2024-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 2021–2113（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5 4% PEG 400 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 O 1–2549（2549 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9ED7 Active state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
9ED8 Intermediate state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.61 Å
9F44 cryo-EM structure of LST2 TOS peptide bound to human mTOR complex 1 提交 2024-04-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
9F45 cryo-EM structure of human LST2 bound to human mTOR complex 1 提交 2024-04-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
9NGT Crystal structure of CRBN-DDB1 and FPFT-2216 in complex with mTOR 提交 2025-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2018–2114（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1BC8 (3S)-3-[(4M)-4-(4-methoxythiophen-3-yl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl]piperidine-2,6-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；70 mM MES pH 6.0, 1.8-3.2 % (w/v) PEG 3,000, and 13-24 % (w/v) PEG 200
分辨率 2.95 Å R-free 0.260
9T7J cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-10 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9T92 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9T93 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9T94 cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9TDT cryo-EM structure of dephosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9TPW cryo-ET structure of mTOR complex 2 on a PIP2-containing membrane 提交 2025-12-18 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
9ZBJ Cryo-EM structure of human apo mTORC2 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 203–2549（2347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9ZBK mTORC2 in complex with Akt1 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 80–2549（2470 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1AID (1M,9M)-1-{4-[4-(prop-2-enoyl)piperazin-1-yl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-9-(quinolin-3-yl)benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å

共 66 个其他 PDB 条目、84 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MTOR_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 42–2590； UniProt 1–2549 作者链 B； PDB构建体 42–2590； UniProt 1–2549

Target of rapamycin complex subunit LST8

Homo sapiens

UniProt Q9BVC4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–326 链 D； UniProt 1–326 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 2 （P42345） Rapamycin-insensitive companion of mTOR × 2 （Q6R327） Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1 × 2 （Q9BPZ7） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9TDS Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4JSN structure of mTORdeltaN-mLST8 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris, pH 8.5, 6-8% PEG 8000, 500 mM NaCl, 10 % (v/v) Glycerol, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.256
4JSN structure of mTORdeltaN-mLST8 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris, pH 8.5, 6-8% PEG 8000, 500 mM NaCl, 10 % (v/v) Glycerol, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.256
4JSP structure of mTORDeltaN-mLST8-ATPgammaS-Mg complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.268
4JSP structure of mTORDeltaN-mLST8-ATPgammaS-Mg complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.268
4JSV mTOR kinase structure, mechanism and regulation. 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.251
4JSV mTOR kinase structure, mechanism and regulation. 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.251
4JSX structure of mTORDeltaN-mLST8-Torin2 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 17G 9-(6-aminopyridin-3-yl)-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.257
4JSX structure of mTORDeltaN-mLST8-Torin2 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 17G 9-(6-aminopyridin-3-yl)-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.257
4JT5 mTORdeltaN-mLST8-pp242 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–323（323 aa）
未记录 P2X 2-[4-amino-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]-1H-indol-5-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.45 Å R-free 0.271
4JT5 mTORdeltaN-mLST8-pp242 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–323（323 aa）
未记录 P2X 2-[4-amino-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]-1H-indol-5-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.45 Å R-free 0.271
4JT6 structure of mTORDeltaN-mLST8-PI-103 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.275
4JT6 structure of mTORDeltaN-mLST8-PI-103 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.275
5FLC Architecture of human mTOR Complex 1 - 5.9 Angstrom reconstruction 提交 2015-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–326（326 aa）
链 H 1–326（326 aa）
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 100 MM NACL, 10 MM NABICINE, 1 MM TCEP；pH 8；100 MM NACL, 10 MM NABICINE, 1 MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK I, METHOD- 4 SECOND BLOTTING,
分辨率 5.90 Å
5H64 Cryo-EM structure of mTORC1 提交 2016-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–326（326 aa）
链 c 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5WBU Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(alpha-helix & beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000
分辨率 3.42 Å R-free 0.266
5WBU Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(alpha-helix & beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000
分辨率 3.42 Å R-free 0.266
5WBY Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 3.10 Å R-free 0.276
5WBY Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 3.10 Å R-free 0.276
5ZCS 4.9 Angstrom Cryo-EM structure of human mTOR complex 2 提交 2018-02-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
6BCU Cryo-EM structure of the activated RHEB-mTORC1 refined to 3.4 angstrom 提交 2017-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 1–326（326 aa）
链 E 1–326（326 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6BCX mTORC1 structure refined to 3.0 angstroms 提交 2017-10-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–326（326 aa） 片段：mLST8
链 E 1–326（326 aa） 片段：mLST8
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
6SB0 cryo-EM structure of mTORC1 bound to PRAS40-fused active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–326（326 aa）
链 H 1–326（326 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM HEPES pH 7.0, 100mM NaCl, 2mM MgCl2, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6SB2 cryo-EM structure of mTORC1 bound to active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–326（326 aa）
链 H 1–326（326 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；100mM Tris-HCl pH7.0, 260mM NaCl, 5mM MgCl2, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
6ZWM cryo-EM structure of human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2020-07-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6ZWO cryo-EM structure of human mTOR complex 2, focused on one half 提交 2020-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
7OWG human DEPTOR in a complex with mutant human mTORC1 A1459P 提交 2021-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：Octameric
链 E 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES, pH 7.5, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, 1 mM MgCl2, 500 uM AMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time of 2 s and a force of -15.
分辨率 4.70 Å
7PE7 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2021-08-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
7PE8 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7PE9 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7PEA cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, overall refinement 提交 2021-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7PEB cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.67 Å
7PEC cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.24 Å
7TZO The apo structure of human mTORC2 complex 提交 2022-02-16 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
7UXC cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion 提交 2022-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7UXH cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 B 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8ERA RMC-5552 in complex with mTORC1 and FKBP12 提交 2022-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 XZ9 1-[6-{[(3M)-4-amino-3-(2-amino-1,3-benzoxazol-5-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]methyl}-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-3-hydroxypropan-1-one × 1 XYU (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-5,9,27-trihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-10,21-dimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8RCH CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, overall refinement 提交 2023-12-06 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–326（326 aa）
链 E 1–326（326 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RCK CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, Focused on one protomer copy. 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–326（326 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 B 1–326（326 aa）
链 M 1–326（326 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9ED6 CryoEM map of the mLST8-Rag-Ragultor subcomplex 提交 2024-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 I 1–326（326 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
9ED7 Active state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–326（326 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
9ED8 Intermediate state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–326（326 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.61 Å
9F44 cryo-EM structure of LST2 TOS peptide bound to human mTOR complex 1 提交 2024-04-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
9F45 cryo-EM structure of human LST2 bound to human mTOR complex 1 提交 2024-04-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
9T7J cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-10 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9T92 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9T93 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9T94 cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9TDT cryo-EM structure of dephosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9TPW cryo-ET structure of mTOR complex 2 on a PIP2-containing membrane 提交 2025-12-18 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
9ZBJ Cryo-EM structure of human apo mTORC2 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 7–323（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9ZBK mTORC2 in complex with Akt1 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 7–324（318 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1AID (1M,9M)-1-{4-[4-(prop-2-enoyl)piperazin-1-yl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-9-(quinolin-3-yl)benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å

共 44 个其他 PDB 条目、52 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LST8_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–326； UniProt 1–326 作者链 D； PDB构建体 1–326； UniProt 1–326

Rapamycin-insensitive companion of mTOR

Homo sapiens

UniProt Q6R327

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 1–1708 链 F； UniProt 1–1708 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 2 （P42345） Target of rapamycin complex subunit LST8 × 2 （Q9BVC4） Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1 × 2 （Q9BPZ7） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9TDS Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5ZCS 4.9 Angstrom Cryo-EM structure of human mTOR complex 2 提交 2018-02-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–1018（1018 aa）
链 F 1–1018（1018 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
6ZWM cryo-EM structure of human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2020-07-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–1708（1708 aa）
链 F 1–1708（1708 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6ZWO cryo-EM structure of human mTOR complex 2, focused on one half 提交 2020-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–1708（1708 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
7PE7 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2021-08-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–1708（1708 aa）
链 F 1–1708（1708 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
7PE8 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–1708（1708 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7PE9 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–1708（1708 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7TZO The apo structure of human mTORC2 complex 提交 2022-02-16 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–1708（1708 aa）
链 F 1–1708（1708 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9T7J cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-10 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–1708（1708 aa）
链 F 1–1708（1708 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9T92 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–1708（1708 aa）
链 F 1–1708（1708 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9T93 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–1708（1708 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9T94 cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–1708（1708 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9TDT cryo-EM structure of dephosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–1708（1708 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9TPW cryo-ET structure of mTOR complex 2 on a PIP2-containing membrane 提交 2025-12-18 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–1708（1708 aa）
链 F 1–1708（1708 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
9ZBJ Cryo-EM structure of human apo mTORC2 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 23–1694（1672 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9ZBK mTORC2 in complex with Akt1 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 25–1694（1670 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1AID (1M,9M)-1-{4-[4-(prop-2-enoyl)piperazin-1-yl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-9-(quinolin-3-yl)benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RICTR_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 27–1734； UniProt 1–1708 作者链 F； PDB构建体 27–1734； UniProt 1–1708

Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1

Homo sapiens

UniProt Q9BPZ7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 2–522 链 H； UniProt 2–522 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） Serine/threonine-protein kinase mTOR × 2 （P42345） Target of rapamycin complex subunit LST8 × 2 （Q9BVC4） Rapamycin-insensitive companion of mTOR × 2 （Q6R327） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9TDS Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3VOQ Crystal structure of the pleckstrin homology domain of human Sin1, a TORC2 subunit 提交 2012-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 372–493（122 aa） 片段：C-terminal PH domain, UNP residues 372-493
链 B 372–493（122 aa） 片段：C-terminal PH domain, UNP residues 372-493
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris, 1.26M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.224
5ZCS 4.9 Angstrom Cryo-EM structure of human mTOR complex 2 提交 2018-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 141–522（382 aa）
链 H 141–522（382 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
6ZWM cryo-EM structure of human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2020-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–522（522 aa）
链 H 1–522（522 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6ZWO cryo-EM structure of human mTOR complex 2, focused on one half 提交 2020-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 2–522（521 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
7LC1 Crystal Structure of KRAS4b (GMPPNP-bound) in complex with the RBD-PH domains of SIN1 提交 2021-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 275–510（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；200 mM ammonium sulfate, 100 mM HEPES (N-2-hydroxyethyl piperazine-N-ethane sulfonic acid) pH 7.5, 25% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.279
7LC1 Crystal Structure of KRAS4b (GMPPNP-bound) in complex with the RBD-PH domains of SIN1 提交 2021-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 275–510（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；200 mM ammonium sulfate, 100 mM HEPES (N-2-hydroxyethyl piperazine-N-ethane sulfonic acid) pH 7.5, 25% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.279
7LC2 Crystal Structure of KRAS4b-Q61R (GMPPNP-bound) in complex with the RAS-binding domain (RBD) of SIN1 提交 2021-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 275–361（87 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；100mM MMT buffer (DL-malic acid, MES and Tris base in 1:2:2 ratio) pH 5, 25% PEG (polyethylene glycol) 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.287
7LC2 Crystal Structure of KRAS4b-Q61R (GMPPNP-bound) in complex with the RAS-binding domain (RBD) of SIN1 提交 2021-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 275–361（87 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；100mM MMT buffer (DL-malic acid, MES and Tris base in 1:2:2 ratio) pH 5, 25% PEG (polyethylene glycol) 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.287
7PE7 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 G 1–522（522 aa）
链 H 1–522（522 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
7PE8 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 1–522（522 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7PE9 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 1–522（522 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7TZO The apo structure of human mTORC2 complex 提交 2022-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–522（522 aa）
链 H 1–522（522 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
7VV8 Crystal Structure of HRasQ61L(GMPPNP-bound) in complex with the Ras-binding domain(RBD) of SIN1 提交 2021-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 274–360（87 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG20000, 0.1M Sodim citrate. pH 5.0
分辨率 1.70 Å R-free 0.199
7VV9 Crystal Structure of HRas(GMPPNP-bound) in complex with the Ras-binding domain(RBD) of SIN1 提交 2021-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 275–360（86 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；278 K；PEG 20000, Sodium citrate
分辨率 1.60 Å R-free 0.200
7VVB Crystal Structure of KRas4A(GMPPNP-bound) in complex with the Ras-binding domain(RBD) of SIN1 提交 2021-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–522（522 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；278 K；PEG 5000 MME
分辨率 1.70 Å R-free 0.197
7VVG Crystal Structure of HRasG12V(GMPPNP-bound) in complex with the Ras-binding domain(RBD) of SIN1 提交 2021-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 274–360（87 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；278 K；PEG2000
分辨率 1.70 Å R-free 0.202
9T7J cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-10 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 2–522（521 aa）
链 H 2–522（521 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9T92 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 2–522（521 aa）
链 H 2–522（521 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9T93 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 2–522（521 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9T94 cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 2–522（521 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9TDT cryo-EM structure of dephosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 2–522（521 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9TPW cryo-ET structure of mTOR complex 2 on a PIP2-containing membrane 提交 2025-12-18 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 2–522（521 aa）
链 H 2–522（521 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
9ZBJ Cryo-EM structure of human apo mTORC2 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–148（148 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9ZBK mTORC2 in complex with Akt1 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–268（268 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1AID (1M,9M)-1-{4-[4-(prop-2-enoyl)piperazin-1-yl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-9-(quinolin-3-yl)benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å

共 22 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SIN1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 2–522； UniProt 2–522 作者链 H； PDB构建体 2–522； UniProt 2–522

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9tds

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9tds
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9tds
沉积日期 deposition_date2025-11-24
结构标题 titlecryo-EM structure of dephosphorylated mTOR complex 2, overall refinement
关键词 keywordsKinase, Complex, Signaling protein, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier74.20 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron73.85 Å
零角强度 I(0) i07717910000.00
分子量 molecular_weight752350.0 kDa
排除体积 excluded_volume945430 ų
包络体积 envelope_volume1549100 ų
水化壳体积 shell_volume175960 ų
包络直径 envelope_diameter245.4 Å
壳层 Rg shell_rg74.15 Å
包络 Rg envelope_rg70.74 Å
形状 Rg shape_rg73.85 Å
总 Rg total_rg73.86 Å
总原子数 total_atoms52832
残基数 n_residues6562
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax274.3 Å
Rg (实空间) rg_real78.09 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.78 Å
I(0) (实空间) i0_real7.7710e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.6270e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal74.51 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal7724000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8942
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary91.4 Å
偏度 Skewness skewness0.532
峰度 Kurtosis kurtosis0.233
角度范围 angular_range— – 0.1050 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.8738
最高正则化参数 α highest_alpha377600000.0000
实空间数据点数 n_real_points22
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.776; Stabil: 0.868; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.975; Smooth: 0.817
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)