9uzp

Cryo-EM Structure of the Vaccinia Virus Entry/Fusion Complex (EFC) Including the F9 Subunit

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Virion membrane protein OPG143

Orthopoxvirus vaccinia

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Entry-fusion complex protein OPG094 × 1 （P07611） Envelope protein OPG155 × 2 （P68633） Protein OPG107 × 2 （P08583） Entry-fusion complex protein OPG086 × 2 （P68458） Entry-fusion complex protein OPG094 × 2 （P68623） Entry-fusion complex associated protein OPG083 × 1 （P24361） Protein OPG104 × 1 （P07618） Virion membrane protein OPG147 × 2 （P68712） Entry-fusion complex protein OPG076 × 2 （P0CK21）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PG143_VACCW
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377

Entry-fusion complex protein OPG094

Orthopoxvirus vaccinia

UniProt P07611

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Virion membrane protein OPG143 × 1 （P16710） Envelope protein OPG155 × 2 （P68633） Protein OPG107 × 2 （P08583） Entry-fusion complex protein OPG086 × 2 （P68458） Entry-fusion complex protein OPG094 × 2 （P68623） Entry-fusion complex associated protein OPG083 × 1 （P24361） Protein OPG104 × 1 （P07618） Virion membrane protein OPG147 × 2 （P68712） Entry-fusion complex protein OPG076 × 2 （P0CK21）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PG094_VACCW
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–340； UniProt 1–340

Envelope protein OPG155

Orthopoxvirus vaccinia

UniProt P68633

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Virion membrane protein OPG143 × 1 （P16710） Entry-fusion complex protein OPG094 × 1 （P07611） Protein OPG107 × 2 （P08583） Entry-fusion complex protein OPG086 × 2 （P68458） Entry-fusion complex protein OPG094 × 2 （P68623） Entry-fusion complex associated protein OPG083 × 1 （P24361） Protein OPG104 × 1 （P07618） Virion membrane protein OPG147 × 2 （P68712） Entry-fusion complex protein OPG076 × 2 （P0CK21）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PG155_VACCW
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–146； UniProt 1–146 作者链 c； PDB构建体 1–146； UniProt 1–146

Protein OPG107

Orthopoxvirus vaccinia

UniProt P08583

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Virion membrane protein OPG143 × 1 （P16710） Entry-fusion complex protein OPG094 × 1 （P07611） Envelope protein OPG155 × 2 （P68633） Entry-fusion complex protein OPG086 × 2 （P68458） Entry-fusion complex protein OPG094 × 2 （P68623） Entry-fusion complex associated protein OPG083 × 1 （P24361） Protein OPG104 × 1 （P07618） Virion membrane protein OPG147 × 2 （P68712） Entry-fusion complex protein OPG076 × 2 （P0CK21）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PG107_VACCW
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 d； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189

Entry-fusion complex protein OPG086

Orthopoxvirus vaccinia

UniProt P68458

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Virion membrane protein OPG143 × 1 （P16710） Entry-fusion complex protein OPG094 × 1 （P07611） Envelope protein OPG155 × 2 （P68633） Protein OPG107 × 2 （P08583） Entry-fusion complex protein OPG094 × 2 （P68623） Entry-fusion complex associated protein OPG083 × 1 （P24361） Protein OPG104 × 1 （P07618） Virion membrane protein OPG147 × 2 （P68712） Entry-fusion complex protein OPG076 × 2 （P0CK21）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PG086_VACCW
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 e； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111

Entry-fusion complex protein OPG094

Orthopoxvirus vaccinia

UniProt P68623

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Virion membrane protein OPG143 × 1 （P16710） Entry-fusion complex protein OPG094 × 1 （P07611） Envelope protein OPG155 × 2 （P68633） Protein OPG107 × 2 （P08583） Entry-fusion complex protein OPG086 × 2 （P68458） Entry-fusion complex associated protein OPG083 × 1 （P24361） Protein OPG104 × 1 （P07618） Virion membrane protein OPG147 × 2 （P68712） Entry-fusion complex protein OPG076 × 2 （P0CK21）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PG099_VACCW
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128 作者链 f； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128

Entry-fusion complex associated protein OPG083

Orthopoxvirus vaccinia

UniProt P24361

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Virion membrane protein OPG143 × 1 （P16710） Entry-fusion complex protein OPG094 × 1 （P07611） Envelope protein OPG155 × 2 （P68633） Protein OPG107 × 2 （P08583） Entry-fusion complex protein OPG086 × 2 （P68458） Entry-fusion complex protein OPG094 × 2 （P68623） Protein OPG104 × 1 （P07618） Virion membrane protein OPG147 × 2 （P68712） Entry-fusion complex protein OPG076 × 2 （P0CK21）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PG053_VACCW
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–212； UniProt 1–212

Protein OPG104

Orthopoxvirus vaccinia

UniProt P07618

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Virion membrane protein OPG143 × 1 （P16710） Entry-fusion complex protein OPG094 × 1 （P07611） Envelope protein OPG155 × 2 （P68633） Protein OPG107 × 2 （P08583） Entry-fusion complex protein OPG086 × 2 （P68458） Entry-fusion complex protein OPG094 × 2 （P68623） Entry-fusion complex associated protein OPG083 × 1 （P24361） Virion membrane protein OPG147 × 2 （P68712） Entry-fusion complex protein OPG076 × 2 （P0CK21）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PG104_VACCW
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–133； UniProt 1–133

Virion membrane protein OPG147

Orthopoxvirus vaccinia

UniProt P68712

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Virion membrane protein OPG143 × 1 （P16710） Entry-fusion complex protein OPG094 × 1 （P07611） Envelope protein OPG155 × 2 （P68633） Protein OPG107 × 2 （P08583） Entry-fusion complex protein OPG086 × 2 （P68458） Entry-fusion complex protein OPG094 × 2 （P68623） Entry-fusion complex associated protein OPG083 × 1 （P24361） Protein OPG104 × 1 （P07618） Entry-fusion complex protein OPG076 × 2 （P0CK21）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PG147_VACCW
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117 作者链 j； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

Entry-fusion complex protein OPG076

Orthopoxvirus vaccinia

UniProt P0CK21

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Virion membrane protein OPG143 × 1 （P16710） Entry-fusion complex protein OPG094 × 1 （P07611） Envelope protein OPG155 × 2 （P68633） Protein OPG107 × 2 （P08583） Entry-fusion complex protein OPG086 × 2 （P68458） Entry-fusion complex protein OPG094 × 2 （P68623） Entry-fusion complex associated protein OPG083 × 1 （P24361） Protein OPG104 × 1 （P07618） Virion membrane protein OPG147 × 2 （P68712）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PG076_VACCW
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–35； UniProt 1–35 作者链 k； PDB构建体 1–35； UniProt 1–35

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9uzp
沉积日期 deposition_date	2025-05-16
结构标题 title	Cryo-EM Structure of the Vaccinia Virus Entry/Fusion Complex (EFC) Including the F9 Subunit
关键词 keywords	Vaccinia Virus, Entry-Fusion Complex (EFC), cryo-EM, Single-particle reconstruction, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9uzp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9uzp__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9uzp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	50.24 Å
Rg（电子密度）	51.06 Å
总 Rg	51.06 Å
原子数	19067
残基数	2365
排除体积	342350 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9uzp__assembly_1__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Virion membrane protein OPG143
分子量 formula_weight	43486.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	19067

MGAAVTLNRIKIAPGIADIRDKYMELGFNYPEYNRAVKFAEESYTYYYETSPGEIKPKFCLIDGMSIDHCSSFIVPEFAKQYVLIHGEPCSSFKFRPGSLIYYQNEVTPEYIKDLKHATDYIASGQRCHFIKKDYLLGDSDSVAKCCSKTNTKHCPKIFNNNYKTEHCDDFMTGFCRNDPGNPNCLEWLRAKRKPAMSTYSDICSKHMDARYCSEFIRIIRPDYFTFGDTALYVFCNDHKGNRNCWCANYPKSNSGDKYLGPRVCWLHECTDESRDRKWLYYNQDVQRTRCKYVGCTINVNSLALKNSQAELTSNCTRTTSAVGDVHPGEPVVKDKIKLPTWLGAAITLVVISVIFYFISIYSRPKIKTNDINVRRR

来源 Source

来源生物 organism	Orthopoxvirus vaccinia
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10245
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Entry-fusion complex protein OPG094
分子量 formula_weight	38840.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MGGGVSVELPKRDPPPGVPTDEMLLNVDKMHDVIAPAKLLEYVHIGPLAKDKEDKVKKRYPEFRLVNTGPGGLSALLRQSYNGTAPNCCRTFNRTHYWKKDGKISDKYEEGAVLESCWPDVHDTGKCDVDLFDWCQGDTFDRNICHQWIGSAFNRSNRTVEGQQSLINLYNKMQTLCSKDASVPICESFLHHLRAHNTEDSKEMIDYILRQQSADFKQKYMRCSYPTRDKLEESLKYAEPRECWDPECSNANVNFLLTRNYNNLGLCNIVRCNTSVNNLQMDKTSSLRLSCGLSNSDRFSTVPVNRAKVVQHNIKHSFDLKLHLISLLSLLVIWILIVAI

来源 Source

来源生物 organism	Orthopoxvirus vaccinia
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10245
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Envelope protein OPG155
分子量 formula_weight	16340.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,c

MNSLSIFFIVVATAAVCLLFIQGYSIYENYGNIKEFNATHAAFEYSKSIGGTPALDRRVQDVNDTISDVKQKWRCVVYPGNGFVSASIFGFQAEVGPNNTRSIRKFNTMQQCIDFTFSDVININIYNPCVVPNINNAECQFLKSVL

来源 Source

来源生物 organism	Orthopoxvirus vaccinia
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10245
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Protein OPG107
分子量 formula_weight	21568.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,d

MDKTTLSVNACNLEYVREKAIVGVQAAKTSTLIFFVIILAISALLLWFQTSDNPVFNELTRYMRIKNTVNDWKSLTDSKTKLESDRGRLLAAGKDDIFEFKCVDFGAYFIAMRLDKKTYLPQAIRRGTGDAWMVKKAAKVDPSAQQFCQYLIKHKSNNVITCGNEMLNELGYSGYFMSPHWCSDFSNME

来源 Source

来源生物 organism	Orthopoxvirus vaccinia
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10245
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Entry-fusion complex protein OPG086
分子量 formula_weight	12814.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,e

MASLLYLILFLLFVCISYYFTYYPTNKLQAAVMETDRENAIIRQRNDEIPTRTLDTAIFTDASTVASAQIHLYYNSNIGKIIMSLNGKKHTFNLYDDNDIRTLLPILLLSK

来源 Source

来源生物 organism	Orthopoxvirus vaccinia
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10245
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Entry-fusion complex protein OPG094
分子量 formula_weight	15062.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,f

MENVPNVYFNPVFIEPTFKHSLLSVYKHRLIVLFEVFVVFILIYVFFRSELNMFFMPKRKIPDPIDRLRRANLACEDDKLMIYGLPWMTTQTSALSINSKPIVYKDCAKLLRSINGSQPVSLNDVLRR

来源 Source

来源生物 organism	Orthopoxvirus vaccinia
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10245
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Entry-fusion complex associated protein OPG083
分子量 formula_weight	23900.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MAETKEFKTLYNLFIDSYLQKLAQHSIPTNVTCAIHIGEVIGQFKNCALRITNKCMSNSRLSFTLMVESFIEVISLLPEKDRRRIAEEIGIDLDDVPSAVSKLEKNCNAYAEVNNIIDIQKLDIGECSAPPGQHMLLQIVNTGSAEANCGLQTIVKSLNKIYVPPIIENRLPYYDPWFLVGVAIILVIFTVAICSIRRNLALKYRYGTFLYV

来源 Source

来源生物 organism	Orthopoxvirus vaccinia
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10245
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Protein OPG104
分子量 formula_weight	15174.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MTDEQIYAFCDANKDDIRCKCIYPDKSIVRIGIDTRLPYYCWYEPCKRSDALLPASLKKNITKCNVSDCTISLGNVSITDSKLDVNNVCDSKRVATENIAVRYLNQEIRYPIIDIKWLPIGLLALAILILAFF

来源 Source

来源生物 organism	Orthopoxvirus vaccinia
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10245
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Virion membrane protein OPG147
分子量 formula_weight	13661.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,j

MITLFLILCYFILIFNIIVPAISEKMRRERAAYVNYKRLNKNFICVDDRLFSYNFTTSGIKAKVAVDNKNVPIPCSKINEVNNNKDVDTLYCDKDRDDIPGFARSCYRAYSDLFFTT

来源 Source

来源生物 organism	Orthopoxvirus vaccinia
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10245
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Entry-fusion complex protein OPG076
分子量 formula_weight	4230.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,k

MLVVIMFFIAFAFCSWLSYSYLRPYISTKELNKSR

来源 Source

来源生物 organism	Orthopoxvirus vaccinia
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10245
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

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分辨率 resolution	3.05 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	474787

Cryo-EM Structure of the Vaccinia Virus Entry/Fusion Complex (EFC) Including the F9 Subunit

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Virion membrane protein OPG143

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Entry-fusion complex protein OPG094

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Envelope protein OPG155

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein OPG107

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Entry-fusion complex protein OPG086

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Entry-fusion complex protein OPG094

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Entry-fusion complex associated protein OPG083

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein OPG104

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Virion membrane protein OPG147

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Entry-fusion complex protein OPG076

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体