9ya3

Cryo-EM structure of the apical region of subpellicular microtubule (SPMT) from Toxoplasma gondii (8-nm repeat)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 338.1 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Microtubule associated protein SPM1

物种未注明

UniProt A0A7J6K285

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 108 PDB 声明:108-meric(108) 与蛋白拷贝数一致 链 0; UniProt 1–351 链 1; UniProt 1–351 链 10; UniProt 1–351 链 11; UniProt 1–351 链 12; UniProt 1–351 链 13; UniProt 1–351 链 14; UniProt 1–351 链 15; UniProt 1–351 链 16; UniProt 1–351 链 17; UniProt 1–351 链 18; UniProt 1–351 链 19; UniProt 1–351 链 2; UniProt 1–351 链 22; UniProt 1–351 链 23; UniProt 1–351 链 3; UniProt 1–351 链 4; UniProt 1–351 链 5; UniProt 1–351 链 6; UniProt 1–351 链 7; UniProt 1–351 链 8; UniProt 1–351 链 9; UniProt 1–351 未记录 TLAP3 (apical cap protein AC5), TGME49_235380 × 3 (A0A151H4L4) Tubulin alpha chain × 26 (P10873) Tubulin beta chain × 26 (I7BFC9) TLAP4 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_201760 × 3 (A0A7J6K913) TLAP2 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_232130 × 4 (A0A125YLA3) TRXL1, TGME49_232410 × 22 (Q8MPF4) TRXL2, TGME49_225790 × 2 (A0A7J6K232) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26 MG MAGNESIUM ION × 26 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A7J6K285_TOXGO
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 0; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 1; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 10; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 11; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 12; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 13; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 14; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 15; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 16; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 17; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 18; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 19; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 2; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 22; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 23; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 3; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 4; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 5; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 6; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 7; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 8; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 9; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351

TLAP3 (apical cap protein AC5), TGME49_235380

物种未注明

UniProt A0A151H4L4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 108 PDB 声明:108-meric(108) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–583 链 B; UniProt 1–583 链 C; UniProt 1–583 未记录 Microtubule associated protein SPM1 × 22 (A0A7J6K285) Tubulin alpha chain × 26 (P10873) Tubulin beta chain × 26 (I7BFC9) TLAP4 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_201760 × 3 (A0A7J6K913) TLAP2 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_232130 × 4 (A0A125YLA3) TRXL1, TGME49_232410 × 22 (Q8MPF4) TRXL2, TGME49_225790 × 2 (A0A7J6K232) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26 MG MAGNESIUM ION × 26 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A151H4L4_TOXGO
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–583; UniProt 1–583 作者链 B; PDB构建体 1–583; UniProt 1–583 作者链 C; PDB构建体 1–583; UniProt 1–583

Tubulin alpha chain

物种未注明

UniProt P10873

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 108 PDB 声明:108-meric(108) 与蛋白拷贝数一致 链 A0; UniProt 1–453 链 A2; UniProt 1–453 链 A4; UniProt 1–453 链 A6; UniProt 1–453 链 A8; UniProt 1–453 链 B0; UniProt 1–453 链 B2; UniProt 1–453 链 B4; UniProt 1–453 链 B6; UniProt 1–453 链 B8; UniProt 1–453 链 C0; UniProt 1–453 链 C2; UniProt 1–453 链 C4; UniProt 1–453 链 C6; UniProt 1–453 链 C8; UniProt 1–453 链 D0; UniProt 1–453 链 D2; UniProt 1–453 链 D4; UniProt 1–453 链 D6; UniProt 1–453 链 D8; UniProt 1–453 链 E0; UniProt 1–453 链 E2; UniProt 1–453 链 E4; UniProt 1–453 链 E6; UniProt 1–453 链 E8; UniProt 1–453 链 F0; UniProt 1–453 未记录 Microtubule associated protein SPM1 × 22 (A0A7J6K285) TLAP3 (apical cap protein AC5), TGME49_235380 × 3 (A0A151H4L4) Tubulin beta chain × 26 (I7BFC9) TLAP4 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_201760 × 3 (A0A7J6K913) TLAP2 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_232130 × 4 (A0A125YLA3) TRXL1, TGME49_232410 × 22 (Q8MPF4) TRXL2, TGME49_225790 × 2 (A0A7J6K232) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26 MG MAGNESIUM ION × 26 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TBA_TOXGO
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A0; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 A2; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 A4; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 A6; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 A8; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 B0; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 B2; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 B4; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 B6; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 B8; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 C0; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 C2; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 C4; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 C6; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 C8; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 D0; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 D2; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 D4; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 D6; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 D8; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 E0; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 E2; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 E4; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 E6; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 E8; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453 作者链 F0; PDB构建体 1–453; UniProt 1–453

Tubulin beta chain

物种未注明

UniProt I7BFC9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 108 PDB 声明:108-meric(108) 与蛋白拷贝数一致 链 A1; UniProt 1–449 链 A3; UniProt 1–449 链 A5; UniProt 1–449 链 A7; UniProt 1–449 链 A9; UniProt 1–449 链 B1; UniProt 1–449 链 B3; UniProt 1–449 链 B5; UniProt 1–449 链 B7; UniProt 1–449 链 B9; UniProt 1–449 链 C1; UniProt 1–449 链 C3; UniProt 1–449 链 C5; UniProt 1–449 链 C7; UniProt 1–449 链 C9; UniProt 1–449 链 D1; UniProt 1–449 链 D3; UniProt 1–449 链 D5; UniProt 1–449 链 D7; UniProt 1–449 链 D9; UniProt 1–449 链 E1; UniProt 1–449 链 E3; UniProt 1–449 链 E5; UniProt 1–449 链 E7; UniProt 1–449 链 E9; UniProt 1–449 链 F1; UniProt 1–449 未记录 Microtubule associated protein SPM1 × 22 (A0A7J6K285) TLAP3 (apical cap protein AC5), TGME49_235380 × 3 (A0A151H4L4) Tubulin alpha chain × 26 (P10873) TLAP4 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_201760 × 3 (A0A7J6K913) TLAP2 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_232130 × 4 (A0A125YLA3) TRXL1, TGME49_232410 × 22 (Q8MPF4) TRXL2, TGME49_225790 × 2 (A0A7J6K232) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26 MG MAGNESIUM ION × 26 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I7BFC9_TOXGO
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 A1; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 A3; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 A5; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 A7; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 A9; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 B1; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 B3; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 B5; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 B7; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 B9; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 C1; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 C3; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 C5; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 C7; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 C9; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 D1; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 D3; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 D5; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 D7; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 D9; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 E1; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 E3; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 E5; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 E7; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 E9; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449 作者链 F1; PDB构建体 1–449; UniProt 1–449

TLAP4 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_201760

物种未注明

UniProt A0A7J6K913

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 108 PDB 声明:108-meric(108) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 1–336 链 F; UniProt 1–336 链 G; UniProt 1–336 未记录 Microtubule associated protein SPM1 × 22 (A0A7J6K285) TLAP3 (apical cap protein AC5), TGME49_235380 × 3 (A0A151H4L4) Tubulin alpha chain × 26 (P10873) Tubulin beta chain × 26 (I7BFC9) TLAP2 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_232130 × 4 (A0A125YLA3) TRXL1, TGME49_232410 × 22 (Q8MPF4) TRXL2, TGME49_225790 × 2 (A0A7J6K232) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26 MG MAGNESIUM ION × 26 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A7J6K913_TOXGO
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–336; UniProt 1–336 作者链 F; PDB构建体 1–336; UniProt 1–336 作者链 G; PDB构建体 1–336; UniProt 1–336

TLAP2 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_232130

物种未注明

UniProt A0A125YLA3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 108 PDB 声明:108-meric(108) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 1–446 链 I; UniProt 1–446 链 J; UniProt 1–446 链 K; UniProt 1–446 未记录 Microtubule associated protein SPM1 × 22 (A0A7J6K285) TLAP3 (apical cap protein AC5), TGME49_235380 × 3 (A0A151H4L4) Tubulin alpha chain × 26 (P10873) Tubulin beta chain × 26 (I7BFC9) TLAP4 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_201760 × 3 (A0A7J6K913) TRXL1, TGME49_232410 × 22 (Q8MPF4) TRXL2, TGME49_225790 × 2 (A0A7J6K232) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26 MG MAGNESIUM ION × 26 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A125YLA3_TOXGM
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–446; UniProt 1–446 作者链 I; PDB构建体 1–446; UniProt 1–446 作者链 J; PDB构建体 1–446; UniProt 1–446 作者链 K; PDB构建体 1–446; UniProt 1–446

TRXL1, TGME49_232410

物种未注明

UniProt Q8MPF4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 108 PDB 声明:108-meric(108) 与蛋白拷贝数一致 链 a; UniProt 1–220 链 b; UniProt 1–220 链 c; UniProt 1–220 链 d; UniProt 1–220 链 e; UniProt 1–220 链 f; UniProt 1–220 链 g; UniProt 1–220 链 h; UniProt 1–220 链 i; UniProt 1–220 链 j; UniProt 1–220 链 m; UniProt 1–220 链 n; UniProt 1–220 链 o; UniProt 1–220 链 p; UniProt 1–220 链 q; UniProt 1–220 链 r; UniProt 1–220 链 s; UniProt 1–220 链 t; UniProt 1–220 链 u; UniProt 1–220 链 v; UniProt 1–220 链 w; UniProt 1–220 链 x; UniProt 1–220 未记录 Microtubule associated protein SPM1 × 22 (A0A7J6K285) TLAP3 (apical cap protein AC5), TGME49_235380 × 3 (A0A151H4L4) Tubulin alpha chain × 26 (P10873) Tubulin beta chain × 26 (I7BFC9) TLAP4 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_201760 × 3 (A0A7J6K913) TLAP2 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_232130 × 4 (A0A125YLA3) TRXL2, TGME49_225790 × 2 (A0A7J6K232) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26 MG MAGNESIUM ION × 26 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8MPF4_TOXGO
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 b; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 c; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 d; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 e; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 f; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 g; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 h; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 i; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 j; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 m; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 n; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 o; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 p; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 q; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 r; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 s; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 t; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 u; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 v; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 w; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 x; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220

TRXL2, TGME49_225790

物种未注明

UniProt A0A7J6K232

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 108 PDB 声明:108-meric(108) 与蛋白拷贝数一致 链 k; UniProt 1–166 链 l; UniProt 1–166 未记录 Microtubule associated protein SPM1 × 22 (A0A7J6K285) TLAP3 (apical cap protein AC5), TGME49_235380 × 3 (A0A151H4L4) Tubulin alpha chain × 26 (P10873) Tubulin beta chain × 26 (I7BFC9) TLAP4 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_201760 × 3 (A0A7J6K913) TLAP2 (thioredoxin-like associated protein), TGME49_232130 × 4 (A0A125YLA3) TRXL1, TGME49_232410 × 22 (Q8MPF4) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26 MG MAGNESIUM ION × 26 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A7J6K232_TOXGO
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 k; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 l; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9ya3

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9ya3
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9ya3
沉积日期 deposition_date2025-09-15
结构标题 titleCryo-EM structure of the apical region of subpellicular microtubule (SPMT) from Toxoplasma gondii (8-nm repeat)
关键词 keywords;Tubulin, Microtubule, Microtubule Inner Protein, Microtubule-associated Protein, Toxoplasma gondii, conoid, conoid fiber, subpellicular microtubule, SPMT, STRUCTURAL PROTEIN ;; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron120.50
零角强度 I(0) i0149597000000.00
分子量 molecular_weight3251100.0 kDa
排除体积 excluded_volume4037400 ų
包络体积 envelope_volume7064500 ų
水化壳体积 shell_volume470050 ų
包络直径 envelope_diameter372.6
壳层 Rg shell_rg136.40
包络 Rg envelope_rg110.40
形状 Rg shape_rg120.50
总 Rg total_rg120.60
总原子数 total_atoms228257
残基数 n_residues28883
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax338.1
Rg (实空间) rg_real121.20
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.15
I(0) (实空间) i0_real1.4590e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.3570e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal127.20
I(0) (倒空间) i0_reciprocal152600000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8932
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary182.0
偏度 Skewness skewness-0.135
峰度 Kurtosis kurtosis-0.721
角度范围 angular_range— – 0.0650 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.7570
最高正则化参数 α highest_alpha3476000000.0000
实空间数据点数 n_real_points14
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.951; Stabil: 0.930; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.977; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)