9yfg

Flagellar outer membrane complex in Vibrio cholerae at disassembled, closed state

Method: ELECTRON MICROSCOPY
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar L-ring protein

Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961

UniProt Q9KQ13

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 298 Flagellar P-ring protein × 26 (Q9KQ14) Flagellar protein FlgT × 26 (Q9KPZ9) Sodium-type flagellar protein MotY × 26 (Q9KT95) Sodium-type flagellar protein MotX × 26 (Q9KNX9) FlgP × 52 Lipoprotein × 58 (Q9KQ01) FlgO domain-containing protein × 58 (Q9KQ00) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLGH_VIBCH
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 Aa; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ab; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ac; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ad; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ae; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Af; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ag; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ah; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ai; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Aj; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ak; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Al; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Am; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 An; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ao; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ap; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Aq; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ar; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 As; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 At; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Au; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Av; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Aw; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ax; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ay; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Az; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258

Flagellar P-ring protein

Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961

UniProt Q9KQ14

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 298 Flagellar L-ring protein × 26 (Q9KQ13) Flagellar protein FlgT × 26 (Q9KPZ9) Sodium-type flagellar protein MotY × 26 (Q9KT95) Sodium-type flagellar protein MotX × 26 (Q9KNX9) FlgP × 52 Lipoprotein × 58 (Q9KQ01) FlgO domain-containing protein × 58 (Q9KQ00) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLGI_VIBCH
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 Ba; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bb; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bc; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bd; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Be; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bf; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bg; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bh; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bi; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bj; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bk; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bl; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bm; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bn; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bo; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bp; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bq; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Br; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bs; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bt; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bu; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bv; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bw; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bx; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 By; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bz; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361

Flagellar protein FlgT

Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961

UniProt Q9KPZ9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 298 Flagellar L-ring protein × 26 (Q9KQ13) Flagellar P-ring protein × 26 (Q9KQ14) Sodium-type flagellar protein MotY × 26 (Q9KT95) Sodium-type flagellar protein MotX × 26 (Q9KNX9) FlgP × 52 Lipoprotein × 58 (Q9KQ01) FlgO domain-containing protein × 58 (Q9KQ00) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9KPZ9_VIBCH
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 Ca; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cb; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cc; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cd; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Ce; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cf; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cg; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Ch; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Ci; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cj; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Ck; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cl; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cm; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cn; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Co; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cp; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cq; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cr; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cs; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Ct; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cu; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cv; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cw; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cx; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cy; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cz; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377

Sodium-type flagellar protein MotY

Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961

UniProt Q9KT95

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 298 Flagellar L-ring protein × 26 (Q9KQ13) Flagellar P-ring protein × 26 (Q9KQ14) Flagellar protein FlgT × 26 (Q9KPZ9) Sodium-type flagellar protein MotX × 26 (Q9KNX9) FlgP × 52 Lipoprotein × 58 (Q9KQ01) FlgO domain-containing protein × 58 (Q9KQ00) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9KT95_VIBCH
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 Da; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Db; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dc; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dd; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 De; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Df; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dg; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dh; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Di; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dj; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dk; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dl; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dm; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dn; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Do; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dp; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dq; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dr; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Ds; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dt; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Du; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dv; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dw; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dx; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dy; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293 作者链 Dz; PDB构建体 1–271; UniProt 23–293

Sodium-type flagellar protein MotX

Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961

UniProt Q9KNX9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 298 Flagellar L-ring protein × 26 (Q9KQ13) Flagellar P-ring protein × 26 (Q9KQ14) Flagellar protein FlgT × 26 (Q9KPZ9) Sodium-type flagellar protein MotY × 26 (Q9KT95) FlgP × 52 Lipoprotein × 58 (Q9KQ01) FlgO domain-containing protein × 58 (Q9KQ00) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9KNX9_VIBCH
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 Ea; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Eb; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ec; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ed; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ee; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ef; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Eg; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Eh; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ei; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ej; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ek; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 El; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Em; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 En; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Eo; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ep; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Eq; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Er; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Es; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Et; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Eu; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ev; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ew; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ex; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ey; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211 作者链 Ez; PDB构建体 1–183; UniProt 29–211

Lipoprotein

Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961

UniProt Q9KQ01

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 298 Flagellar L-ring protein × 26 (Q9KQ13) Flagellar P-ring protein × 26 (Q9KQ14) Flagellar protein FlgT × 26 (Q9KPZ9) Sodium-type flagellar protein MotY × 26 (Q9KT95) Sodium-type flagellar protein MotX × 26 (Q9KNX9) FlgP × 52 FlgO domain-containing protein × 58 (Q9KQ00) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9KQ01_VIBCH
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 Ha; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Hc; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 He; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Hg; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Hi; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Hk; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Hm; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ho; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Hq; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Hs; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Hu; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Hw; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Hy; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ia; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ic; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ie; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ig; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ii; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ik; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Im; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Io; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Iq; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Is; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Iu; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Iw; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Iy; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ja; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Jc; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Je; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Jg; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ji; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Jk; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Jm; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Jo; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Jq; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Js; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ju; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Jw; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Jy; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ka; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Kc; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ke; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Kg; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ki; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Kk; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Km; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ko; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Kq; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ks; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ku; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Kw; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Ky; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 La; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Lc; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Le; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Lg; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Li; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130 作者链 Lk; PDB构建体 1–105; UniProt 26–130

FlgO domain-containing protein

Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961

UniProt Q9KQ00

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 298 Flagellar L-ring protein × 26 (Q9KQ13) Flagellar P-ring protein × 26 (Q9KQ14) Flagellar protein FlgT × 26 (Q9KPZ9) Sodium-type flagellar protein MotY × 26 (Q9KT95) Sodium-type flagellar protein MotX × 26 (Q9KNX9) FlgP × 52 Lipoprotein × 58 (Q9KQ01) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9KQ00_VIBCH
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 Hb; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Hd; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Hf; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Hh; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Hj; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Hl; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Hn; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Hp; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Hr; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Ht; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Hv; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Hx; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Hz; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Ib; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Id; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 If; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Ih; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Ij; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Il; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 In; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Ip; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Ir; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 It; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Iv; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Ix; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Iz; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jb; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jd; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jf; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jh; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jj; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jl; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jn; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jp; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jr; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jt; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jv; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jx; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Jz; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kb; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kd; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kf; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kh; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kj; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kl; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kn; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kp; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kr; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kt; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kv; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kx; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Kz; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Lb; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Ld; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Lf; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Lh; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Lj; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221 作者链 Ll; PDB构建体 1–190; UniProt 32–221

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9yfg
沉积日期 deposition_date2025-09-25
结构标题 titleFlagellar outer membrane complex in Vibrio cholerae at disassembled, closed state
关键词 keywordsVibrio cholerae, in situ cryo-EM, closed, flagellar outer membrane complex, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9yfg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9yfg__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9yfg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)152.40 Å
总 Rg152.30 Å
原子数412635
残基数52997
排除体积7299400 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9yfg__assembly_1__model_1 298-meric (298) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

▶

7. 引用文献 (1)