当前蛋白身份：A0A059PIQ0
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 28QL GFP bound to distal DARPin (AHIR dodecamer scaffold system) 提交 2026-02-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3–229（227 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å |
| 5BT0 Switching GFP fluorescence using genetically encoded phenyl azide chemistry through two different non-native post-translational modifications routes at the same position. 提交 2015-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–234（232 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；50 mM MMT, 2.5 M (NH4)2SO4
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.204 |
| 5BT0 Switching GFP fluorescence using genetically encoded phenyl azide chemistry through two different non-native post-translational modifications routes at the same position. 提交 2015-06-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–234（232 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；50 mM MMT, 2.5 M (NH4)2SO4
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.204 |
| 5BTT Switching GFP fluorescence using genetically encoded phenyl azide chemistry through two different non-native post-translational modifications routes at the same position. 提交 2015-06-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–231（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；50 mM MMT, 2.5 M (NH4)2SO4
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.207 |
| 5BTT Switching GFP fluorescence using genetically encoded phenyl azide chemistry through two different non-native post-translational modifications routes at the same position. 提交 2015-06-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–231（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；50 mM MMT, 2.5 M (NH4)2SO4
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.207 |
| 5DPG sfGFP mutant - 133 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(4CF), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；22% PEG 3350, 2% Tacsimate pH 6, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.192 |
| 5DPH sfGFP mutant - 149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CO2 CARBON DIOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris pH 8.5, 20% PEG 4000, 0.21 M MgCl2-6H2O
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.208 |
| 5DPH sfGFP mutant - 149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CO2 CARBON DIOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris pH 8.5, 20% PEG 4000, 0.21 M MgCl2-6H2O
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.208 |
| 5DPI sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 5DPI sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 5DPI sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 5DPI sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 5DPI sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 5DPI sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 5DPJ sfGFP double mutant - 133/149 p-ethynyl-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(5DW), N149(5DW), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 3350 and 0.20 M sodium citrate tribasic, pH 7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.244 |
| 5DPJ sfGFP double mutant - 133/149 p-ethynyl-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(5DW), N149(5DW), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 3350 and 0.20 M sodium citrate tribasic, pH 7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.244 |
| 5DPJ sfGFP double mutant - 133/149 p-ethynyl-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(5DW), N149(5DW), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 3350 and 0.20 M sodium citrate tribasic, pH 7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.244 |
| 5DPJ sfGFP double mutant - 133/149 p-ethynyl-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(5DW), N149(5DW), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 3350 and 0.20 M sodium citrate tribasic, pH 7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.244 |
| 5DY6 Enhanced superfolder GFP with DBCO at 148 提交 2015-09-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5–232（228 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；294 K；0.1 M PCTP Buffer, 15% PEG 1500
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.290 |
| 5DY6 Enhanced superfolder GFP with DBCO at 148 提交 2015-09-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5–232（228 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；294 K；0.1 M PCTP Buffer, 15% PEG 1500
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.290 |
| 5EHU sfGFP mutant with unnatural amino acid 4-azidoethoxy-L-phenylalanine incorporated at the 149 site 提交 2015-10-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, A72S, Q80R, N149(4LZ), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；A 40 mg/mL solution of sfGFP-149-AePhe in a 20 mM Hepes buffer pH 7.5 was combined with a precipitation solution (20% PEG 8000, 100 mM Hepes pH 7.5) in a 1:1 ratio to form crystals in a sitting drop well at room temperature
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.208 |
| 5EHU sfGFP mutant with unnatural amino acid 4-azidoethoxy-L-phenylalanine incorporated at the 149 site 提交 2015-10-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, A72S, Q80R, N149(4LZ), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；A 40 mg/mL solution of sfGFP-149-AePhe in a 20 mM Hepes buffer pH 7.5 was combined with a precipitation solution (20% PEG 8000, 100 mM Hepes pH 7.5) in a 1:1 ratio to form crystals in a sitting drop well at room temperature
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.208 |
| 5JZK The Structure of Ultra Stable Green Fluorescent Protein 提交 2016-05-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
片段：UNP residues 3-238
链 B
3–238（236 aa）
片段：UNP residues 3-238
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NO3 NITRATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；20 % w/v PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris propane pH 6.5, 0.2 M Sodium nitrate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.176 |
| 5JZL The Structure of Monomeric Ultra Stable Green Fluorescent Protein 提交 2016-05-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
片段：UNP residues 3-238
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；22% w/v PEG 8000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M phosphate-citrate buffer pH 3.7, 4% v/v acetone
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 5JZL The Structure of Monomeric Ultra Stable Green Fluorescent Protein 提交 2016-05-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
片段：UNP residues 3-238
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；22% w/v PEG 8000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M phosphate-citrate buffer pH 3.7, 4% v/v acetone
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 5MFC Designed armadillo repeat protein YIIIM5AII in complex with (KR)4-GFP 提交 2016-11-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；8% w/v PEG 4000, 0.1M Na acetate trihydrate pH 4.6,
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.240 |
| 5MFC Designed armadillo repeat protein YIIIM5AII in complex with (KR)4-GFP 提交 2016-11-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；8% w/v PEG 4000, 0.1M Na acetate trihydrate pH 4.6,
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.240 |
| 5NHN Super-Folder Green Fluorescent Protein Artificiall dimer linked via 148 position 提交 2017-03-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–231（229 aa）
链 B
3–231（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | DB5 [(4~{S})-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1~{H}-cycloocta[d][1,2,3]triazol-4-yl] hydrogen carbonate × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；300 K；Condition C6 of the PACT Premier screen:
0.1 M PCTP Buffer, pH 9.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.209 |
| 5NI3 sfGFP 204-204 mutant dimer 提交 2017-03-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–229（227 aa）
链 D
3–233（231 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 6 DB5 [(4~{S})-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1~{H}-cycloocta[d][1,2,3]triazol-4-yl] hydrogen carbonate × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PACT condition C6: 0.1M PCTP Buffer, pH 9.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.28 Å R-free 0.191 |
| 5NI3 sfGFP 204-204 mutant dimer 提交 2017-03-23 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3–233（231 aa）
链 C
3–233（231 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 4 DB5 [(4~{S})-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1~{H}-cycloocta[d][1,2,3]triazol-4-yl] hydrogen carbonate × 1 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PACT condition C6: 0.1M PCTP Buffer, pH 9.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.28 Å R-free 0.191 |
| 5YR2 Structure of cpGFP66BPA 提交 2017-11-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
146–235（90 aa）
链 A
3–144（142 aa）
|
突变：Y163(BPA) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Y163(BPA) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289.15 K；PEG 3350 25%, 0.2M MgCl2,0.1M Bis-Tris pH 5.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.215 |
| 5YR2 Structure of cpGFP66BPA 提交 2017-11-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
146–235（90 aa）
链 B
3–144（142 aa）
|
突变：Y163(BPA) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Y163(BPA) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289.15 K；PEG 3350 25%, 0.2M MgCl2,0.1M Bis-Tris pH 5.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.215 |
| 5Z6Y Structure of sfYFP48S95C66BPA 提交 2018-01-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–230（228 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；289 K；0.1M sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.236 |
| 6B9C Superfolder Green Fluorescent Protein with 4-nitro-L-phenylalanine at the chromophore (position 66) 提交 2017-10-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
突变：S30R, A72S, Q80R, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CO2 CARBON DIOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1.4 M DL-Malic acid
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.195 |
| 6B9C Superfolder Green Fluorescent Protein with 4-nitro-L-phenylalanine at the chromophore (position 66) 提交 2017-10-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
突变：S30R, A72S, Q80R, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CO2 CARBON DIOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1.4 M DL-Malic acid
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.195 |
| 6H01 Crystal structure of a domain-swapped dark-state sfGFP containing the unnatural amino acid ortho-nitrobenzyl-tyrosine (ONBY) at residue 66 提交 2018-07-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
链 C
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1.1 M tri-Na-citrate
0.1 M Na-HEPES
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.239 |
| 6H01 Crystal structure of a domain-swapped dark-state sfGFP containing the unnatural amino acid ortho-nitrobenzyl-tyrosine (ONBY) at residue 66 提交 2018-07-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
链 D
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1.1 M tri-Na-citrate
0.1 M Na-HEPES
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.239 |
| 6HUT GFP8 - a stabilized variant of cycle-3 GFP 提交 2018-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–245（245 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；200 mM HEPES, 10% v/v isopropanol, 200 mM NaCl
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.203 |
| 6KRG Crystal structure of sfGFP Y182TMSiPhe 提交 2019-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–236（236 aa）
|
突变：Y182T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；289 K；PEG 6000, SODIUM CHLORIDE
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.173 |
| 6OA8 Superfolder Green Fluorescent Protein with 4-cyano-L-phenylalanine at the chromophore (position 66) 提交 2019-03-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 8 NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；0.1 M Tris-HCl, 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.189 |
| 6UN5 Crystal structure of green fluorescent protein (GFP); S65T, Y66(2,3,5-F3Y); ih circular permutant (50-51) 提交 2019-10-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
51–237（187 aa）
链 B
51–237（187 aa）
|
突变：;A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S,A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：;A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S,A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M ammonium acetate, 31% PEG 3350
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.205 |
| 6UN6 Crystal structure of green fluorescent protein (GFP); S65T, Y66(3-NO2Y); ih circular permutant (50-51) 提交 2019-10-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
51–237（187 aa）
链 B
51–237（187 aa）
|
突变：A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M ammonium acetate, 34% PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.181 |
| 6UN7 Crystal structure of green fluorescent protein (GFP); S65T, Y66(3-OMeY); ih circular permutant (50-51) 提交 2019-10-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
51–237（187 aa）
链 B
51–237（187 aa）
|
突变：A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M ammonium acetate, 34% PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.191 |
| 6WV3 Human VKOR with warfarin 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 A
146–231（86 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 SWF S-WARFARIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；37% PEG400, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.223 |
| 6WV4 Human VKOR C43S with warfarin 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 A
146–231（86 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
突变：C43S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C43S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SWF S-WARFARIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；25-33% PEG400, 185-220 mM potassium formate, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.292 |
| 6WV5 Human VKOR C43S mutant with vitamin K1 epoxide 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 A
146–231（86 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
突变：C43S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C43S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UAV (2R,3R)-2-hydroxy-3-methyl-2-[(2E,7S)-3,7,11,15-tetramethylhexadec-2-en-1-yl]-2,3-dihydronaphthalene-1,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；25% PEG400, 0.1 M ammonium citrate dibasic, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.270 |
| 6WV6 Human VKOR with phenindione 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 A
146–231（86 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 UAS Phenindione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；34% PEG400, 80 mM lithium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.268 |
| 6WV7 Human VKOR with Chlorophacinone 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 A
146–231（86 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UAJ Chlorophacinone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；33% PEG400, 5% DMSO, 0.1 M sodium acetate, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.245 |
| 6WV7 Human VKOR with Chlorophacinone 提交 2020-05-05 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–144（144 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 B
146–231（86 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UAJ Chlorophacinone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；33% PEG400, 5% DMSO, 0.1 M sodium acetate, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.245 |
| 6WV8 Takifugu rubripes VKOR-like C138S mutant with vitamin K1 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
146–238（93 aa）
|
突变：C138S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PQN PHYLLOQUINONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；295 K；25% PEG 400, 300 mM ammonium fluoride, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.293 |
| 6WVB Takifugu rubripes VKOR-like with warfarin 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
146–238（93 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SWF S-WARFARIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；295 K；23% PEG400, 0.1 M Sodium nitrate, 0.1 M MES pH 5.5
|
分辨率 2.87 Å R-free 0.286 |
| 6WVH Human VKOR with Brodifacoum 提交 2020-05-06 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 A
146–231（86 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UA7 Brodifacoum × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；32% PEG400, 0.1 M ammonium acetate, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.215 |
| 6WVH Human VKOR with Brodifacoum 提交 2020-05-06 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–144（144 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 B
146–231（86 aa）
片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UA7 Brodifacoum × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；32% PEG400, 0.1 M ammonium acetate, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.215 |
| 7A7M rsGreen0.7b in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；150 mM KBr
30 % PEG 2000 mme
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.198 |
| 7A7N rsGreen0.7b in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MMT pH 5.0
25 % PEG 1500
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.170 |
| 7A7O rsGreen0.7-K206A in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM Ammonium acetate
100 mM Bis-tris pH 5.5
25 % PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.241 |
| 7A7P rsGreen0.7-K206A partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NO3 NITRATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；22 % PEG 4000
140 mM Mg(NO3)2
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.197 |
| 7A7Q rsGreenF-K206A in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM NaCl
100 mM MES pH 6.0
20 % PEG 6000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.218 |
| 7A7R rsGreenF-K206A in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM NaCl
100 mM MES pH 6.0
20 % PEG 6000
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.243 |
| 7A7S rsGreenF in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MIB pH 4.0
25 % PEG 1500
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.235 |
| 7A7T rsGreenF partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MIB pH 4.0
25 % PEG 1500
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.197 |
| 7A7U rsGreen1 in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.0 M (NH4)2SO4
200 mM NaCl
100 mM Na-cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.201 |
| 7A7V rsGreen1-K206A partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 5.5
200 mM (NH4)2SO4
16 % PEG 8000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.194 |
| 7A7W rsGreen0.7-F145M partially in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM NH4HCO2
20 % PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.165 |
| 7A7X rsGreen0.7-F145M in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MMT pH 8.0
25 % PEG 1500
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.207 |
| 7A7Y rsGreen0.7-F145Q in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NO3 NITRATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；200 mM KNO3
20 % PEG 3350
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.142 |
| 7A7Z rsGreen0.7-K206A-E222G in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM (Li)2SO4
100 mM Tris pH 8.5
40 % PEG 400
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.142 |
| 7A80 rsGreen0.7-K206A-E222V in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NO3 NITRATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；26 % PEG 4000
500 mM Mg(NO3)
50 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 7A80 rsGreen0.7-K206A-E222V in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NO3 NITRATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；26 % PEG 4000
500 mM Mg(NO3)
50 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 7A80 rsGreen0.7-K206A-E222V in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NO3 NITRATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；26 % PEG 4000
500 mM Mg(NO3)
50 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 7A80 rsGreen0.7-K206A-E222V in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NO3 NITRATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；26 % PEG 4000
500 mM Mg(NO3)
50 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 7A81 rsGreen0.7-K206A-F145A partially in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM NaCl
100 mM MES pH 6.0
20 % PEG 6000
4% 2,2,2-trifluoroethanol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.248 |
| 7A82 rsGreen0.7-K206A-F145A partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM NaCl
100 mM MES pH 6.0
20 % PEG 6000
200 mM NDSB-211
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 7A83 rsGreen0.7-K206A-F145H in the green-on-state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；125 mM MES pH 6.0
9 % PEG 4000
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.192 |
| 7A84 rsGreen0.7-K206A-F145H partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.0
14 % PEG 400
300 mM NGSB-195
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.269 |
| 7A85 rsGreen0.7-K206A-F145L in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.5
12 % PEG 20 000
10 mM NaBr
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.237 |
| 7A86 rsGreen0.7-K206A-F145L partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.5
12 % PEG 20 000
4 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.210 |
| 7A86 rsGreen0.7-K206A-F145L partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.5
12 % PEG 20 000
4 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.210 |
| 7A87 rsGreen0.7-K206A-F145M in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 1500
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.228 |
| 7A88 rsGreen0.7-K206A-F145M in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MMT
25 % PEG 1500
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.226 |
| 7A89 rsGreen0.7-K206A-F145Q in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；22 % PEG 4000
140 mM Mg(NO3)2
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.234 |
| 7A89 rsGreen0.7-K206A-F145Q in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；22 % PEG 4000
140 mM Mg(NO3)2
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.234 |
| 7A8A rsGreen0.7-K206A-F145Q partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM NaCl
100 mM MES pH 6.0
20 % PEG 6000
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.254 |
| 7A8B rsGreen0.7-K206A-F145S partially in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.0
14 % PEG 4000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.232 |
| 7A8C rsGreen0.7-K206A-F145S in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.5
25 % PEG 4000
400 mM D-galactose
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.253 |
| 7A8D rsGreen0.7-K206A-F165W partially in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；200 mM NH4F
20 % PEG 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.219 |
| 7A8E rsGreen0.7-K206A-F165W partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM HEPES pH 7.5
25 % PEG 4000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.261 |
| 7A8F rsGreen0.7-K206A-F165L in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM HEPES pH 7.5
25 % PEG 4000
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.257 |
| 7A8G rsGreen0.7-K206A-H148G in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM TMAO
100mM Tris pH 8.5
20 % Peg 2000 mme
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 7A8G rsGreen0.7-K206A-H148G in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM TMAO
100mM Tris pH 8.5
20 % Peg 2000 mme
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 7A8H rsGreen0.7-K206A-H148S in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.209 |
| 7A8H rsGreen0.7-K206A-H148S in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.209 |
| 7A8H rsGreen0.7-K206A-H148S in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.209 |
| 7A8H rsGreen0.7-K206A-H148S in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.209 |
| 7A8I rsGreen0.7-K206A-H148S partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 7A8I rsGreen0.7-K206A-H148S partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 7A8I rsGreen0.7-K206A-H148S partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 7A8I rsGreen0.7-K206A-H148S partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 7A8J rsGreen0.7-K206A-H148V in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.5
25 % PEG 550 mme
10 mM ZnSO4
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.232 |
| 7A8K rsGreen0.7-K206A-H148V partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM HEPES pH 7.5
12 % PEG 4000
1% tryptone
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.263 |
| 7A8L rsGreen0.7-K206A-N205C in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.5
25 % PEG 3000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.225 |
| 7A8M rsGreen0.7-K206A-N205G in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.0
20 % PEG 2000 mme
10 mM BaCl2
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.245 |
| 7A8N rsGreen0.7-K206A-N205L in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM HEPES pH 7.5
25 % PEG 8000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.258 |
| 7A8O rsGreen0.7-K206A-N205S in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM Maic acid pH 7.0
20 % PEG 3350
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.201 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1–238（238 aa）
|
突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–238（238 aa）
|
突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1–238（238 aa）
|
突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
1–238（238 aa）
|
突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
1–238（238 aa）
|
突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 O
1–238（238 aa）
|
突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7E53 Crystal structure of sfGFP complexed with the nanobody nb2 at 2.2 Angstron resolution 提交 2021-02-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–232（230 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% (w/v) Polyethylene glycol 400, 100mM CAPS/ Sodium hydroxide, pH 10.5
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.258 |
| 8DHY N-terminal fragment of MsbA fused to GFP in complex with copper(II) 提交 2022-06-28 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–239（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；70% Tacsimate pH 7.0
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.228 |
| 8GW6 AtSLAC1 6D mutant in closed state 提交 2022-09-16 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–240（240 aa）
链 B
1–240（240 aa）
链 C
1–240（240 aa）
|
突变：T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D 突变：T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D 突变：T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D | CL CHLORIDE ION × 3 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8GW7 AtSLAC1 6D mutant in open state 提交 2022-09-16 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–240（240 aa）
链 B
1–240（240 aa）
链 C
1–240（240 aa）
|
突变：T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D 突变：T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D 突变：T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D | CL CHLORIDE ION × 6 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8J6M SIDT1 protein 提交 2023-04-26 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–236（234 aa）
链 B
3–236（234 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 8 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 1 OLA OLEIC ACID × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.77 Å |
| 8J6O transport T2 提交 2023-04-26 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–236（234 aa）
链 B
3–236（234 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 8J7M ion channel 提交 2023-04-27 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–235（233 aa）
链 B
3–235（233 aa）
链 C
3–235（233 aa）
链 D
3–235（233 aa）
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 CLR CHOLESTEROL × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8RL9 RECQL5:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 8RLB RECQL5:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody - sfGFP local refinement 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å |
| 8RLC SPNS2:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
未记录 | LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8RLE SPNS2:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody - sfGFP local refinement 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.75 Å |
| 8UBG DpHF19 filament 提交 2023-09-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric（20） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
链 B
3–238（236 aa）
链 C
3–238（236 aa）
链 D
3–238（236 aa）
链 E
3–238（236 aa）
链 F
3–238（236 aa）
链 G
3–238（236 aa）
链 H
3–238（236 aa）
链 I
3–238（236 aa）
链 J
3–238（236 aa）
链 K
3–238（236 aa）
链 L
3–238（236 aa）
链 M
3–238（236 aa）
链 N
3–238（236 aa）
链 O
3–238（236 aa）
链 P
3–238（236 aa）
链 Q
3–238（236 aa）
链 R
3–238（236 aa）
链 S
3–238（236 aa）
链 T
3–238（236 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8XAL Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-BQ.1 in complex with ACE2 提交 2023-12-04 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
3–238（236 aa）
链 J
3–238（236 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
|
分辨率 3.20 Å |
| 9BCF Chimeric protein of crocodile allergen Cro p 1.0101 and GFP 提交 2024-04-09 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% v/v PEG 300
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.238 |
| 9BCF Chimeric protein of crocodile allergen Cro p 1.0101 and GFP 提交 2024-04-09 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% v/v PEG 300
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.238 |
| 9BCF Chimeric protein of crocodile allergen Cro p 1.0101 and GFP 提交 2024-04-09 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% v/v PEG 300
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.238 |
| 9C74 superfolder Green Fluorescent Protein with meta-nitro-tyrosine incorporated at position 66 提交 2024-06-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Y66mNO2Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1% tryptone, 0.001 M NaN3, 0.05 M Hepes pH 7.0, 20% w/v PEG350
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.220 |
| 9IRV MultiBody Refinement of dimeric DARPin and its bound GFP on a symmetric scaffold 提交 2024-07-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–231（231 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 9J48 GFP bound to 24-mer DARPin-apoferritin model 6c 提交 2024-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 a
1–231（231 aa）
链 b
1–231（231 aa）
链 c
1–231（231 aa）
链 d
1–231（231 aa）
链 e
1–231（231 aa）
链 f
1–231（231 aa）
链 g
1–231（231 aa）
链 h
1–231（231 aa）
链 i
1–231（231 aa）
链 j
1–231（231 aa）
链 k
1–231（231 aa）
链 l
1–231（231 aa）
链 m
1–231（231 aa）
链 n
1–231（231 aa）
链 o
1–231（231 aa）
链 p
1–231（231 aa）
链 q
1–231（231 aa）
链 r
1–231（231 aa）
链 s
1–231（231 aa）
链 t
1–231（231 aa）
链 v
1–231（231 aa）
链 w
1–231（231 aa）
链 x
1–231（231 aa）
链 y
1–231（231 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 9N6A GP23 C-termimal receptor binding domain from TM4 phage 提交 2025-02-05 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；289 K；0.2 M Lithium Sulfate
0.1 M MES: NaOH, pH 6
20 % (v/v) 1,4-Butanediol
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.280 |
| 9V85 Superfolder GFP fused gp38 receptor binding domain of bacteriophage PP01 提交 2025-05-29 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；10% (w/v) PEG8000, 0.1M Na-HEPES-MOPS, pH7.5, 3mM CaCl2, 3mM MgCl2, 20 % (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 9V85 Superfolder GFP fused gp38 receptor binding domain of bacteriophage PP01 提交 2025-05-29 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；10% (w/v) PEG8000, 0.1M Na-HEPES-MOPS, pH7.5, 3mM CaCl2, 3mM MgCl2, 20 % (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 9ZG5 Structure of superfolder GFP bound to nanobody 15 提交 2025-12-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–239（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.40 Å R-free 0.331 |
| 9ZG5 Structure of superfolder GFP bound to nanobody 15 提交 2025-12-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3–239（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.40 Å R-free 0.331 |
| 9ZG5 Structure of superfolder GFP bound to nanobody 15 提交 2025-12-02 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
3–239（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.40 Å R-free 0.331 |
| 9ZG5 Structure of superfolder GFP bound to nanobody 15 提交 2025-12-02 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
3–239（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.40 Å R-free 0.331 |