当前蛋白身份:O14776 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2DK7 Solution structure of WW domain in transcription elongation regulator 1 提交 2006-04-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 520–579(60 aa) 片段:WW domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 0.8mM U-15N, 13C; 20mM phosphate buffer NA; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90%H2O,10%D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2DOD Solution structure of the first FF domain of human transcription factor CA150 提交 2006-04-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 651–719(69 aa) 片段:FF domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 1.2mM 13C/15N-PROTEIN; 20mM d-Tris-HCl(pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2DOE Solution structure of the third FF domain of human transcription factor CA150 提交 2006-04-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 784–853(70 aa) 片段:FF domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 1.1mM 13C/15N-PROTEIN; 20mM d-Tris-HCl(pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3;90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2DOF Solution structure of the fourth FF domain of human transcription factor CA150 提交 2006-04-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 888–959(72 aa) 片段:FF domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 1.1mM 13C/15N-PROTEIN, 20mM d-Tris-HCl(pH7.0), 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02% NaN3, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2E71 Solution structure of the second FF domain of human transcription factor CA150 提交 2007-01-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 717–786(70 aa) 片段:FF domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 20mM d-Tris-HCl(pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2KIQ Solution structure of the FF Domain 2 of human transcription elongation factor CA150 提交 2009-05-07 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 724–782(59 aa) 片段:UNP residues 724-782
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;303 K;离子强度(mmCIF原始值)25;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] CA150 FF2-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CA150 FF2-2, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2KIS Solution structure of CA150 FF1 domain and FF1-FF2 interdomain linker 提交 2009-05-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 659–724(66 aa) 片段:FF1 domain: UNP residues 659-724
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;285 K;离子强度(mmCIF原始值)0.137;压力 ambient
NMR样品组成 1-1.7 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2MW9 NMR structure of FBP28 WW2 Y438R mutant 提交 2014-11-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 428–464(37 aa) 片段:WW 2 domain residues 428-464
突变:Y438R 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;285 K;压力 ambient
NMR样品组成 0.7 mM protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MWA NMR structure of FBP28 WW2 mutant Y446L 提交 2014-11-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 428–464(37 aa) 片段:WW 2 domain residues 430-466
突变:Y446L 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;285 K;压力 ambient
NMR样品组成 0.7 mM protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MWB FBP28 WW2 mutant W457F 提交 2014-11-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 428–464(37 aa) 片段:WW 2 domain residues 430-466
突变:W457F 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;285 K;压力 ambient
NMR样品组成 0.7 mM protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MWD NMR structure of FBP28 WW2 mutant Y438R DNDC 提交 2014-11-04 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 433–460(28 aa) 片段:WW 2 domain residues 433-460
突变:Y438R 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;285 K;压力 ambient
NMR样品组成 0.7 mM protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MWE NMR structure of FBP28 WW2 mutant Y438R, L453A DNDC 提交 2014-11-04 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 433–460(28 aa) 片段:WW 2 domain residues 433-460
突变:Y238R, L453A 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;285 K;压力 ambient
NMR样品组成 0.7 mM protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MWF NMR structure of FBP28 WW2 mutant Y438R DN 提交 2014-11-04 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 433–464(32 aa) 片段:WW 2 domain residues 433-464
突变:Y438R 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;285 K;压力 ambient
NMR样品组成 0.7 mM protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2N4R NMR structure of Fbp28 WW domain L453D mutant 提交 2015-07-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 428–464(37 aa)
突变:L453D 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.8;285 K;压力 ambient
NMR样品组成 500-1000 uM protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2N4S NMR structure of Fbp28 WW domain L453E mutant 提交 2015-07-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 428–464(37 aa)
突变:L453E 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.8;285 K;压力 ambient
NMR样品组成 500-1000 uM protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2N4T NMR structure of Fbp28 WW domain L453W mutant 提交 2015-07-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 428–464(37 aa)
突变:L453W 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.8;285 K;压力 ambient
NMR样品组成 500-1000 uM protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2N4U NMR structure of Fbp28 WW domain E454Y mutant 提交 2015-07-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 428–464(37 aa)
突变:E454Y 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.8;285 K;压力 ambient
NMR样品组成 500-1000 uM protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2N4V NMR structure of Fbp28 WW domain T456D mutant 提交 2015-07-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 428–464(37 aa)
突变:T456D 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.8;285 K;压力 ambient
NMR样品组成 500-1000 uM protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2N4W NMR structure of Fbp28 WW domain T456Y mutant 提交 2015-07-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 428–464(37 aa)
突变:T456Y 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.8;285 K;压力 ambient
NMR样品组成 500-1000 uM protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2NNT General structural motifs of amyloid protofilaments 提交 2006-10-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 428–464(37 aa) 片段:second WW domain
链 B 428–464(37 aa) 片段:second WW domain
链 C 428–464(37 aa) 片段:second WW domain
链 D 428–464(37 aa) 片段:second WW domain
突变:Y446F 突变:Y446F 突变:Y446F 突变:Y446F 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7;285 K;压力 1
NMR样品组成 uniform 13C,15N labeling, 15 mg fibre in phosphate buffer | phosphate buffer
NMR样品组成 uniform 2H,13C,15N labeling, 15 mg fibre in phosphate buffer | phosphate buffer
NMR样品组成 uniform 15N labeling, 13C labeling is based on 1,3[13C]-glycerol as carbon source for the bacteria, 15 mg fibre in phosphate buffer | phosphate buffer
NMR样品组成 uniform 15N labeling, 13C labeling is based on 2[13C]-glycerol as carbon source for the bacteria, 15 mg fibre in phosphate buffer | phosphate buffer
分辨率未提供
3HFH Crystal structure of tandem FF domains 提交 2009-05-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 661–845(185 aa) 片段:FF domains: UNP residues 661-845
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;50mM Bis-Tris pH 6.5, 50 mM Ammonium sulfate, 30% Pentaerythritol ethoxylate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.283
3HFH Crystal structure of tandem FF domains 提交 2009-05-11 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 661–845(185 aa) 片段:FF domains: UNP residues 661-845
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;50mM Bis-Tris pH 6.5, 50 mM Ammonium sulfate, 30% Pentaerythritol ethoxylate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.283
3Q1I Polo-like kinase I Polo-box domain in complex with FMPPPMSpSM phosphopeptide from TCERG1 提交 2010-12-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 99–107(9 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;30% PEG400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.222
4FQG Crystal structure of the TCERG1 FF4-6 tandem repeat domain 提交 2012-06-25 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 895–1081(187 aa) 片段:TCERG1 FF4-6 tandem repeat domain (unp residues 895:1081)
未记录 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;277 K;0.016 M NiCl2, 0.1 M Tris-HCl, 16% polyethylene glycol monomethyl ether 2000, and 0.13 M glycine, pH 9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.241
4FQG Crystal structure of the TCERG1 FF4-6 tandem repeat domain 提交 2012-06-25 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 895–1081(187 aa) 片段:TCERG1 FF4-6 tandem repeat domain (unp residues 895:1081)
未记录 NI NICKEL (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;277 K;0.016 M NiCl2, 0.1 M Tris-HCl, 16% polyethylene glycol monomethyl ether 2000, and 0.13 M glycine, pH 9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.241
7ABF Human pre-Bact-1 spliceosome core structure 提交 2020-09-07 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致
链 A4 1–1077(1077 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7ABG Human pre-Bact-1 spliceosome 提交 2020-09-07 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:58-meric(58) 与全部聚合物一致
链 A4 1–1098(1098 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.80 Å
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致
链 T 1–1098(1098 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:71-meric(71) 与全部聚合物一致
链 T 1–1098(1098 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.29 Å
9R3D Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-04 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:17-meric(17) 与全部聚合物一致
链 T 1–1098(1098 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
9R8V Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 59 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致
链 T 1–1098(1098 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.50 Å