当前蛋白身份：O95619
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5R68 XChem group deposition -- Crystal Structure of human YEATS4 in complex with FM000199e 提交 2020-02-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
18–190（173 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 RYD (1-methylbenzotriazol-5-yl)methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M tris pH 7.5, 0.15M lithium sulfate, 40% PEG400
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.251 |
| 5R68 XChem group deposition -- Crystal Structure of human YEATS4 in complex with FM000199e 提交 2020-02-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
18–190（173 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 RYD (1-methylbenzotriazol-5-yl)methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M tris pH 7.5, 0.15M lithium sulfate, 40% PEG400
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.251 |
| 5R69 XChem group deposition -- Crystal Structure of human YEATS4 in complex with XS038644e 提交 2020-02-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
18–190（173 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZHA ~{N}-(5-oxidanylidene-7,8-dihydro-6~{H}-naphthalen-2-yl)ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M tris pH 7.5, 0.15M lithium sulfate, 40% PEG400
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.248 |
| 5R69 XChem group deposition -- Crystal Structure of human YEATS4 in complex with XS038644e 提交 2020-02-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
18–190（173 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZHA ~{N}-(5-oxidanylidene-7,8-dihydro-6~{H}-naphthalen-2-yl)ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M tris pH 7.5, 0.15M lithium sulfate, 40% PEG400
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.248 |
| 5VNA Crystal structure of human YEATS domain 提交 2017-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
片段：UNP residues 1-148
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.4；290 K；1.24 M ammonium sulfate, 100 mM CHES pH 9.4
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.222 |
| 5VNA Crystal structure of human YEATS domain 提交 2017-04-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–148（148 aa）
片段：UNP residues 1-148
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.4；290 K；1.24 M ammonium sulfate, 100 mM CHES pH 9.4
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.222 |
| 5VNA Crystal structure of human YEATS domain 提交 2017-04-29 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–148（148 aa）
片段：UNP residues 1-148
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.4；290 K；1.24 M ammonium sulfate, 100 mM CHES pH 9.4
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.222 |
| 5VNA Crystal structure of human YEATS domain 提交 2017-04-29 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–148（148 aa）
片段：UNP residues 1-148
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.4；290 K；1.24 M ammonium sulfate, 100 mM CHES pH 9.4
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.222 |
| 5VNB YEATS in complex with histone H3 提交 2017-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
片段：UNP residues 1-148
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.4；290 K；1.36 M ammonium sulfate, 100 mM CHES pH 9.4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 5VNB YEATS in complex with histone H3 提交 2017-04-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–148（148 aa）
片段：UNP residues 1-148
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.4；290 K；1.36 M ammonium sulfate, 100 mM CHES pH 9.4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 5VNB YEATS in complex with histone H3 提交 2017-04-29 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–148（148 aa）
片段：UNP residues 1-148
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.4；290 K；1.36 M ammonium sulfate, 100 mM CHES pH 9.4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 5VNB YEATS in complex with histone H3 提交 2017-04-29 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–148（148 aa）
片段：UNP residues 1-148
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.4；290 K；1.36 M ammonium sulfate, 100 mM CHES pH 9.4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 5XTZ Crystal structure of GAS41 YEATS bound to H3K27ac peptide 提交 2017-06-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
15–159（145 aa）
片段：UNP RESIDUES 15-159
链 B
15–159（145 aa）
片段：UNP RESIDUES 15-159
链 C
15–159（145 aa）
片段：UNP RESIDUES 15-159
链 D
15–159（145 aa）
片段：UNP RESIDUES 15-159
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；0.1 M sodium acetate trihydrate, pH 4.6, 4.0 M ammonium acetate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.233 |
| 5XTZ Crystal structure of GAS41 YEATS bound to H3K27ac peptide 提交 2017-06-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
15–159（145 aa）
片段：UNP RESIDUES 15-159
链 B
15–159（145 aa）
片段：UNP RESIDUES 15-159
链 C
15–159（145 aa）
片段：UNP RESIDUES 15-159
链 D
15–159（145 aa）
片段：UNP RESIDUES 15-159
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；0.1 M sodium acetate trihydrate, pH 4.6, 4.0 M ammonium acetate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.233 |
| 5Y8V Crystal structure of GAS41 提交 2017-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
21–160（140 aa）
片段：UNP residues 21-160
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；291 K；0.1M MES pH 6.5, 1.6M MgSO4
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.280 |
| 5Y8V Crystal structure of GAS41 提交 2017-08-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
21–160（140 aa）
片段：UNP residues 21-160
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；291 K；0.1M MES pH 6.5, 1.6M MgSO4
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.280 |
| 5Y8V Crystal structure of GAS41 提交 2017-08-21 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
21–160（140 aa）
片段：UNP residues 21-160
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；291 K；0.1M MES pH 6.5, 1.6M MgSO4
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.280 |
| 5Y8V Crystal structure of GAS41 提交 2017-08-21 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
21–160（140 aa）
片段：UNP residues 21-160
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；291 K；0.1M MES pH 6.5, 1.6M MgSO4
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.280 |
| 7EIF Crystal structure of GAS41 YEATS domain 提交 2021-03-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
19–159（141 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-Tris buffer (pH 5.9) containing 3.3 M NaCl
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.158 |
| 7JFY GAS41 YEATS domain in complex with 5 提交 2020-07-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
链 B
1–148（148 aa）
链 C
1–148（148 aa）
链 D
1–148（148 aa）
|
未记录 | V91 N-(5-{3-[(2S)-1,3-thiazolidin-2-yl]azetidine-1-carbonyl}thiophen-2-yl)-L-prolinamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；277 K；0.1 M Tris, pH 7.3, 0.2 M magnesium chloride, 2.2 M sodium chloride
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 8DKB Crystal Structure of human YEATS4 in complex with Pfizer small molecule compound 3b 提交 2022-07-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–149（149 aa）
|
未记录 | SJI N-ethyl-1-{(3S,4S)-1-[(1-hydroxycyclohexyl)methyl]-3-methylpiperidin-4-yl}-2-methyl-1H-benzimidazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.6), 2% (v/v) tacsimate (pH 5.0), and 16% PEG 3350, 0.1M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.226 |
| 8DKB Crystal Structure of human YEATS4 in complex with Pfizer small molecule compound 3b 提交 2022-07-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–149（149 aa）
|
未记录 | SJI N-ethyl-1-{(3S,4S)-1-[(1-hydroxycyclohexyl)methyl]-3-methylpiperidin-4-yl}-2-methyl-1H-benzimidazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.6), 2% (v/v) tacsimate (pH 5.0), and 16% PEG 3350, 0.1M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.226 |
| 8DKB Crystal Structure of human YEATS4 in complex with Pfizer small molecule compound 3b 提交 2022-07-05 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–149（149 aa）
|
未记录 | SJI N-ethyl-1-{(3S,4S)-1-[(1-hydroxycyclohexyl)methyl]-3-methylpiperidin-4-yl}-2-methyl-1H-benzimidazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.6), 2% (v/v) tacsimate (pH 5.0), and 16% PEG 3350, 0.1M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.226 |
| 8DKB Crystal Structure of human YEATS4 in complex with Pfizer small molecule compound 3b 提交 2022-07-05 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–149（149 aa）
|
未记录 | SJI N-ethyl-1-{(3S,4S)-1-[(1-hydroxycyclohexyl)methyl]-3-methylpiperidin-4-yl}-2-methyl-1H-benzimidazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.6), 2% (v/v) tacsimate (pH 5.0), and 16% PEG 3350, 0.1M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.226 |
| 8DKB Crystal Structure of human YEATS4 in complex with Pfizer small molecule compound 3b 提交 2022-07-05 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1–149（149 aa）
|
未记录 | SJI N-ethyl-1-{(3S,4S)-1-[(1-hydroxycyclohexyl)methyl]-3-methylpiperidin-4-yl}-2-methyl-1H-benzimidazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.6), 2% (v/v) tacsimate (pH 5.0), and 16% PEG 3350, 0.1M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.226 |
| 8DKB Crystal Structure of human YEATS4 in complex with Pfizer small molecule compound 3b 提交 2022-07-05 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1–149（149 aa）
|
未记录 | SJI N-ethyl-1-{(3S,4S)-1-[(1-hydroxycyclohexyl)methyl]-3-methylpiperidin-4-yl}-2-methyl-1H-benzimidazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.6), 2% (v/v) tacsimate (pH 5.0), and 16% PEG 3350, 0.1M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.226 |
| 8DKB Crystal Structure of human YEATS4 in complex with Pfizer small molecule compound 3b 提交 2022-07-05 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
1–149（149 aa）
|
未记录 | SJI N-ethyl-1-{(3S,4S)-1-[(1-hydroxycyclohexyl)methyl]-3-methylpiperidin-4-yl}-2-methyl-1H-benzimidazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.6), 2% (v/v) tacsimate (pH 5.0), and 16% PEG 3350, 0.1M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.226 |
| 8DKB Crystal Structure of human YEATS4 in complex with Pfizer small molecule compound 3b 提交 2022-07-05 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
1–149（149 aa）
|
未记录 | SJI N-ethyl-1-{(3S,4S)-1-[(1-hydroxycyclohexyl)methyl]-3-methylpiperidin-4-yl}-2-methyl-1H-benzimidazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.6), 2% (v/v) tacsimate (pH 5.0), and 16% PEG 3350, 0.1M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.226 |
| 8I60 Crystal structure of GAS41 YEATS domain in complex with histone H3K27cr 提交 2023-01-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
11–150（140 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；Ammonium sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.291 |
| 8I60 Crystal structure of GAS41 YEATS domain in complex with histone H3K27cr 提交 2023-01-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
11–150（140 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；Ammonium sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.291 |
| 8IIY Crystal structure of MBP fused GAS41 YEATS domain in complex with H3K14ac peptide 提交 2023-02-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
19–159（141 aa）
|
突变：D108A, K109A, E198A, N199A, K265A | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris buffer (pH 8.5) containing 20% (w/v) PEG monomethyl ether 2000, 200 mM trimethylamine N-oxide
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.247 |
| 8IIZ Crystal structure of MBP fused GAS41 YEATS domain in complex with H3K27ac peptide 提交 2023-02-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
19–159（141 aa）
|
突变：D108A, K109A, E198A, N199A, K265A | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris buffer (pH 8.5) containing 20% (w/v) PEG monomethyl ether 2000, 200 mM trimethylamine N-oxide
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.301 |
| 8IJ0 Crystal structure of GAS41 YEATS domain in complex with H3K9ac peptide 提交 2023-02-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
19–159（141 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Na-HEPES buffer (pH 7.5) containing 5% (w/v) PEG 400 and 2 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.189 |
| 8IJ0 Crystal structure of GAS41 YEATS domain in complex with H3K9ac peptide 提交 2023-02-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
19–159（141 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Na-HEPES buffer (pH 7.5) containing 5% (w/v) PEG 400 and 2 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.189 |
| 8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 W
1–227（227 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 W
1–227（227 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 W
1–227（227 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 9O4Y GAS41 YEATS domain in complex with DLG-1 提交 2025-04-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–148（148 aa）
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未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 A1B9P N-[5-(3-{(5M)-5-[3-(aminomethyl)phenyl]-1,3-thiazol-2-yl}azetidine-1-carbonyl)thiophen-2-yl]-L-prolinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；1260 mM Ammonium sulfate, 100 mM HEPES, pH 7.5, 25% Glycerol
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分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 9O4Y GAS41 YEATS domain in complex with DLG-1 提交 2025-04-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
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未记录 | A1B9P N-[5-(3-{(5M)-5-[3-(aminomethyl)phenyl]-1,3-thiazol-2-yl}azetidine-1-carbonyl)thiophen-2-yl]-L-prolinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；1260 mM Ammonium sulfate, 100 mM HEPES, pH 7.5, 25% Glycerol
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分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 9O4Y GAS41 YEATS domain in complex with DLG-1 提交 2025-04-09 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–148（148 aa）
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未记录 | A1B9P N-[5-(3-{(5M)-5-[3-(aminomethyl)phenyl]-1,3-thiazol-2-yl}azetidine-1-carbonyl)thiophen-2-yl]-L-prolinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；1260 mM Ammonium sulfate, 100 mM HEPES, pH 7.5, 25% Glycerol
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分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 9O4Y GAS41 YEATS domain in complex with DLG-1 提交 2025-04-09 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–148（148 aa）
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未记录 | A1B9P N-[5-(3-{(5M)-5-[3-(aminomethyl)phenyl]-1,3-thiazol-2-yl}azetidine-1-carbonyl)thiophen-2-yl]-L-prolinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；1260 mM Ammonium sulfate, 100 mM HEPES, pH 7.5, 25% Glycerol
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分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 9X8S Crystal structure of the human GAS41 YEATS domain in complex with an acetylated YFV capsid peptide (K4ac) 提交 2025-10-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
15–146（132 aa）
链 B
15–146（132 aa）
链 C
15–146（132 aa）
链 D
15–146（132 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；Sodium sulfate , Bis-Tris propane (pH= 6.5), PEG 3350
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分辨率 1.70 Å R-free 0.206 |
| 9X8U Crystal structure of the human GAS41 YEATS domain in complex with an acetylated YFV capsid peptide (K8ac) 提交 2025-10-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
15–145（131 aa）
链 B
15–145（131 aa）
链 C
15–145（131 aa）
链 D
15–145（131 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；Sodium sulfate , Bis-Tris propane (pH= 6.5), PEG 3350
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分辨率 3.00 Å R-free 0.266 |