当前蛋白身份：P00877
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1GK8 Rubisco from Chlamydomonas reinhardtii 提交 2001-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 66 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；291 K；50 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4000, 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG/ML PROTEIN
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.162 |
| 1IR2 Crystal Structure of Activated Ribulose-1,5-bisphosphate Carboxylase/oxygenase (Rubisco) from Green alga, Chlamydomonas reinhardtii Complexed with 2-Carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate (2-CABP) 提交 2001-09-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 D
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 F
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 GOL GLYCEROL × 20 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, HEPES-KOH, glycerol, NaHCO3, MgCl2, DTT, 2-carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate (2-CABP), EDTA, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.181 |
| 1IR2 Crystal Structure of Activated Ribulose-1,5-bisphosphate Carboxylase/oxygenase (Rubisco) from Green alga, Chlamydomonas reinhardtii Complexed with 2-Carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate (2-CABP) 提交 2001-09-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 S
1–475（475 aa）
链 T
1–475（475 aa）
链 U
1–475（475 aa）
链 V
1–475（475 aa）
链 W
1–475（475 aa）
链 X
1–475（475 aa）
链 Y
1–475（475 aa）
链 Z
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 GOL GLYCEROL × 20 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, HEPES-KOH, glycerol, NaHCO3, MgCl2, DTT, 2-carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate (2-CABP), EDTA, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.181 |
| 1UW9 L290F-A222T chlamydomonas Rubisco mutant 提交 2004-02-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
链 K
1–475（475 aa）
链 O
1–475（475 aa）
链 R
1–475（475 aa）
链 V
1–475（475 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 55 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；291 K；0 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.194 |
| 1UWA L290F mutant rubisco from chlamydomonas 提交 2004-02-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
链 K
1–475（475 aa）
链 O
1–475（475 aa）
链 R
1–475（475 aa）
链 V
1–475（475 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 59 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；291 K；HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.205 |
| 1UZH A CHIMERIC CHLAMYDOMONAS, SYNECHOCOCCUS RUBISCO ENZYME 提交 2004-03-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
链 K
1–475（475 aa）
链 O
1–475（475 aa）
链 R
1–475（475 aa）
链 V
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 50 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；291 K；50 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.193 |
| 2V63 Crystal structure of Rubisco from Chlamydomonas reinhardtii with a large-subunit V331A mutation 提交 2007-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 D
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 F
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 46 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.214 |
| 2V67 Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with a large- subunit supressor mutation T342I 提交 2007-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 D
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 F
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 58 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 2V68 Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with large- subunit mutations V331A, T342I 提交 2007-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 D
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 F
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 49 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.203 |
| 2V69 Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with a large- subunit mutation D473E 提交 2007-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 D
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 F
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.228 |
| 2V6A Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with large- subunit mutations V331A, G344S 提交 2007-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 D
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 F
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 59 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.192 |
| 2VDH Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with a large- subunit C172S mutation 提交 2007-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 D
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 F
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 57 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.203 |
| 2VDI Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with a large- subunit C192S mutation 提交 2007-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 D
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 F
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 43 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.234 |
| 5BS2 Crystal structure of RbcX-IIa from Chlamydomonas reinhardtii in complex with RbcL C-terminal tail 提交 2015-06-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
462–473（12 aa）
片段：UNP residues 462-473,UNP residues 44-156
链 B
462–473（12 aa）
片段：UNP residues 462-473,UNP residues 44-156
链 R
462–467（6 aa）
片段：UNP residues 462-467
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 25% PEG2000 MME
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.222 |
| 7JFO EPYC1(49-72)-bound Rubisco 提交 2020-07-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
链 I
1–475（475 aa）
链 K
1–475（475 aa）
链 M
1–475（475 aa）
链 O
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.13 Å |
| 9HVM In-cell Structure of Pyrenoid Rubisco 提交 2024-12-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
7–475（469 aa）
链 C
7–475（469 aa）
链 E
7–475（469 aa）
链 G
7–475（469 aa）
链 I
7–475（469 aa）
链 K
7–475（469 aa）
链 M
7–475（469 aa）
链 O
7–475（469 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.10 Å |