当前蛋白身份:P06210
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EAH PV2L COMPLEXED WITH ANTIVIRAL AGENT SCH48973 提交 1997-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 240 PDB 声明:240-MERIC(240) 与蛋白数一致 |
链 1
578–878(301 aa)
链 2
69–339(271 aa)
链 3
340–577(238 aa)
链 4
1–68(68 aa)
|
未记录 | SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 60 MYR MYRISTIC ACID × 60 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å |
| 1EAH PV2L COMPLEXED WITH ANTIVIRAL AGENT SCH48973 提交 1997-07-22 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 1
578–878(301 aa)
链 2
69–339(271 aa)
链 3
340–577(238 aa)
链 4
1–68(68 aa)
|
未记录 | SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å |
| 1EAH PV2L COMPLEXED WITH ANTIVIRAL AGENT SCH48973 提交 1997-07-22 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致 |
链 1
578–878(301 aa)
链 2
69–339(271 aa)
链 3
340–577(238 aa)
链 4
1–68(68 aa)
|
未记录 | SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 5 MYR MYRISTIC ACID × 5 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å |
| 1EAH PV2L COMPLEXED WITH ANTIVIRAL AGENT SCH48973 提交 1997-07-22 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致 |
链 1
578–878(301 aa)
链 2
69–339(271 aa)
链 3
340–577(238 aa)
链 4
1–68(68 aa)
|
未记录 | SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 6 MYR MYRISTIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å |
| 1EAH PV2L COMPLEXED WITH ANTIVIRAL AGENT SCH48973 提交 1997-07-22 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 1
578–878(301 aa)
链 2
69–339(271 aa)
链 3
340–577(238 aa)
链 4
1–68(68 aa)
|
未记录 | SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å |
| 1EAH PV2L COMPLEXED WITH ANTIVIRAL AGENT SCH48973 提交 1997-07-22 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 120 PDB 声明:120-meric(120) 与蛋白数一致 |
链 1
578–878(301 aa)
链 2
69–339(271 aa)
链 3
340–577(238 aa)
链 4
1–68(68 aa)
|
未记录 | SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 30 MYR MYRISTIC ACID × 30 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å |
| 3EPF CryoEM structure of poliovirus receptor bound to poliovirus type 2 提交 2008-09-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 300 PDB 声明:300-MERIC(300) 与蛋白数一致 |
链 1
602–879(278 aa)
链 2
79–340(262 aa)
链 3
341–575(235 aa)
链 4
2–69(68 aa)
|
未记录 | SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 60 MYR MYRISTIC ACID × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;10mM Tris-HCl, 20mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 3EPF CryoEM structure of poliovirus receptor bound to poliovirus type 2 提交 2008-09-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 1
602–879(278 aa)
链 2
79–340(262 aa)
链 3
341–575(235 aa)
链 4
2–69(68 aa)
|
未记录 | SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;10mM Tris-HCl, 20mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 3EPF CryoEM structure of poliovirus receptor bound to poliovirus type 2 提交 2008-09-29 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 25 PDB 声明:25-meric(25) 与蛋白数一致 |
链 1
602–879(278 aa)
链 2
79–340(262 aa)
链 3
341–575(235 aa)
链 4
2–69(68 aa)
|
未记录 | SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 5 MYR MYRISTIC ACID × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;10mM Tris-HCl, 20mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 3EPF CryoEM structure of poliovirus receptor bound to poliovirus type 2 提交 2008-09-29 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:30-meric(30) 与蛋白数一致 |
链 1
602–879(278 aa)
链 2
79–340(262 aa)
链 3
341–575(235 aa)
链 4
2–69(68 aa)
|
未记录 | SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 6 MYR MYRISTIC ACID × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;10mM Tris-HCl, 20mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 3EPF CryoEM structure of poliovirus receptor bound to poliovirus type 2 提交 2008-09-29 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 1
602–879(278 aa)
链 2
79–340(262 aa)
链 3
341–575(235 aa)
链 4
2–69(68 aa)
|
未记录 | SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;10mM Tris-HCl, 20mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 8AYZ Poliovirus type 2 (strain MEF-1) virus-like particle in complex with capsid binder compound 17 提交 2022-09-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 180 PDB 声明:180-meric(180) 与蛋白数一致 |
链 A
579–879(301 aa)
链 B
1–340(340 aa)
链 C
342–578(237 aa)
|
未记录 | SPH SPHINGOSINE × 60 FHK 4-[[4-[1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-2-yl]phenyl]sulfonylamino]benzoic acid × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7;1 x DPBS was made from tissue culture grade Dulbecco's Phosphate Buffered Saline (Sigma-Aldrich). 20 mM EDTA was prepared from fresh stocks of buffered EDTA.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;Single blotting with 3.5ul of sample. Four second blot time and -17 blot force on the vitrobot.
|
分辨率 1.88 Å |
| 9F59 Poliovirus type 2 (strain MEF-1) stabilised virus-like particle (PV2 SC6b) from a mammalian expression system. 提交 2024-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 180 PDB 声明:180-meric(180) 与蛋白数一致 |
链 A
579–879(301 aa)
链 B
2–340(339 aa)
链 C
341–578(238 aa)
|
突变:VP1 V107I, VP1 F134L, VP1 V183L 突变:VP2 I57V, VP2 D126A 突变:VP3 Q178L | SPH SPHINGOSINE × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7;1 x DPBS, 20 mM EDTA, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;4 ul of sample blotted for 3.5 seconds with -15 blot force on FEI Vitrobot mark IV.
|
分辨率 2.30 Å |
| 9F5P Poliovirus type 2 (strain MEF-1) stabilised virus-like particle (PV2 SC6b) from an insect cell expression system. 提交 2024-04-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 180 PDB 声明:180-meric(180) 与蛋白数一致 |
链 A
579–879(301 aa)
链 B
2–340(339 aa)
链 C
341–578(238 aa)
|
突变:VP1 V107I, VP1 V134L, VP1 V183L 突变:VP2 I57V, VP2 D126A 突变:VP3 Q178L | SPH SPHINGOSINE × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7;1 x DPBS, 20 mM EDTA, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;4 ul of sample blotted for 3.5 seconds with -15 blot force on FEI Vitrobot mark IV.
|
分辨率 2.60 Å |
| 9H93 Poliovirus type 2 (strain MEF-1) stabilised virus-like particle (PV2 SC6b) from a yeast expression system. 提交 2024-10-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 180 PDB 声明:180-meric(180) 与蛋白数一致 |
链 B
1–340(340 aa)
|
突变:VP4 I57V, VP2 D57A | SPH SPHINGOSINE × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7;1 x DPBS, 20 mM EDTA, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;3ul of sample double blotted for 3.5 seconds with -15 blot force on FEI Vitrobot mark IV.
|
分辨率 2.40 Å |
| 9H94 Poliovirus type 2 (strain MEF-1) stabilised virus-like particle (PV2 SC5a) from a yeast expression system. 提交 2024-10-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 180 PDB 声明:180-meric(180) 与蛋白数一致 |
链 B
1–340(340 aa)
|
未记录 | SPH SPHINGOSINE × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7;1 x DPBS, 20 mM EDTA, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;3ul of sample double blotted for 3.5 seconds with -15 blot force on FEI Vitrobot mark IV.
|
分辨率 2.10 Å |
| 9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 360 PDB 声明:360-meric(360) 与蛋白数一致 |
链 1
579–879(301 aa)
链 2
70–340(271 aa)
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |
| 9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 1
579–879(301 aa)
链 2
70–340(271 aa)
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |
| 9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:30-meric(30) 与蛋白数一致 |
链 1
579–879(301 aa)
链 2
70–340(271 aa)
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |
| 9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric(36) 与蛋白数一致 |
链 1
579–879(301 aa)
链 2
70–340(271 aa)
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |
| 9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 1
579–879(301 aa)
链 2
70–340(271 aa)
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |