当前蛋白身份：P0A6G7
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1TYF THE STRUCTURE OF CLPP AT 2.3 ANGSTROM RESOLUTION SUGGESTS A MODEL FOR ATP-DEPENDENT PROTEOLYSIS 提交 1997-10-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
15–207（193 aa）
链 B
15–207（193 aa）
链 C
15–207（193 aa）
链 D
15–207（193 aa）
链 E
15–207（193 aa）
链 F
15–207（193 aa）
链 G
15–207（193 aa）
链 H
15–207（193 aa）
链 I
15–207（193 aa）
链 J
15–207（193 aa）
链 K
15–207（193 aa）
链 L
15–207（193 aa）
链 M
15–207（193 aa）
链 N
15–207（193 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å R-free 0.292 |
| 1YG6 ClpP 提交 2005-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
15–207（193 aa）
链 B
15–207（193 aa）
链 C
15–207（193 aa）
链 D
15–207（193 aa）
链 E
15–207（193 aa）
链 F
15–207（193 aa）
链 G
15–207（193 aa）
链 H
15–207（193 aa）
链 I
15–207（193 aa）
链 J
15–207（193 aa）
链 K
15–207（193 aa）
链 L
15–207（193 aa）
链 M
15–207（193 aa）
链 N
15–207（193 aa）
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；298 K；mpd, mes, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.251 |
| 2FZS Crystal structure of E. coli ClpP with a Peptide Chloromethyl Ketone Covalently Bound at the Active Site 提交 2006-02-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
15–207（193 aa）
链 B
15–207（193 aa）
链 C
15–207（193 aa）
链 D
15–207（193 aa）
链 E
15–207（193 aa）
链 F
15–207（193 aa）
链 G
15–207（193 aa）
链 H
15–207（193 aa）
链 I
15–207（193 aa）
链 J
15–207（193 aa）
链 K
15–207（193 aa）
链 L
15–207（193 aa）
链 M
15–207（193 aa）
链 N
15–207（193 aa）
|
未记录 | CMQ N~2~-[(BENZYLOXY)CARBONYL]-N-[(1S,2S)-2-HYDROXY-1-(4-HYDROXYBENZYL)PROPYL]-L-LEUCINAMIDE × 14 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 15 GOL GLYCEROL × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；0.1M tri-sodium citrate, 0.15M ammonium acetate, 30% PEG 4000 , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.233 |
| 3HLN Crystal structure of ClpP A153C mutant with inter-heptamer disulfide bonds 提交 2009-05-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 B
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 C
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 D
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 E
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 F
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 G
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 H
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 I
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 J
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 K
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 L
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 M
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 N
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
|
突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；1 M 1,6-hexanediol, 0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 10 mM CoCl2, 100 mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.253 |
| 3HLN Crystal structure of ClpP A153C mutant with inter-heptamer disulfide bonds 提交 2009-05-27 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 1
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 2
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 O
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 P
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 Q
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 R
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 S
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 T
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 U
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 V
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 W
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 X
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 Y
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
链 Z
15–207（193 aa）
片段：UNP residues 15-207
|
突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C 突变：A153C | CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；1 M 1,6-hexanediol, 0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 10 mM CoCl2, 100 mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.253 |
| 3MT6 Structure of ClpP from Escherichia coli in complex with ADEP1 提交 2010-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric（28） 与蛋白数一致 |
链 O
1–207（207 aa）
链 P
1–207（207 aa）
链 Q
1–207（207 aa）
链 R
1–207（207 aa）
链 S
1–207（207 aa）
链 T
1–207（207 aa）
链 U
1–207（207 aa）
链 V
1–207（207 aa）
链 W
1–207（207 aa）
链 X
1–207（207 aa）
链 Y
1–207（207 aa）
链 Z
1–207（207 aa）
链 a
1–207（207 aa）
链 b
1–207（207 aa）
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 27 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；295.15 K；25-35% (v/v) MPD and 0.1 M sodium acetate at pH 5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.15K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.204 |
| 3MT6 Structure of ClpP from Escherichia coli in complex with ADEP1 提交 2010-04-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric（28） 与蛋白数一致 |
链 A
1–207（207 aa）
链 B
1–207（207 aa）
链 C
1–207（207 aa）
链 D
1–207（207 aa）
链 E
1–207（207 aa）
链 F
1–207（207 aa）
链 G
1–207（207 aa）
链 H
1–207（207 aa）
链 I
1–207（207 aa）
链 J
1–207（207 aa）
链 K
1–207（207 aa）
链 L
1–207（207 aa）
链 M
1–207（207 aa）
链 N
1–207（207 aa）
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 28 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；295.15 K；25-35% (v/v) MPD and 0.1 M sodium acetate at pH 5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.15K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.204 |
| 6NB1 Crystal structure of Escherichia coli ClpP protease complexed with small molecule activator, ACP1-06 提交 2018-12-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
1–207（207 aa）
链 B
1–207（207 aa）
链 C
1–207（207 aa）
链 D
1–207（207 aa）
链 E
1–207（207 aa）
链 F
1–207（207 aa）
链 G
1–207（207 aa）
链 H
1–207（207 aa）
链 I
1–207（207 aa）
链 J
1–207（207 aa）
链 K
1–207（207 aa）
链 L
1–207（207 aa）
链 M
1–207（207 aa）
链 N
1–207（207 aa）
|
未记录 | KHS N-{2-[(2-chlorophenyl)sulfanyl]ethyl}-2-methyl-2-{[5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]sulfonyl}propanamide × 14 GOL GLYCEROL × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；294 K；51-63% MPD
0.1 M sodium acetate pH 5.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.244 |
| 6WR2 ClpP and ClpX IGF loop in ClpX-ClpP complex bound to ssrA tagged GFP 提交 2020-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 H
16–207（192 aa）
链 I
16–207（192 aa）
链 J
16–207（192 aa）
链 K
16–207（192 aa）
链 L
16–207（192 aa）
链 M
16–207（192 aa）
链 N
16–207（192 aa）
链 h
16–207（192 aa）
链 i
16–207（192 aa）
链 j
16–207（192 aa）
链 k
16–207（192 aa）
链 l
16–207（192 aa）
链 m
16–207（192 aa）
链 n
16–207（192 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.88 Å |
| 6WRF ClpX-ClpP complex bound to GFP-ssrA, recognition complex 提交 2020-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 H
16–207（192 aa）
链 I
16–207（192 aa）
链 J
16–207（192 aa）
链 K
16–207（192 aa）
链 L
16–207（192 aa）
链 M
16–207（192 aa）
链 N
16–207（192 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 6WSG ClpX-ClpP complex bound to ssrA-tagged GFP, intermediate complex 提交 2020-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 H
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 I
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 J
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 K
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 L
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 M
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 N
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 7MK5 Crystal structure of Escherichia coli ClpP covalently inhibited by clipibicyclene 提交 2021-04-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
15–207（193 aa）
链 B
15–207（193 aa）
链 C
15–207（193 aa）
链 D
15–207（193 aa）
链 E
15–207（193 aa）
链 F
15–207（193 aa）
链 G
15–207（193 aa）
链 H
15–207（193 aa）
链 I
15–207（193 aa）
链 J
15–207（193 aa）
链 K
15–207（193 aa）
链 L
15–207（193 aa）
链 M
15–207（193 aa）
链 N
15–207（193 aa）
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 25 ACT ACETATE ION × 6 ZGV 4-[(1E)-3-{[(2E,4E,6E,8S)-8-hydroxy-4-methyldeca-2,4,6-trienoyl]amino}-3-oxoprop-1-en-1-yl]azete-1(2H)-carboxylic acid × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M sodium acetate, 30% MPD
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.248 |
| 7MK5 Crystal structure of Escherichia coli ClpP covalently inhibited by clipibicyclene 提交 2021-04-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 O
15–207（193 aa）
链 P
15–207（193 aa）
链 Q
15–207（193 aa）
链 R
15–207（193 aa）
链 S
15–207（193 aa）
链 T
15–207（193 aa）
链 U
15–207（193 aa）
链 V
15–207（193 aa）
链 W
15–207（193 aa）
链 X
15–207（193 aa）
链 Y
15–207（193 aa）
链 Z
15–207（193 aa）
链 a
15–207（193 aa）
链 b
15–207（193 aa）
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 25 ACT ACETATE ION × 4 ZGV 4-[(1E)-3-{[(2E,4E,6E,8S)-8-hydroxy-4-methyldeca-2,4,6-trienoyl]amino}-3-oxoprop-1-en-1-yl]azete-1(2H)-carboxylic acid × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M sodium acetate, 30% MPD
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.248 |
| 8E7V Cryo-EM structure of substrate-free DNClpX.ClpP from singly capped particles 提交 2022-08-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 H
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 I
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 J
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 K
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 L
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 M
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 N
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 h
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 i
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 j
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 k
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 l
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 m
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 n
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8E8Q Cryo-EM structure of substrate-free DNClpX.ClpP 提交 2022-08-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 H
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 I
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 J
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 K
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 L
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 M
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 N
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 h
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 i
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 j
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 k
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 l
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 m
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 n
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 8E91 Cryo-EM structure of substrate-free ClpX.ClpP 提交 2022-08-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 H
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 I
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 J
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 K
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 L
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 M
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 N
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 h
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 i
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 j
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 k
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 l
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 m
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 n
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å |
| 8ET3 Cryo-EM structure of a delivery complex containing the SspB adaptor, an ssrA-tagged substrate, and the AAA+ ClpXP protease 提交 2022-10-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 H
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 I
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 J
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 K
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 L
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 M
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 N
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8V9R Cryo-EM Structure of a Proteolytic ClpXP AAA+ Machine Poised to Unfold a Branched-Degron DHFR-ssrA Substrate Bound with MTX 提交 2023-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 h
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 i
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 j
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 k
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 l
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 m
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 n
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 p
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 q
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 r
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 s
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 t
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 u
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 v
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MTX METHOTREXATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9C87 Cryo-EM Structure of a Proteolytic ClpXP AAA+ Machine Poised to Unfold a Linear-Degron DHFR-ssrA Substrate Bound with MTX 提交 2024-06-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 h
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 i
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 j
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 k
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 l
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 m
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 n
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 p
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 q
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 r
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 s
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 t
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 u
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 v
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MTX METHOTREXATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9C88 Cryo-EM Structure of a Proteolytic ClpXP AAA+ Machine Translocating a Portion of a Branched-Degron DHFR Substrate 提交 2024-06-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 h
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 i
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 j
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 k
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 l
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 m
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 n
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 p
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 q
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 r
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 s
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 t
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 u
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 v
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9PIO Cryo-EM structure of the ClpXP AAA+ protease bound to lambdaO-tagged Arc in a recognition complex 提交 2025-07-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 H
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 I
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 J
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 K
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 L
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 M
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 N
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 O
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 P
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 Q
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 R
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 S
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 T
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 U
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.61 Å |
| 9PJD Cryo-EM structure of the ClpXP AAA+ protease bound to an unidentified portion of lambdaO-tagged Arc substrate within a translocation complex 提交 2025-07-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 H
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 I
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 J
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 K
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 L
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 M
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 N
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 O
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 P
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 Q
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 R
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 S
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 T
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
链 U
16–207（192 aa）
片段：UNP residues 16-207
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 6 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å |