当前蛋白身份：P11940
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CVJ X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE POLY(A)-BINDING PROTEIN IN COMPLEX WITH POLYADENYLATE RNA 提交 1999-08-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–190（190 aa）
片段：RESIDUES 1-190
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；296.7 K；AMMONIUM SULFATE, TCEP, TRIS-HCL, POTASSIUM CHLORIDE, GLYCEROL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.7K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.304 |
| 1CVJ X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE POLY(A)-BINDING PROTEIN IN COMPLEX WITH POLYADENYLATE RNA 提交 1999-08-23 | Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–190（190 aa）
片段：RESIDUES 1-190
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；296.7 K；AMMONIUM SULFATE, TCEP, TRIS-HCL, POTASSIUM CHLORIDE, GLYCEROL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.7K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.304 |
| 1CVJ X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE POLY(A)-BINDING PROTEIN IN COMPLEX WITH POLYADENYLATE RNA 提交 1999-08-23 | Assembly 3 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–190（190 aa）
片段：RESIDUES 1-190
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；296.7 K；AMMONIUM SULFATE, TCEP, TRIS-HCL, POTASSIUM CHLORIDE, GLYCEROL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.7K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.304 |
| 1CVJ X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE POLY(A)-BINDING PROTEIN IN COMPLEX WITH POLYADENYLATE RNA 提交 1999-08-23 | Assembly 4 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–190（190 aa）
片段：RESIDUES 1-190
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；296.7 K；AMMONIUM SULFATE, TCEP, TRIS-HCL, POTASSIUM CHLORIDE, GLYCEROL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.7K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.304 |
| 1CVJ X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE POLY(A)-BINDING PROTEIN IN COMPLEX WITH POLYADENYLATE RNA 提交 1999-08-23 | Assembly 5 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 E
1–190（190 aa）
片段：RESIDUES 1-190
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；296.7 K；AMMONIUM SULFATE, TCEP, TRIS-HCL, POTASSIUM CHLORIDE, GLYCEROL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.7K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.304 |
| 1CVJ X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE POLY(A)-BINDING PROTEIN IN COMPLEX WITH POLYADENYLATE RNA 提交 1999-08-23 | Assembly 6 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–190（190 aa）
片段：RESIDUES 1-190
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；296.7 K；AMMONIUM SULFATE, TCEP, TRIS-HCL, POTASSIUM CHLORIDE, GLYCEROL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.7K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.304 |
| 1CVJ X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE POLY(A)-BINDING PROTEIN IN COMPLEX WITH POLYADENYLATE RNA 提交 1999-08-23 | Assembly 7 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–190（190 aa）
片段：RESIDUES 1-190
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；296.7 K；AMMONIUM SULFATE, TCEP, TRIS-HCL, POTASSIUM CHLORIDE, GLYCEROL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.7K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.304 |
| 1CVJ X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE POLY(A)-BINDING PROTEIN IN COMPLEX WITH POLYADENYLATE RNA 提交 1999-08-23 | Assembly 8 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 H
1–190（190 aa）
片段：RESIDUES 1-190
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；296.7 K；AMMONIUM SULFATE, TCEP, TRIS-HCL, POTASSIUM CHLORIDE, GLYCEROL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.7K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.304 |
| 1G9L SOLUTION STRUCTURE OF THE PABC DOMAIN OF HUMAN POLY(A) BINDING PROTEIN 提交 2000-11-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
498–636（139 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN (RESIDUES 498-636)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2；压力 ambient
NMR样品组成
3mM 15N-labeled PABC; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
3mM 15N,13C-labeled PABC; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 100% D2O
NMR样品组成
3mM unlabeled PABC; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1JGN Solution structure of the C-terminal PABC domain of human poly(A)-binding protein in complex with the peptide from Paip2 提交 2001-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
544–636（93 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1M NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
3mM 15N-labeled PABC; 4mM unlabeled peptide; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
3mM 15N,13C-labeled PABC; 4mM unlabeled peptide; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 100% D2O
NMR样品组成
2.5mM 15N-labeled peptide; 3mM unlabeled PABC; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2mM 15N,13C-labeled peptide; 3mM unlabeled PABC; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 100% D2O
NMR样品组成
3mM unlabeled PABC; 3mM unlabeled peptide; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
3mM unlabeled PABC; 3mM unlabeled peptide; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1JH4 Solution structure of the C-terminal PABC domain of human poly(A)-binding protein in complex with the peptide from Paip1 提交 2001-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
544–636（93 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1M NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
3mM 15N-labeled PABC; 3mM 15N-labeled peptide; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
3mM unlabeled PABC; 3mM unlabeled peptide; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
3mM unlabeled PABC; 3mM unlabeled peptide; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 100% D2O
NMR样品组成
3mM unlabeled PABC; 3mM N15-labeled peptide; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 1mM NaN3; pH 6.3 | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2K8G Solution structure of RRM2 domain of PABP1 提交 2008-09-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
90–182（93 aa）
片段：RRM2 domain (UNP residues 90-182)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.1；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.04；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] PABP1, 20 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-98% 15N] PABP1, 20 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM PABP1, 20 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2RQG Structure of GSPT1/ERF3A-PABC 提交 2009-05-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
541–623（83 aa）
片段：PABC DOMAIN
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15M；压力 AMBIENT
NMR样品组成
1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] G1 TO S PHASE TRANSITION 1-1, 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] POLYADENYLATE-BINDING PROTEIN 1-2, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2RQH Structure of GSPT1/ERF3A-PABC 提交 2009-05-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
541–623（83 aa）
片段：PABC DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15M；压力 AMBIENT
NMR样品组成
1 mM G1 TO S PHASE TRANSITION 1-1, 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] POLYADENYLATE-BINDING PROTEIN 1-2, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2X04 Crystal structure of the PABC-TNRC6C complex 提交 2009-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
456–530（75 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN (PABC), RESIDUES 456-530
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；0.1 M NA-ACETATE PH 4.6, 200 MM AMMONIUM SULFATE, 30% (W/V) PEG 4000
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.186 |
| 2X04 Crystal structure of the PABC-TNRC6C complex 提交 2009-12-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
456–530（75 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN (PABC), RESIDUES 456-530
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；0.1 M NA-ACETATE PH 4.6, 200 MM AMMONIUM SULFATE, 30% (W/V) PEG 4000
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.186 |
| 3KTP Structural basis of GW182 recognition by poly(A)-binding protein 提交 2009-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
544–626（83 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.231 |
| 3KTR Structural basis of ataxin-2 recognition by poly(A)-binding protein 提交 2009-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
544–626（83 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | CD CADMIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.2 M CdCl2, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.245 |
| 3KUI Crystal structure of C-terminal domain of PABPC1 in complex with binding region of eRF3a 提交 2009-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
544–626（83 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；2.1M ammonium sulfate, 0.2M sodium sulfate, 10mM zinc chloride, 0.1M sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.255 |
| 3KUJ Crystal structure of C-terminal domain of PABPC1 in complex with binding region of eRF3a 提交 2009-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
544–626（83 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；295 K；1.4M ammonium sulfate, 0.1M citric acid, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.223 |
| 3KUR Crystal structure of the MLLE domain of poly(A)-binding protein 提交 2009-11-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
544–617（74 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.3M ammonium sulfate, 0.5M lithium sulfate, 5% glycerol, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.272 |
| 3KUR Crystal structure of the MLLE domain of poly(A)-binding protein 提交 2009-11-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
544–617（74 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.3M ammonium sulfate, 0.5M lithium sulfate, 5% glycerol, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.272 |
| 3KUR Crystal structure of the MLLE domain of poly(A)-binding protein 提交 2009-11-27 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
544–617（74 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.3M ammonium sulfate, 0.5M lithium sulfate, 5% glycerol, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.272 |
| 3KUR Crystal structure of the MLLE domain of poly(A)-binding protein 提交 2009-11-27 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
544–617（74 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.3M ammonium sulfate, 0.5M lithium sulfate, 5% glycerol, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.272 |
| 3KUR Crystal structure of the MLLE domain of poly(A)-binding protein 提交 2009-11-27 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
544–617（74 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.3M ammonium sulfate, 0.5M lithium sulfate, 5% glycerol, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.272 |
| 3KUR Crystal structure of the MLLE domain of poly(A)-binding protein 提交 2009-11-27 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
544–617（74 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.3M ammonium sulfate, 0.5M lithium sulfate, 5% glycerol, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.272 |
| 3KUR Crystal structure of the MLLE domain of poly(A)-binding protein 提交 2009-11-27 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
544–617（74 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.3M ammonium sulfate, 0.5M lithium sulfate, 5% glycerol, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.272 |
| 3KUR Crystal structure of the MLLE domain of poly(A)-binding protein 提交 2009-11-27 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
544–617（74 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.3M ammonium sulfate, 0.5M lithium sulfate, 5% glycerol, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.272 |
| 3KUS Crystal structure of the MLLE domain of poly(A)-binding protein in complex with the binding region of Paip2 提交 2009-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
544–626（83 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；2.3M ammonium sulfate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.205 |
| 3KUS Crystal structure of the MLLE domain of poly(A)-binding protein in complex with the binding region of Paip2 提交 2009-11-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
544–626（83 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；2.3M ammonium sulfate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.205 |
| 3KUT Crystal structure of the MLLE domain of poly(A)-binding protein in complex with the binding region of Paip2 提交 2009-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
544–626（83 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；2.25M ammonium sulfate, 0.2M KBr, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.201 |
| 3KUT Crystal structure of the MLLE domain of poly(A)-binding protein in complex with the binding region of Paip2 提交 2009-11-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
544–626（83 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；2.25M ammonium sulfate, 0.2M KBr, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.201 |
| 3PKN Crystal structure of MLLE domain of poly(A) binding protein in complex with PAM2 motif of La-related protein 4 (LARP4) 提交 2010-11-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
544–626（83 aa）
片段：MLLE domain (UNP residues 544-626)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 IOD IODIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.25 M potassium iodide, 1.9 M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.269 |
| 3PKN Crystal structure of MLLE domain of poly(A) binding protein in complex with PAM2 motif of La-related protein 4 (LARP4) 提交 2010-11-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
544–626（83 aa）
片段：MLLE domain (UNP residues 544-626)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 IOD IODIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.25 M potassium iodide, 1.9 M ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.269 |
| 3PTH The PABC1 MLLE domain bound to the variant PAM2 motif of LARP4B 提交 2010-12-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
543–621（79 aa）
片段：UNP residues 543-621
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；289 K；2 ul protein solution at 43 mg/ml containing the 1.5 fold molar amount of peptide ligand was mixed with 2ul reservoir solution containing 1.5M magnesium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.218 |
| 4F02 Crystal structure of the PABP-binding site of eIF4G in complex with RRM1-2 of PABP and poly(A) 提交 2012-05-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–190（190 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；0.03 M Tris, 1.3 M (NH4)2SO4, 5% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.230 |
| 4F02 Crystal structure of the PABP-binding site of eIF4G in complex with RRM1-2 of PABP and poly(A) 提交 2012-05-03 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–190（190 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；0.03 M Tris, 1.3 M (NH4)2SO4, 5% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.230 |
| 4F25 Crystal structure of the second RRM domain of human PABPC1 at pH 6.0 提交 2012-05-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
99–199（101 aa）
片段：RRM2 domain (un residues 99-119)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；25% PEG 1500 and 0.1 M MIB buffer, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.269 |
| 4F26 Crystal structure of the second RRM domain of human PABPC1 a pH 9.0 提交 2012-05-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
99–199（101 aa）
片段：RRM2 domain (un residues 99-119)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；294 K；25% PEG 1500 and 0.1 M MMT buffer , pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.286 |
| 5DX1 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
449–466（18 aa）
片段：UNP residues 449-466
链 G
449–466（18 aa）
片段：UNP residues 449-466
|
突变：Nterminal biotin and aminohexanoic acid, methylated R460 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Nterminal biotin and aminohexanoic acid, methylated R460 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.238 |
| 5DX1 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 H
449–466（18 aa）
片段：UNP residues 449-466
链 I
449–466（18 aa）
片段：UNP residues 449-466
|
突变：Nterminal biotin and aminohexanoic acid, methylated R460 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Nterminal biotin and aminohexanoic acid, methylated R460 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.238 |
| 5DX8 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
449–466（18 aa）
片段：UNP residues 449-466
链 F
449–466（18 aa）
片段：UNP residues 449-466
|
突变：Nterminal biotin and aminohexanoic acid, methylated R455 and R460 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Nterminal biotin and aminohexanoic acid, methylated R455 and R460 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SFG SINEFUNGIN × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.246 |
| 5DX8 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
449–466（18 aa）
片段：UNP residues 449-466
链 H
449–466（18 aa）
片段：UNP residues 449-466
|
突变：Nterminal biotin and aminohexanoic acid, methylated R455 and R460 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Nterminal biotin and aminohexanoic acid, methylated R455 and R460 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SFG SINEFUNGIN × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.246 |
| 5DXA Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R460) 提交 2015-09-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
449–466（18 aa）
片段：UNP residues 449-466
链 G
449–466（18 aa）
片段：UNP residues 449-466
|
突变：Nterminal biotin and aminohexanoic acid, methylated R460, asymmetrically dimethylated R455 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Nterminal biotin and aminohexanoic acid, methylated R460, asymmetrically dimethylated R455 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.244 |
| 5DXA Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R460) 提交 2015-09-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
449–466（18 aa）
片段：UNP residues 449-466
|
突变：Nterminal biotin and aminohexanoic acid, methylated R460, asymmetrically dimethylated R455 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.244 |
| 5LGQ Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P2C3s 提交 2016-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
456–466（11 aa）
链 F
456–466（11 aa）
链 G
456–466（11 aa）
链 H
456–466（11 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 8ZB (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-propyl-oxolane-3,4-diol × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5
14% PEG 3350
200 mM A.S.
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.236 |
| 5LGR Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P1C3u 提交 2016-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
447–458（12 aa）
链 F
447–458（12 aa）
链 G
447–458（12 aa）
链 H
447–458（12 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 LPD L-PROLINAMIDE × 4 ACE ACETYL GROUP × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；Tris-HCl pH 8.5 100 mM
PEG 3350 14 %
Ammonium Sulfate 200 mM
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 5LGS Crystal structure of mouse CARM1 in complex with ligand P2C3u 提交 2016-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
456–464（9 aa）
链 F
456–464（9 aa）
链 G
456–464（9 aa）
链 H
456–464（9 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris-HCl pH 8.5 100 mM
PEG 3350 20 %
A.S. 200 mM
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.215 |
| 7BN3 Crystal structure of C-terminal domain of PABPC1 in complex with Nucleoprotein from Human Coronavirus 229E 提交 2021-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
455–537（83 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES sodium salt pH-6.5, 1.8 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.228 |
| 7BN3 Crystal structure of C-terminal domain of PABPC1 in complex with Nucleoprotein from Human Coronavirus 229E 提交 2021-01-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
455–537（83 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES sodium salt pH-6.5, 1.8 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.228 |
| 7BN3 Crystal structure of C-terminal domain of PABPC1 in complex with Nucleoprotein from Human Coronavirus 229E 提交 2021-01-21 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
455–537（83 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES sodium salt pH-6.5, 1.8 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.228 |
| 8SMO Crystal structure of the complex between truncated MLLE domain of PABPC1 and engineered superPAM2 peptide 提交 2023-04-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
556–626（71 aa）
片段：MLLE domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M citric acid pH 4.0, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 8SMO Crystal structure of the complex between truncated MLLE domain of PABPC1 and engineered superPAM2 peptide 提交 2023-04-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
556–626（71 aa）
片段：MLLE domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M citric acid pH 4.0, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 8SMO Crystal structure of the complex between truncated MLLE domain of PABPC1 and engineered superPAM2 peptide 提交 2023-04-26 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
556–626（71 aa）
片段：MLLE domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M citric acid pH 4.0, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 8SMO Crystal structure of the complex between truncated MLLE domain of PABPC1 and engineered superPAM2 peptide 提交 2023-04-26 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
556–626（71 aa）
片段：MLLE domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M citric acid pH 4.0, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 8SMO Crystal structure of the complex between truncated MLLE domain of PABPC1 and engineered superPAM2 peptide 提交 2023-04-26 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
556–626（71 aa）
片段：MLLE domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M citric acid pH 4.0, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 8SMO Crystal structure of the complex between truncated MLLE domain of PABPC1 and engineered superPAM2 peptide 提交 2023-04-26 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
556–626（71 aa）
片段：MLLE domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M citric acid pH 4.0, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 8SMO Crystal structure of the complex between truncated MLLE domain of PABPC1 and engineered superPAM2 peptide 提交 2023-04-26 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
556–626（71 aa）
片段：MLLE domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M citric acid pH 4.0, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 8SMO Crystal structure of the complex between truncated MLLE domain of PABPC1 and engineered superPAM2 peptide 提交 2023-04-26 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 O
556–626（71 aa）
片段：MLLE domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M citric acid pH 4.0, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |