当前蛋白身份：P13123
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AZP HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D BOUND WITH KINKED DNA DUPLEX 提交 1997-11-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–65（65 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 1AZQ HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D BOUND WITH KINKED DNA DUPLEX 提交 1997-11-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–65（65 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.238 |
| 1BF4 CHROMOSOMAL DNA-BINDING PROTEIN SSO7D/D(GCGAACGC) COMPLEX 提交 1998-05-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–63（63 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.288 |
| 1CA5 INTERCALATION SITE OF HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SSO7D/SAC7D BOUND TO DNA 提交 1999-02-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–65（65 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 1CA6 INTERCALATION SITE OF HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SSO7D/SAC7D BOUND TO DNA 提交 1999-02-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–65（65 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.257 |
| 1SAP HYPERTHERMOPHILE PROTEIN, RELAXATION MATRIX REFINEMENT STRUCTURE 提交 1995-04-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–65（65 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1WD0 Crystal structures of the hyperthermophilic chromosomal protein Sac7d in complex with DNA decamers 提交 2004-05-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
0–65（66 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；Tris-HCl, PEG400, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.257 |
| 1WD1 Crystal structures of the hyperthermophilic chromosomal protein Sac7d in complex with DNA decamers 提交 2004-05-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
0–65（66 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；potassium phosphate, PEG8000, pH 4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.290 |
| 1WTO Hyperthermophile chromosomal protein SAC7D double mutant V26F/M29F in complex with DNA GCGATCGC 提交 2004-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
0–65（66 aa）
|
突变：V26F/M29F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG 400, Tris buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.231 |
| 1WTP Hyperthermophile chromosomal protein SAC7D single mutant M29F in complex with DNA GCGA(UBr)CGC 提交 2004-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
0–65（66 aa）
链 B
0–65（66 aa）
|
突变：M29F 突变：M29F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG 400, Tris buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.287 |
| 1WTQ Hyperthermophile chromosomal protein SAC7D single mutant M29F in complex with DNA GTAATTAC 提交 2004-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
0–65（66 aa）
|
突变：M29F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG 400, Tris buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.225 |
| 1WTR Hyperthermophile chromosomal protein SAC7D single mutant M29A in complex with DNA GCGATCGC 提交 2004-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
0–65（66 aa）
|
突变：M29A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG 400, Tris buffer , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.274 |
| 1WTV Hyperthermophile chromosomal protein SAC7D single mutant M29A in complex with DNA GTAATTAC 提交 2004-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
0–65（66 aa）
|
突变：M29A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG 400, Tris buffer , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.238 |
| 1WTW Hyperthermophile chromosomal protein SAC7D single mutant V26A in complex with DNA GCGATCGC 提交 2004-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
0–65（66 aa）
|
突变：V26A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG 400, Tris buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.286 |
| 1WTX Hyperthermophile chromosomal protein SAC7D single mutant V26A in complex with DNA GTAATTAC 提交 2004-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
0–65（66 aa）
|
突变：V26A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG 400, Tris buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.253 |
| 1WVL Crystal Structure of Multimeric DNA-binding Protein Sac7d-GCN4 with DNA decamer 提交 2004-12-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 未唯一映射
参考区间未声明
链 A
0–65（66 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1.6M Tri-Sodium Citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.269 |
| 1XX8 NMR Structure of the W24A Mutant of the Hyperthermophile Sac7d Protein 提交 2004-11-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
0–65（66 aa）
|
突变：W24A | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.5；303 K；压力 ambient
NMR样品组成
5 mM Sac7d, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1XYI Hyperthermophile chromosomal protein Sac7d double mutant Val26Ala/Met29Ala in complex with DNA GCGATCGC 提交 2004-11-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
0–65（66 aa）
|
突变：V26A, M29A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；Tris, PEG400, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.255 |
| 2XIW Crystal structure of the Sac7d-derived IgG1-binder C3-C24S 提交 2010-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–66（65 aa）
链 B
2–66（65 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
3.5 M (NH4)2SO4
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.191 |
| 8CMN 18mer DNA mimic Foldamer with an aliphatic linker in complex with Sac7d wild protein 提交 2023-02-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：monomeric（1） 待复核 |
链 AA
1–66（66 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；10% PEG 400, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.297 |
| 8Q2M 18mer DNA mimic Foldamer with an Aliphatic linker in complex with Sac7d V26A/M29A protein 提交 2023-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 AA
1–66（66 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；9 % PEG 400, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.335 |
| 8QPC 18mer DNA mimic Foldamer with an Aromatic linker in complex with Sac7d V26A/M29A protein 提交 2023-10-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：monomeric（1） 待复核 |
链 AA
1–66（66 aa）
|
突变：V26A/M29A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；10 % PEG 400, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 3.24 Å R-free 0.348 |
| 9HIZ Complex of the Nanofitin Sac7d-C3(C24A) with a human IgG1 Fc fragment 提交 2024-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 R
2–66（65 aa）
链 S
2–66（65 aa）
链 T
2–66（65 aa）
链 U
2–66（65 aa）
|
突变：K7L,Y8L,K9N,K21R,K22D,W24A,V26Q,M29N,S31K,T33L,D35N,T40Y,R42A,A44N,S46D 突变：K7L,Y8L,K9N,K21R,K22D,W24A,V26Q,M29N,S31K,T33L,D35N,T40Y,R42A,A44N,S46D 突变：K7L,Y8L,K9N,K21R,K22D,W24A,V26Q,M29N,S31K,T33L,D35N,T40Y,R42A,A44N,S46D 突变：K7L,Y8L,K9N,K21R,K22D,W24A,V26Q,M29N,S31K,T33L,D35N,T40Y,R42A,A44N,S46D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；24 % (w/v) PEG8000, 0.1 M Tris/HCl pH 8.5
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.279 |
| 9QT7 Crystal structure of affitin C10 fused to a coiled-coil domain in complex with a quinoline oligoamide foldamer 提交 2025-04-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–65（64 aa）
链 B
2–65（64 aa）
链 C
2–65（64 aa）
链 D
2–65（64 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG 400
0.1M Sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.296 |
| 9QT7 Crystal structure of affitin C10 fused to a coiled-coil domain in complex with a quinoline oligoamide foldamer 提交 2025-04-08 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–65（64 aa）
链 D
2–65（64 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG 400
0.1M Sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.296 |
| 9QT7 Crystal structure of affitin C10 fused to a coiled-coil domain in complex with a quinoline oligoamide foldamer 提交 2025-04-08 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–65（64 aa）
链 C
2–65（64 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG 400
0.1M Sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.296 |