当前蛋白身份:P20290 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
28LN XBP1u-stalled RPL4 RNC in complex with NAC 提交 2026-02-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 Bv 1–206(206 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å
3LKX Human nac dimerization domain 提交 2010-01-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 97–162(66 aa) 片段:UNP residues 97-162
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;285 K;PEG 6000, Sodium citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
分辨率 2.50 Å R-free 0.253
3MCB Crystal structure of NAC domains of human nascent polypeptide-associated complex (NAC) 提交 2010-03-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 97–154(58 aa) 片段:NAC domain (UNP RESIDUES 97-154)
未记录 IOD IODIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;289 K;0.1M sodium citrate (pH 5.6), 0.1 M NaCl, 12% (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
分辨率 1.90 Å R-free 0.247
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:52-meric(52) 与全部聚合物一致
链 u 1–162(162 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 45 PDB 声明:48-meric(48) 与全部聚合物一致
链 u 1–162(162 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 83 PDB 声明:89-meric(89) 与全部聚合物一致
链 Cu 45–206(162 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 84 PDB 声明:90-meric(90) 与全部聚合物一致
链 Cu 45–206(162 aa)
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 85 PDB 声明:91-meric(91) 与全部聚合物一致
链 Cu 1–162(162 aa)
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9FQ0 Human NatA-NAC-MAP1 80S ribosome complex 提交 2024-06-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 D 1–206(206 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.67 Å
9I2D NMT1-NAC bound human RNC with 10 amino acid ARF1-linker 提交 2025-01-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric(88) 与全部聚合物一致
链 NB 1–162(162 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 191 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I2E NMT1-NAC bound human ribosome (combined translational states) 提交 2025-01-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 NB 1–162(162 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 256 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 EF 45–206(162 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致
链 EF 1–162(162 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9P6Z In situ human P-Z state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
9P72 In situ human P-E state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9P73 In situ human eEF2-A/P-P/E state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
9P76 In situ human eEF1A-A/T-P state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9P78 In situ human Hibernating rotate 3 with E-site tRNA state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9P79 In situ human Hibernating rotate3 with Z site tRNA state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9P7A In situ human hibernating class2 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
9P7C In situ human Hibernating class3 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9P7D In situ human Hibernating class4 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.57 Å
9P7E In situ human Hibernating class5 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 CI 1–206(206 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.59 Å
9P7F In situ HHT and CHX treated A-P state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9P7G In situ HHT and CHX treated A-P-Z state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9P7H In situ HHT and CHX treated human eEF1A-A/T-P state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
9P7I In situ HHT and CHX treated human eEF1A-A/T-P-Z state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
9P7J In situ HHT and CHX treated human P state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:83-meric(83) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
9P7K In situ human post eEF1A-A/T-P-E state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9P7L In situ human Post-eEF1A-AT-P state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
9P7N In situ human Post-eEF1A-A/T-P-Z state 80S ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9P7O In situ human AT-P-Z state ribosome 提交 2025-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9P7W In situ human A-P state 80S ribosome 提交 2025-06-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
9P7X In situ human A-P-Z state 80S ribosome 提交 2025-06-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9P7Y In situ human A-P-E state 80S ribosome 提交 2025-06-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
9P8B In situ human eEF1A-A/T-P-E state 80S ribosome 提交 2025-06-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
9P8C In situ human Hibernating class1 (rotate3) without E tRNA state 80S ribosome 提交 2025-06-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
9P8H In situ human A/P-P/E state 80S ribosome 提交 2025-06-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
9P8I In situ HHT and CHX treated human P-Z state 80S ribosome 提交 2025-06-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.89 Å
9P9H In situ human unrotated hibernating with CCDC124 state 80S ribosome 提交 2025-06-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.84 Å
9P9I In situ human unrotated hibernating without CCDC124 state 80S ribosome 提交 2025-06-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
9PA7 In situ human 80S consensus ribosome with EBP1 提交 2025-06-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 225 SPM SPERMINE × 8 SPD SPERMIDINE × 12 K POTASSIUM ION × 75 ZN ZINC ION × 7 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.67 Å
9PBE In situ human 80S ribosome (composite map) 提交 2025-06-26 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 225 SPM SPERMINE × 8 SPD SPERMIDINE × 12 K POTASSIUM ION × 75 ZN ZINC ION × 7 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9PKG In situ human P state 80S ribosome 提交 2025-07-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:83-meric(83) 与全部聚合物一致
链 CI 49–79(31 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
9QLO NMT1-NAC bound human RNC with full length ARF1 - State 1 提交 2025-03-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric(88) 与全部聚合物一致
链 NB 1–162(162 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 191 G3D GUANOSINE-3'-MONOPHOSPHATE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.47 Å
9QLP NMT1-NAC bound human RNC with full length ARF1 - State 2 提交 2025-03-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric(88) 与全部聚合物一致
链 NB 1–162(162 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 191 G3D GUANOSINE-3'-MONOPHOSPHATE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
9QLQ NMT1-NAC bound human RNC with full length ARF1 - alternative State 提交 2025-03-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric(88) 与全部聚合物一致
链 NB 1–162(162 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 191 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.57 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 Nu 1–162(162 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 84 PDB 声明:89-meric(89) 与全部聚合物一致
链 Nu 1–162(162 aa)
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9S3B NMT1-NAC bound human RNC with 58 amino acid ARF1-linker - State 1 提交 2025-07-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric(88) 与全部聚合物一致
链 NB 1–162(162 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 191 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9S3C NMT1-NAC bound human RNC with 58 amino acid ARF1-linker - State 2 提交 2025-07-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric(88) 与全部聚合物一致
链 NB 1–162(162 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 191 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.42 Å
9S3D NAC bound human RNC with 58 amino acid ARF1-linker 提交 2025-07-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致
链 NB 1–162(162 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 191 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.32 Å
9SYR Human quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatD 提交 2025-10-13 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 Nb 1–162(162 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 COA COENZYME A × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.55 Å