当前蛋白身份：P33297
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3JCO Structure of yeast 26S proteasome in M1 state derived from Titan dataset 提交 2016-01-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
50mM Tris pH 7.5, 100mM NaCl, 5mM MgCl2, 2mM ATP；pH 7.5；50mM Tris pH 7.5, 100mM NaCl, 5mM MgCl2, 2mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 3JCP Structure of yeast 26S proteasome in M2 state derived from Titan dataset 提交 2016-01-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
50mM Tris pH 7.5, 100mM NaCl, 5mM MgCl2, 2mM ATP；pH 7.5；50mM Tris pH 7.5, 100mM NaCl, 5mM MgCl2, 2mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 3WHK Crystal structure of PAN-Rpt5C chimera 提交 2013-08-26 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
356–434（79 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；8% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH6.0), 0.1M magnesium formate, 3mM CHAPSO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 3WHK Crystal structure of PAN-Rpt5C chimera 提交 2013-08-26 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
356–434（79 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；8% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH6.0), 0.1M magnesium formate, 3mM CHAPSO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 3WHK Crystal structure of PAN-Rpt5C chimera 提交 2013-08-26 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
356–434（79 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；8% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH6.0), 0.1M magnesium formate, 3mM CHAPSO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 3WHK Crystal structure of PAN-Rpt5C chimera 提交 2013-08-26 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
356–434（79 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；8% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH6.0), 0.1M magnesium formate, 3mM CHAPSO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 3WHK Crystal structure of PAN-Rpt5C chimera 提交 2013-08-26 | Assembly 5 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
356–434（79 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；8% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH6.0), 0.1M magnesium formate, 3mM CHAPSO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 3WHK Crystal structure of PAN-Rpt5C chimera 提交 2013-08-26 | Assembly 6 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
356–434（79 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；8% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH6.0), 0.1M magnesium formate, 3mM CHAPSO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 3WHK Crystal structure of PAN-Rpt5C chimera 提交 2013-08-26 | Assembly 7 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
356–434（79 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；8% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH6.0), 0.1M magnesium formate, 3mM CHAPSO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 3WHK Crystal structure of PAN-Rpt5C chimera 提交 2013-08-26 | Assembly 8 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
356–434（79 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；8% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH6.0), 0.1M magnesium formate, 3mM CHAPSO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 3WHL Crystal structure of Nas2 N-terminal domain complexed with PAN-Rpt5C chimera 提交 2013-08-26 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
356–434（79 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；8% PEG 6000, 0.1M MES (pH6.0), 80mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.285 |
| 3WHL Crystal structure of Nas2 N-terminal domain complexed with PAN-Rpt5C chimera 提交 2013-08-26 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
356–434（79 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；8% PEG 6000, 0.1M MES (pH6.0), 80mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.285 |
| 3WHL Crystal structure of Nas2 N-terminal domain complexed with PAN-Rpt5C chimera 提交 2013-08-26 | Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
356–434（79 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；8% PEG 6000, 0.1M MES (pH6.0), 80mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.285 |
| 3WHL Crystal structure of Nas2 N-terminal domain complexed with PAN-Rpt5C chimera 提交 2013-08-26 | Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
356–434（79 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；8% PEG 6000, 0.1M MES (pH6.0), 80mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.285 |
| 4CR2 Deep classification of a large cryo-EM dataset defines the conformational landscape of the 26S proteasome 提交 2014-02-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric（33） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER,
|
分辨率 7.70 Å |
| 4CR3 Deep classification of a large cryo-EM dataset defines the conformational landscape of the 26S proteasome 提交 2014-02-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric（33） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER,
|
分辨率 9.30 Å |
| 4CR4 Deep classification of a large cryo-EM dataset defines the conformational landscape of the 26S proteasome 提交 2014-02-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric（33） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER,
|
分辨率 8.80 Å |
| 5A5B Structure of the 26S proteasome-Ubp6 complex 提交 2015-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric（35） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER,
|
分辨率 9.50 Å |
| 5MP9 26S proteasome in presence of ATP (s1) 提交 2016-12-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric（34） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 5MPA 26S proteasome in presence of ATP (s2) 提交 2016-12-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric（34） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 5MPB 26S proteasome in presence of AMP-PNP (s3) 提交 2016-12-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.80 Å |
| 5MPC 26S proteasome in presence of BeFx (s4) 提交 2016-12-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 5WVI The resting state of yeast proteasome 提交 2016-12-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.30 Å |
| 5WVK Yeast proteasome-ADP-AlFx 提交 2016-12-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6EF0 Yeast 26S proteasome bound to ubiquitinated substrate (1D* motor state) 提交 2018-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 M
176–433（258 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；specimens were manually blotted with Whatman #1 filter paper
|
分辨率 4.43 Å |
| 6EF1 Yeast 26S proteasome bound to ubiquitinated substrate (5D motor state) 提交 2018-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 M
173–434（262 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；specimens were manually blotted with Whatman #1 filter paper
|
分辨率 4.73 Å |
| 6EF2 Yeast 26S proteasome bound to ubiquitinated substrate (5T motor state) 提交 2018-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 M
165–434（270 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；specimens were manually blotted with Whatman #1 filter paper
|
分辨率 4.27 Å |
| 6EF3 Yeast 26S proteasome bound to ubiquitinated substrate (4D motor state) 提交 2018-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；specimens were manually blotted with Whatman #1 filter paper
|
分辨率 4.17 Å |
| 6FVT 26S proteasome, s1 state 提交 2018-03-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
14–434（421 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6FVU 26S proteasome, s2 state 提交 2018-03-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
14–434（421 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6FVV 26S proteasome, s3 state 提交 2018-03-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
14–434（421 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 5.40 Å |
| 6FVW 26S proteasome, s4 state 提交 2018-03-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
14–434（421 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6FVX 26S proteasome, s5 state 提交 2018-03-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
14–434（421 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.90 Å |
| 6FVY 26S proteasome, s6 state 提交 2018-03-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
14–434（421 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 6J2C Yeast proteasome in translocation competent state (C3-a) 提交 2019-01-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6J2N yeast proteasome in substrate-processing state (C3-b) 提交 2019-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.50 Å |
| 6J2Q Yeast proteasome in Ub-accepted state (C1-b) 提交 2019-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6J2X Yeast proteasome in resting state (C1-a) 提交 2019-01-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6J30 yeast proteasome in Ub-engaged state (C2) 提交 2019-01-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7QO5 26S proteasome Rpt1-RK -Ubp6-UbVS complex in the si state 提交 2021-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric（49） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.00 Å |
| 9CGC Yeast 26S proteasome non-substrate-engaged (S1 state) 提交 2024-06-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：39-meric（39） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ZN ZINC ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 mM HEPES pH7.4, 25 mM NaCl, 25 mM KCl, 3% (v/v) glycerol, 5 mM MgCl2
2 mM ATP and 0.5 mM TCEP, 0.02% NP-40.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.61 Å |
| 9IWR 26S proteasome trimer 提交 2024-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：47-meric（47） 与蛋白数一致 |
链 M
1–434（434 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；YPD buffer
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 9.10 Å |