当前蛋白身份：P40460
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5TCS Crystal structure of a Dwarf Ndc80 Tetramer 提交 2016-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
114–318（205 aa）
链 A
621–689（69 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；1.2 magnesium sulfate, 0.1 M ME pH 6.0
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.266 |
| 5TD8 Crystal structure of an Extended Dwarf Ndc80 Complex 提交 2016-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
114–318（205 aa）
链 A
621–691（71 aa）
|
未记录 | HG MERCURY (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG 4,000, 0.1 M CHES, pH 9.0
|
分辨率 7.53 Å R-free 0.328 |
| 8G0Q Crystal structure of the yeast Ndc80:Nuf2 head region with a bound Dam1 segment 提交 2023-02-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
106–318（213 aa）
片段：residues 106-318,residues 621-691
链 A
621–691（71 aa）
片段：residues 106-318,residues 621-691
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；12% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M ADA buffer pH 6.8
|
分辨率 3.22 Å R-free 0.285 |
| 8G0Q Crystal structure of the yeast Ndc80:Nuf2 head region with a bound Dam1 segment 提交 2023-02-01 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
106–318（213 aa）
片段：residues 106-318,residues 621-691
链 C
621–691（71 aa）
片段：residues 106-318,residues 621-691
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；12% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M ADA buffer pH 6.8
|
分辨率 3.22 Å R-free 0.285 |
| 8Q84 Outer kinetochore Dam1 protomer dimer Ndc80-Nuf2 coiled-coil complex 提交 2023-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric（25） 与蛋白数一致 |
链 A
1–691（691 aa）
链 F
1–691（691 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 8Q85 Outer kinetochore Dam1 protomer monomer Ndc80-Nuf2 coiled-coil complex 提交 2023-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 F
1–691（691 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.97 Å |
| 8QAU Outer kinetochore Ndc80-Dam1 alpha/beta-tubulin complex 提交 2023-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–691（691 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 8V10 Structure of a Saccharomyces cerevisiae Mps1 peptide bound to dwarf Ndc80 Complex 提交 2023-11-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
114–318（205 aa）
链 A
621–691（71 aa）
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；291 K；13% polyethylene glycol 8000,
1M sodium chloride
100 mM PIPES pH 6.1
|
分辨率 3.02 Å R-free 0.271 |
| 8V11 Structure of a Saccharomyces cerevisiae Ipl1 peptide Bound to dwarf Ndc80 complex 提交 2023-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
114–318（205 aa）
链 A
621–684（64 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；15% polyethylene glycol 2000 monomethyl ether,500 mM sodium chloride,50 mM Tris pH 7.5
|
分辨率 3.95 Å R-free 0.327 |
| 8V11 Structure of a Saccharomyces cerevisiae Ipl1 peptide Bound to dwarf Ndc80 complex 提交 2023-11-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
114–318（205 aa）
链 E
621–684（64 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；15% polyethylene glycol 2000 monomethyl ether,500 mM sodium chloride,50 mM Tris pH 7.5
|
分辨率 3.95 Å R-free 0.327 |