当前蛋白身份：P49951
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B89 CLATHRIN HEAVY CHAIN PROXIMAL LEG SEGMENT (BOVINE) 提交 1999-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1074–1522（449 aa）
片段：PROXIMAL LEG
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；250 MM SODIUM FORMATE, 100 MM TRIS-HCL, PH 8, pH 8.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 1UTC Clathrin terminal domain complexed with TLPWDLWTT 提交 2003-12-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–363（363 aa）
片段：TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-363
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；VAPOUR DIFFUSION OVER A RESERVOIR CONTAINING 20% PEG8000, 200 MM MGCL2, 4 MM DTT,100 MM CAPS PH 9, DRIED UP DROP
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.253 |
| 1UTC Clathrin terminal domain complexed with TLPWDLWTT 提交 2003-12-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–363（363 aa）
片段：TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-363
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；VAPOUR DIFFUSION OVER A RESERVOIR CONTAINING 20% PEG8000, 200 MM MGCL2, 4 MM DTT,100 MM CAPS PH 9, DRIED UP DROP
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.253 |
| 1XI4 Clathrin D6 Coat 提交 2004-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 216 PDB 声明：216-MERIC（216） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 B
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 C
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 D
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 E
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 F
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 G
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 H
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 I
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25mM MES；pH 6.5；25mM MES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED
|
分辨率 7.90 Å |
| 1XI4 Clathrin D6 Coat 提交 2004-09-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 B
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 C
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 D
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 E
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 F
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 G
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 H
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 I
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25mM MES；pH 6.5；25mM MES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED
|
分辨率 7.90 Å |
| 1XI4 Clathrin D6 Coat 提交 2004-09-21 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 B
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 C
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 D
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 E
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 F
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 G
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 H
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 I
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25mM MES；pH 6.5；25mM MES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED
|
分辨率 7.90 Å |
| 1XI5 Clathrin D6 coat with auxilin J-domain 提交 2004-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 216 PDB 声明：216-MERIC（216） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 B
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 C
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 D
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 E
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 F
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 G
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 H
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 I
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM HEPES；pH 7；20MM HEPES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED
|
分辨率 12.00 Å |
| 1XI5 Clathrin D6 coat with auxilin J-domain 提交 2004-09-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 B
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 C
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 D
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 E
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 F
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 G
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 H
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 I
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM HEPES；pH 7；20MM HEPES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED
|
分辨率 12.00 Å |
| 1XI5 Clathrin D6 coat with auxilin J-domain 提交 2004-09-21 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 B
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 C
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 D
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 E
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 F
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 G
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 H
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
链 I
1–1630（1630 aa）
片段：residues 1-1630
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM HEPES；pH 7；20MM HEPES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED
|
分辨率 12.00 Å |
| 3GC3 Crystal Structure of Arrestin2S and Clathrin 提交 2009-02-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–363（363 aa）
片段：WD domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM bis_tris propane
4 -4.5 M ammonium acetate
4.5% ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.251 |
| 3GD1 Structure of an Arrestin/Clathrin complex reveals a novel clathrin binding domain that modulates receptor trafficking 提交 2009-02-23 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 I
1–363（363 aa）
片段：WD domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；293 K；100mM Bicine, 7% O-(2-aminopropyl)-O'-(2-methoxyethyl)polypropylene glycol 500, 6% polyethylene glycol 8000, 4% acetone, 1% ethylene glycol and 10 mM strontium chloride, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.254 |
| 3IYV Clathrin D6 coat as full-length Triskelions 提交 2010-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 216 PDB 声明：216-meric（216） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 B
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 C
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 D
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 E
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 F
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 G
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 H
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 I
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25MM MES；pH 6.5；25MM MES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED
|
分辨率 7.90 Å |
| 3IYV Clathrin D6 coat as full-length Triskelions 提交 2010-06-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 B
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 C
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 D
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 E
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 F
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 G
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 H
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 I
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25MM MES；pH 6.5；25MM MES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED
|
分辨率 7.90 Å |
| 3IYV Clathrin D6 coat as full-length Triskelions 提交 2010-06-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 B
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 C
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 D
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 E
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 F
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 G
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 H
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
链 I
1–1630（1630 aa）
片段：UNP residues 1-1630
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25MM MES；pH 6.5；25MM MES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED
|
分辨率 7.90 Å |
| 3LVG Crystal structure of a clathrin heavy chain and clathrin light chain complex 提交 2010-02-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1074–1675（602 aa）
链 B
1074–1675（602 aa）
链 C
1074–1675（602 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；200mM citrate, 16-22% glycerol, 2% trifluoroethanol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 7.94 Å R-free 0.425 |
| 3LVH Crystal structure of a clathrin heavy chain and clathrin light chain complex 提交 2010-02-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1074–1675（602 aa）
片段：Hub
链 B
1074–1675（602 aa）
片段：Hub
链 C
1074–1675（602 aa）
片段：Hub
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；200mM citrate, 16-22% glycerol, 2% trifluoroethanol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 9.00 Å R-free 0.487 |
| 3QIL Crystal structure analysis of the clathrin trimerization domain 提交 2011-01-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 B
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 C
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
|
突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaCl, Imidazole, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.92 Å R-free 0.386 |
| 3QIL Crystal structure analysis of the clathrin trimerization domain 提交 2011-01-27 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 E
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 F
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
|
突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaCl, Imidazole, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.92 Å R-free 0.386 |
| 3QIL Crystal structure analysis of the clathrin trimerization domain 提交 2011-01-27 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 G
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 H
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 I
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
|
突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaCl, Imidazole, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.92 Å R-free 0.386 |
| 3QIL Crystal structure analysis of the clathrin trimerization domain 提交 2011-01-27 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 J
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 K
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 L
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
|
突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaCl, Imidazole, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.92 Å R-free 0.386 |
| 3QIL Crystal structure analysis of the clathrin trimerization domain 提交 2011-01-27 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 M
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 N
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 O
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
|
突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaCl, Imidazole, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.92 Å R-free 0.386 |
| 3QIL Crystal structure analysis of the clathrin trimerization domain 提交 2011-01-27 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 Q
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 R
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
|
突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaCl, Imidazole, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.92 Å R-free 0.386 |
| 3QIL Crystal structure analysis of the clathrin trimerization domain 提交 2011-01-27 | Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 S
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 T
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 U
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
|
突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaCl, Imidazole, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.92 Å R-free 0.386 |
| 3QIL Crystal structure analysis of the clathrin trimerization domain 提交 2011-01-27 | Assembly 8 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 V
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 W
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
链 X
1521–1624（104 aa）
片段：CLATHRIN TRIMERIZATION DOMAIN
|
突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L 突变：C1528A, T1585L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaCl, Imidazole, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 3.92 Å R-free 0.386 |
| 5M5R Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to beta2 adaptin clathrin box motif 提交 2016-10-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–363（363 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；1 uL protein plus peptide mix (14 mg/mL NTD and 3.4 mM peptide) plus 2 uL reservoir equilibrated against a 200 uL reservoir of 0.94 M sodium malonate pH 6.7
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分辨率 1.76 Å R-free 0.205 |
| 5M5S Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to amphiphysin clathrin-box motif 提交 2016-10-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–363（363 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1 uL protein:peptide mix (14 mg/mL NTD and 3.4 mM peptide) plus 2 uL reservoir equilibrated against a 200 uL reservoir of 0.85 M sodium malonate pH 7.5
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分辨率 1.88 Å R-free 0.234 |
| 5M5S Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to amphiphysin clathrin-box motif 提交 2016-10-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–363（363 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1 uL protein:peptide mix (14 mg/mL NTD and 3.4 mM peptide) plus 2 uL reservoir equilibrated against a 200 uL reservoir of 0.85 M sodium malonate pH 7.5
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分辨率 1.88 Å R-free 0.234 |
| 5M5T Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to a non-natural clathrin-box motif peptide (Amph4T1) 提交 2016-10-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–363（363 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；1 uL protein:peptide mix (14 mg/mL NTD and 3.4 mM peptide) plus 1 uL reservoir equilibrated against a 200 uL reservoir of 1.1 M sodium malonate pH 8.0
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分辨率 1.70 Å R-free 0.185 |
| 5M5T Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to a non-natural clathrin-box motif peptide (Amph4T1) 提交 2016-10-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–363（363 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；1 uL protein:peptide mix (14 mg/mL NTD and 3.4 mM peptide) plus 1 uL reservoir equilibrated against a 200 uL reservoir of 1.1 M sodium malonate pH 8.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.185 |
| 5M5U Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to a clathrin-box motif from hepatitis D virus large antigen (clade 1) 提交 2016-10-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–363（363 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；400 nL protein:peptide mix (14 mg/mL NTD and 3.4 mM) plus 200 nL reservoir equilibrated against a 80 uL reservoir of 1.21 M sodium malonate pH 7.0
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分辨率 2.15 Å R-free 0.207 |
| 5M5U Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to a clathrin-box motif from hepatitis D virus large antigen (clade 1) 提交 2016-10-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–363（363 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；400 nL protein:peptide mix (14 mg/mL NTD and 3.4 mM) plus 200 nL reservoir equilibrated against a 80 uL reservoir of 1.21 M sodium malonate pH 7.0
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分辨率 2.15 Å R-free 0.207 |
| 5M5V Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to a clathrin-box motif from hepatitis D virus large antigen (clade 2) 提交 2016-10-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–363（363 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；200 nL protein:peptide (20 mg/mL NTD and 3.6 mM peptide) plus 400 nL reservoir equilibrated against a 80 uL reservoir of 1.75 M sodium malonate pH 7.0
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分辨率 1.96 Å R-free 0.193 |
| 5M5V Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to a clathrin-box motif from hepatitis D virus large antigen (clade 2) 提交 2016-10-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–363（363 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；200 nL protein:peptide (20 mg/mL NTD and 3.6 mM peptide) plus 400 nL reservoir equilibrated against a 80 uL reservoir of 1.75 M sodium malonate pH 7.0
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.193 |
| 5M61 Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to an extended amphiphysin clathrin-box motif 提交 2016-10-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–363（363 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；293 K；1 uL protein:peptide mix (14 mg/mL protein, 3.4 mM peptide) plus 2 uL of 1.04 M sodium malonate pH 7.1, 0.2 M sodium perchlorate equilibrated against a 200 uL reservoir of 1.15 M sodium malonate pH 7.1
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分辨率 1.84 Å R-free 0.182 |
| 5M61 Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to an extended amphiphysin clathrin-box motif 提交 2016-10-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–363（363 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；293 K；1 uL protein:peptide mix (14 mg/mL protein, 3.4 mM peptide) plus 2 uL of 1.04 M sodium malonate pH 7.1, 0.2 M sodium perchlorate equilibrated against a 200 uL reservoir of 1.15 M sodium malonate pH 7.1
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分辨率 1.84 Å R-free 0.182 |
| 6WCJ Asymmetric vertex of the clathrin minicoat cage 提交 2020-03-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1675（1675 aa）
链 C
1–1675（1675 aa）
链 D
1–1675（1675 aa）
链 G
1–1675（1675 aa）
链 H
1–1675（1675 aa）
链 I
1–1675（1675 aa）
链 K
1–1675（1675 aa）
链 L
1–1675（1675 aa）
链 M
1–1675（1675 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 6.30 Å |
| 9F8T Clathrin terminal domain complexed with C-terminus of AAK1L 提交 2024-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–363（363 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；20% PEG 3,350; 100 mM Bis-Tris propane, pH 6.0; 200 mM sodium citrate; 10 mM DTT
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分辨率 1.71 Å R-free 0.209 |