当前蛋白身份：P60881
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1JTH Crystal structure and biophysical properties of a complex between the N-terminal region of SNAP25 and the SNARE region of syntaxin 1a 提交 2001-08-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–82（82 aa）
片段：N-terminal SNARE motif
链 C
1–82（82 aa）
片段：N-terminal SNARE motif
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；ammonium sulfate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.289 |
| 1N7S High Resolution Structure of a Truncated Neuronal SNARE Complex 提交 2002-11-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
7–83（77 aa）
片段：SN1b
链 D
141–204（64 aa）
片段：SN2c
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；MPD, CaCl2, MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4.0K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.224 |
| 1SFC NEURONAL SYNAPTIC FUSION COMPLEX 提交 1998-08-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–83（83 aa）
片段：PROTEOLYTICALLY PROTECTED FRAGMENT
链 D
120–206（87 aa）
片段：PROTEOLYTICALLY PROTECTED FRAGMENT
|
未记录 | SR STRONTIUM ION × 6 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；35% MPD, 5% PEG350(MME), 25MM TRIS PH 7.0,. 70MM SRCL2, 250MM UREA, 7MM SARKOSYL
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.303 |
| 1SFC NEURONAL SYNAPTIC FUSION COMPLEX 提交 1998-08-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
1–83（83 aa）
片段：PROTEOLYTICALLY PROTECTED FRAGMENT
链 H
120–206（87 aa）
片段：PROTEOLYTICALLY PROTECTED FRAGMENT
|
未记录 | SR STRONTIUM ION × 5 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；35% MPD, 5% PEG350(MME), 25MM TRIS PH 7.0,. 70MM SRCL2, 250MM UREA, 7MM SARKOSYL
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.303 |
| 1SFC NEURONAL SYNAPTIC FUSION COMPLEX 提交 1998-08-24 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 K
1–83（83 aa）
片段：PROTEOLYTICALLY PROTECTED FRAGMENT
链 L
120–206（87 aa）
片段：PROTEOLYTICALLY PROTECTED FRAGMENT
|
未记录 | SR STRONTIUM ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；35% MPD, 5% PEG350(MME), 25MM TRIS PH 7.0,. 70MM SRCL2, 250MM UREA, 7MM SARKOSYL
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.303 |
| 3HD7 HELICAL EXTENSION OF THE NEURONAL SNARE COMPLEX INTO THE MEMBRANE, spacegroup C 1 2 1 提交 2009-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
7–83（77 aa）
片段：N-terminal fragment, UNP residues 7-83
链 D
141–204（64 aa）
片段：C-terminal fragment, UNP residues 141-204
|
未记录 | GGG glycylglycylglycine × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；29% PEG 400, 0.1M HEPES, 0.2M lithium sulfate, 0.1M sodium chloride, 0.03M glycylglycylglycine, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.271 |
| 3HD7 HELICAL EXTENSION OF THE NEURONAL SNARE COMPLEX INTO THE MEMBRANE, spacegroup C 1 2 1 提交 2009-05-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
7–83（77 aa）
片段：N-terminal fragment, UNP residues 7-83
链 H
141–204（64 aa）
片段：C-terminal fragment, UNP residues 141-204
|
未记录 | GGG glycylglycylglycine × 1 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；29% PEG 400, 0.1M HEPES, 0.2M lithium sulfate, 0.1M sodium chloride, 0.03M glycylglycylglycine, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.271 |
| 3IPD Helical extension of the neuronal SNARE complex into the membrane, spacegroup I 21 21 21 提交 2009-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
7–83（77 aa）
片段：N-terminal fragment, UNP Residues 7-83
链 D
141–204（64 aa）
片段：C-terminal fragment, UNP Residues 141-204
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；293 K；16% MPD, 0.1M TRIS, 0.05M MAGNESIUM CHLORIDE, 3% SORBITOL, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.80 Å R-free 0.332 |
| 3IPD Helical extension of the neuronal SNARE complex into the membrane, spacegroup I 21 21 21 提交 2009-08-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
7–83（77 aa）
片段：N-terminal fragment, UNP Residues 7-83
链 H
141–204（64 aa）
片段：C-terminal fragment, UNP Residues 141-204
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；293 K；16% MPD, 0.1M TRIS, 0.05M MAGNESIUM CHLORIDE, 3% SORBITOL, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.80 Å R-free 0.332 |
| 5CCG Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) 提交 2015-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 C
7–83（77 aa）
片段：UNP residues 7-83
链 D
141–204（64 aa）
片段：UNP residues 141-204
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.352 |
| 5CCG Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) 提交 2015-07-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
7–83（77 aa）
片段：UNP residues 7-83
链 J
141–204（64 aa）
片段：UNP residues 141-204
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.352 |
| 5CCH Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (short unit cell form) 提交 2015-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 C
7–83（77 aa）
片段：UNP residues 7-83
链 D
141–204（64 aa）
片段：UNP residues 141-204
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.289 |
| 5CCI Structure of the Mg2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (short unit cell form) 提交 2015-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 C
7–83（77 aa）
片段：UNP residues 7-83
链 D
141–204（64 aa）
片段：UNP residues 141-204
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.75% v/v PEG3350, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.323 |
| 5KJ7 Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) - from XFEL diffraction 提交 2016-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
9–83（75 aa）
片段：UNP residues 9-83
链 D
141–204（64 aa）
片段：UNP residues 141- 204
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.329 |
| 5KJ7 Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) - from XFEL diffraction 提交 2016-06-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
9–83（75 aa）
片段：UNP residues 9-83
链 J
141–204（64 aa）
片段：UNP residues 141- 204
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.329 |
| 5KJ8 Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) - from synchrotron diffraction 提交 2016-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
9–83（75 aa）
片段：UNP residues 9-83
链 D
141–204（64 aa）
片段：UNP residues 141-204
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.297 |
| 5KJ8 Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) - from synchrotron diffraction 提交 2016-06-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
9–83（75 aa）
片段：UNP residues 9-83
链 J
141–204（64 aa）
片段：UNP residues 141-204
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.297 |
| 5LOB Structure of the Ca2+-bound Rabphilin3A C2B- SNAP25 complex (C2 space group) 提交 2016-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 D
7–82（76 aa）
片段：N-terminal helix
链 E
141–203（63 aa）
片段：C-terminal helix
链 F
7–82（76 aa）
片段：N-terminal helix
链 G
141–203（63 aa）
片段：C-terminal helix
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；30% PEG3350
0.35 M Ammonium sulfate
0.1 M Tris pH 8.5
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.286 |
| 5LOW Structure of the Ca2+-bound Rabphilin 3A C2B domain SNAP25 complex (P21 space group) 提交 2016-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 D
7–82（76 aa）
链 E
141–203（63 aa）
链 F
7–82（76 aa）
链 G
141–203（63 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG3350
0.35 M Ammonium sulfate
0.1 M Tris (pH 8.5)
al's oil
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.269 |
| 5LOW Structure of the Ca2+-bound Rabphilin 3A C2B domain SNAP25 complex (P21 space group) 提交 2016-08-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 K
7–82（76 aa）
链 L
141–203（63 aa）
链 M
7–82（76 aa）
链 N
141–203（63 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG3350
0.35 M Ammonium sulfate
0.1 M Tris (pH 8.5)
al's oil
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.269 |
| 5W5C Crystal structure of the primed SNARE-Complexin-Synaptotagmin-1 C2AB complex 提交 2017-06-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 C
7–83（77 aa）
片段：UNP residues 7-83
链 D
141–204（64 aa）
片段：UNP residues 141-204
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM HEPES, pH7.4, 15-20% PEG3350, 200 mM ammonium formate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.232 |
| 5W5D Crystal structure of the primed SNARE-Complexin-Synaptotagmin-1 C2B complex 提交 2017-06-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 C
7–83（77 aa）
片段：UNP residues 7-83
链 D
141–204（64 aa）
片段：UNP residues 141-204
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100 mM HEPES, pH7.0, 15-17% PEG3350, 240 mM sodium malonate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.231 |
| 6IP1 alpha-SNAP-SNARE subcomplex in the whole 20S complex 提交 2018-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–100（100 aa）
片段：UNP residues 1-100
链 D
126–206（81 aa）
片段：UNP residues 126-206
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6MDM The 20S supercomplex engaging the SNAP-25 N-terminus (class 1) 提交 2018-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 H
1–204（204 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging.
|
分辨率 4.40 Å |
| 6MDN The 20S supercomplex engaging the SNAP-25 N-terminus (class 2) 提交 2018-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 H
1–204（204 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging.
|
分辨率 4.40 Å |
| 6MDO The D1 and D2 domain rings of NSF engaging the SNAP-25 N-terminus within the 20S supercomplex (focused refinement on D1/D2 rings, class 1) 提交 2018-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 H
1–204（204 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging.
|
分辨率 3.90 Å |
| 6MDP The D1 and D2 domain rings of NSF engaging the SNAP-25 N-terminus within the 20S supercomplex (focused refinement on D1/D2 rings, class 2) 提交 2018-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 H
1–204（204 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging.
|
分辨率 3.80 Å |
| 6MTI Synaptotagmin-1 C2A, C2B domains and SNARE-pin proteins (5CCI) individually docked into Cryo-EM map of C2AB-SNARE complexes helically organized on lipid nanotube surface in presence of Mg2+ 提交 2018-10-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 C
7–83（77 aa）
片段：residues 7-83
链 D
141–204（64 aa）
片段：residues 141-204
链 G
7–83（77 aa）
片段：residues 7-83
链 H
141–204（64 aa）
片段：residues 141-204
链 K
7–83（77 aa）
片段：residues 7-83
链 L
141–204（64 aa）
片段：residues 141-204
链 O
7–83（77 aa）
片段：residues 7-83
链 P
141–204（64 aa）
片段：residues 141-204
链 S
7–83（77 aa）
片段：residues 7-83
链 T
141–204（64 aa）
片段：residues 141-204
链 W
7–83（77 aa）
片段：residues 7-83
链 X
141–204（64 aa）
片段：residues 141-204
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.40 Å |
| 6WVW Crystal structure of the R59P-SNAP25 containing SNARE complex 提交 2020-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
10–83（74 aa）
链 D
141–204（64 aa）
|
突变：R59P | CA CALCIUM ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM MES (pH 6.0), 100 mM CaCl2, 20-25% (v/v)
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.244 |
| 6WVW Crystal structure of the R59P-SNAP25 containing SNARE complex 提交 2020-05-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
10–83（74 aa）
链 H
141–204（64 aa）
|
突变：R59P | CA CALCIUM ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM MES (pH 6.0), 100 mM CaCl2, 20-25% (v/v)
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.244 |
| 9OJR 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 3 提交 2025-05-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 H
1–83（83 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 9OJU 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 4 提交 2025-05-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 H
1–83（83 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 9OJZ 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 5 提交 2025-05-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 I
1–206（206 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 9OK3 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), 3:2:1 alphaSNAP-syntaxin-1a-SNAP-25 subcomplex local refinement, non-hydrolyzing, class 13 提交 2025-05-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–206（206 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.74 Å |
| 9OLO 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 19 提交 2025-05-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 I
1–206（206 aa）
链 J
1–206（206 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 10 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 9OM6 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), 4:2:2 alphaSNAP-syntaxin-1a-SNAP-25 subcomplex local refinement, hydrolyzing, class 23 提交 2025-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–206（206 aa）
链 D
1–206（206 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.14 Å |
| 9PAF 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 6 提交 2025-06-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 I
1–206（206 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.82 Å |
| 9PAG 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 7 提交 2025-06-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 I
1–206（206 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 9PB9 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 8 提交 2025-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 I
1–206（206 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.45 Å |
| 9PBA 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 9 提交 2025-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 I
1–206（206 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 9PBF 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 10 提交 2025-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 H
1–206（206 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.01 Å |
| 9PBV 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 11 提交 2025-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 H
1–206（206 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å |
| 9PC3 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 12 提交 2025-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 I
1–206（206 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 9PCX 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 14 提交 2025-06-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 I
1–206（206 aa）
链 J
1–206（206 aa）
链 K
1–206（206 aa）
链 L
1–206（206 aa）
链 M
1–206（206 aa）
链 N
1–206（206 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.03 Å |
| 9PCZ 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 15 提交 2025-06-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 K
1–206（206 aa）
链 L
1–206（206 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 10 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |
| 9PD1 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 20 提交 2025-06-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 I
1–206（206 aa）
链 J
1–206（206 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 9PD8 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 21 提交 2025-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 I
1–206（206 aa）
链 J
1–206（206 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.23 Å |
| 9PFF Min22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a H3:SNAP-25 SN1), non-hydrolyzing, class 27 提交 2025-07-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 G
1–83（83 aa）
链 I
1–83（83 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 9PFG Min22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a H3:SNAP-25 SN1), 4:2:2 alphaSNAP-syntaxin-1a H3-SNAP-25 SN1 subcomplex local refinement, non-hydrolyzing, class 28 提交 2025-07-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–83（83 aa）
链 C
1–83（83 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.58 Å |