当前蛋白身份:P62892
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7LS1 80S ribosome from mouse bound to eEF2 (Class II) 提交 2021-02-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致 |
链 f2
1–51(51 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 second blotting, force 3
|
分辨率 3.30 Å |
| 7LS2 80S ribosome from mouse bound to eEF2 (Class I) 提交 2021-02-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致 |
链 f2
1–51(51 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 second blotting, force 3
|
分辨率 3.10 Å |
| 8P8N Mouse RPL39 integrated into the yeast 60S ribosomal subunit 提交 2023-06-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 40 PDB 声明:43-meric(43) 与全部聚合物一致 |
链 2
1–51(51 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 152 CL CHLORIDE ION × 20 SPD SPERMIDINE × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 2.15 Å |
| 9H4N RPL13 (eL13)-mutant 80S ribosome from mouse 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 70 PDB 声明:76-meric(76) 与全部聚合物一致 |
链 f2
2–51(50 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;1,2 second blotting
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分辨率 2.46 Å |
| 9QOH Mouse Ribosome POST translocation state 提交 2025-03-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:83-meric(83) 待复核 |
链 f2
1–51(51 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 122 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.78 Å |
| 9QQL Mouse RPS15 P131 Mutant Ribosome POST translocation state 提交 2025-04-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 76 PDB 声明:83-meric(83) 与全部聚合物一致 |
链 f2
1–51(51 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 122 UNK UNKNOWN × 22 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 9QQP Mouse Ribosome rotated-2 PRE state 提交 2025-04-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致 |
链 f2
1–51(51 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 123 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9QSA Mouse Ribosome rotated-1 PRE state 提交 2025-04-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致 |
链 f2
1–51(51 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9QWT Mouse Ribosome RPS15 (uS19) P131S rotated-2 PRE state 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致 |
链 f2
1–51(51 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 123 ZN ZINC ION × 6 B8N (2~{R})-2-azanyl-4-[5-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-3,4-bis(oxidanyl)-5-(phosphonooxymethyl)oxolan-2-yl]-3-methyl-2,6-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]butanoic acid × 1 4AC N(4)-ACETYLCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9QZP Mouse Ribosome Classical Pre translocation state 提交 2025-04-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致 |
链 f2
1–51(51 aa)
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 118 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |