当前蛋白身份:P68106 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1C9H CRYSTAL STRUCTURE OF FKBP12.6 IN COMPLEX WITH RAPAMYCIN 提交 1999-08-02 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa) 片段:FKBP12.6
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;298 K;PEG 4000, LITHIUM SULFATE, HEPES BUFFER, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.249
4C02 Crystal structure of human ACVR1 (ALK2) in complex with FKBP12.6 and dorsomorphin 提交 2013-07-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–108(108 aa)
未记录 FLC CITRATE ANION × 8 TAK 6-[4-(2-piperidin-1-ylethoxy)phenyl]-3-pyridin-4-ylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2;1.8M AMMONIUM CITRATE, pH 7.2
分辨率 2.17 Å R-free 0.198
4IQ2 P21 crystal form of FKBP12.6 提交 2013-01-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
突变:C22V, C76I MLA MALONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;2.0 M malonic acid, pH 7.0, 4% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.251
4IQ2 P21 crystal form of FKBP12.6 提交 2013-01-10 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 2–108(107 aa)
突变:C22V, C76I 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;2.0 M malonic acid, pH 7.0, 4% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.251
4IQC P3121 crystal form of FKBP12.6 提交 2013-01-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
突变:C22V, C76I 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;62% ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 4% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.222
4IQC P3121 crystal form of FKBP12.6 提交 2013-01-11 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 2–108(107 aa)
突变:C22V, C76I 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;62% ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 4% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.222
5HKG Total chemical synthesis, refolding and crystallographic structure of a fully active immunophilin: calstabin 2 (FKBP12.6). 提交 2016-01-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 CL CHLORIDE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;16 % PEG 8K, 10% Glycerol, 500 mM KCl, 100 mM Hepes
分辨率 1.50 Å R-free 0.194
5L1D Structure of rabbit RyR2 in complex with FKBP12.6 in a closed state (conformation C1) 提交 2016-07-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 2–108(107 aa)
链 D 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;1x Protease Inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot for 2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 11.00 Å
5T15 Structural basis for gating and activation of RyR1 (30 uM Ca2+ dataset, all particles) 提交 2016-08-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 3.60 Å
5T9M Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 1) 提交 2016-09-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.00 Å
5T9N Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 2) 提交 2016-09-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 3.80 Å
5T9R Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 3) 提交 2016-09-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 5.80 Å
5T9S Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 4) 提交 2016-09-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.20 Å
5T9V Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 1) 提交 2016-09-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.40 Å
5TA3 Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 2) 提交 2016-09-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.40 Å
5TAL Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 1&2) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.30 Å
5TAM Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 4) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.30 Å
5TAN Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 3) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.30 Å
5TAP Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, all particles) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.40 Å
5TAQ Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 3&4) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.10 Å
5TAS Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 1) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 6.20 Å
5TAT Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 2) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.80 Å
5TAU Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 3) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 6.20 Å
5TAV Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 4) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.80 Å
5TAW Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, all particles) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.40 Å
5TAX Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 1) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 6.60 Å
5TAY Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 2) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.60 Å
5TAZ Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 3) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.30 Å
5TB0 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, all particles) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.40 Å
5TB1 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 1) 提交 2016-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.60 Å
5TB2 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 2) 提交 2016-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.60 Å
5TB3 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 3) 提交 2016-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.70 Å
5TB4 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 4) 提交 2016-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.50 Å
6JGZ Structure of RyR2 (F/P/Ca2+ dataset) 提交 2019-02-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 C 1–108(108 aa)
链 E 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6JH6 Structure of RyR2 (F/A/Ca2+ dataset) 提交 2019-02-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 C 1–108(108 aa)
链 E 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6JHN Structure of RyR2 (F/C/Ca2+ dataset) 提交 2019-02-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–108(108 aa)
链 D 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6JI0 Structure of RyR2 (F/A/C/Ca2+ dataset) 提交 2019-02-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–108(108 aa)
链 D 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6JI8 Structure of RyR2 (F/apoCaM dataset) 提交 2019-02-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 1–108(108 aa)
链 E 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 K 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6JII Structure of RyR2 (F/A/C/L-Ca2+/apo-CaM-M dataset) 提交 2019-02-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 D 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6JIU Structure of RyR2 (F/A/C/L-Ca2+/Ca2+CaM dataset) 提交 2019-02-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 1–108(108 aa)
链 E 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 K 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 12 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6JIY Structure of RyR2 (F/A/C/H-Ca2+/Ca2+CaM dataset) 提交 2019-02-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 1–108(108 aa)
链 E 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 K 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 20 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6JRR Structure of RyR2 (*F/A/C/L-Ca2+ dataset) 提交 2019-04-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–108(108 aa)
链 D 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6JRS Structure of RyR2 (*F/A/C/L-Ca2+/Ca2+-CaM dataset) 提交 2019-04-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 1–108(108 aa)
链 E 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 K 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 12 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6M2W Structure of RyR1 (Ca2+/Caffeine/ATP/CaM1234/CHL) 提交 2020-03-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 2–108(107 aa)
链 E 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 K 2–108(107 aa)
未记录 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PV6 Functional Pathways of Biomolecules Retrieved from Single-particle Snapshots 提交 2019-07-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6W1N Pig Ryanodine Receptor (WT) in 5mM EGTA condition 提交 2020-03-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
链 C 2–108(107 aa)
链 E 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6WOT Cryo-EM structure of recombinant rabbit Ryanodine Receptor type 1 mutant R164C in complex with FKBP12.6 提交 2020-04-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
6WOU Cryo-EM structure of recombinant mouse Ryanodine Receptor type 2 mutant R176Q in complex with FKBP12.6 in nanodisc 提交 2020-04-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
6WOV Cryo-EM structure of recombinant mouse Ryanodine Receptor type 2 wild type in complex with FKBP12.6 提交 2020-04-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
6X32 Wt pig RyR1 in complex with apoCaM, EGTA condition (class 1 and 2, closed) 提交 2020-05-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
链 D 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6X33 Wt pig RyR1 in complex with apoCaM, EGTA condition (class 3, open) 提交 2020-05-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
链 D 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6X34 Pig R615C RyR1 EGTA (all classes, open) 提交 2020-05-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 2–107(106 aa)
链 C 2–107(106 aa)
链 E 2–107(106 aa)
链 G 2–107(106 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6X35 Pig R615C RyR1 in complex with CaM, EGTA (class 1, open) 提交 2020-05-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
链 D 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6X36 Pig R615C RyR1 in complex with CaM, EGTA (class 3, closed) 提交 2020-05-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
链 D 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
7CF9 Structure of RyR1 (Ca2+/CHL) 提交 2020-06-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 2–108(107 aa)
链 D 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
7JMF Functional Pathways of Biomolecules Retrieved from Single-particle Snapshots - Frame 42 - State 6 (S6) 提交 2020-07-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7JMG Functional Pathways of Biomolecules Retrieved from Single-particle Snapshots - Frame 22 - State 2 (S2) 提交 2020-07-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7JMH Functional Pathways of Biomolecules Retrieved from Single-particle Snapshots - Frame 35 - State 4 (S4) 提交 2020-07-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7JMI Functional Pathways of Biomolecules Retrieved from Single-particle Snapshots - Frame 29 - State 3 (S3) 提交 2020-07-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7JMJ Functional Pathways of Biomolecules Retrieved from Single-particle Snapshots - Frame 37 - State 5 (S5) 提交 2020-07-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7M6A High resolution structure of the membrane embedded skeletal muscle ryanodine receptor 提交 2021-03-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
链 O 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
7M6L High resolution structure of the membrane embedded skeletal muscle ryanodine receptor 提交 2021-03-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 F 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 J 1–108(108 aa)
链 O 1–108(108 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
7T64 Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6 embedded in lipidic nanodisc in the closed state 提交 2021-12-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot force 2; blot for 1.0s before plunging
分辨率 4.00 Å
7T65 Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6 embedded in lipidic nanodisc in the open state 提交 2021-12-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot force 2; blot for 1.0s before plunging
分辨率 4.05 Å
7U9Q Structure of PKA phosphorylated human RyR2 in the closed state 提交 2022-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7U9R Structure of PKA phosphorylated human RyR2 in the open state 提交 2022-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 XAN XANTHINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
7U9T Structure of PKA phosphorylated human RyR2 in the closed state in the presence of Calmodulin 提交 2022-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
7U9X Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the closed state 提交 2022-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.58 Å
7U9Z Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the open state 提交 2022-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 XAN XANTHINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
7UA1 Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the closed state in the presence of ARM210 提交 2022-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å
7UA3 Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the closed state in the presence of Calmodulin 提交 2022-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
7UA4 Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the open state in the presence of Calmodulin 提交 2022-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 XAN XANTHINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
7UA5 Structure of dephosphorylated human RyR2 in the closed state 提交 2022-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
7UA9 Structure of dephosphorylated human RyR2 in the open state 提交 2022-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 XAN XANTHINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
7VML Structure of recombinant RyR2 (EGTA dataset, class 1&2, closed state) 提交 2021-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 I 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7VMM Structure of recombinant RyR2 (EGTA dataset, class 1, closed state) 提交 2021-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 I 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7VMN Structure of recombinant RyR2 (EGTA dataset, class 2, closed state) 提交 2021-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 I 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7VMO Structure of recombinant RyR2 (Ca2+ dataset, class 1, open state) 提交 2021-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 I 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7VMP Structure of recombinant RyR2 (Ca2+ dataset, class 2, open state) 提交 2021-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 I 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7VMQ Structure of recombinant RyR2 (Ca2+ dataset, class 3, open state) 提交 2021-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 I 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7VMR Structure of recombinant RyR2 mutant K4593A (EGTA dataset) 提交 2021-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 I 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7VMS Structure of recombinant RyR2 mutant K4593A (Ca2+ dataset) 提交 2021-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 I 2–108(107 aa)
链 J 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8DTY Recombinant mouse RyR2 triple phosphomimetic mutant S2807D/S2813D/S2030D in complex with FKBP12.6 and nanodisc under closed-state conditions 提交 2022-07-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8DTZ Recombinant mouse RyR2 triple phosphonull mutant S2807A/S2813A/S2030A in complex with FKBP12.6 and nanodisc under closed-state conditions 提交 2022-07-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8DUJ Global map in C1 of RyR1 particles in complex with ImperaCalcin 提交 2022-07-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric(13) 与蛋白数一致
链 B 2–108(107 aa)
链 E 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 K 2–108(107 aa)
未记录 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8DVE RyR1 in presence of IpCa-T26E phosphomimetic and activating ligands 提交 2022-07-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 2–108(107 aa)
链 E 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
链 K 2–108(107 aa)
未记录 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
8DVV Recombinant mouse RyR2 triple phosphomimetic mutant S2807D/S2813D/S2030D in complex with FKBP12.6 and nanodisc under open-state conditions 提交 2022-07-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
8SEN Cryo-EM Structure of RyR1 提交 2023-04-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
8SEO Cryo-EM Structure of RyR1 + ATP-gamma-S 提交 2023-04-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
8SEP Cryo-EM Structure of RyR1 + ADP 提交 2023-04-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.57 Å
8SEQ Cryo-EM Structure of RyR1 + AMP 提交 2023-04-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8SER Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenosine 提交 2023-04-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ADN ADENOSINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
8SES Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenine 提交 2023-04-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ADE ADENINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
8SET Cryo-EM Structure of RyR1 + cAMP 提交 2023-04-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
8UQ2 Structure of human RyR2-S2808D in the subprimed state 提交 2023-10-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
8UQ3 Structure of human RyR2-S2808D in the closed state in the presence of ARM210 提交 2023-10-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
8UQ4 Structure of human RyR2-S2808D in the subprimed state in the presence of H2O2/NOC-12/GSH 提交 2023-10-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;30 minute incubation with H2O2/NOC-12/GSH was stopped by flash freezing (vitrobot)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
8UXC Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420Q in the primed state 提交 2023-11-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8UXE Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420Q in the closed state in the presence of ARM210 提交 2023-11-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
8UXF Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the primed state 提交 2023-11-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8UXG Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the closed state in the presence of ARM210 提交 2023-11-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
8UXH Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the primed state in the presence of calcium 提交 2023-11-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
8UXI Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the open state in the presence of calcium 提交 2023-11-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
8UXL Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the primed state in the presence of calcium and calmodulin 提交 2023-11-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;0.020 mM Calmodulin was added to the final sample
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
8UXM Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the open state in the presence of calcium and calmodulin 提交 2023-11-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 E 1–108(108 aa)
链 F 1–108(108 aa)
链 G 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 20 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;0.020 mM Calmodulin was added to the final sample
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
8XJI Structure of chimeric RyR complex with flubendiamide 提交 2023-12-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 A1LVX Flubendiamide × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
8XKH Structure of chimeric RyR Complex with tetraniliprole 提交 2023-12-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 A1LV1 tetraniliprole × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.87 Å
8XLF Structure of chimeric RyR 提交 2023-12-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
8XLH Structure of chimeric RyR-I4657M/G4819E 提交 2023-12-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
8Y40 Structure of chimeric RyR-I4657M/G4819E complex with chlorantraniliprole 提交 2024-01-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
9C1E Mink RyR3 in closed conformation 提交 2024-05-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
链 C 2–108(107 aa)
链 E 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.02% GDN, 5 mM EGTA, 1:1000 diluted protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blotted for 3 s (blot force of 7 to 10) using ashless blotting paper (Whatman)
分辨率 2.89 Å
9C1F Mink RyR3 in open conformation bound to Ca2+/ATP/caffeine 提交 2024-05-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 2–108(107 aa)
链 C 2–108(107 aa)
链 E 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CFF CAFFEINE × 4 CL CHLORIDE ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.02% GDN, 0.03 mM free Ca2+ buffered with 2 mM EGTA, 5 mM ATP, 5 mM caffeine, 1:1000 diluted protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blotted for 3 s (blot force of 7 to 10) using ashless blotting paper (Whatman)
分辨率 3.22 Å
9CGP RyR1 disease mutant Y523S with FKBP12.6, nanodisc and inhibitor dantrolene in the absence of calcium with refined P1 domain 提交 2024-06-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 U1C Dantrolene × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
9CGQ Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6, nanodisc and inhibitor dantrolene in the presence of activating calcium 提交 2024-06-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 2–108(107 aa)
链 F 2–108(107 aa)
链 G 2–108(107 aa)
链 H 2–108(107 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 U1C Dantrolene × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9KDF CryoEM structure of Calcineurin-fusion Human endothelin receptor type-B in complex with RES-701-3 提交 2024-11-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 2–108(107 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9KDG CryoEM structure of Calcineurin-fusion Human endothelin receptor type-B in the ligand-free form 提交 2024-11-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 2–108(107 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9OL4 Cryo-EM Structure of Ryanodine Receptor 1: Drug Bound Open Conformation 提交 2025-05-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 N 1–108(108 aa)
链 T 1–108(108 aa)
未记录 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 117 7-[2-(4-FLUORO-PHENYL)-5-ISOPROPYL-3-PHENYL-4-PHENYLCARBAMOYL-PYRROL-1-YL]- 3,5-DIHYDROXY-HEPTANOIC ACID × 12 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9OL5 Rabbit Ryanodine Receptor 1: Atorvastatin Bound Closed Conformation 提交 2025-05-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 N 1–108(108 aa)
链 T 1–108(108 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 117 7-[2-(4-FLUORO-PHENYL)-5-ISOPROPYL-3-PHENYL-4-PHENYLCARBAMOYL-PYRROL-1-YL]- 3,5-DIHYDROXY-HEPTANOIC ACID × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9OL6 Rabbit Ryanodine Receptor 1: DMSO Control Closed Conformation 提交 2025-05-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 N 1–108(108 aa)
链 T 1–108(108 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
9PWO Pig Ryanodine Receptor 1 R615C Mutant: Atorvastatin Bound Open Conformation 提交 2025-08-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–108(108 aa)
链 H 1–108(108 aa)
链 N 1–108(108 aa)
链 T 1–108(108 aa)
未记录 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 117 7-[2-(4-FLUORO-PHENYL)-5-ISOPROPYL-3-PHENYL-4-PHENYLCARBAMOYL-PYRROL-1-YL]- 3,5-DIHYDROXY-HEPTANOIC ACID × 12 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å