当前蛋白身份：P68139
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1MDU Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (GS-1) 提交 2002-08-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 12 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；PEG 3350, tris, calcium chloride, magnesium chloride, ADP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.233 |
| 1MDU Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (GS-1) 提交 2002-08-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；PEG 3350, tris, calcium chloride, magnesium chloride, ADP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.233 |
| 5YU8 Cofilin decorated actin filament 提交 2017-11-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
3–377（375 aa）
链 B
3–377（375 aa）
链 C
3–377（375 aa）
链 D
3–377（375 aa）
链 E
3–377（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6D8C Cryo-EM structure of FLNaABD E254K bound to phalloidin-stabilized F-actin 提交 2018-04-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 H
3–377（375 aa）
链 J
3–377（375 aa）
链 K
3–377（375 aa）
链 L
3–377（375 aa）
链 M
3–377（375 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 6DJM Cryo-EM structure of AMPPNP-actin filaments 提交 2018-05-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–377（375 aa）
链 B
3–377（375 aa）
链 C
3–377（375 aa）
链 D
3–377（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6DJN Cryo-EM structure of ADP-Pi-actin filaments 提交 2018-05-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–377（375 aa）
链 B
3–377（375 aa）
链 C
3–377（375 aa）
链 D
3–377（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6DJO Cryo-EM structure of ADP-actin filaments 提交 2018-05-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–377（375 aa）
链 B
3–377（375 aa）
链 C
3–377（375 aa）
链 D
3–377（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6M5G F-actin-Utrophin complex 提交 2020-03-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 D
1–377（377 aa）
链 E
1–377（377 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds
|
分辨率 3.60 Å |
| 6UPV Alpha-E-catenin ABD-F-actin complex 提交 2019-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
3–377（375 aa）
链 B
3–377（375 aa）
链 C
3–377（375 aa）
链 D
3–377（375 aa）
链 E
3–377（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6UPW Metavinculin ABD-F-actin complex 提交 2019-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
3–377（375 aa）
链 B
3–377（375 aa）
链 C
3–377（375 aa）
链 D
3–377（375 aa）
链 E
3–377（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 6X5Z Bovine Cardiac Myosin in Complex with Chicken Skeletal Actin and Human Cardiac Tropomyosin in the Rigor State 提交 2020-05-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Thin filaments were reconstituted by first mixing F-actin and tropomyosin to final concentrations of 10 uM actin and 7 uM tropomyosin. Just before applying 1.5 uL actin-tropomyosin to a freshly glow discharged holey-carbon grid, the surfactant octyl B-D-glucopyranoside was added to the protein solution to a concentration of 12 nM. The grid sample was manually blotted for 1 second and a 1.5 uL drop of 7.5 uM myosin-S1 sub-fragment was then applied to the blotted grid sample. The sample was immediately blotted for 4 seconds and plunge-frozen in liquid ethane.
|
分辨率 4.24 Å |
| 7BT7 F-actin-ADP complex structure 提交 2020-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 D
1–377（377 aa）
链 E
1–377（377 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 3.5 seconds
|
分辨率 3.80 Å |
| 7BTE Lifeact-F-actin complex 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 E
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
链 I
1–377（377 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50mM KCl,1mM MgCl2,0.2mM EGTA, 10mM Imidazole buffer pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 3.5 seconds
|
分辨率 4.20 Å |
| 7BTI Phalloidin bound F-actin complex 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 D
1–377（377 aa）
链 E
1–377（377 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50mM KCl,1mM MgCl2,0.2mM EGTA, 10mM Imidazole buffer pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 3.5 seconds
|
分辨率 3.60 Å |
| 7K20 Cryo-EM structure of pyrene-labeled ADP-actin filaments 提交 2020-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–377（375 aa）
链 B
3–377（375 aa）
链 C
3–377（375 aa）
链 D
3–377（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 1T4 N-(pyren-1-yl)acetamide × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7K21 Cryo-EM structure of pyrene-labeled ADP-Pi-actin filaments 提交 2020-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–377（375 aa）
链 B
3–377（375 aa）
链 C
3–377（375 aa）
链 D
3–377（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 1T4 N-(pyren-1-yl)acetamide × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7KCH Myosin XI-F-actin complex 提交 2020-10-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；10 mM imidazole pH 7.0,50 mM KCl,1mM MgCl2, 1mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.33 Å |
| 7R8V Cryo-EM structure of the ADP state actin filament 提交 2021-06-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
7–377（371 aa）
链 B
7–377（371 aa）
链 C
7–377（371 aa）
链 D
7–377（371 aa）
链 E
7–377（371 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å |
| 7R91 cryo-EM structure of the rigor state wild type myosin-15-F-actin complex 提交 2021-06-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
7–377（371 aa）
链 B
7–377（371 aa）
链 C
7–377（371 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 7R94 T-Plastin-F-actin complex 提交 2021-06-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 D
1–377（377 aa）
链 E
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7RB8 cryo-EM structure of the ADP state wild type myosin-15-F-actin complex 提交 2021-07-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
5–377（373 aa）
链 B
5–377（373 aa）
链 C
5–377（373 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.63 Å |
| 7RB9 Cryo-EM structure of the rigor state Jordan myosin-15-F-actin complex 提交 2021-07-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
5–377（373 aa）
链 B
5–377（373 aa）
链 C
5–377（373 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.76 Å |
| 7SX8 T-Plastin-F-actin complex, parallel bundled state 提交 2021-11-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 E
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
链 H
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 7SX9 T-Plastin-F-actin complex, anti-parallel bundled state 提交 2021-11-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 E
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
链 H
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.00 Å |
| 7SXA T-Plastin-F-actin complex, pre-bundling intermediate state 提交 2021-11-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 D
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.87 Å |
| 7UDT cryo-EM structure of the rigor state wild type myosin-15-F-actin complex (symmetry expansion and re-centering) 提交 2022-03-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
5–377（373 aa）
链 B
5–377（373 aa）
链 C
5–377（373 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 7UDU cryo-EM structure of the ADP state wild type myosin-15-F-actin complex (symmetry expansion and re-centering) 提交 2022-03-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
5–377（373 aa）
链 B
5–377（373 aa）
链 C
5–377（373 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.15 Å |
| 7W4Z Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (AMPPNP-form) 提交 2021-11-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Na2HPO4, 19% PEG3350
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.158 |
| 7W50 Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (ADP-Pi-form) 提交 2021-11-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Na2HPO4, 18% PEG3350
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.162 |
| 7W51 Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (ADP-form) 提交 2021-11-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 8.0, 16% PEG3350
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.176 |
| 7W52 Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin 提交 2021-11-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 7W52 Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin 提交 2021-11-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 7W52 Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin 提交 2021-11-29 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 7W52 Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin 提交 2021-11-29 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 8C4C F-actin decorated by SipA497-669 提交 2023-01-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 D
1–377（377 aa）
链 E
1–377（377 aa）
链 F
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
链 H
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；5 mM Tris buffer, pH 7.5, 0.1 mM DTT, 0.2 mM ATP, 0.2 mM EGTA and 0.05 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8C4E F-actin decorated by SipA426-685 提交 2023-01-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 D
1–377（377 aa）
链 E
1–377（377 aa）
链 F
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
链 H
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；5 mM Tris buffer, pH 7.5, 0.1 mM DTT, 0.2 mM ATP, 0.2 mM EGTA and 0.05 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8D13 Helical ADP-F-actin 提交 2022-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.43 Å |
| 8D14 Helical ADP-Pi-F-actin 提交 2022-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.51 Å |
| 8D15 Bent ADP-F-actin 提交 2022-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 D
1–377（377 aa）
链 E
1–377（377 aa）
链 F
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.61 Å |
| 8D16 Bent ADP-Pi-F-actin 提交 2022-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
7–377（371 aa）
链 B
7–377（371 aa）
链 C
7–377（371 aa）
链 D
7–377（371 aa）
链 E
7–377（371 aa）
链 F
7–377（371 aa）
链 G
7–377（371 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.71 Å |
| 8D17 Straight ADP-F-actin 1 提交 2022-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 D
1–377（377 aa）
链 E
1–377（377 aa）
链 F
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 8D18 Straight ADP-F-actin 2 提交 2022-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–377（377 aa）
链 B
1–377（377 aa）
链 C
1–377（377 aa）
链 D
1–377（377 aa）
链 E
1–377（377 aa）
链 F
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.66 Å |
| 8E9B Cryo-EM structure of S. pombe Arp2/3 complex in the branch junction 提交 2022-08-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 H
3–377（375 aa）
链 I
3–377（375 aa）
链 M
3–377（375 aa）
链 N
3–377（375 aa）
链 O
3–377（375 aa）
链 P
3–377（375 aa）
链 Q
3–377（375 aa）
链 R
3–377（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8R3H Phalloidin bound F-actin 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 F
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
链 H
1–377（377 aa）
链 I
1–377（377 aa）
链 J
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 8SYF Homology model of Acto-HMM complex in ADP-state. Chicken smooth muscle HMM and chicken pectoralis actin 提交 2023-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
3–377（375 aa）
链 D
3–377（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 19.00 Å |
| 8VFM Salmonella effector protein SipA decorated actin filament 提交 2023-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 J
1–377（377 aa）
链 L
1–377（377 aa）
链 M
1–377（377 aa）
链 N
1–377（377 aa）
链 R
1–377（377 aa）
链 S
1–377（377 aa）
链 U
1–377（377 aa）
链 W
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8VO5 Cryo-EM structure of fascin bound to F-actin (actin binding site 1) 提交 2024-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
5–377（373 aa）
链 C
5–377（373 aa）
链 D
5–377（373 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8VO6 Cryo-EM structure of fascin bound to F-actin (actin binding site 2) 提交 2024-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
5–377（373 aa）
链 F
5–377（373 aa）
链 G
5–377（373 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8VO7 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin 提交 2024-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 B
5–377（373 aa）
链 C
5–377（373 aa）
链 D
5–377（373 aa）
链 E
5–377（373 aa）
链 F
5–377（373 aa）
链 G
5–377（373 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8VO8 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_left) 提交 2024-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 B
5–377（373 aa）
链 C
5–377（373 aa）
链 D
5–377（373 aa）
链 E
5–377（373 aa）
链 F
5–377（373 aa）
链 G
5–377（373 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8VO9 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_middle) 提交 2024-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 B
5–377（373 aa）
链 C
5–377（373 aa）
链 D
5–377（373 aa）
链 E
5–377（373 aa）
链 F
5–377（373 aa）
链 G
5–377（373 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8VOA Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_right) 提交 2024-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 B
5–377（373 aa）
链 C
5–377（373 aa）
链 D
5–377（373 aa）
链 E
5–377（373 aa）
链 F
5–377（373 aa）
链 G
5–377（373 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 9DVA F-actin binding interface of alpha-E-catenin ABD (cadherin-catenin complex) and afadin 提交 2024-10-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
3–377（375 aa）
链 B
3–377（375 aa）
链 C
3–377（375 aa）
链 D
3–377（375 aa）
链 E
3–377（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9JUS Structure of villin bound to an actin trimer 提交 2024-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 f
1–377（377 aa）
链 g
1–377（377 aa）
链 p
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5
10% PEG 3350
0.2 M KSCN
5 mM CaCl2/MgCl2
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 9JUS Structure of villin bound to an actin trimer 提交 2024-10-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
链 P
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 8 SCN THIOCYANATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5
10% PEG 3350
0.2 M KSCN
5 mM CaCl2/MgCl2
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 9JVT Structure of the C-terminal 4 domains (V4-V6-HP) villin bound to an actin 提交 2024-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 g
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris, pH 8.0
50% PEG 400
0.2 M Li2SO4
1 mM CaCl2
|
分辨率 3.29 Å R-free 0.268 |
| 9JVT Structure of the C-terminal 4 domains (V4-V6-HP) villin bound to an actin 提交 2024-10-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris, pH 8.0
50% PEG 400
0.2 M Li2SO4
1 mM CaCl2
|
分辨率 3.29 Å R-free 0.268 |
| 9JW0 Structure of the N-terminal 3 domains (V1-V3) villin bound to actin 提交 2024-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–377（377 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 20% PEG 3350, 0.2 M sodium nitrate, 1 mM CaCl2
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.259 |
| 9L2N Crystal structure of Cytochalasin D bound to a filamentous conformation actin 提交 2024-12-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–377（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 CY9 (3S,3aR,4S,6S,6aR,7E,10S,12R,13E,15R,15aR)-3-benzyl-6,12-dihydroxy-4,10,12-trimethyl-5-methylidene-1,11-dioxo-2,3,3a,4,5,6,6a,9,10,11,12,15-dodecahydro-1H-cycloundeca[d]isoindol-15-yl acetate × 1 CA CALCIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；17% (w/v) PEG3350 and 20 mM Na2HPO4
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.204 |
| 9M5E Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complex-nucleated actin filament (singlet complex) 提交 2025-03-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 I
1–377（377 aa）
链 J
1–377（377 aa）
链 K
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.55 Å |
| 9M64 Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complexes-nucleated actin filaments (Doublet Complex) 提交 2025-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 I
1–377（377 aa）
链 J
1–377（377 aa）
链 K
1–377（377 aa）
链 L
1–377（377 aa）
链 i
1–377（377 aa）
链 j
1–377（377 aa）
链 k
1–377（377 aa）
链 l
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9QGK F-actin decorated by ITPKA 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric（13） 与蛋白数一致 |
链 F
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
链 H
1–377（377 aa）
链 I
1–377（377 aa）
链 J
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 9SGK F-actin in complex with USP54 M1 actin binding motif 提交 2025-08-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 F
1–377（377 aa）
链 G
1–377（377 aa）
链 H
1–377（377 aa）
链 I
1–377（377 aa）
链 J
1–377（377 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |