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蛋白结构与聚集状态

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当前蛋白身份：P82673 重新检索
77PDB条目
77Biological assembly
77链与assembly记录
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

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PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3J9M Structure of the human mitochondrial ribosome (class 1) 提交 2015-02-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 127 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES-KOH, pH 7.45, 100 mM KCl, 20 mM MgOAc, 2 mM DTT；pH 7.45；20 mM HEPES-KOH, pH 7.45, 100 mM KCl, 20 mM MgOAc, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot 2.5 seconds before plunging；90 K；冷冻剂 ETHANE；Blot 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
分辨率 3.50 Å
6NU2 Structural insights into unique features of the human mitochondrial ribosome recycling 提交 2019-01-30 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致
链 A1 52–323（272 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 127 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6NU3 Structural insights into unique features of the human mitochondrial ribosome recycling 提交 2019-01-30 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 127 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6RW4 Structure of human mitochondrial 28S ribosome in complex with mitochondrial IF3 提交 2019-06-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SRY STREPTOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 60 K POTASSIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
6RW5 Structure of human mitochondrial 28S ribosome in complex with mitochondrial IF2 and IF3 提交 2019-06-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SRY STREPTOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 61 K POTASSIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
6VLZ Structure of the human mitochondrial ribosome-EF-G1 complex (ClassI) 提交 2020-01-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：90-meric（90） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
6VMI Structure of the human mitochondrial ribosome-EF-G1 complex (ClassIII) 提交 2020-01-28 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric（91） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
6ZM5 Human mitochondrial ribosome in complex with OXA1L, mRNA, A/A tRNA, P/P tRNA and nascent polypeptide 提交 2020-07-01 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric（94） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 189 K POTASSIUM ION × 44 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ALA ALANINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
6ZM6 Human mitochondrial ribosome in complex with mRNA, A/A tRNA and P/P tRNA 提交 2020-07-01 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric（92） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 189 K POTASSIUM ION × 44 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.59 Å
6ZS9 Human mitochondrial ribosome in complex with ribosome recycling factor 提交 2020-07-15 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：91-meric（91） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 195 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6ZSA Human mitochondrial ribosome bound to mRNA, A-site tRNA and P-site tRNA 提交 2020-07-15 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric（92） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 195 H8Q ~{N}-[(3~{S},6~{R},12~{R},15~{S},16~{S},19~{S},22~{S},25~{S})-25-[[(3~{S})-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-yl]sulfanylmethyl]-3-[[4-(dimethylamino)phenyl]methyl]-12-ethyl-4,16-dimethyl-2,5,11,14,18,21,24-heptakis(oxidanylidene)-19-phenyl-17-oxa-1,4,10,13,20-pentazatricyclo[20.4.0.0^{6,10}]hexacosan-15-yl]-3-oxidanyl-pyridine-2-carboxamide × 1 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6ZSB Human mitochondrial ribosome in complex with mRNA and P-site tRNA 提交 2020-07-15 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric（92） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 195 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6ZSC Human mitochondrial ribosome in complex with E-site tRNA 提交 2020-07-15 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：91-meric（91） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 195 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6ZSD Human mitochondrial ribosome in complex with mRNA, P-site tRNA and E-site tRNA 提交 2020-07-15 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 195 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6ZSE Human mitochondrial ribosome in complex with mRNA, A/P-tRNA and P/E-tRNA 提交 2020-07-15 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 195 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
6ZSG Human mitochondrial ribosome in complex with mRNA, A-site tRNA, P-site tRNA and E-site tRNA 提交 2020-07-15 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：94-meric（94） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 195 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7A5F Structure of the stalled human mitoribosome with P- and E-site mt-tRNAs 提交 2020-08-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric（91） 与全部聚合物一致
链 b6 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 128 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 MLI MALONATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7A5G Structure of the elongating human mitoribosome bound to mtEF-Tu.GMPPCP and A/T mt-tRNA 提交 2020-08-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：94-meric（94） 与全部聚合物一致
链 b6 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 128 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 NA SODIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1 MLI MALONATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.33 Å
7A5I Structure of the human mitoribosome with A- P-and E-site mt-tRNAs 提交 2020-08-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：90-meric（90） 与全部聚合物一致
链 b6 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 127 ZN ZINC ION × 7 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7A5K Structure of the human mitoribosome in the post translocation state bound to mtEF-G1 提交 2020-08-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致
链 b6 1–323（323 aa）
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 128 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7L08 Cryo-EM structure of the human 55S mitoribosome-RRFmt complex. 提交 2020-12-11 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：87-meric（87） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 127 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7OG4 Human mitochondrial ribosome in complex with P/E-tRNA 提交 2021-05-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：90-meric（90） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 195 H8Q ~{N}-[(3~{S},6~{R},12~{R},15~{S},16~{S},19~{S},22~{S},25~{S})-25-[[(3~{S})-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-yl]sulfanylmethyl]-3-[[4-(dimethylamino)phenyl]methyl]-12-ethyl-4,16-dimethyl-2,5,11,14,18,21,24-heptakis(oxidanylidene)-19-phenyl-17-oxa-1,4,10,13,20-pentazatricyclo[20.4.0.0^{6,10}]hexacosan-15-yl]-3-oxidanyl-pyridine-2-carboxamide × 1 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7P2E Human mitochondrial ribosome small subunit in complex with IF3, GMPPMP and streptomycin 提交 2021-07-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 5I0 [(2~{S},3~{S},4~{S},5~{R},6~{S})-2-[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-2-[(1~{R},2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-2,4-bis[[azaniumylidene(azanyl)methyl]amino]-3,5,6-tris(oxidanyl)cyclohexyl]oxy-4-[bis(oxidanyl)methyl]-5-methyl-4-oxidanyl-oxolan-3-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-3-yl]-methyl-azanium × 1 K POTASSIUM ION × 21 MG MAGNESIUM ION × 62 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
7PNX Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit without mS37 in complex with RBFA and METTL15 conformation a 提交 2021-09-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 64 K POTASSIUM ION × 16 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7PNY Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit without mS37 in complex with RBFA and METTL15 conformation b 提交 2021-09-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 61 K POTASSIUM ION × 20 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
7PNZ Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit without mS37 in complex with RBFA and METTL15 conformation c 提交 2021-09-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 61 K POTASSIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
7PO0 Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit without mS37 in complex with RBFA and IF3 提交 2021-09-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 65 K POTASSIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7PO1 Initiation complex of human mitochondrial ribosome small subunit with IF3 提交 2021-09-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 71 K POTASSIUM ION × 20 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
7PO2 Initiation complex of human mitochondrial ribosome small subunit with IF2, fMet-tRNAMet and mRNA 提交 2021-09-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric（35） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 72 K POTASSIUM ION × 20 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
7PO3 Human mitochondrial ribosome small subunit 提交 2021-09-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 64 K POTASSIUM ION × 21 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
7QI4 Human mitochondrial ribosome at 2.2 A resolution (bound to partly built tRNAs and mRNA) 提交 2021-12-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：94-meric（94） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 4 MG MAGNESIUM ION × 206 K POTASSIUM ION × 54 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.21 Å
7QI5 Human mitochondrial ribosome in complex with mRNA, A/A-, P/P- and E/E-tRNAs at 2.63 A resolution 提交 2021-12-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：94-meric（94） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 4 MG MAGNESIUM ION × 208 K POTASSIUM ION × 54 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
7QI6 Human mitochondrial ribosome in complex with mRNA, A/P- and P/E-tRNAs at 2.98 A resolution 提交 2021-12-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 54 MG MAGNESIUM ION × 202 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
8ANY Human mitochondrial ribosome in complex with LRPPRC, SLIRP, A-site, P-site, E-site tRNAs and mRNA 提交 2022-08-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：96-meric（96） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 4 MG MAGNESIUM ION × 206 K POTASSIUM ION × 49 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
8CSP Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State A) 提交 2022-05-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 28 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
8CSQ Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State B) 提交 2022-05-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 27 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.54 Å
8CSR Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State C) 提交 2022-05-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 31 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.54 Å
8CSS Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State D) 提交 2022-05-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 32 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.36 Å
8CST Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State E) 提交 2022-05-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 30 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
8CSU Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State C*) 提交 2022-05-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 26 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
8K2A Cryo-EM structure of the human 55S mitoribosome with Tigecycline 提交 2023-07-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：83-meric（83） 与全部聚合物一致
链 Sk 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 145 T1C TIGECYCLINE × 4 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8OIR 55S human mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric（94） 与全部聚合物一致
链 AB 1–323（323 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 51 MG MAGNESIUM ION × 354 VAL VALINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 3 MET METHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
8OIS 28S human mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物一致
链 AB 1–323（323 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 126 MET METHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
8QRK mt-SSU assembly intermediate in GTPBP8 knock-out cells, state 1 提交 2023-10-09 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：30-meric（30） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 49 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SRY STREPTOMYCIN × 1 K POTASSIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.69 Å
8QRL mt-SSU assembly intermediate in GTPBP8 knock-out cells, state 2 提交 2023-10-09 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 64 K POTASSIUM ION × 16 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
8QRM mt-SSU assembly intermediate in GTPBP8 knock-out cells, state 3 提交 2023-10-09 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SRY STREPTOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 59 K POTASSIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8QRN mt-SSU in GTPBP8 knock-out cells, state 4 提交 2023-10-09 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SRY STREPTOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 58 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
8RRI Human mitochondrial ribosome in complex with antibiotic tigecycline 提交 2024-01-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 VAL VALINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 94 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 T1C TIGECYCLINE × 3 K POTASSIUM ION × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8XT0 Cryo-EM structure of the human 55S mitoribosome with 5um Tigecycline 提交 2024-01-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：83-meric（83） 与全部聚合物一致
链 Sk 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 145 T1C TIGECYCLINE × 3 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8XT2 Cryo-EM structure of the human 55S mitoribosome with 10uM Tigecycline 提交 2024-01-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：83-meric（83） 与全部聚合物一致
链 Sk 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 145 T1C TIGECYCLINE × 3 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9G5B Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit (State A) 提交 2024-07-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9G5C Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit (State B) 提交 2024-07-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 23 K POTASSIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9G5D Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit (State C) 提交 2024-07-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 10 K POTASSIUM ION × 1 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9G5E Translation-initiation state of human mitochondrial ribosome small subunit (State F) 提交 2024-07-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 45 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9H51 Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit in complex with PUS1, METTL15 and RBFA(IN conformation) (state M1) 提交 2024-10-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 40 K POTASSIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9H54 Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit in complex with NOA1 and partial RBFA (state N2) 提交 2024-10-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9H55 Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit in complex with NOA1 and TFB1M (state N3) 提交 2024-10-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 41 K POTASSIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9HFM Translation-initiation state of human mitochondrial ribosome small subunit (State D) 提交 2024-11-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 44 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9HFN Translation-initiation state of human mitochondrial ribosome small subunit (State E) 提交 2024-11-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 45 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9HFO Translation-initiation state of human mitochondrial ribosome small subunit (State G) 提交 2024-11-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 45 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9IGT Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit bound to METTL15, RBFA, and mtIF2 (State M2.1) 提交 2025-02-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.96 Å
9IGU Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit bound to METTL15 and RBFA (Inward conformation) (State M2) 提交 2025-02-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致
链 1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 31 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
9OJM Human mitochondrial 28S PIC with tRNA and mtIF2 提交 2025-05-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致
链 1 46–323（278 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 72 K POTASSIUM ION × 20 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9OLF Membrane-associated human mitoribosome in complex with TACO1 提交 2025-05-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 93 PDB 声明：100-meric（100） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 SPD SPERMIDINE × 7 MG MAGNESIUM ION × 205 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 K POTASSIUM ION × 54 SPM SPERMINE × 2 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.46 Å
9PG8 In situ structure of the human mitoribosome in the P-E state 提交 2025-07-07 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 54 SPD SPERMIDINE × 8 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MG MAGNESIUM ION × 205 VAL VALINE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
9PGF In situ structure of the human mitoribosome in the P state 提交 2025-07-07 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：91-meric（91） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 54 SPD SPERMIDINE × 8 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MG MAGNESIUM ION × 205 VAL VALINE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
9PGI In situ structure of the human mitoribosome in the A-P-E state with TACO1 提交 2025-07-07 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：94-meric（94） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 54 SPD SPERMIDINE × 7 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MG MAGNESIUM ION × 204 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
9PGL In situ structure of the human mitoribosome in the A-P state with TACO1 提交 2025-07-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric（92） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 54 SPD SPERMIDINE × 8 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MG MAGNESIUM ION × 204 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9PGM In situ structure of the human mitoribosome in the P-E state from TACO1-knockout cells 提交 2025-07-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric（91） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 54 SPD SPERMIDINE × 7 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MG MAGNESIUM ION × 204 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
9PRD In situ structure of the human mitoribosome in the P state from TACO1-knockout cells 提交 2025-07-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric（89） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 54 SPD SPERMIDINE × 7 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MG MAGNESIUM ION × 204 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9PRQ In situ structure of human mitoribosome in the A/T-P state from TACO1-knockout cells 提交 2025-07-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric（91） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 54 SPD SPERMIDINE × 7 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MG MAGNESIUM ION × 204 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
9PRX In situ structure of the human mitoribosome in the A-P state from TACO1-knockout cells 提交 2025-07-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric（90） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 VAL VALINE × 1 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 54 SPD SPERMIDINE × 7 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MG MAGNESIUM ION × 204 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9PS0 In situ structure of the human mitoribosome in the A/P-P/E state from TACO1-knockout cells 提交 2025-07-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric（91） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 52 SPD SPERMIDINE × 7 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MG MAGNESIUM ION × 204 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9PS7 In situ structure of the human mitoribosome in the A/T-P-E state from TACO1-knockout cells 提交 2025-07-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 54 SPD SPERMIDINE × 7 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MG MAGNESIUM ION × 204 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
9PSI In situ structure of the human mitoribosome in the A-P-E state from TACO1-knockout cells 提交 2025-07-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：92-meric（92） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 54 SPD SPERMIDINE × 7 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MG MAGNESIUM ION × 204 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
9PSM In situ structure of the human mitoribosome in the A/P-P/E state 提交 2025-07-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 54 SPD SPERMIDINE × 8 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MG MAGNESIUM ION × 204 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 VAL VALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
9UWH human mitoribosome trapped by retapamulin 提交 2025-05-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致
链 A1 1–323（323 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 208 K POTASSIUM ION × 53 G34 Retapamulin × 1 VAL VALINE × 1 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å

页面展示的是PDB/mmCIF中的结构证据。“未记录非水小分子”不等于实验样品绝对无配体； 实验环境属于整个PDB实验记录，配体与拷贝数按具体biological assembly展示。