当前蛋白身份:Q13362 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2IAE Crystal structure of a protein phosphatase 2A (PP2A) holoenzyme. 提交 2006-09-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 30–436(407 aa) 片段:B56gamma1 subunit, residues 30-436
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M MES, pH 7.0, 50mM NaCl, 1.4M ammonium sulfate, 0.2M LiCl, 2% 1,6-diaminohexane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.316
2IAE Crystal structure of a protein phosphatase 2A (PP2A) holoenzyme. 提交 2006-09-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 30–436(407 aa) 片段:B56gamma1 subunit, residues 30-436
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M MES, pH 7.0, 50mM NaCl, 1.4M ammonium sulfate, 0.2M LiCl, 2% 1,6-diaminohexane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.316
2JAK Human PP2A regulatory subunit B56g 提交 2006-11-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 11–380(370 aa) 片段:RESIDUES 11-380
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 29% MPD 0.1M TRIS, PH 8.0 20MM L-PROLINE
分辨率 2.60 Å R-free 0.260
2NPP Structure of the Protein Phosphatase 2A Holoenzyme 提交 2006-10-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 1–439(439 aa)
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.5 K;15% PEG 8000, 0.1 M Tris-Cl pH 8.5, and 0.2 M magnesium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.5K
分辨率 3.30 Å R-free 0.299
2NPP Structure of the Protein Phosphatase 2A Holoenzyme 提交 2006-10-28 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 1–439(439 aa)
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.5 K;15% PEG 8000, 0.1 M Tris-Cl pH 8.5, and 0.2 M magnesium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.5K
分辨率 3.30 Å R-free 0.299
2NYL Crystal structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) holoenzyme with the catalytic subunit carboxyl terminus truncated 提交 2006-11-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 38–425(388 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.80 Å R-free 0.335
2NYL Crystal structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) holoenzyme with the catalytic subunit carboxyl terminus truncated 提交 2006-11-20 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 38–425(388 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.80 Å R-free 0.335
2NYM Crystal Structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) with C-terminus truncated catalytic subunit 提交 2006-11-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 38–425(388 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.60 Å R-free 0.331
2NYM Crystal Structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) with C-terminus truncated catalytic subunit 提交 2006-11-21 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 38–425(388 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.60 Å R-free 0.331
3FGA Structural Basis of PP2A and Sgo interaction 提交 2008-12-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 B 34–436(403 aa) 片段:sequence database residues 34-436
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 7;295 K;0.2 M SCTD, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350, pH 7, EVAPORATION, temperature 295K
分辨率 2.70 Å R-free 0.277
5JJA Crystal structure of a PP2A B56gamma/BubR1 complex 提交 2016-04-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 30–380(351 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 20% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.204
5JJA Crystal structure of a PP2A B56gamma/BubR1 complex 提交 2016-04-22 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 30–380(351 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 20% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.204
5K6S The structure of the PP2A B56 subunit BubR1 complex 提交 2016-05-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 62–411(350 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.75;298 K;8% PEG 6K, 0.8 M HEPES, 0.8 M LiCl
分辨率 2.79 Å R-free 0.227
5SW9 The structure of the PP2A B56 subunit RepoMan complex 提交 2016-08-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 62–411(350 aa) 片段:UNP residues 62-411
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.75;298 K;8% PEG 8K, 0.8 M HEPES, 0.8 M LiCl
分辨率 2.85 Å R-free 0.227
5SWF The structure of the PP2A B56 subunit double phosphorylated BubR1 complex 提交 2016-08-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 62–411(350 aa) 片段:UNP residues 62-411
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.75;298 K;8% PEG 8k, 0.8 M HEPES, 0.8 M LiCl
分辨率 2.82 Å R-free 0.231
6OYL The structure of the PP2A B56 subunit KIF4A complex 提交 2019-05-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 62–411(350 aa) 片段:UNP residues 62-411
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.75;298 K;0.1 M HEPES, pH 7.75, 0.8 M lithium chloride, 8% PEG8000
分辨率 3.15 Å R-free 0.231
6TOQ Crystal structure of a PP2A B56y/HTLV-1 integrase complex 提交 2019-12-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 AAA 11–380(370 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;293.15 K;0.1 M Na/KPO4 pH 6.2, 20-% 1,2-propanediol, 10% glycerol
分辨率 3.16 Å R-free 0.294
6VOY Cryo-EM structure of HTLV-1 instasome 提交 2020-02-01 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 E 30–372(343 aa)
链 F 30–372(343 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.70 Å
6VRO The structure of the PP2A B56 subunit AIM1 complex 提交 2020-02-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 62–411(350 aa) 片段:UNP residues 62-411
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M Tris, pH 8.0, 9% PEG8000, 0.9 M lithium chloride
分辨率 2.45 Å R-free 0.235
7OUF Structure of the STLV intasome:B56 complex bound to the strand-transfer inhibitor XZ450 提交 2021-06-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 C 11–380(370 aa)
链 F 11–380(370 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 1L0 4-azanyl-~{N}-[[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]methyl]-6-[3-(dimethylamino)-3-oxidanylidene-propyl]-1-oxidanyl-2-oxidanylidene-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7OUG STLV-1 intasome:B56 in complex with the strand-transfer inhibitor raltegravir 提交 2021-06-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 C 11–380(370 aa)
链 F 11–380(370 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 RLT N-(4-fluorobenzyl)-5-hydroxy-1-methyl-2-(1-methyl-1-{[(5-methyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)carbonyl]amino}ethyl)-6-oxo-1,6-di hydropyrimidine-4-carboxamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7PEL CryoEM structure of simian T-cell lymphotropic virus intasome in complex with PP2A regulatory subunit B56 gamma 提交 2021-08-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 C 11–380(370 aa)
链 F 11–380(370 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
7SOY The structure of the PP2A-B56gamma1 holoenzyme-PME-1 complex 提交 2021-11-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 1–449(449 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9GNJ Crystal structure of a PP2A B56gamma double phosphorylated BRCA2 complex 提交 2024-09-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 30–380(351 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;18% de PEG3350, 100mM Bis-Tris propane, 200 mM de Sodium Citrate
分辨率 2.85 Å R-free 0.229
9MF5 CryoEM structure of the Protein Phosphatase 2A (Abeta-B56gamma-Calpha) holoenzyme complex 提交 2024-12-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1–524(524 aa)
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9MIP CryoEM structure of the Protein Phasphatase 2A (Aalpha-B56gamma-Calpha) holoenzyme complex 提交 2024-12-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1–524(524 aa)
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å