当前蛋白身份：Q13618
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2MYL Cullin3 - BTB interface: a novel target for stapled peptides 提交 2015-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
49–68（20 aa）
片段：UNP residues 49-68
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 3；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM Cul349-68EN, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water
|
分辨率未提供 |
| 2MYM Cullin3 - BTB interface: a novel target for stapled peptides 提交 2015-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
49–68（20 aa）
片段：UNP residues 49-68
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 3；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM Cul349-68LA, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water
|
分辨率未提供 |
| 4AP2 Crystal structure of the human KLHL11-Cul3 complex at 2.8A resolution 提交 2012-03-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–388（388 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-388
|
突变：YES | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 IOD IODIDE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
25% PEG3350, 0.15M NAI, 8% ETHGLY
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.236 |
| 4APF Crystal structure of the human KLHL11-Cul3 complex at 3.1A resolution 提交 2012-04-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
23–388（366 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 23-388
|
突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.12 M K CITRATE; 17% PEG 3350; 10% ETHYLENE GLYCOL; PH 6.5 BIS TRIS PROPANE
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.222 |
| 4EOZ Crystal structure of the SPOP BTB domain complexed with the Cul3 N-terminal domain 提交 2012-04-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
20–381（362 aa）
片段：N-terminal domain from Cul3, unp residue 20-381
链 D
20–381（362 aa）
片段：N-terminal domain from Cul3, unp residue 20-381
|
突变：I342R, L346D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：I342R, L346D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.025M Hepes pH 6.5, 0.1M MgCl2, 13% PEG 2000, 11% 2,4-Methyl-2-Pentanediol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.263 |
| 4EOZ Crystal structure of the SPOP BTB domain complexed with the Cul3 N-terminal domain 提交 2012-04-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
20–381（362 aa）
片段：N-terminal domain from Cul3, unp residue 20-381
|
突变：I342R, L346D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.025M Hepes pH 6.5, 0.1M MgCl2, 13% PEG 2000, 11% 2,4-Methyl-2-Pentanediol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.263 |
| 4EOZ Crystal structure of the SPOP BTB domain complexed with the Cul3 N-terminal domain 提交 2012-04-16 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
20–381（362 aa）
片段：N-terminal domain from Cul3, unp residue 20-381
|
突变：I342R, L346D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.025M Hepes pH 6.5, 0.1M MgCl2, 13% PEG 2000, 11% 2,4-Methyl-2-Pentanediol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.263 |
| 4HXI Crystal structure of KLHL3/Cul3 complex 提交 2012-11-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
20–381（362 aa）
片段：NTD
|
突变：K274R, I342R, L346D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.2M ammonium tartrate, 14% PEG 3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.51 Å R-free 0.278 |
| 5NLB Crystal structure of human CUL3 N-terminal domain bound to KEAP1 BTB and 3-box 提交 2017-04-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
26–381（356 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15% PEG3350, 10% ethylene glycol, 0.2M potassium citrate tribasic
|
分辨率 3.45 Å R-free 0.288 |
| 6I2M Crystal structure of vaccinia virus protein A55 BTB-Back domain in complex with human Cullin-3 N-terminus 提交 2018-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
23–388（366 aa）
|
突变：I342R and L346D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；3.29% tacsimate pH 6.5, 9.92% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.282 |
| 8GQ6 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CUL3-Rbx1 dimeric complex 提交 2022-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–768（768 aa）
链 F
1–768（768 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.96 Å |
| 8H33 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-Cul3-Rbx1 tetrameric complex 提交 2022-10-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 C
1–768（768 aa）
链 F
1–768（768 aa）
链 H
1–768（768 aa）
链 I
1–768（768 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.86 Å |
| 8H34 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-Cul3-Rbx1 hexameric complex 提交 2022-10-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 C
1–768（768 aa）
链 F
1–768（768 aa）
链 H
1–768（768 aa）
链 I
1–768（768 aa）
链 M
1–768（768 aa）
链 O
1–768（768 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 18 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.99 Å |
| 8H35 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-Cul3-Rbx1 octameric complex 提交 2022-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 C
1–768（768 aa）
链 F
1–768（768 aa）
链 H
1–768（768 aa）
链 I
1–768（768 aa）
链 M
1–768（768 aa）
链 O
1–768（768 aa）
链 T
1–768（768 aa）
链 V
1–768（768 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.41 Å |
| 8H36 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CUL3-Rbx1-p85a dimeric complex 提交 2022-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–768（768 aa）
链 F
1–768（768 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 8H37 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CUL3-Rbx1-p85a tetrameric complex 提交 2022-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 C
1–768（768 aa）
链 F
1–768（768 aa）
链 M
1–768（768 aa）
链 O
1–768（768 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.52 Å |
| 8H38 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CRL3~N8-CSN(mutate) complex 提交 2022-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 L
1–768（768 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
|
分辨率 4.25 Å |
| 8H3A Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CRL3~N8(removed)-CSN complex 提交 2022-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 L
1–768（768 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.51 Å |
| 8H3F Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CRL3-CSN complex 提交 2022-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 L
1–768（768 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.73 Å |
| 8H3Q Cryo-EM Structure of the CAND1-Cul3-Rbx1 complex 提交 2022-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–768（768 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.76 Å |
| 8H3R Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CRL3~N8 dimeric complex 提交 2022-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–768（768 aa）
链 F
1–768（768 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.36 Å |
| 8I79 Cryo-EM structure of KCTD7 in complex with Cullin3 提交 2023-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 B
22–388（367 aa）
链 C
22–388（367 aa）
链 E
22–388（367 aa）
链 H
22–388（367 aa）
链 J
22–388（367 aa）
|
突变：I342R, L346D 突变：I342R, L346D 突变：I342R, L346D 突变：I342R, L346D 突变：I342R, L346D | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8K8T Structure of CUL3-RBX1-KLHL22 complex 提交 2023-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–768（768 aa）
链 D
1–768（768 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8K9I Structure of CUL3-RBX1-KLHL22 complex without CUL3 NA motif 提交 2023-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
25–768（744 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8KHP CULLIN3-KLHL22-RBX1 E3 ligase 提交 2023-08-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–768（768 aa）
链 D
1–768（768 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.67 Å |
| 8U80 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: Local Refinment of KCTD5(BTB)/Cullin3(NTD) 提交 2023-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 C1
1–381（381 aa）
链 C2
1–381（381 aa）
链 C3
1–381（381 aa）
链 C4
1–381（381 aa）
链 C5
1–381（381 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8U81 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: State A From Composite RELION Multi-body Refinement Map 提交 2023-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 C1
1–381（381 aa）
链 C2
1–381（381 aa）
链 C3
1–381（381 aa）
链 C4
1–381（381 aa）
链 C5
1–381（381 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.82 Å |
| 8U82 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: State B From Composite RELION Multi-body Refinement Map 提交 2023-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 C1
2–381（380 aa）
链 C2
2–381（380 aa）
链 C3
2–381（380 aa）
链 C4
2–381（380 aa）
链 C5
2–381（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |
| 8U83 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: State C From Composite RELION Multi-body Refinement Map 提交 2023-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 C1
1–381（381 aa）
片段：UNP residues 1-381
链 C2
1–381（381 aa）
片段：UNP residues 1-381
链 C3
1–381（381 aa）
片段：UNP residues 1-381
链 C4
1–381（381 aa）
片段：UNP residues 1-381
链 C5
1–381（381 aa）
片段：UNP residues 1-381
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |
| 8U84 KCTD5/Cullin3/Gbeta1gamma2 Complex: State D From Composite RELION Multi-body Refinement Map 提交 2023-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 C1
1–381（381 aa）
链 C2
1–381（381 aa）
链 C3
1–381（381 aa）
链 C4
1–381（381 aa）
链 C5
1–381（381 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.88 Å |
| 9EGL Cryo-EM structure of COP9 signalosome precatalytic state with neddylated cullin-3 提交 2024-11-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 J
1–768（768 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.93 Å |
| 9RWZ ZSWIM8-CUL3 complex bound to AGO2-miR-7-CYRANO 提交 2025-07-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric（11） 与全部聚合物一致 |
链 H
1–390（390 aa）
链 I
1–390（390 aa）
|
突变：I342R, L346D 突变：I342R, L346D | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8；25 mM HEPES, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP, pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |