当前蛋白身份：Q14790
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1F9E CASPASE-8 SPECIFICITY PROBED AT SUBSITE S4: CRYSTAL STRUCTURE OF THE CASPASE-8-Z-DEVD-CHO 提交 2000-07-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
222–374（153 aa）
链 B
390–478（89 aa）
链 C
222–374（153 aa）
链 D
390–478（89 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；1-propanol, sodium citrate, MES
, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 4.0K, temperature 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.289 |
| 1F9E CASPASE-8 SPECIFICITY PROBED AT SUBSITE S4: CRYSTAL STRUCTURE OF THE CASPASE-8-Z-DEVD-CHO 提交 2000-07-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
222–374（153 aa）
链 F
390–478（89 aa）
链 G
222–374（153 aa）
链 H
390–478（89 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；1-propanol, sodium citrate, MES
, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 4.0K, temperature 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.289 |
| 1F9E CASPASE-8 SPECIFICITY PROBED AT SUBSITE S4: CRYSTAL STRUCTURE OF THE CASPASE-8-Z-DEVD-CHO 提交 2000-07-10 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 I
222–374（153 aa）
链 J
390–478（89 aa）
链 K
222–374（153 aa）
链 L
390–478（89 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；1-propanol, sodium citrate, MES
, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 4.0K, temperature 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.289 |
| 1I4E CRYSTAL STRUCTURE OF THE CASPASE-8/P35 COMPLEX 提交 2001-02-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
222–479（258 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.296 |
| 1I4E CRYSTAL STRUCTURE OF THE CASPASE-8/P35 COMPLEX 提交 2001-02-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
222–479（258 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.296 |
| 1QDU CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX OF CASPASE-8 WITH THE TRIPEPTIDE KETONE INHIBITOR ZEVD-DCBMK 提交 1999-07-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
222–374（153 aa）
链 B
390–477（88 aa）
链 C
222–374（153 aa）
链 D
390–477（88 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；300mM ammonium phosphate, 27% (w/v) isopropanol, 100mM sodium phosphate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.302 |
| 1QDU CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX OF CASPASE-8 WITH THE TRIPEPTIDE KETONE INHIBITOR ZEVD-DCBMK 提交 1999-07-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
222–374（153 aa）
链 F
390–477（88 aa）
链 G
222–374（153 aa）
链 H
390–477（88 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；300mM ammonium phosphate, 27% (w/v) isopropanol, 100mM sodium phosphate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.302 |
| 1QDU CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX OF CASPASE-8 WITH THE TRIPEPTIDE KETONE INHIBITOR ZEVD-DCBMK 提交 1999-07-10 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 I
222–374（153 aa）
链 J
390–477（88 aa）
链 K
222–374（153 aa）
链 L
390–477（88 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；300mM ammonium phosphate, 27% (w/v) isopropanol, 100mM sodium phosphate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.302 |
| 1QTN CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX OF CASPASE-8 WITH THE TETRAPEPTIDE INHIBITOR ACE-IETD-ALDEHYDE 提交 1999-06-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
223–374（152 aa）
片段：P18 FRAGMENT
链 B
390–479（90 aa）
片段：P11 FRAGMENT
|
未记录 | DTD DITHIANE DIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；282 K；3 MICROLITERS PROTEIN (8.4 MG/ ML IN 20 MM TRISHCL, 100MM DTT AT PH 8.0) MIXED
WITH 3 MICROLITERS WELL BUFFER (1.4 SODIUM CITRATE, 0.1M HEPES, AT PH 8.0) AT
4 DEG. C, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 282K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.188 |
| 2C2Z Crystal structure of caspase-8 in complex with aza-peptide Michael acceptor inhibitor 提交 2005-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
218–374（157 aa）
片段：ALPHA SUB-UNIT, RESIDUES 218-374
链 B
376–479（104 aa）
片段：BETA-SUBUNIT, RESIDUES 376-479
|
未记录 | DTD DITHIANE DIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；1.4M SODIUM CITRATE, 100MM HEPES PH 8.0
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.187 |
| 2FUN alternative p35-caspase-8 complex 提交 2006-01-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
222–479（258 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 7, temperature 295K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.260 |
| 2FUN alternative p35-caspase-8 complex 提交 2006-01-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
222–479（258 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 7, temperature 295K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.260 |
| 2K7Z Solution Structure of the Catalytic Domain of Procaspase-8 提交 2008-08-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
217–479（263 aa）
片段：UNP residues 213-479
|
突变：C360A | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] procaspase8, 10 mM DTT,
100 mM sodium chloride, 20 mM [U-2H] TRIS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; 80% 2H] procaspase8, 10 mM DTT,
100 mM sodium chloride, 20 mM [U-2H] TRIS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2Y1L Caspase-8 in Complex with DARPin-8.4 提交 2010-12-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：octameric（8） 待复核 |
链 A
217–374（158 aa）
片段：P18 SUBUNIT, RESIDUES 218-374
链 B
376–479（104 aa）
片段：P10 SUBUNIT, RESIDUES 376-479
链 C
217–374（158 aa）
片段：P18 SUBUNIT, RESIDUES 218-374
链 D
376–479（104 aa）
片段：P10 SUBUNIT, RESIDUES 376-479
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.8；100 MM CITRIC ACID PH 4.9 (RT), 200 MM LI2SO4, 22.5% PEG 4K.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.218 |
| 3H11 Zymogen caspase-8:c-FLIPL protease domain complex 提交 2009-04-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
217–479（263 aa）
|
突变：D359A, D369A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；293 K；0.9 M sodium dihydrogen phosphate, 0.8 M dipotassium hydrogen phosphate, 0.1 M N-cyclohexyl-3-aminopropanesulfonic acid (CAPS), 0.2 M lithium sulfate, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 3KJN Caspase 8 bound to a covalent inhibitor 提交 2009-11-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
211–374（164 aa）
片段：residues 211-374
链 B
385–479（95 aa）
片段：residues 385-479
|
未记录 | DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 B93 (3S)-3-({[(5S)-2-{2-[(1H-benzimidazol-5-ylcarbonyl)amino]ethyl}-7-(cyclohexylmethyl)-1,3-dioxo-2,3,5,8-tetrahydro-1H-[1,2,4]triazolo[1,2-a]pyridazin-5-yl]carbonyl}amino)-4-oxopentanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；2 microliters of 100 mM inhibitor stock in DMSO was added to 100 microliters of 8.4 mg/mL protein in 20 mM Tris, 100 mM DTT, pH 8.0. Protein solution was mixed with an equal volume of well solution (1.0-1.1 M Citrate, 50 mM HEPES or PIPES pH 6.5, 25 mM DTT), VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.202 |
| 3KJQ Caspase 8 with covalent inhibitor 提交 2009-11-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
211–374（164 aa）
链 B
385–479（95 aa）
|
未记录 | B94 (3S)-3-({[(5S,8R)-2-(3-carboxypropyl)-8-(2-{[(4-chlorophenyl)acetyl]amino}ethyl)-1,3-dioxo-2,3,5,8-tetrahydro-1H-[1,2,4]triazolo[1,2-a]pyridazin-5-yl]carbonyl}amino)-4-oxopentanoic acid × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；2 microliters of 100 mM inhibitor stock in DMSO was added to 100 microliters of 8.4 mg/mL protein in 20 mM Tris, 100 mM DTT, pH 8.0. Protein solution was mixed with an equal volume of well solution (1.0-1.1 M Citrate, 50 mM HEPES or PIPES pH 6.5, 25 mM DTT), VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.207 |
| 4JJ7 Caspase-3 specific unnatural amino acid-based peptides 提交 2013-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
217–479（263 aa）
|
未记录 | DTD DITHIANE DIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；1 M Sodium citrate, 0.1M HEPES pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.157 |
| 4PRZ Caspase-8 specific unnatural amino acid peptides 提交 2014-03-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
217–479（263 aa）
片段：UNP RESIDUES 217-479
|
未记录 | DTD DITHIANE DIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；295 K；1.0 M sodium citrate, 0.1 M HEPES, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.218 |
| 4PS1 Caspase-8 specific unnatural amino acid peptides 提交 2014-03-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
217–479（263 aa）
片段：UNP RESIDUES 217-479
|
未记录 | DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；0.1 M Sodium citrate, pH 5.5, 36% PEG600, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.185 |
| 4PS1 Caspase-8 specific unnatural amino acid peptides 提交 2014-03-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
217–479（263 aa）
片段：UNP RESIDUES 217-479
|
未记录 | DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；0.1 M Sodium citrate, pH 5.5, 36% PEG600, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.185 |
| 4PS1 Caspase-8 specific unnatural amino acid peptides 提交 2014-03-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
217–479（263 aa）
片段：UNP RESIDUES 217-479
|
未记录 | DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；0.1 M Sodium citrate, pH 5.5, 36% PEG600, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.185 |
| 4PS1 Caspase-8 specific unnatural amino acid peptides 提交 2014-03-06 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
217–479（263 aa）
片段：UNP RESIDUES 217-479
|
未记录 | DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；0.1 M Sodium citrate, pH 5.5, 36% PEG600, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.185 |
| 4ZBW Crystal structure of death effector domain of Caspase8 in Homo Sapiens 提交 2015-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
61–247（187 aa）
链 B
61–247（187 aa）
|
突变：F122A, I128D 突变：F122A, I128D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.5；293 K；0.2M sodium chloride, 25% PEG3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.251 |
| 5H31 Structural basis for dimerization of the death effector domains of Caspase-8 提交 2016-10-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–188（188 aa）
片段：UNP residues 1-188
链 B
1–188（188 aa）
片段：UNP residues 1-188
|
突变：F122A 突变：F122A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.5；293 K；100 mM sodium chloride, 100 mM Tris, 21% PEG3350, 10 mM Sarcosine,
|
分辨率 3.17 Å R-free 0.268 |
| 5H31 Structural basis for dimerization of the death effector domains of Caspase-8 提交 2016-10-19 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–188（188 aa）
片段：UNP residues 1-188
链 D
1–188（188 aa）
片段：UNP residues 1-188
|
突变：F122A 突变：F122A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.5；293 K；100 mM sodium chloride, 100 mM Tris, 21% PEG3350, 10 mM Sarcosine,
|
分辨率 3.17 Å R-free 0.268 |
| 5H33 Structural basis for dimerization of the death effector domains of Caspase-8 提交 2016-10-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–188（188 aa）
链 B
1–188（188 aa）
|
突变：F122A 突变：F122A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.5；293 K；50mM sodium chloride, 100mM Tris pH 8.5, 22.5% PEG3350
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.313 |
| 5JQE Crystal structure of caspase8 tDED 提交 2016-05-04 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–186（186 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；293 K；0.1M MMT buffer, pH 8.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 3.16 Å R-free 0.274 |
| 5L08 Cryo-EM structure of Casp-8 tDED filament 提交 2016-07-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
60–243（184 aa）
链 B
60–243（184 aa）
链 C
60–243（184 aa）
链 D
60–243（184 aa）
链 E
60–243（184 aa）
链 F
60–243（184 aa）
链 G
60–243（184 aa）
链 H
60–243（184 aa）
链 I
60–243（184 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 6AGW Pro-domain of Caspase-8 提交 2018-08-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–180（180 aa）
片段：UNP residues 1-180
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；(NH4)2SO4, Cacodylate, NaCl
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.269 |
| 6PX9 Crystal structure of procaspase-8 in complex with covalent small molecule inhibitor 63-R 提交 2019-07-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
276–538（263 aa）
片段：UNP residues 276-538
链 B
276–538（263 aa）
片段：UNP residues 276-538
|
突变：D374A, D384A, C409S, C433S 突变：D374A, D384A, C409S, C433S | 63R N-{(3R)-1-[4-(morpholin-4-yl)benzene-1-carbonyl]piperidin-3-yl}-N-phenylacetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M imidazole, pH 8.0, 1.0 M sodium citrate
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.366 |
| 6PX9 Crystal structure of procaspase-8 in complex with covalent small molecule inhibitor 63-R 提交 2019-07-25 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
276–538（263 aa）
片段：UNP residues 276-538
链 D
276–538（263 aa）
片段：UNP residues 276-538
|
突变：D374A, D384A, C409S, C433S 突变：D374A, D384A, C409S, C433S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M imidazole, pH 8.0, 1.0 M sodium citrate
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.366 |
| 6PX9 Crystal structure of procaspase-8 in complex with covalent small molecule inhibitor 63-R 提交 2019-07-25 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
276–538（263 aa）
片段：UNP residues 276-538
链 F
276–538（263 aa）
片段：UNP residues 276-538
|
突变：D374A, D384A, C409S, C433S 突变：D374A, D384A, C409S, C433S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M imidazole, pH 8.0, 1.0 M sodium citrate
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.366 |
| 6X8H Caspase-8 in complex with AOMK inhibitor, Ac-DW3-KE, forms tetrahedral adduct 提交 2020-06-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
276–443（168 aa）
片段：p18 (UNP residues 276-443)
链 B
444–538（95 aa）
片段：p10 (UNP residues 444-538)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.1；295 K；1:1 protein : 0.10 M HEPES, 1.0 M sodium citrate
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.167 |
| 7LVM CASP8 isoform B DED domain 提交 2021-02-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；100mM Hepes pH 7.5, 20% Ethylene Glycol, 18% PEG 3350, 200mM Sodium Chloride
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.233 |
| 8YBX Structure of the FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–479（479 aa）
链 B
1–479（479 aa）
链 C
1–479（479 aa）
|
突变：F122G/L123G, C360A, D374A, D384A 突变：F122G/L123G, C360A, D374A, D384A 突变：F122G/L123G, C360A, D374A, D384A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.68 Å |
| 8YD7 Structure of FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–185（185 aa）
链 B
1–185（185 aa）
链 C
1–185（185 aa）
链 D
1–185（185 aa）
链 E
1–185（185 aa）
|
突变：F122G,L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F122G,L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F122G,L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F122G,L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F122G,L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SE SELENIUM ATOM × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；HEPES, TBG, PEG8000, TCEP, sodium chloride
|
分辨率 3.32 Å R-free 0.231 |
| 8YD8 Structure of FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–185（185 aa）
链 B
1–185（185 aa）
链 C
1–185（185 aa）
链 D
1–185（185 aa）
链 E
1–185（185 aa）
|
突变：F122G, L123G 突变：F122G, L123G 突变：F122G, L123G 突变：F122G, L123G 突变：F122G, L123G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；HEPES, PEG 8000, TBG, TCEP, sodium chloride
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.241 |
| 8YM4 Structure of Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–185（185 aa）
链 B
1–185（185 aa）
链 C
1–185（185 aa）
链 D
1–185（185 aa）
|
突变：F122G, L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F122G, L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F122G, L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F122G, L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SE SELENIUM ATOM × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M MES pH 6.5, 0.08 M sodium chloride, 0.2 M Potassium Thiocyanate, 10 % PEG 4000, 0.01 M TCEP
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.253 |
| 8YM5 Structure of Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–185（185 aa）
链 B
1–185（185 aa）
链 C
1–185（185 aa）
链 D
1–185（185 aa）
|
突变：F122G, L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F122G, L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F122G, L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F122G, L123G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M MES pH 6.5, 0.08 M sodium chloride, 0.2 M Potassium Thiocyanate, 10 % PEG 4000, 0.01 M TCEP
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.231 |
| 8YM6 Structure of Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 A
1–185（185 aa）
链 B
1–185（185 aa）
链 C
1–185（185 aa）
链 D
1–185（185 aa）
|
突变：F122G, L123G 突变：F122G, L123G 突变：F122G, L123G 突变：F122G, L123G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M Lithium chloride, 20 % PEG 400, 0.1 M TBG pH 9.0
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.264 |
| 8YNI Structure of the FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric（11） 与蛋白数一致 |
链 A
1–479（479 aa）
链 B
1–479（479 aa）
链 C
1–479（479 aa）
|
突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A 突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A 突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.66 Å |
| 8YNK Structure of the Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–479（479 aa）
链 B
1–479（479 aa）
链 C
1–479（479 aa）
|
突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A 突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A 突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 8YNL Structure of the Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–479（479 aa）
链 B
1–479（479 aa）
链 C
1–479（479 aa）
|
突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A 突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A 突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.55 Å |
| 8YNM Structure of the Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 A
1–479（479 aa）
链 B
1–479（479 aa）
链 C
1–479（479 aa）
|
突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A 突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A 突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 8YNN Structure of the Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–479（479 aa）
链 B
1–479（479 aa）
链 C
1–479（479 aa）
|
突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A 突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A 突变：F122G, L123G, C360A, D374A, D384A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.97 Å |