当前蛋白身份：Q15788
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1TFC CRYSTAL STRUCTURE OF THE LIGAND-BINDING DOMAIN OF THE ESTROGEN-RELATED RECEPTOR GAMMA IN COMPLEX WITH A STEROID RECEPTOR COACTIVATOR-1 PEPTIDE 提交 2004-05-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
686–700（15 aa）
片段：SECOND NR-BOX
链 D
686–700（15 aa）
片段：SECOND NR-BOX
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；TRIS.HCL, AMMONIUM SULFATE,
GLYCEROL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.258 |
| 1XIU Crystal structure of the agonist-bound ligand-binding domain of Biomphalaria glabrata RXR 提交 2004-09-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
686–700（15 aa）
链 F
686–700（15 aa）
|
未记录 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES, sodium formate, sodium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.243 |
| 1ZAF Crystal structure of estrogen receptor beta complexed with 3-Bromo-6-hydroxy-2-(4-hydroxy-phenyl)-inden-1-one 提交 2005-04-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
630–640（11 aa）
链 D
630–640（11 aa）
|
未记录 | 789 3-BROMO-6-HYDROXY-2-(4-HYDROXYPHENYL)-1H-INDEN-1-ONE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；15% PEG3350, 0.2M Mg Acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.286 |
| 2A3I Structural and Biochemical Mechanisms for the Specificity of Hormone Binding and Coactivator Assembly by Mineralocorticoid Receptor 提交 2005-06-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1430–1441（12 aa）
|
未记录 | C0R CORTICOSTERONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.9；293 K；PEG mme5K, Sodium Acetate, 1-6 Hexanediol, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.253 |
| 2C52 Structural diversity in CBP p160 complexes 提交 2005-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
920–970（51 aa）
片段：AD1, RESIDUES 920-970
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100
NMR样品组成
90% WATER/10% D2O
NMR样品组成
90% WATER/10% D2O
NMR样品组成
100% D2O
NMR样品组成
100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2FVJ A novel anti-adipogenic partial agonist of peroxisome proliferator-activated receptor-gamma (PPARG) recruits pparg-coactivator-1 alpha (PGC1A) but potentiates insulin signaling in vitro 提交 2006-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
628–640（13 aa）
片段：COACTIVATOR FRAGMENT SRC-1, 13-mer peptide from Nuclear receptor coactivator 1
|
未记录 | RO0 1-(3,4-DIMETHOXYBENZYL)-6,7-DIMETHOXY-4-{[4-(2-METHOXYPHENYL)PIPERIDIN-1-YL]METHYL}ISOQUINOLINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG3350, 0.2M magnesium chloride, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.246 |
| 2GTK Structure-based Design of Indole Propionic Acids as Novel PPARag CO-Agonists 提交 2006-04-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
631–640（10 aa）
片段：residues 631-640
|
未记录 | 208 (2S)-3-(1-{[2-(2-CHLOROPHENYL)-5-METHYL-1,3-OXAZOL-4-YL]METHYL}-1H-INDOL-5-YL)-2-ETHOXYPROPANOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M TRIS, PEG 3350, 0.2M MGSO4, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.261 |
| 2HBH Crystal structure of Vitamin D nuclear receptor ligand binding domain bound to a locked side-chain analog of calcitriol and SRC-1 peptide 提交 2006-06-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | XE4 1,3-CYCLOHEXANEDIOL, 4-METHYLENE-5-[(2E)-[(1S,3AS,7AS)-OCTAHYDRO-1-(5-HYDROXY-5-METHYL-1,3-HEXADIYNYL)-7A-METHYL-4H-INDEN-4-YLIDENE]ETHYLIDENE]-, (1R,3S,5Z) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；Li sulfate 1.6M, Mg sulfate 50mM, Bis Tris 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.261 |
| 2HC4 Crystal structure of the LBD of VDR of Danio rerio in complex with calcitriol 提交 2006-06-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | VDX 5-{2-[1-(5-HYDROXY-1,5-DIMETHYL-HEXYL)-7A-METHYL-OCTAHYDRO-INDEN-4-YLIDENE]-ETHYLIDENE}-4-METHYLENE-CYCLOHEXANE-1,3-DIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；Li sulfate 1.6M, Mg sulfate 50mM, Bis Tris 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.250 |
| 2HCD Crystal structure of the ligand binding domain of the Vitamin D nuclear receptor in complex with Gemini and a coactivator peptide 提交 2006-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | BIV 21-NOR-9,10-SECOCHOLESTA-5,7,10(19)-TRIENE-1,3,25-TRIOL, 20-(4-HYDROXY-4-METHYLPENTYL)-, (1A,3B,5Z,7E) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；Li sulfate 1.6M, Mgsulfate 50mM, Bis tris 0.1M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.260 |
| 2NV7 Crystal Structure of Estrogen Receptor Beta Complexed with WAY-555 提交 2006-11-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
631–640（10 aa）
链 D
631–640（10 aa）
|
未记录 | 555 4-(4-HYDROXYPHENYL)-1-NAPHTHALDEHYDE OXIME × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；precipitant: PEG3350, Mg formate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.265 |
| 2P54 a crystal structure of PPAR alpha bound with SRC1 peptide and GW735 提交 2007-03-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
686–696（11 aa）
片段：SRC1 peptide
|
未记录 | 735 2-METHYL-2-(4-{[({4-METHYL-2-[4-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]-1,3-THIAZOL-5-YL}CARBONYL)AMINO]METHYL}PHENOXY)PROPANOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；7% PEG 3350, 200 mM NaF, 12% 2,5-hexanediol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.227 |
| 3BEJ Structure of human FXR in complex with MFA-1 and co-activator peptide 提交 2007-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
676–700（25 aa）
片段：residues 676-700
|
未记录 | YT3 YTTRIUM (III) ION × 1 MUF (8alpha,10alpha,13alpha,17beta)-17-[(4-hydroxyphenyl)carbonyl]androsta-3,5-diene-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；16-22% PEG3350, 0.1M Bis-Tris, 4 mM YCl(3), 0.2M Ammonium acetate, 1 mM DTT.
Protein was carboxymethylated with iodoacetic acid, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.254 |
| 3BEJ Structure of human FXR in complex with MFA-1 and co-activator peptide 提交 2007-11-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
676–700（25 aa）
片段：residues 676-700
|
未记录 | YT3 YTTRIUM (III) ION × 1 MUF (8alpha,10alpha,13alpha,17beta)-17-[(4-hydroxyphenyl)carbonyl]androsta-3,5-diene-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；16-22% PEG3350, 0.1M Bis-Tris, 4 mM YCl(3), 0.2M Ammonium acetate, 1 mM DTT.
Protein was carboxymethylated with iodoacetic acid, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.254 |
| 3BQD Doubling the Size of the Glucocorticoid Receptor Ligand Binding Pocket by Deacylcortivazol 提交 2007-12-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1429–1441（13 aa）
片段：nuclear receptor coactivator 1 isoform 1 coactivator motif (residues 739-751)
|
未记录 | DAY 1-[(1R,2R,3aS,3bS,10aR,10bS,11S,12aS)-1,11-dihydroxy-2,5,10a,12a-tetramethyl-7-phenyl-1,2,3,3a,3b,7,10,10a,10b,11,12,12a-dodecahydrocyclopenta[5,6]naphtho[1,2-f]indazol-1-yl]-2-hydroxyethanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；1.3 M ammonium sulfate, 100 mM Tris, 8% glycerol, 3 mM n-hexadecyl-beta-maltoside, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.261 |
| 3CTB Tethered PXR-LBD/SRC-1p apoprotein 提交 2008-04-11 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
678–700（23 aa）
片段：PXR, residues 130-434, linker, SRC-1, residues 678-700
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；10-30% MPD or isopropanol, 100 mM imidazole, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 3CTB Tethered PXR-LBD/SRC-1p apoprotein 提交 2008-04-11 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
678–700（23 aa）
片段：PXR, residues 130-434, linker, SRC-1, residues 678-700
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；10-30% MPD or isopropanol, 100 mM imidazole, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 3CTB Tethered PXR-LBD/SRC-1p apoprotein 提交 2008-04-11 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–700（23 aa）
片段：PXR, residues 130-434, linker, SRC-1, residues 678-700
链 B
678–700（23 aa）
片段：PXR, residues 130-434, linker, SRC-1, residues 678-700
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；10-30% MPD or isopropanol, 100 mM imidazole, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 3CWD Molecular recognition of nitro-fatty acids by PPAR gamma 提交 2008-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
685–700（16 aa）
片段：LXXLL motif of SRC1-2
|
未记录 | LNA (9E,12Z)-10-nitrooctadeca-9,12-dienoic acid × 1 LNB (9Z,12E)-12-nitrooctadeca-9,12-dienoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.290 |
| 3CWD Molecular recognition of nitro-fatty acids by PPAR gamma 提交 2008-04-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
685–700（16 aa）
片段：LXXLL motif of SRC1-2
|
未记录 | LNA (9E,12Z)-10-nitrooctadeca-9,12-dienoic acid × 1 LNB (9Z,12E)-12-nitrooctadeca-9,12-dienoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.290 |
| 3DCT FXR with SRC1 and GW4064 提交 2008-06-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
741–761（21 aa）
片段：UNP residues 741-761
|
未记录 | 064 3-[(E)-2-(2-chloro-4-{[3-(2,6-dichlorophenyl)-5-(1-methylethyl)isoxazol-4-yl]methoxy}phenyl)ethenyl]benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 6.5；298 K；0.2M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 25% PEG3350, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.240 |
| 3DCU FXR with SRC1 and GSK8062 提交 2008-06-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
741–761（21 aa）
片段：UNP residues 741-761
|
未记录 | O62 6-(4-{[3-(2,6-dichlorophenyl)-5-(1-methylethyl)isoxazol-4-yl]methoxy}phenyl)naphthalene-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.228 |
| 3DR1 Side-chain fluorine atoms of non-steroidal vitamin D3 analogs stabilize helix 12 of vitamin D receptor 提交 2008-07-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 C5D (1R,3R)-5-[(2E)-3-{(1S,3R)-2,2,3-trimethyl-3-[6,6,6-trifluoro-5-hydroxy-5-(trifluoromethyl)hex-3-yn-1-yl]cyclopentyl}prop-2-en-1-ylidene]cyclohexane-1,3-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；Li sulfate 1.6M, Mg sulfate 50mM, Bis Tris 0.1M , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.286 |
| 3ET1 Structure of PPARalpha with 3-[5-Methoxy-1-(4-methoxy-benzenesulfonyl)-1H-indol-3-yl]-propionic acid 提交 2008-10-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
681–696（16 aa）
片段：residues 681-696
|
未记录 | ET1 3-{5-methoxy-1-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]-1H-indol-3-yl}propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；277 K；The purified PPARa LBD protein was diluted to 10 mg/ml and 1mM of indeglitazar and 2x molar excess of SRC-1 peptide were added prior to crystallization by mixing equal volumes of protein/compound sample with reservoir solution containing 16% PEG 8000, 0.1 M Tris buffer at pH 8.0, 0.02 M lithium sulfate, and 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.258 |
| 3ET1 Structure of PPARalpha with 3-[5-Methoxy-1-(4-methoxy-benzenesulfonyl)-1H-indol-3-yl]-propionic acid 提交 2008-10-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Q
681–696（16 aa）
片段：residues 681-696
|
未记录 | ET1 3-{5-methoxy-1-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]-1H-indol-3-yl}propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；277 K；The purified PPARa LBD protein was diluted to 10 mg/ml and 1mM of indeglitazar and 2x molar excess of SRC-1 peptide were added prior to crystallization by mixing equal volumes of protein/compound sample with reservoir solution containing 16% PEG 8000, 0.1 M Tris buffer at pH 8.0, 0.02 M lithium sulfate, and 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.258 |
| 3ET3 Structure of PPARgamma with 3-[5-Methoxy-1-(4-methoxy-benzenesulfonyl)-1H-indol-3-yl]-propionic acid 提交 2008-10-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
680–695（16 aa）
片段：residues 681-696
|
未记录 | ET1 3-{5-methoxy-1-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]-1H-indol-3-yl}propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；The purified PPARg LBD protein was diluted to 12 mg/ml and 1mM of indeglitazar and 2x molar excess of SRC-1 peptide were added prior to crystallization by mixing equal volumes of protein/compound sample with reservoir solution containing 27% polyethylene glycol (PEG) 4000, 0.1 M 2-(bis-(2-hydroxy-ethyl)-amino)-2-hydroxymethyl- propane-1,3-diol (BisTris) buffer at pH 6.5, 0.2 M ammonium acetate, and 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.236 |
| 3FEI Design and biological evaluation of novel, balanced dual PPARa/g agonists 提交 2008-11-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Z
744–756（13 aa）
|
未记录 | CTM (2S)-3-(4-{[2-(4-chlorophenyl)-1,3-thiazol-4-yl]methoxy}-2-methylphenyl)-2-ethoxypropanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris, 0.2M MgCl2, 25% PEG3350, 15% Glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 3FEJ Design and biological evaluation of novel, balanced dual PPARa/g agonists 提交 2008-11-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
628–640（13 aa）
|
未记录 | CTM (2S)-3-(4-{[2-(4-chlorophenyl)-1,3-thiazol-4-yl]methoxy}-2-methylphenyl)-2-ethoxypropanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris, 15-20% PEG3350, 10% Glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.250 |
| 3FUR Crystal Structure of PPARg in complex with INT131 提交 2009-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
629–640（12 aa）
片段：FRAGMENT CONTAINING HD1, UNP residues 629-640
|
未记录 | Z12 2,4-dichloro-N-[3,5-dichloro-4-(quinolin-3-yloxy)phenyl]benzenesulfonamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；30% PEG 4000, 0.2M MgCl2, Tris-HCl 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.242 |
| 3FXV Identification of an N-oxide pyridine GW4064 analogue as a potent FXR agonist 提交 2009-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
744–756（13 aa）
片段：residues 744-756
|
未记录 | 643 6-(4-{[3-(3,5-dichloropyridin-4-yl)-5-(1-methylethyl)isoxazol-4-yl]methoxy}-2-methylphenyl)-1-methyl-1H-indole-3-carbox ylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.26 Å R-free 0.242 |
| 3G8I Aleglitazar, a new, potent, and balanced PPAR alpha/gamma agonist for the treatment of type II diabetes 提交 2009-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Z
744–756（13 aa）
片段：motif 5
|
未记录 | RO7 (2S)-2-methoxy-3-{4-[2-(5-methyl-2-phenyl-1,3-oxazol-4-yl)ethoxy]-1-benzothiophen-7-yl}propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；20-22% PEG 2000, 0.2M NACL, 5% GLYCEROL, 0.1M TRIS-CL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.261 |
| 3G9E Aleglitaar. a new. potent, and balanced dual ppara/g agonist for the treatment of type II diabetes 提交 2009-02-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
628–640（13 aa）
片段：CO-ACTIVATOR MOTIF 3
|
未记录 | RO7 (2S)-2-methoxy-3-{4-[2-(5-methyl-2-phenyl-1,3-oxazol-4-yl)ethoxy]-1-benzothiophen-7-yl}propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M NaK TARTRATE, 25% PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.262 |
| 3H0A Crystal Structure of Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma (PPARg) and Retinoic Acid Receptor Alpha (RXRa) in Complex with 9-cis Retinoic Acid, Co-activator Peptide, and a Partial Agonist 提交 2009-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
629–640（12 aa）
片段：UNP RESIDUES 629-640
链 E
629–640（12 aa）
片段：UNP RESIDUES 629-640
|
未记录 | 9RA 4-[1-(3,5,5,8,8-pentamethyl-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)ethenyl]benzoic acid × 1 D30 [(4-{[2-(pent-2-yn-1-yloxy)-4-{[4-(trifluoromethyl)phenoxy]methyl}phenyl]sulfanyl}-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-1-yl)oxy]acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；289 K；25% PEG 2000 monomethyl ether, 0.3 M sodium acetate, 0.1 M Hepes 7.5, vapor diffusion, temperature 289K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.342 |
| 3HC5 FXR with SRC1 and GSK826 提交 2009-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
741–761（21 aa）
片段：SRC1
|
未记录 | 82X 3-(6-{[3-(2,6-dichlorophenyl)-5-(1-methylethyl)isoxazol-4-yl]methoxy}-1-benzothiophen-2-yl)benzoic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris, 25% PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.269 |
| 3HC6 FXR with SRC1 and GSK088 提交 2009-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
741–761（21 aa）
片段：LXXLL Motif
|
未记录 | 088 3-[(5-{[3-(2,6-dichlorophenyl)-5-(1-methylethyl)isoxazol-4-yl]methoxy}-1H-indol-1-yl)methyl]benzoic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris, 25% PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.287 |
| 3HVL Tethered PXR-LBD/SRC-1p complexed with SR-12813 提交 2009-06-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
678–700（23 aa）
片段：PXR, residues 130-434, linker, SRC-1, residues 678-700
|
未记录 | SRL [2-(3,5-DI-TERT-BUTYL-4-HYDROXY-PHENYL)-1-(DIETHOXY-PHOSPHORYL)-VINYL]-PHOSPHONIC ACID DIETHLYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；10-30% MPD OR ISOPROPANOL, 100 mM IMIDAZOLE, 1 mM SR12813, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.265 |
| 3HVL Tethered PXR-LBD/SRC-1p complexed with SR-12813 提交 2009-06-16 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
678–700（23 aa）
片段：PXR, residues 130-434, linker, SRC-1, residues 678-700
|
未记录 | SRL [2-(3,5-DI-TERT-BUTYL-4-HYDROXY-PHENYL)-1-(DIETHOXY-PHOSPHORYL)-VINYL]-PHOSPHONIC ACID DIETHLYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；10-30% MPD OR ISOPROPANOL, 100 mM IMIDAZOLE, 1 mM SR12813, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.265 |
| 3HVL Tethered PXR-LBD/SRC-1p complexed with SR-12813 提交 2009-06-16 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–700（23 aa）
片段：PXR, residues 130-434, linker, SRC-1, residues 678-700
链 B
678–700（23 aa）
片段：PXR, residues 130-434, linker, SRC-1, residues 678-700
|
未记录 | SRL [2-(3,5-DI-TERT-BUTYL-4-HYDROXY-PHENYL)-1-(DIETHOXY-PHOSPHORYL)-VINYL]-PHOSPHONIC ACID DIETHLYL ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；10-30% MPD OR ISOPROPANOL, 100 mM IMIDAZOLE, 1 mM SR12813, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.265 |
| 3IPQ X-ray structure of GW3965 synthetic agonist bound to the LXR-alpha 提交 2009-08-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
676–700（25 aa）
片段：Steroid receptor co-activator 1: UNP residues 676-700
|
未记录 | 965 [3-(3-{[2-chloro-3-(trifluoromethyl)benzyl](2,2-diphenylethyl)amino}propoxy)phenyl]acetic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100mM (NH4)2SO4, 40mM Tris-HCl pH 7.8, 60mM Imidazole pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 3IPS X-ray structure of benzisoxazole synthetic agonist bound to the LXR-alpha 提交 2009-08-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
676–700（25 aa）
片段：Steroid receptor co-activator 1: UNP residues 676-700
链 D
676–700（25 aa）
片段：Steroid receptor co-activator 1: UNP residues 676-700
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 O90 {3-chloro-4-[(3-{[7-propyl-3-(trifluoromethyl)-1,2-benzisoxazol-6-yl]oxy}propyl)sulfanyl]phenyl}acetic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；18% PEG MME 2000, 100mM (NH4)2SO4, 35mM Tris-HCl pH 7.8, 65mM Imidazole, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.315 |
| 3IPU X-ray structure of benzisoxazole urea synthetic agonist bound to the LXR-alpha 提交 2009-08-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
676–700（25 aa）
片段：Steroid receptor co-activator 1: UNP residues 676-700
链 D
676–700（25 aa）
片段：Steroid receptor co-activator 1: UNP residues 676-700
|
未记录 | O40 4-{[methyl(3-{[7-propyl-3-(trifluoromethyl)-1,2-benzisoxazol-6-yl]oxy}propyl)carbamoyl]amino}benzoic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10% PEG MME 2000, 100mM (NH4)2SO4, 40mM Tris-HCl pH 7.8, 60mM Imidazole pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.291 |
| 3KMR Crystal structure of RARalpha ligand binding domain in complex with an agonist ligand (Am580) and a coactivator fragment 提交 2009-11-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
686–698（13 aa）
片段：NR interaction motif 2 (UNP RESIDUE 686-698)
|
未记录 | EQN 4-{[(5,5,8,8-tetramethyl-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)carbonyl]amino}benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；15% (w/v) PEG 6000, 5% (w/v) glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.237 |
| 3LMP Crystal structure of the PPARgamma-LBD complexed with a cercosporamide derivative modulator 提交 2010-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
686–700（15 aa）
片段：UNP residues 686-700
|
未记录 | CEK (9aS)-8-acetyl-1,7-dihydroxy-3-methoxy-9a-methyl-N-(1-naphthylmethyl)-9-oxo-9,9a-dihydrodibenzo[b,d]furan-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；PEG 4000, NaSCN, vapor diffusion, temperature 295K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 8.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.242 |
| 3OKH Crystal structure of human FXR in complex with 2-(4-chlorophenyl)-1-[(1S)-1-cyclohexyl-2-(cyclohexylamino)-2-oxoethyl]-1H-benzimidazole-6-carboxylic acid 提交 2010-08-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OKH 2-(4-chlorophenyl)-1-[(1S)-1-cyclohexyl-2-(cyclohexylamino)-2-oxoethyl]-1H-benzimidazole-6-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M NaCl, 0.1M BisTris pH6.5, 1.5M AmmSulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.273 |
| 3OKI Crystal structure of human FXR in complex with (2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-1H-benzimidazol-1-yl]-N,2-dicyclohexylethanamide 提交 2010-08-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OKI (2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-1H-benzimidazol-1-yl]-N,2-dicyclohexylethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 28% PEG 2000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.280 |
| 3OKI Crystal structure of human FXR in complex with (2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-1H-benzimidazol-1-yl]-N,2-dicyclohexylethanamide 提交 2010-08-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OKI (2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-1H-benzimidazol-1-yl]-N,2-dicyclohexylethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 28% PEG 2000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.280 |
| 3OLF Crystal structure of human FXR in complex with 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)-3-methylbenzoic acid 提交 2010-08-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OLF 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)-3-methylbenzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M HEPES pH 7.5, 1.4M tri-sodium citrate dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.238 |
| 3OLF Crystal structure of human FXR in complex with 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)-3-methylbenzoic acid 提交 2010-08-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OLF 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)-3-methylbenzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M HEPES pH 7.5, 1.4M tri-sodium citrate dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.238 |
| 3OLL Crystal structure of phosphorylated estrogen receptor beta ligand binding domain 提交 2010-08-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
683–701（19 aa）
片段：UNP residues 683-701
|
未记录 | EST ESTRADIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.208 |
| 3OLL Crystal structure of phosphorylated estrogen receptor beta ligand binding domain 提交 2010-08-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
683–701（19 aa）
片段：UNP residues 683-701
|
未记录 | EST ESTRADIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.208 |
| 3OLL Crystal structure of phosphorylated estrogen receptor beta ligand binding domain 提交 2010-08-26 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
683–701（19 aa）
片段：UNP residues 683-701
链 D
683–701（19 aa）
片段：UNP residues 683-701
|
未记录 | EST ESTRADIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.208 |
| 3OLS Crystal structure of estrogen receptor beta ligand binding domain 提交 2010-08-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
|
未记录 | EST ESTRADIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.266 |
| 3OLS Crystal structure of estrogen receptor beta ligand binding domain 提交 2010-08-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
|
未记录 | EST ESTRADIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.266 |
| 3OLS Crystal structure of estrogen receptor beta ligand binding domain 提交 2010-08-26 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
链 D
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
|
未记录 | EST ESTRADIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.266 |
| 3OMK Crystal structure of human FXR in complex with (2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexyl-N-(2-methylphenyl)ethanamide 提交 2010-08-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OMK (2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexyl-N-(2-methylphenyl)ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.245 |
| 3OMK Crystal structure of human FXR in complex with (2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexyl-N-(2-methylphenyl)ethanamide 提交 2010-08-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OMK (2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexyl-N-(2-methylphenyl)ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.245 |
| 3OMM Crystal structure of human FXR in complex with 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)-3-fluorobenzoic acid 提交 2010-08-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OMM 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)-3-fluorobenzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M 2,2-Bis(hydroxymethyl)-2,2',2''-nitrilotriethanol pH 6.5, 20% PEG 5000 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.256 |
| 3OMM Crystal structure of human FXR in complex with 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)-3-fluorobenzoic acid 提交 2010-08-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OMM 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)-3-fluorobenzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M 2,2-Bis(hydroxymethyl)-2,2',2''-nitrilotriethanol pH 6.5, 20% PEG 5000 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.256 |
| 3OMO Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
|
未记录 | WV7 2-(trifluoroacetyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.264 |
| 3OMO Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
|
未记录 | WV7 2-(trifluoroacetyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.264 |
| 3OMO Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
链 D
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
|
未记录 | WV7 2-(trifluoroacetyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.264 |
| 3OMP Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
|
未记录 | W14 2-(trifluoroacetyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-7-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.255 |
| 3OMP Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
|
未记录 | W14 2-(trifluoroacetyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-7-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.255 |
| 3OMP Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
链 D
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
|
未记录 | W14 2-(trifluoroacetyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-7-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.255 |
| 3OMQ Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
|
未记录 | W23 2-[(trifluoromethyl)sulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.260 |
| 3OMQ Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
|
未记录 | W23 2-[(trifluoromethyl)sulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.260 |
| 3OMQ Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
链 D
683–701（19 aa）
片段：Box 2 (UNP residues 683-701)
|
未记录 | W23 2-[(trifluoromethyl)sulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.260 |
| 3OOF Crystal structure of human FXR in complex with 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)benzoic acid 提交 2010-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OOF 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.255 |
| 3OOF Crystal structure of human FXR in complex with 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)benzoic acid 提交 2010-08-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OOF 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.255 |
| 3OOK Crystal structure of human FXR in complex with 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)-3,5-difluorobenzoic acid 提交 2010-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OOK 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)-3,5-difluorobenzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 20% PEG 5000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.271 |
| 3OOK Crystal structure of human FXR in complex with 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)-3,5-difluorobenzoic acid 提交 2010-08-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
744–757（14 aa）
片段：UNP RESIDUES 744-757
|
未记录 | OOK 4-({(2S)-2-[2-(4-chlorophenyl)-5,6-difluoro-1H-benzimidazol-1-yl]-2-cyclohexylacetyl}amino)-3,5-difluorobenzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 20% PEG 5000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.271 |
| 3QT0 Revealing a steroid receptor ligand as a unique PPARgamma agonist 提交 2011-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
685–700（16 aa）
片段：UNP residies 685-700
|
未记录 | 486 11-(4-DIMETHYLAMINO-PHENYL)-17-HYDROXY-13-METHYL-17-PROP-1-YNYL-1,2,6,7,8,11,12,13,14,15,16,17-DODEC AHYDRO-CYCLOPENTA[A]PHENANTHREN-3-ONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG, Tris-HCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.277 |
| 3RUT FXR with SRC1 and GSK359 提交 2011-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
745–755（11 aa）
片段：UNP residues 745-755
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 59G 6-(4-{[3-(2,6-dichlorophenyl)-5-(propan-2-yl)-1,2-oxazol-4-yl]methoxy}phenyl)-1-benzothiophene-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.266 |
| 3RUU FXR with SRC1 and GSK237 提交 2011-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
745–755（11 aa）
片段：UNP residues 745-755
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 37G 6-(4-{[3-(2,6-dichlorophenyl)-5-(propan-2-yl)-1,2-oxazol-4-yl]methoxy}phenyl)-1H-indole-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.253 |
| 3RVF FXR with SRC1 and GSK2034 提交 2011-05-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
741–761（21 aa）
片段：UNP residues 741-761
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 034 5-(4-{[3-(2,6-dichlorophenyl)-5-(propan-2-yl)-1,2-oxazol-4-yl]methoxy}phenyl)-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.290 |
| 3S9S Ligand binding domain of PPARgamma complexed with a benzimidazole partial agonist 提交 2011-06-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–697（13 aa）
片段：LXXLL MOTIF 4 (RESIDUES 685-697)
|
未记录 | M0T 1-(3,4-dichlorobenzyl)-2-methyl-N-[(1R)-1-phenylpropyl]-1H-benzimidazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；100MM HEPES, 1.4M SODIUM CITRATE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.284 |
| 3T03 Crystal structure of PPAR gamma ligand binding domain in complex with a novel partial agonist GQ-16 提交 2011-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：monomeric（1） 待复核 |
链 C
683–700（18 aa）
片段：UNP residues 683-700
|
未记录 | 3T0 (5Z)-5-(5-bromo-2-methoxybenzylidene)-3-(4-methylbenzyl)-1,3-thiazolidine-2,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate, pH 5.6, 30%(w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.247 |
| 3T03 Crystal structure of PPAR gamma ligand binding domain in complex with a novel partial agonist GQ-16 提交 2011-07-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：monomeric（1） 待复核 |
链 D
683–700（18 aa）
片段：UNP residues 683-700
|
未记录 | 3T0 (5Z)-5-(5-bromo-2-methoxybenzylidene)-3-(4-methylbenzyl)-1,3-thiazolidine-2,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate, pH 5.6, 30%(w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.247 |
| 3UU7 Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with bisphenol-A 提交 2011-11-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
686–698（13 aa）
片段：Coactivator peptide SRC-1
链 G
686–698（13 aa）
片段：Coactivator peptide SRC-1
|
未记录 | 2OH 4,4'-PROPANE-2,2-DIYLDIPHENOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；300 mM NaCl, 100 mM NaHepes pH 7.75, 30% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.246 |
| 3UU7 Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with bisphenol-A 提交 2011-11-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
686–698（13 aa）
片段：Coactivator peptide SRC-1
|
未记录 | 2OH 4,4'-PROPANE-2,2-DIYLDIPHENOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；300 mM NaCl, 100 mM NaHepes pH 7.75, 30% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.246 |
| 3UU7 Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with bisphenol-A 提交 2011-11-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
686–698（13 aa）
片段：Coactivator peptide SRC-1
|
未记录 | 2OH 4,4'-PROPANE-2,2-DIYLDIPHENOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；300 mM NaCl, 100 mM NaHepes pH 7.75, 30% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.246 |
| 3UUA Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with bisphenol-AF 提交 2011-11-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
686–698（13 aa）
片段：Coactivator peptide SRC-1
链 G
686–698（13 aa）
片段：Coactivator peptide SRC-1
|
未记录 | 0CZ 4,4'-(1,1,1,3,3,3-hexafluoropropane-2,2-diyl)diphenol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；300 mM NaCl, 100 mM Hepes pH 7.75, 32% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.231 |
| 3UUA Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with bisphenol-AF 提交 2011-11-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
686–698（13 aa）
片段：Coactivator peptide SRC-1
|
未记录 | 0CZ 4,4'-(1,1,1,3,3,3-hexafluoropropane-2,2-diyl)diphenol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；300 mM NaCl, 100 mM Hepes pH 7.75, 32% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.231 |
| 3UUA Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with bisphenol-AF 提交 2011-11-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
686–698（13 aa）
片段：Coactivator peptide SRC-1
|
未记录 | 0CZ 4,4'-(1,1,1,3,3,3-hexafluoropropane-2,2-diyl)diphenol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；300 mM NaCl, 100 mM Hepes pH 7.75, 32% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.231 |
| 3UUD Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with estradiol 提交 2011-11-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
686–698（13 aa）
片段：Coactivator peptide SRC-1
链 D
686–698（13 aa）
片段：Coactivator peptide SRC-1
|
未记录 | EST ESTRADIOL × 2 GOL GLYCEROL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；200 mM Li2SO4, 100 mM Tris pH 8.5, 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.195 |
| 3UUD Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with estradiol 提交 2011-11-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
686–698（13 aa）
片段：Coactivator peptide SRC-1
|
未记录 | EST ESTRADIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；200 mM Li2SO4, 100 mM Tris pH 8.5, 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.195 |
| 3UUD Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with estradiol 提交 2011-11-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
686–698（13 aa）
片段：Coactivator peptide SRC-1
|
未记录 | EST ESTRADIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；200 mM Li2SO4, 100 mM Tris pH 8.5, 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.195 |
| 3V9Y Crystal structure of the PPARgamma-LBD complexed with a cercosporamide derivative modulator 提交 2011-12-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | 24L 4-{4-[({[(9aS)-8-acetyl-1,7-dihydroxy-3-methoxy-9a-methyl-9-oxo-9,9a-dihydrodibenzo[b,d]furan-4-yl]carbonyl}amino)methyl]naphthalen-2-yl}butanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；PEG 4000, sodium thiocyanate, Tris-hydrochloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.252 |
| 3VN2 Crystal Structure of PPARgamma complexed with Telmisartan 提交 2011-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
685–700（16 aa）
片段：Coactivator fragment SRC-1, UNP residues 685-700
|
未记录 | TLS 4'-[(1,7'-dimethyl-2'-propyl-1H,3'H-2,5'-bibenzimidazol-3'-yl)methyl]biphenyl-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M TRIS-HCL, 0.8M SODIUM CITRATE TRIBASIC DIHYDRATE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.309 |
| 4DK7 Crystal structure of LXR ligand binding domain in complex with full agonist 1 提交 2012-02-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
745–756（12 aa）
片段：UNp residues 745-756
链 D
745–756（12 aa）
片段：UNp residues 745-756
|
未记录 | 0KS N-[4-(1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-hydroxypropan-2-yl)phenyl]-N-methylbenzenesulfonamide × 2 ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1 M Tris pH 8, 12% PEG 10000, 0.2 M calcium acetate, 0.005 M DTT, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.270 |
| 4DK8 Crystal structure of LXR ligand binding domain in complex with partial agonist 5 提交 2012-02-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
745–756（12 aa）
片段：UNP residues 745-756
链 D
745–756（12 aa）
片段：UNP residues 745-756
|
未记录 | 0KT N-methyl-N-(4-{(1S)-2,2,2-trifluoro-1-hydroxy-1-[1-(2-methoxyethyl)-1H-pyrrol-2-yl]ethyl}phenyl)benzenesulfonamide × 2 ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1 M Tris, 12% PEG 10000, 0.2 M calcium acetate, 0.005 M DTT, pH 8, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.278 |
| 4DM6 Crystal structure of RARb LBD homodimer in complex with TTNPB 提交 2012-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
676–700（25 aa）
片段：unp residues 676-700
|
未记录 | TTB 4-[(1E)-2-(5,5,8,8-TETRAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRONAPHTHALEN-2-YL)PROP-1-ENYL]BENZOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；5% polyethylene glycol 8000, 0.2 M KCl, 0.01 M MgCl2 and 0.05 M MES, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K, pH 5.6
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 4DM6 Crystal structure of RARb LBD homodimer in complex with TTNPB 提交 2012-02-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
676–700（25 aa）
片段：unp residues 676-700
|
未记录 | TTB 4-[(1E)-2-(5,5,8,8-TETRAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRONAPHTHALEN-2-YL)PROP-1-ENYL]BENZOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；5% polyethylene glycol 8000, 0.2 M KCl, 0.01 M MgCl2 and 0.05 M MES, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K, pH 5.6
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 4DM8 Crystal structure of RARb LBD in complex with 9cis retinoic acid 提交 2012-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
676–700（25 aa）
片段：unp residues 676-700
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；5% polyethylene glycol 8000, 0.2 M
KCl, 0.01 M MgCl2 and 0.05 M MES pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 4DM8 Crystal structure of RARb LBD in complex with 9cis retinoic acid 提交 2012-02-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
676–700（25 aa）
片段：unp residues 676-700
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；5% polyethylene glycol 8000, 0.2 M
KCl, 0.01 M MgCl2 and 0.05 M MES pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 4DQM Revealing a marine natural product as a novel agonist for retinoic acid receptors with a unique binding mode and antitumor activity 提交 2012-02-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1432–1441（10 aa）
片段：LXXLL motif 7, UNP RESIDUES 1432-1441
|
未记录 | LUF (5S)-4-[(3E,7E)-4,8-dimethyl-10-(2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl)deca-3,7-dien-1-yl]-5-hydroxyfuran-2(5H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2% v/v Tacsimate pH7.0, 5% 2-propanol, 0.1M imadazole , 8% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.259 |
| 4DQM Revealing a marine natural product as a novel agonist for retinoic acid receptors with a unique binding mode and antitumor activity 提交 2012-02-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1432–1441（10 aa）
片段：LXXLL motif 7, UNP RESIDUES 1432-1441
|
未记录 | LUF (5S)-4-[(3E,7E)-4,8-dimethyl-10-(2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl)deca-3,7-dien-1-yl]-5-hydroxyfuran-2(5H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2% v/v Tacsimate pH7.0, 5% 2-propanol, 0.1M imadazole , 8% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.259 |
| 4F9M Crystal structure of the PPARgamma-LBD complexed with a cercosporamide derivative modulator 提交 2012-05-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
686–700（15 aa）
片段：LXXLL box, UNP residues 686-700
|
未记录 | FCM (9aS)-8-acetyl-N-[(2-ethyl-4-fluoronaphthalen-1-yl)methyl]-1,7-dihydroxy-3-methoxy-9a-methyl-9-oxo-9,9a-dihydrodibenzo[b,d]furan-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；PEG 4000, Sodium thiocyanate, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.254 |
| 4FGY Identification of a unique PPAR ligand with an unexpected binding mode and antibetic activity 提交 2012-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
686–696（11 aa）
片段：UNP RESIDUES 686-696
|
未记录 | 0W3 (4R,6S,8S,12R,14R,16Z,18R,19R,20S,21S)-19,21-dihydroxy-22-{(2S,2'R,5S,5'S)-5'-[(1R)-1-hydroxyethyl]-2,5'-dimethyloctahydro-2,2'-bifuran-5-yl}-4,6,8,12,14,18,20-heptamethyl-9,11-dioxodocos-16-enoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；0.2 M sodium acetate, 5% ethylene glycol, 20% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.84 Å R-free 0.285 |
| 4G1D Structural basis for the accommodation of bis- and tris-aromatic derivatives in Vitamin D Nuclear Receptor 提交 2012-07-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：unp residues 686-700
|
未记录 | 0VK 3-(5'-{[3,4-bis(hydroxymethyl)benzyl]oxy}-2'-methyl-2-propylbiphenyl-4-yl)pentan-3-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；Bis-Tris 0.1 M, lithium sulfate 1.6 M and magnesium sulfate 50 mM, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K, pH 6.5
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.291 |
| 4G1Y Structural basis for the accommodation of bis- and tris-aromatic derivatives in Vitamin D Nuclear Receptor 提交 2012-07-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：unp residues 686-700
|
未记录 | 0VO (4E,6Z)-7-(3-{[3,4-bis(hydroxymethyl)benzyl]oxy}phenyl)-3-ethylnona-4,6-dien-3-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；Bis-Tris 0.1 M, lithium sulfate 1.6 M and magnesium sulfate 50 mM, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.270 |
| 4G1Z Structural basis for the accommodation of bis- and tris-aromatic derivatives in Vitamin D Nuclear Receptor 提交 2012-07-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：unp residues 686-692
|
未记录 | 0VP 3-(5'-{[3,4-bis(hydroxymethyl)benzyl]oxy}-2'-ethyl-2-propylbiphenyl-4-yl)pentan-3-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；Bis-Tris 0.1 M, lithium sulfate 1.6 M and magnesium sulfate 50 mM, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K, pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.274 |
| 4G20 Structural basis for the accommodation of bis- and tris-aromatic derivatives in Vitamin D Nuclear Receptor 提交 2012-07-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：unp residues 686-700
|
未记录 | 484 3-(5'-{2-[3,4-bis(hydroxymethyl)phenyl]ethyl}-2'-methyl-2-propylbiphenyl-4-yl)pentan-3-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Bis-Tris 0.1 M, lithium sulfate 1.6 M and magnesium sulfate 50 mM, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.287 |
| 4G21 Structural basis for the accommodation of bis- and tris-aromatic derivatives in Vitamin D Nuclear Receptor 提交 2012-07-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：unp residues 686-700
|
未记录 | 0VP 3-(5'-{[3,4-bis(hydroxymethyl)benzyl]oxy}-2'-ethyl-2-propylbiphenyl-4-yl)pentan-3-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；Bis-Tris 0.1 M, lithium sulfate 1.6 M and magnesium sulfate 50 mM , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.291 |
| 4G2H Structural basis for the accommodation of bis- and tris-aromatic derivatives in Vitamin D Nuclear Receptor 提交 2012-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：unp residues 686-692
|
未记录 | 0VQ (3E,5E)-6-(3-{2-[3,4-bis(hydroxymethyl)phenyl]ethyl}phenyl)-1,1,1-trifluoro-2-(trifluoromethyl)octa-3,5-dien-2-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Bis-Tris 0.1 M, lithium sulfate 1.6 M and magnesium sulfate 50 mM, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.285 |
| 4HEE Crystal structure of PPARgamma in complex with compound 13 提交 2012-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Y
676–700（25 aa）
片段：UNP Residues 676-700
|
未记录 | 14R 5-benzyl-2-ethyl-3-{(1S)-5-[2-(1H-tetrazol-5-yl)phenyl]-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl}-3,5-dihydro-4H-imidazo[4,5-c]pyridin-4-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100mM PIPES, 200mM Sodium Thiocyanate, 16% PEG4000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.258 |
| 4J5W Crystal Structure of the apo-PXR/RXRalpha LBD Heterotetramer Complex 提交 2013-02-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
678–700（23 aa）
链 B
678–700（23 aa）
链 C
678–700（23 aa）
链 D
678–700（23 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；16-20% PEG 8000, 0.1-0.2 M MgCl, 0.1 M bis-tris proprane, 0.02% sodium azide, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277.15K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.298 |
| 4J5X Crystal Structure of the SR12813-bound PXR/RXRalpha LBD Heterotetramer Complex 提交 2013-02-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
678–700（23 aa）
链 B
678–700（23 aa）
链 C
678–700（23 aa）
链 D
678–700（23 aa）
|
未记录 | SRL [2-(3,5-DI-TERT-BUTYL-4-HYDROXY-PHENYL)-1-(DIETHOXY-PHOSPHORYL)-VINYL]-PHOSPHONIC ACID DIETHLYL ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；16-20% PEG 8000, 0.1-0.2 M MgCl, 0.1 M bis-tris proprane, 0.02% sodium azide, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277.15K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.298 |
| 4JYG Crystal structure of RARbeta LBD in complex with agonist BMS411 [4-{[(5,5-dimethyl-8-phenyl-5,6-dihydronaphthalen-2-yl)carbonyl]amino}benzoic acid] 提交 2013-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
686–698（13 aa）
片段：UNP residues 686-698
链 G
686–698（13 aa）
片段：UNP residues 686-698
|
未记录 | 1NY 4-{[(5,5-dimethyl-8-phenyl-5,6-dihydronaphthalen-2-yl)carbonyl]amino}benzoic acid × 2 PE4 2-{2-[2-(2-{2-[2-(2-ETHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；291 K；200 mM Tri Sodium Citrate pH 5.5, 25 % PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.257 |
| 4JYH Crystal structure of RARbeta LBD in complex with selective agonist BMS948 [4-{[(8-phenylnaphthalen-2-yl)carbonyl]amino}benzoic acid] 提交 2013-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
686–698（13 aa）
片段：UNP residues 686-698
链 G
686–698（13 aa）
片段：UNP residues 686-698
|
未记录 | JYH 4-{[(8-phenylnaphthalen-2-yl)carbonyl]amino}benzoic acid × 2 FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；291 K；200 mM Tri Sodium Citrate pH 5.5, 25% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 4JYI Crystal structure of RARbeta LBD in complex with selective partial agonist BMS641 [3-chloro-4-[(E)-2-(5,5-dimethyl-8-phenyl-5,6-dihydronaphthalen-2-yl)ethenyl]benzoic acid] 提交 2013-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
686–698（13 aa）
片段：UNP residues 686-698
链 G
686–698（13 aa）
片段：UNP residues 686-698
|
未记录 | JYI 3-chloro-4-[(E)-2-(5,5-dimethyl-8-phenyl-5,6-dihydronaphthalen-2-yl)ethenyl]benzoic acid × 2 FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；291 K；200 mM Tri Sodium Citrate pH 5.5, 25% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.227 |
| 4MG5 Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with chlordecone 提交 2013-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
链 D
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 A1AQV chlordecone × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；340 mM sodium chloride, 100 mM HEPES, 32% PEG3350, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.228 |
| 4MG6 Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with benzylbutylphtalate 提交 2013-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
链 D
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
|
未记录 | 27G benzyl butyl benzene-1,2-dicarboxylate × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；320 mM sodium chloride, 100 mM HEPES, 26% PEG3350, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.230 |
| 4MG7 Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with ferutinine 提交 2013-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
链 D
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
|
未记录 | 27H ferutinine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；320 mM sodium chloride, 100 mM HEPES, 24% PEG3350, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.230 |
| 4MG8 Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with alpha-zearalanol 提交 2013-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
链 D
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
|
未记录 | 27J alpha-zearalanol × 2 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；300 mM sodium chloride, 100 mM HEPES, 24% PEG3350, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.213 |
| 4MG9 Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with butylparaben 提交 2013-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
链 G
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
|
未记录 | 27K butyl 4-hydroxybenzoate × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；300 mM sodium chloride, 100 mM HEPES, 28% PEG3350, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.237 |
| 4MGA Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with 4-tert-octylphenol 提交 2013-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
链 D
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
|
未记录 | 27L 4-(2,4,4-trimethylpentan-2-yl)phenol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；320 mM sodium chloride, 100 mM HEPES, 28% PEG3350, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 4MGB Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with TCBPA 提交 2013-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
链 D
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
|
未记录 | XDH 4,4'-propane-2,2-diylbis(2,6-dichlorophenol) × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；320 mM sodium chloride, 100 mM HEPES, 30% PEG3350, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.250 |
| 4MGC Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with benzophenone-2 提交 2013-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
链 G
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
|
未记录 | 27M bis(2,4-dihydroxyphenyl)methanone × 2 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；300 mM sodium chloride, 100 mM HEPES, 28% PEG3350, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.240 |
| 4MGD Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with HPTE 提交 2013-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
链 G
686–698（13 aa）
片段：coactivator peptide SRC-1 (UNP residues 686-698)
|
未记录 | 27N 4,4'-(2,2,2-trichloroethane-1,1-diyl)diphenol × 2 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；340 mM sodium chloride, 100 mM HEPES, 24% PEG3350, pH 7.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.234 |
| 4RUJ Crystal structure of zVDR L337H mutant-VD complex 提交 2014-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：UNP residues 686-700
|
未记录 | VDX 5-{2-[1-(5-HYDROXY-1,5-DIMETHYL-HEXYL)-7A-METHYL-OCTAHYDRO-INDEN-4-YLIDENE]-ETHYLIDENE}-4-METHYLENE-CYCLOHEXANE-1,3-DIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；297 K；50 mM BIS-TRIS pH6.5, 1.6 M lithium sulfate, 50 mM magnesium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.255 |
| 4RUP Crystal structure of zVDR L337H mutant-Gemini72 complex 提交 2014-11-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：UNP residues 686-700
|
未记录 | H97 (1R,3R,7E,17beta)-17-[(1R)-6,6,6-trifluoro-5-hydroxy-1-(4-hydroxy-4-methylpentyl)-5-(trifluoromethyl)hex-3-yn-1-yl]-9,1 0-secoestra-5,7-diene-1,3-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；Bis-Tris 0.1 M, lithium sulfate 1.6 M and magnesium sulfate 50 mM, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.253 |
| 4UDA MR in complex with dexamethasone 提交 2014-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1427–1441（15 aa）
片段：RESIDUES 1427-1441
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 DEX DEXAMETHASONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；30% PEG4000, 0.1M NACL, 0.2M PIPES PH 7.5
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.240 |
| 4UDB MR in complex with desisobutyrylciclesonide 提交 2014-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1427–1441（15 aa）
片段：RESIDUES 1427-1441
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CV7 DESISOBUYTYRYL CICLESONIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；18% PEG4K, 0.14M LISO4, 85MM TRIS PH 8.5, 15% GLYCEROL
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.218 |
| 4Y29 Identification of a novel PPARg ligand that regulates metabolism 提交 2015-02-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1432–1441（10 aa）
|
未记录 | CTI 1,2-dimethoxy-12-methyl[1,3]benzodioxolo[5,6-c]phenanthridin-12-ium × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.2 M Sodium thiocyanate, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.219 |
| 5A86 Structure of pregnane X receptor in complex with a Sphingosine 1- Phosphate Receptor 1 Antagonist 提交 2015-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
682–698（17 aa）
链 D
682–698（17 aa）
|
未记录 | D7E 4-chloro-N-[(1R)-1-[1-ethyl-6-(trifluoromethyl)benzimidazol-2-yl]ethyl]benzenesulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.25 Å R-free 0.256 |
| 5AVI Crystal structure of LXRalpha in complex with tert-butyl benzoate analog, compound 4 提交 2015-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
676–700（25 aa）
片段：UNP residues 676-700
链 D
676–700（25 aa）
片段：UNP residues 676-700
|
未记录 | 4KM tert-butyl 2-[[4-[ethanoyl(methyl)amino]phenoxy]methyl]-5-(trifluoromethyl)benzoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG2000MME, ammonium sulfate, Tris-HCl
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 5AVL Crystal structure of LXRalpha in complex with tert-butyl benzoate analog, compound 32b 提交 2015-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
676–700（25 aa）
片段：UNP residues 676-700
|
未记录 | 4KQ 2-[4-[4-[[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]-3-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)phenyl]methoxy]phenyl]phenyl]ethanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG2000MME, ammonium sulfate, Tris-HCl
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.243 |
| 5AZT Ternary complex of hPPARalpha ligand binding domain, 17-oxoDHA and a SRC1 peptide 提交 2015-10-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
683–697（15 aa）
|
未记录 | 4M5 (4~{Z},7~{Z},10~{Z},13~{Z},19~{Z})-17-oxidanylidenedocosa-4,7,10,13,19-pentaenoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M HEPES, 35% PEG3350
|
分辨率 3.45 Å R-free 0.308 |
| 5DV3 Human PPARgamma ligand binding dmain complexed with SB1405 in a covalent bonded form 提交 2015-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
片段：UNP RESIDUES 685-700
|
未记录 | B05 N-[2-(benzyloxy)phenyl]-3-nitrobenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；297 K；2.2M sodium malonate pH 7.0
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.230 |
| 5DV6 Human PPARgamma ligand binding dmain complexed with SB1404 in a covalent bonded form 提交 2015-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
片段：UNP RESIDUES 685-700
|
未记录 | B4H N-methylidene-3-nitrobenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；297 K；2.2M sodium malonate pH 7.0
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 5DV8 Human PPARgamma ligand binding dmain complexed with SB1451 in a covalent bonded form 提交 2015-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
片段：UNP RESIDUES 685-700
|
未记录 | T51 N-[2-({2-[({4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]benzoyl}amino)methyl]benzyl}oxy)phenyl]-3-nitrobenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；297 K；0.19M sodium acetate trihydrate, 0.1M sodium cacodylate pH 6.5, 26% PEG 8000
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.243 |
| 5DVC Human PPARgamma ligand binding dmain complexed with SB1453 in a covalent bonded form 提交 2015-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
片段：UNP RESIDUES 685-700
|
未记录 | T53 N-[2-({3-[({4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]benzoyl}amino)methyl]benzyl}oxy)phenyl]-3-nitrobenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；297 K；2.2 M sodium malonate pH 7.0
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.241 |
| 5DWL Human PPARgamma ligand binding dmain in complex with SR1664 提交 2015-09-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
片段：UNP RESIDUES 685-700
|
未记录 | 3JX 4'-[(2,3-dimethyl-5-{[(1S)-1-(4-nitrophenyl)ethyl]carbamoyl}-1H-indol-1-yl)methyl]biphenyl-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；297 K；2.2 M sodium malonate pH7.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.238 |
| 5HJS Identification of LXRbeta selective agonists for the treatment of Alzheimer's Disease 提交 2016-01-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
676–700（25 aa）
链 D
676–700（25 aa）
|
未记录 | 668 2-chloro-4-{1'-[(2R)-2-hydroxy-3-methyl-2-(trifluoromethyl)butanoyl]-4,4'-bipiperidin-1-yl}-N,N-dimethylbenzamide × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；12% PEG MME 2000, 0.1M Ammonium Sulfate, 0.1M Tris buffer pH 7.8
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.238 |
| 5JI0 PPARgamma-RXRalpha(S427F) heterodimer in complex with SRC-1, rosiglitazone, and 9-cis-retanoic acid 提交 2016-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
676–700（25 aa）
链 F
676–700（25 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 BRL 2,4-THIAZOLIDIINEDIONE, 5-[[4-[2-(METHYL-2-PYRIDINYLAMINO)ETHOXY]PHENYL]METHYL]-(9CL) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；Crystals grew in the dark at room temperature from 0.5 + 0.5 uL sitting drops equilibrated over a reservoir containing 20-24% PEG3350 and 0.02M Na Citrate
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.246 |
| 5JI0 PPARgamma-RXRalpha(S427F) heterodimer in complex with SRC-1, rosiglitazone, and 9-cis-retanoic acid 提交 2016-04-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
676–700（25 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；Crystals grew in the dark at room temperature from 0.5 + 0.5 uL sitting drops equilibrated over a reservoir containing 20-24% PEG3350 and 0.02M Na Citrate
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.246 |
| 5JI0 PPARgamma-RXRalpha(S427F) heterodimer in complex with SRC-1, rosiglitazone, and 9-cis-retanoic acid 提交 2016-04-21 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
676–700（25 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BRL 2,4-THIAZOLIDIINEDIONE, 5-[[4-[2-(METHYL-2-PYRIDINYLAMINO)ETHOXY]PHENYL]METHYL]-(9CL) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；Crystals grew in the dark at room temperature from 0.5 + 0.5 uL sitting drops equilibrated over a reservoir containing 20-24% PEG3350 and 0.02M Na Citrate
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.246 |
| 5JMM Crystal structure of hERa-LBD (Y537S) in complex with biochanin A 提交 2016-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
686–698（13 aa）
片段：UNP residues 686-698
链 G
686–698（13 aa）
片段：UNP residues 686-698
|
未记录 | QSO 5,7-dihydroxy-3-(4-methoxyphenyl)-4H-chromen-4-one × 2 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；291 K；250 mM NaCl
100 mM Hepes
16% PEG3350
5% DMSO
10 mM b-mercaptoethanol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.216 |
| 5MX7 1a,20S-dihydroxyvitamin D3 VDR complex 提交 2017-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B1
686–700（15 aa）
片段：UNP residues 686-700
|
未记录 | D3V 1a,20S-dihydroxyvitamin D3 × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；BisTris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.225 |
| 5NMA Structure-activity relationship study of vitamin D analogs with oxolane group in their side chain 提交 2017-04-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：UNP residues 686-700
|
未记录 | 9CW (1~{R},3~{S},5~{Z})-5-[(2~{E})-2-[(1~{R},3~{a}~{S},7~{a}~{R})-7~{a}-methyl-1-[(1~{S})-1-[(2~{S},5~{S})-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)oxolan-2-yl]ethyl]-2,3,3~{a},5,6,7-hexahydro-1~{H}-inden-4-ylidene]ethylidene]-4-methylidene-cyclohexane-1,3-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；290 K；0.1 M BTP pH 7.0, 3 M NaOAc
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.272 |
| 5NMB Structure-activity relationship study of vitamin D analogs with oxolane group in their side chain 提交 2017-04-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B2
686–700（15 aa）
片段：UNP residues 686-700
|
未记录 | 9CZ (1~{R},3~{S},5~{Z})-5-[(2~{E})-2-[(1~{R},3~{a}~{S},7~{a}~{R})-7~{a}-methyl-1-[(1~{S})-1-[(2~{S},5~{R})-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)oxolan-2-yl]ethyl]-2,3,3~{a},5,6,7-hexahydro-1~{H}-inden-4-ylidene]ethylidene]-4-methylidene-cyclohexane-1,3-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；290 K；0.1 M BTP pH 7.0, 3 M NaOAc
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.260 |
| 5NWM Insight into the molecular recognition mechanism of the coactivator NCoA1 by STAT6 提交 2017-05-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
257–385（129 aa）
片段：UNP residues 257-385
|
突变：K343R | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；309 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成
50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 10 % D2O, 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] STAT6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] STAT6, 0.7 mM NCoA1, 50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 10 % D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] NCoA1, 1 mM STAT6, 50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 10 % D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-99% 15N] STAT6, 0.7 mM NCoA1, 50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 10 % D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7 mM [U-99% 15N] NCoA1, 1 mM STAT6, 50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 10 % D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-99% 15N] STAT6, 50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 10 % D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] STAT6, 0.7 mM NCoA1, 50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 100 % D2O, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.7 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] NCoA1, 1 mM STAT6, 50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 100 % D2O, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5OW7 VDR complex 提交 2017-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：UNP residues 686-700
|
未记录 | AYK (3~{S})-3-[(1~{S},3~{a}~{S},4~{E},7~{a}~{S})-7~{a}-methyl-4-[(2~{Z})-2-[(5~{S})-2-methylidene-5-oxidanyl-cyclohexylidene]ethylidene]-2,3,3~{a},5,6,7-hexahydro-1~{H}-inden-1-yl]-3-oxidanyl-~{N}-propan-2-yl-butanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；50 mM Bis-Tris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.227 |
| 5OW9 Vitamin D receptor complex 提交 2017-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：UNP residues 686-700
|
未记录 | AYT (1~{S},3~{Z})-3-[(2~{E})-2-[(1~{S},3~{a}~{S},7~{a}~{S})-7~{a}-methyl-1-[(2~{S})-6-methyl-2-oxidanyl-heptan-2-yl]-2,3,3~{a},5,6,7-hexahydro-1~{H}-inden-4-ylidene]ethylidene]-4-methylidene-cyclohexan-1-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；50 mM Bis-Tris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.246 |
| 5OWD Vitamin D receptor complex 提交 2017-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：UNP residues 686-700
|
未记录 | B0B (1~{S},3~{Z})-3-[(2~{E})-2-[(1~{S},3~{a}~{S},7~{a}~{S})-7~{a}-methyl-1-[(2~{S})-6-methyl-2-oxidanyl-hept-5-en-2-yl]-2,3,3~{a},5,6,7-hexahydro-1~{H}-inden-4-ylidene]ethylidene]-4-methylidene-cyclohexan-1-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；50 mM Bis-Tris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.219 |
| 5X0R Crystal Structure of PXR LBD Complexed with SJB7 提交 2017-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
676–700（25 aa）
链 D
676–700（25 aa）
|
未记录 | 4WH 4-[(4-tert-butylphenyl)sulfonyl]-1-(2,4-dimethoxy-5-methylphenyl)-5-methyl-1H-1,2,3-triazole × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；Tris-HCl, imidazole, isopropanol,sodium chloride, glycerol, EDTA, pH 7.2-7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.0K
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.252 |
| 5X8U Crystal Structure of the wild Human ROR gamma Ligand Binding Domain. 提交 2017-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
片段：UNP residues 686-700
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M Sodium acetate pH8.0, 4M ammonium acetate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.247 |
| 5X8W Crystal Structure of the mutant Human ROR gamma Ligand Binding Domain. 提交 2017-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M Sodium acetate pH8.0, 4M ammonium acetate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.230 |
| 5Y44 A novel moderator XD4 for bile acid receptor 提交 2017-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
745–755（11 aa）
|
未记录 | XD4 [(1R,2R,4R)-1,7,7-trimethyl-2-bicyclo[2.2.1]heptanyl] 4-azanyl-3-methyl-benzoate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Magnesium sulfate,
25% w/v polyethylene glycol 8000
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.271 |
| 5YCN Human PPARgamma ligand binding domain complexed with Lobeglitazone 提交 2017-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
片段：UNP RESIDUES 685-700
|
未记录 | 8LX (5S)-5-[[4-[2-[[6-(4-methoxyphenoxy)pyrimidin-4-yl]-methyl-amino]ethoxy]phenyl]methyl]-1,3-thiazolidine-2,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；1.6 M sodium citrate tribasic dihydrate (pH 6.5)
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.228 |
| 5YCP Human PPARgamma ligand binding domain complexed with Rosiglitazone 提交 2017-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
片段：UNP RESIDUES 685-700
|
未记录 | BRL 2,4-THIAZOLIDIINEDIONE, 5-[[4-[2-(METHYL-2-PYRIDINYLAMINO)ETHOXY]PHENYL]METHYL]-(9CL) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；2.2 M sodium malonate (pH 7.0)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 6BNS STRUCTURE OF HUMAN PREGNANE X RECEPTOR LIGAND BINDING DOMAIN BOUND TETHERED WITH SRC co-activator peptide and Compound 25a AKA BICYCLIC HEXAFLUOROISOPROPYL 2 ALCOHOL SULFONAMIDES 提交 2017-11-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
链 B
678–710（33 aa）
|
未记录 | XGH 2-[(2S)-4-[(4-fluorophenyl)sulfonyl]-7-(1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-hydroxypropan-2-yl)-3,4-dihydro-2H-1,4-benzothiazin-2-yl]-N-(2-hydroxy-2-methylpropyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 10-15%(V/V)PEG10K.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.246 |
| 6FO7 Vitamin D nuclear receptor complex 3 提交 2018-02-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | LX3 (1~{R},3~{S},5~{Z})-4-methylidene-5-[(~{E})-3-[3-(6-methyl-6-oxidanyl-heptyl)phenyl]hept-2-enylidene]cyclohexane-1,3-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；BisTris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.230 |
| 6GEV Mineralocorticoid receptor in complex with (s)-13 提交 2018-04-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1427–1441（15 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 EWN 6-[[(3~{S})-7-fluoranyl-3-(2-methylpropyl)-2,3-dihydro-1,4-benzoxazin-4-yl]carbonyl]-4~{H}-1,4-benzoxazin-3-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.9 M (NH4)2SO4, 3.5% 1,4-butanediol, 0.1 M CHES pH 9.5
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.190 |
| 6GG8 Mineralocorticoid receptor in complex with (s)-13 提交 2018-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1427–1441（15 aa）
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 EY8 [(3~{R})-7-fluoranyl-4-[(3-oxidanylidene-4~{H}-1,4-benzoxazin-6-yl)carbonyl]-2,3-dihydro-1,4-benzoxazin-3-yl]methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.9M (NH4)2SO4, 0.1 M CHES pH9.5, 10% (v/v) of condition C8 of the Morpheus Screen (Molecular Dimension)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.228 |
| 6HTY PXR in complex with P2X4 inhibitor compound 25 提交 2018-10-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
678–700（23 aa）
|
突变：K129G,K129G | GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；1 microliter protein at 12.1 mg/ml (in 20 millimolar Tris pH 7.8, 250 millimolar NaCl, 2.5 millimolar EDTA, 5% (v/v) glycerol, 5 mM DTT), preincubated with 10 millimolar compound 15 (from 200 millimolar stock in DMSO), mixed with 1 microliter of reservoir (100 mM imidazole pH 8.0, 17 % (v/v) MPD). Crystals additionally soaked in 20 millimolar compound 15 prior to data collection. cryo buffer 34% (v/v) MPD supplemented with 20 millimolar compound 15
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.226 |
| 6HTY PXR in complex with P2X4 inhibitor compound 25 提交 2018-10-05 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
678–700（23 aa）
|
突变：K129G,K129G | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GRH (2~{R})-~{N}-[4-(3-chloranylphenoxy)-3-sulfamoyl-phenyl]-2-phenyl-propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；1 microliter protein at 12.1 mg/ml (in 20 millimolar Tris pH 7.8, 250 millimolar NaCl, 2.5 millimolar EDTA, 5% (v/v) glycerol, 5 mM DTT), preincubated with 10 millimolar compound 15 (from 200 millimolar stock in DMSO), mixed with 1 microliter of reservoir (100 mM imidazole pH 8.0, 17 % (v/v) MPD). Crystals additionally soaked in 20 millimolar compound 15 prior to data collection. cryo buffer 34% (v/v) MPD supplemented with 20 millimolar compound 15
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.226 |
| 6ICJ Crystal structure of PPARgamma with compound BR102375K 提交 2018-09-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
676–700（25 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 A0L 2-butyl-5-[(3-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)methyl]-6-methyl-3-{[2'-(5-oxo-4,5-dihydro-1,2,4-oxadiazol-3-yl)[1,1'-biphenyl]-4-yl]methyl}pyrimidin-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M NH4 Acetate, 0.1 M HEPES 7.5 pH, 25 %w/v PEG 3350
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.282 |
| 6IJR Human PPARgamma ligand binding domain complexed with SB1495 提交 2018-10-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
|
未记录 | A9C N-{[3-({[(1S,2R)-2-{[(2E)-2-cyano-4,4-dimethylpent-2-enoyl]amino}cyclopentyl]oxy}methyl)phenyl]methyl}-4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；60% (v/v) Tacsimate
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.266 |
| 6IJR Human PPARgamma ligand binding domain complexed with SB1495 提交 2018-10-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
685–700（16 aa）
|
未记录 | A9C N-{[3-({[(1S,2R)-2-{[(2E)-2-cyano-4,4-dimethylpent-2-enoyl]amino}cyclopentyl]oxy}methyl)phenyl]methyl}-4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；60% (v/v) Tacsimate
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.266 |
| 6IJS Human PPARgamma ligand binding domain complexed with SB1494 提交 2018-10-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
|
未记录 | A9F N-{[3-({[(1R,2S)-2-{[(2E)-2-cyano-4,4-dimethylpent-2-enoyl]amino}cyclopentyl]oxy}methyl)phenyl]methyl}-4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.2 M sodium malonate
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.241 |
| 6ILQ Crystal structure of PPARgamma with compound BR101549 提交 2018-10-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
676–700（25 aa）
|
未记录 | AE0 ethyl [2-butyl-6-oxo-1-{[2'-(5-oxo-4,5-dihydro-1,2,4-oxadiazol-3-yl)[1,1'-biphenyl]-4-yl]methyl}-4-(propan-2-yl)-1,6-dihydropyrimidin-5-yl]acetate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M TRIS 8.5 pH, 27 %w/v PEG 3350
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.303 |
| 6ITM Crystal structure of FXR in complex with agonist XJ034 提交 2018-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
744–757（14 aa）
|
未记录 | AWL 1-adamantyl-[4-(5-chloranyl-2-methyl-phenyl)piperazin-1-yl]methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 6ITM Crystal structure of FXR in complex with agonist XJ034 提交 2018-11-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
744–757（14 aa）
|
未记录 | AWL 1-adamantyl-[4-(5-chloranyl-2-methyl-phenyl)piperazin-1-yl]methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 6JQ7 The ligand-free structure of human PPARgamma LBD in the presence of the SRC-1 coactivator peptide 提交 2019-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；60% (v/v) Tacsimate (pH 7.0)
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.257 |
| 6KTM The ligand-free structure of human PPARgamma ligand-binding domain R288A mutant in the presence of the SRC-1 coactivator peptide 提交 2019-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；2.2 M sodium malonate (pH 7.0)
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.258 |
| 6KTN Human PPARgamma ligand-binding domain R288A mutant in complex with imatinib 提交 2019-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
|
未记录 | STI 4-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YLMETHYL)-N-[4-METHYL-3-(4-PYRIDIN-3-YL-PYRIMIDIN-2-YLAMINO)-PHENYL]-BENZAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；2.2 M sodium malonate (pH 7.0)
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.256 |
| 6NX1 STRUCTURE OF HUMAN PREGNANE X RECEPTOR LIGAND BINDING DOMAIN BOUND TETHERED WITH SRC CO-ACTIVATOR PEPTIDE AND COMPOUND-3 AKA 1,1,1,3,3,3-HEXAFLUORO-2-{4-[1-(4- LUOROBENZENESULFONYL)CYCLOPENTYL]PHENYL}PROPAN-2-OL 提交 2019-02-07 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN
链 B
678–710（33 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN
|
未记录 | L7D 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-(4-{1-[(4-fluorophenyl)sulfonyl]cyclopentyl}phenyl)propan-2-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 10-15%(V/V)PEG10K, Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.240 |
| 6NX1 STRUCTURE OF HUMAN PREGNANE X RECEPTOR LIGAND BINDING DOMAIN BOUND TETHERED WITH SRC CO-ACTIVATOR PEPTIDE AND COMPOUND-3 AKA 1,1,1,3,3,3-HEXAFLUORO-2-{4-[1-(4- LUOROBENZENESULFONYL)CYCLOPENTYL]PHENYL}PROPAN-2-OL 提交 2019-02-07 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN
链 B
678–710（33 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN
|
未记录 | L7D 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-(4-{1-[(4-fluorophenyl)sulfonyl]cyclopentyl}phenyl)propan-2-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 10-15%(V/V)PEG10K, Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.240 |
| 6P9F Crystal structure of RAR-related orphan receptor C (NHIS-RORGT(244-487)-L6-SRC1(678-692)) in complex with a phenyl (3-phenylpyrrolidin-3-yl)sulfone inhibitor 提交 2019-06-10 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
683–696（14 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 265-508) fused to SRC peptide (UNP residues 683-696)
|
未记录 | O5A trans-4-{(3R)-3-[(4-fluorophenyl)sulfonyl]-3-[4-(1,1,1,2,3,3,3-heptafluoropropan-2-yl)phenyl]pyrrolidine-1-carbonyl}cyclohexane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-26% PEG3350, 0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.223 |
| 6P9F Crystal structure of RAR-related orphan receptor C (NHIS-RORGT(244-487)-L6-SRC1(678-692)) in complex with a phenyl (3-phenylpyrrolidin-3-yl)sulfone inhibitor 提交 2019-06-10 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
683–696（14 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 265-508) fused to SRC peptide (UNP residues 683-696)
|
未记录 | O5A trans-4-{(3R)-3-[(4-fluorophenyl)sulfonyl]-3-[4-(1,1,1,2,3,3,3-heptafluoropropan-2-yl)phenyl]pyrrolidine-1-carbonyl}cyclohexane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-26% PEG3350, 0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.223 |
| 6SSQ Crystal structure of RARbeta LBD in complex with LG 100754 提交 2019-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
686–698（13 aa）
链 G
686–698（13 aa）
|
未记录 | 754 (2E,4E,6Z)-3-methyl-7-(5,5,8,8-tetramethyl-3-propoxy-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)octa-2,4,6-trienoic acid × 2 FLC CITRATE ANION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；200 mM Tri Sodium Citrate pH 5.5, 25 % PEG 4000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.208 |
| 6T2M VDR-ZK168281 complex 提交 2019-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | M9Q ethyl (~{Z})-3-[1-[(~{E},1~{R},4~{R})-4-[(1~{R},3~{a}~{S},4~{E},7~{a}~{R})-7~{a}-methyl-4-[(2~{Z})-2-[(3~{S},5~{R})-2-methylidene-3,5-bis(oxidanyl)cyclohexylidene]ethylidene]-2,3,3~{a},5,6,7-hexahydro-1~{H}-inden-1-yl]-1-oxidanyl-pent-2-enyl]cyclopropyl]prop-2-enoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.259 |
| 6TFI PXR IN COMPLEX WITH THROMBIN INHIBITOR COMPOUND 17 提交 2019-11-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
681–700（20 aa）
|
突变：K129G | GOL GLYCEROL × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；1 MICROLITER PROTEIN AT 12.1 MG/ML (IN 20 MILLIMOLAR TRIS PH 7.8, 250 MILLIMOLAR NACL, 2.5 MILLIMOLAR EDTA, 5% (V/V) GLYCEROL, 5 MM DTT), PREINCUBATED WITH 25 MILLIMOLAR COMPOUND 17 (FROM 500 MILLIMOLAR STOCK IN DMSO) for 24 hours at 277 K, MIXED WITH 1 MICROLITER OF RESERVOIR (100 MILLIMOLAR IMIDAZOLE PH 8.0, 20 % (V/V) MPD). CRYO BUFFER 100 MILLIMOLAR IMIDAZOLE PH 8.0, 30 % (V/V) MPD
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.199 |
| 6TFI PXR IN COMPLEX WITH THROMBIN INHIBITOR COMPOUND 17 提交 2019-11-14 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
681–700（20 aa）
|
突变：K129G | GOL GLYCEROL × 3 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 N6H [2-[(3-chlorophenyl)methylamino]-7-methoxy-1,3-benzoxazol-5-yl]-(2,2-dimethylmorpholin-4-yl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；1 MICROLITER PROTEIN AT 12.1 MG/ML (IN 20 MILLIMOLAR TRIS PH 7.8, 250 MILLIMOLAR NACL, 2.5 MILLIMOLAR EDTA, 5% (V/V) GLYCEROL, 5 MM DTT), PREINCUBATED WITH 25 MILLIMOLAR COMPOUND 17 (FROM 500 MILLIMOLAR STOCK IN DMSO) for 24 hours at 277 K, MIXED WITH 1 MICROLITER OF RESERVOIR (100 MILLIMOLAR IMIDAZOLE PH 8.0, 20 % (V/V) MPD). CRYO BUFFER 100 MILLIMOLAR IMIDAZOLE PH 8.0, 30 % (V/V) MPD
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.199 |
| 6U25 CRYSTAL STRUCTURE OF RAR-RELATED ORPHAN RECEPTOR C (NHIS- RORGT(244-487)-L6-SRC1(678-692)) IN COMPLEX WITH A TRICYCLIC INVERSE AGONIST 提交 2019-08-19 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
683–696（14 aa）
片段：LIGAND-BINDING DOMAIN (UNP RESIDUES 265-508) FUSED TO SRC PEPTIDE (UNP RESIDUES 683-696)
|
未记录 | O5B trans-4-[(3aR,9bR)-9b-[(4-fluorophenyl)sulfonyl]-7-(1,1,1,2,3,3,3-heptafluoropropan-2-yl)-1,2,3a,4,5,9b-hexahydro-3H-benzo[e]indole-3-carbonyl]cyclohexane-1-carboxylic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-26% PEG3350, 0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5-6.5
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.247 |
| 6W9H SUBSTITUTED BENZYLOXYTRICYCLIC COMPOUNDS AS RETINOIC ACID-RELATED ORPHAN RECEPTOR GAMMA T AGONISTS 提交 2020-03-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
683–696（14 aa）
|
未记录 | TKJ 4-{(3R)-3-[4-(benzyloxy)phenyl]-3-[(4-fluorophenyl)sulfonyl]pyrrolidine-1-carbonyl}-1lambda~6~-thiane-1,1-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；protein at 8-10mg/ml, with 0.2M MgCl2, 22% PEG3350, 0.1M Bis-Tris pH 5.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.258 |
| 6W9I SUBSTITUTED BENZYLOXYTRICYCLIC COMPOUNDS AS RETINOIC ACID-RELATED ORPHAN RECEPTOR GAMMA T AGONISTS 提交 2020-03-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
683–696（14 aa）
|
未记录 | Z7D 1-(benzyloxy)-4-{1-[(4-fluorophenyl)sulfonyl]cyclopentyl}benzene × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；protein at 8-10mg/ml, with 0.2M MgCl2, 22% PEG3350, 0.1M Bis-Tris pH 5.5
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.235 |
| 6XP9 STRUCTURE OF HUMAN PREGNANE X RECEPTOR LIGAND BINDING DOMAIN BOUND TETHERED WITH SRC co-activator peptide IN COMPLEX WITH (S,S)-1 提交 2020-07-08 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
片段：Ligand Binding Domain tethered with SRC co-activator peptide
|
未记录 | QCG (2S)-tert-butoxy[7-(8-fluoro-5-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-6-yl)-5-methyl-2-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidin-6-yl]acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；0.1 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium HEPES pH 7.5, 18-20 % w/v PEG 4000.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 20% (v/v) Glycerol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.220 |
| 6XP9 STRUCTURE OF HUMAN PREGNANE X RECEPTOR LIGAND BINDING DOMAIN BOUND TETHERED WITH SRC co-activator peptide IN COMPLEX WITH (S,S)-1 提交 2020-07-08 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
678–710（33 aa）
片段：Ligand Binding Domain tethered with SRC co-activator peptide
|
未记录 | QCG (2S)-tert-butoxy[7-(8-fluoro-5-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-6-yl)-5-methyl-2-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidin-6-yl]acetic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；0.1 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium HEPES pH 7.5, 18-20 % w/v PEG 4000.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 20% (v/v) Glycerol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.220 |
| 7AOS crystal structure of the RARalpha/RXRalpha ligand binding domain heterodimer in complex with a fragment of SRC1 coactivator 提交 2020-10-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
686–712（27 aa）
链 D
686–712（27 aa）
|
未记录 | LG2 6-[1-(3,5,5,8,8-PENTAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRONAPHTHALEN-2-YL)CYCLOPROPYL]PYRIDINE-3-CARBOXYLIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 EQN 4-{[(5,5,8,8-tetramethyl-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)carbonyl]amino}benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；24% PEG 3350, 0.2M Na acetate, 0.1M Bis Tris Propane pH 7.0
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.262 |
| 7B39 Allene-Based Design of a Noncalcemic Vitamin D Receptor Agonist 提交 2020-11-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | T0H (1R,3S,Z)-5-(2-((3aS,7aS,E)-1-(6-hydroxy-6-methylhept-1-en-1-ylidene)-7a-methyloctahydro-4H-inden-4-ylidene)ethylidene)-4-methylenecyclohexane-1,3-diol × 2 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM BisTris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.247 |
| 7BNS VDR complex with BXL-62 提交 2021-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B2
686–700（15 aa）
|
未记录 | U5W 1,25-Dihydroxy-16-ene-20-cyclopropyl-vitamin D3 × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；273 K；50 mM Bis-Tris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.260 |
| 7BNU VDR complex with BXL-62 提交 2021-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B2
686–700（15 aa）
|
未记录 | U5W 1,25-Dihydroxy-16-ene-20-cyclopropyl-vitamin D3 × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；273 K；50 mM Bis-Tris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.261 |
| 7BO6 VDR complex with LCA derivative 提交 2021-01-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | FKC (4R)-4-[(3R,5R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-3-(2-methyl-2-oxidanyl-propyl)-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.86 Å R-free 0.263 |
| 7BPY X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-clofibric acid-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | E0O 2-(4-chloranylphenoxy)-2-methyl-propanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 30 %(w/v) PEG3350
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.215 |
| 7BPY X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-clofibric acid-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-03-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
683–697（15 aa）
|
未记录 | E0O 2-(4-chloranylphenoxy)-2-methyl-propanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 30 %(w/v) PEG3350
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.215 |
| 7BPZ X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-bezafibrate-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by soaking 提交 2020-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | PEM 2-[P-[2-P-CHLOROBENZAMIDO)ETHYL]PHENOXY]-2-METHYLPROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.242 |
| 7BPZ X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-bezafibrate-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by soaking 提交 2020-03-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
683–697（15 aa）
|
未记录 | PEM 2-[P-[2-P-CHLOROBENZAMIDO)ETHYL]PHENOXY]-2-METHYLPROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.242 |
| 7BQ0 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-fenofibric acid-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | F5A 2-[4-(4-chlorobenzene-1-carbonyl)phenoxy]-2-methylpropanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.217 |
| 7BQ0 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-fenofibric acid-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-03-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
683–697（15 aa）
|
未记录 | F5A 2-[4-(4-chlorobenzene-1-carbonyl)phenoxy]-2-methylpropanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.217 |
| 7BQ1 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-intrinsic fatty acid (E. coli origin)-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by co-crystallization 提交 2020-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 25 %(w/v) PEG3350
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.213 |
| 7BQ2 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-pemafibrate-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by soaking 提交 2020-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | P7F (2~{R})-2-[3-[[1,3-benzoxazol-2-yl-[3-(4-methoxyphenoxy)propyl]amino]methyl]phenoxy]butanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.0), 25%(w/v) PEG3350
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.206 |
| 7BQ3 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW7647-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | 2VN 2-[(4-{2-[(4-cyclohexylbutyl)(cyclohexylcarbamoyl)amino]ethyl}phenyl)sulfanyl]-2-methylpropanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.5), 25%(w/v) PEG3350
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.237 |
| 7BQ4 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-eicosapentaenoic acid (EPA)-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | EPA 5,8,11,14,17-EICOSAPENTAENOIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 30 %(w/v) PEG3350
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.214 |
| 7CXF The ligand-free structure of human PPARgamma LBD C285Y mutant in the presence of the SRC-1 coactivator peptide 提交 2020-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
|
未记录 | MLA MALONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.2 M sodium malonate (pH 7.0)
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.269 |
| 7CXH The ligand-free structure of human PPARgamma LBD Q286E mutant in the presence of the SRC-1 coactivator peptide 提交 2020-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.2 M sodium malonate (pH 7.0)
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.257 |
| 7CXI The ligand-free structure of human PPARgamma LBD F287Y mutant in the presence of the SRC-1 coactivator peptide 提交 2020-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
|
未记录 | MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.2 M sodium malonate (pH 7.0)
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.276 |
| 7CXJ The ligand-free structure of human PPARgamma LBD R288C mutant in the presence of the SRC-1 coactivator peptide 提交 2020-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.2 M sodium malonate (pH 7.0)
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.275 |
| 7CXK The ligand-free structure of human PPARgamma LBD R288H mutant in the presence of the SRC-1 coactivator peptide 提交 2020-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
|
未记录 | MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.2 M sodium malonate (pH 7.0)
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.264 |
| 7CXL The ligand-free structure of human PPARgamma LBD S289C mutant in the presence of the SRC-1 coactivator peptide 提交 2020-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
685–700（16 aa）
|
未记录 | MLA MALONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.2 M sodium malonate (pH 7.0)
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.255 |
| 7JYM CRYSTAL STRUCTURE OF RAR-RELATED ORPHAN RECEPTOR C (NHIS-RORGT(244-487)-L6-SRC1(678-692)) IN COMPLEX WITH A TRICYCLIC SULFONE INVERSE AGONIST 提交 2020-08-31 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
683–696（14 aa）
片段：;LIGAND-BINDING DOMAIN (UNP RESIDUES 265-508) FUSED TO SRC PEPTIDE (UNP RESIDUES 683-696),LIGAND-BINDING DOMAIN (UNP RESIDUES 265-508) FUSED TO SRC PEPTIDE (UNP RESIDUES 683-696)
;
|
未记录 | Z8I (3R,5S)-3-fluoro-5-[(3aR,9bR)-9b-[(4-fluorophenyl)sulfonyl]-7-(1,1,1,2,3,3,3-heptafluoropropan-2-yl)-1,2,3a,4,5,9b-hexahydro-3H-benzo[e]indole-3-carbonyl]-1-(2-hydroxy-2-methylpropyl)pyrrolidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-26% PEG3350, 0.2 M MAGNESIUM
CHLORIDE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5-6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING
DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.264 |
| 7KXD CRYSTAL STRUCTURE OF RAR-RELATED ORPHAN RECEPTOR C (NHIS-RORGT(244-487)-L6-SRC1(678-692)) IN COMPLEX WITH {3,5-DICHLORO-4-[4-METHOXY-3-(PROPAN-2-YL)PHENOXY]PHENYL}METHANOL 提交 2020-12-03 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
683–696（14 aa）
|
未记录 | Z7G {3,5-dichloro-4-[4-methoxy-3-(propan-2-yl)phenoxy]phenyl}methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22% PEG3350,
0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.239 |
| 7KXE CRYSTAL STRUCTURE OF RAR-RELATED ORPHAN RECEPTOR C (NHIS-RORGT(244-487)-L6-SRC1(678-692)) IN COMPLEX WITH {3,5-DICHLORO-4-[4-METHOXY-3-(PROPAN-2-YL)PHENOXY]PHENYL}METHANOL 提交 2020-12-03 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
683–696（14 aa）
|
未记录 | Z7H N-{3,5-dichloro-4-[4-methoxy-3-(propan-2-yl)phenoxy]phenyl}-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；22% PEG3350,
0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.241 |
| 7KXF CRYSTAL STRUCTURE OF RAR-RELATED ORPHAN RECEPTOR C (NHIS-RORGT(244-487)-L6-SRC1(678-692)) IN COMPLEX WITH {3,5-DICHLORO-4-[4-METHOXY-3-(PROPAN-2-YL)PHENOXY]PHENYL}METHANOL 提交 2020-12-03 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
683–696（14 aa）
|
未记录 | Z7I N-(3,5-dichloro-4-{[6-methoxy-5-(propan-2-yl)pyridin-3-yl]oxy}phenyl)-2-[1-(methylsulfonyl)piperidin-4-yl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22% PEG3350,
0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.234 |
| 7OXZ VDR complex with a side-chain hydroxylated derivative of lithocholic acid 提交 2021-06-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | 2UI (3R,6R)-6-[(3R,5R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-3-(2-methyl-2-oxidanyl-propyl)-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]heptane-1,3-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.254 |
| 7OY4 VDR complex of a side-chain hydroxylated derivatives of lithocholic acid 提交 2021-06-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | 2WV (3S,6R)-6-[(3R,5R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-3-(2-methyl-2-oxidanyl-propyl)-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]heptane-1,3-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；50 mM Bis-Tris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.238 |
| 7QPI Structure of lamprey VDR in complex with 1,25D3 提交 2022-01-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 U
686–698（13 aa）
|
未记录 | VDX 5-{2-[1-(5-HYDROXY-1,5-DIMETHYL-HEXYL)-7A-METHYL-OCTAHYDRO-INDEN-4-YLIDENE]-ETHYLIDENE}-4-METHYLENE-CYCLOHEXANE-1,3-DIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG 3350 25%, Tris 0.1M pH 8.5, magnesium chloride 0.2M
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.256 |
| 7WGO X-ray structure of human PPAR gamma ligand binding domain-bezafibrate co-rystals obtained by co-crystallization 提交 2021-12-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | PEM 2-[P-[2-P-CHLOROBENZAMIDO)ETHYL]PHENOXY]-2-METHYLPROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 1.1 M trisodium citrate
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.225 |
| 7WGP X-ray structure of human PPAR gamma ligand binding domain-fenofibric acid co-crystals obtained by co-crystallization 提交 2021-12-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | F5A 2-[4-(4-chlorobenzene-1-carbonyl)phenoxy]-2-methylpropanoic acid × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 1.1 M trisodium citrate
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.269 |
| 7WGQ X-ray structure of human PPAR gamma ligand binding domain-pemafibrate co-crystals obtained by co-crystallization 提交 2021-12-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | P7F (2~{R})-2-[3-[[1,3-benzoxazol-2-yl-[3-(4-methoxyphenoxy)propyl]amino]methyl]phenoxy]butanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 1.1 M trisodium citrate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.252 |
| 7WQQ Retinoic acid receptor alpha mutant - N299H 提交 2022-01-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
686–698（13 aa）
|
未记录 | 5Z6 4-[(E)-3-(3,5-ditert-butylphenyl)-3-oxidanylidene-prop-1-enyl]benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.05M Bis-Tris Propane pH 5.0, 0.05M Citric acid, 18% PEG 3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.206 |
| 7XVY Human Estrogen Receptor beta Ligand-binding Domain in Complex with S-DPN 提交 2022-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
628–640（13 aa）
链 D
628–640（13 aa）
|
未记录 | I0K (2~{S})-2,3-bis(4-hydroxyphenyl)propanenitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；16-20% PEG3350, 100 mM BisTris pH6.5, 200 mM Magnesium Acetate
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.237 |
| 7YFK The structure of human pregnane X receptor in complex with an SRC-1 coactivator peptide and a limonoid compound, nomilin 提交 2022-07-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
676–700（25 aa）
链 B
676–700（25 aa）
|
未记录 | G3L Nomilin × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；277.15 K；10% (v/v) 2-propanol, 100 mM Imidazole/ Hydrochloric acid, pH 8.0
|
分辨率 2.10 Å |
| 7ZFG VDR complex with aromatic D-ring analog 提交 2022-04-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 IV5 (1R,3S,5Z)-4-methylidene-5-[(E)-9-methyl-3-[3-(6-methyl-6-oxidanyl-heptyl)phenyl]-9-oxidanyl-dec-2-enylidene]cyclohexane-1,3-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；NaAcetate 2.5M, BisTris 0.1M
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.261 |
| 7ZFX VDR complex with Aromatic-D-Ring Analog 提交 2022-04-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 IV1 (1R,3S,5Z)-5-[(E)-3-[3,5-bis(6-methyl-6-oxidanyl-heptyl)phenyl]prop-2-enylidene]-4-methylidene-cyclohexane-1,3-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；NaActetae 2.5M, Tris 0.1M
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.254 |
| 8CK5 VDR LBD complex with 25-nitro derivative of 1,25D3 提交 2023-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 UYO (1S,3R,5Z,7E,13xi)-25-nitro-9,10-secocholesta-5,7,10-triene-1,3-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 8CKC Vitamin D receptor complex with 25-amine derivative of 1,25D3 提交 2023-02-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 UYU (1R,3S,5Z)-5-[(2E)-2-[(1R,3aS,7aR)-1-[(2R)-6-azanyl-6-methyl-heptan-2-yl]-7a-methyl-2,3,3a,5,6,7-hexahydro-1H-inden-4-ylidene]ethylidene]-4-methylidene-cyclohexane-1,3-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.5, 1.6 M lithium sulfate and 50 mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.232 |
| 8F5Y Crystal structure of pregnane X receptor ligand binding domain complexed with JQ1 提交 2022-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
676–700（25 aa）
链 D
676–700（25 aa）
|
未记录 | JQ1 (6S)-6-(2-tert-butoxy-2-oxoethyl)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6,7-dihydrothieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-10-ium × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；50 mM imidazole pH 7.0, 8% isopropanol
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.215 |
| 8HUK X-ray structure of human PPAR alpha ligand binding domain-lanifibranor-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by soaking 提交 2022-12-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25%(w/v) PEG3350
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.254 |
| 8HUM X-ray structure of human PPAR gamma ligand binding domain-lanifibranor-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by co-crystallization 提交 2022-12-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | BJB 4-[1-(1,3-benzothiazol-6-ylsulfonyl)-5-chloro-indol-2-yl]butanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 1.0 M trisodium citrate
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.250 |
| 8HUP X-ray structure of human PPAR gamma ligand binding domain-seladelpar-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by co-crystallization 提交 2022-12-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | KKB Seladelpar × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 1.1 M trisodium citrate
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.234 |
| 8HUQ X-ray structure of human PPAR alpha ligand binding domain-elafibranor-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by soaking 提交 2022-12-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
683–697（15 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 MUO 2-[2,6-dimethyl-4-[(~{E})-3-(4-methylsulfanylphenyl)-3-oxidanylidene-prop-1-enyl]phenoxy]-2-methyl-propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25%(w/v) PEG3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.213 |
| 8P9W vitamin D receptor complex with Xe4MeCF3 analog 提交 2023-06-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | XDO (1~{R},3~{S},5~{Z})-5-[(2~{E})-2-[(1~{S},3~{a}~{S},7~{a}~{S})-1,7~{a}-dimethyl-1-[6,6,6-tris(fluoranyl)-5-oxidanyl-5-(trifluoromethyl)hexa-1,3-diynyl]-2,3,3~{a},5,6,7-hexahydroinden-4-ylidene]ethylidene]-4-methylidene-cyclohexane-1,3-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BTP pH 7.0, 3 M NaOAc
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.234 |
| 8SVN Crystal structure of the apo form of pregnane X receptor ligand binding domain 提交 2023-05-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
链 B
678–710（33 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；in 0.1 M HEPES pH 7.0, and 14% Isopropanol
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.235 |
| 8SVO Crystal structure of pregnane X receptor ligand binding domain in complex with SJPYT-310 提交 2023-05-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
链 B
678–710（33 aa）
|
未记录 | WSO (1P)-N-(5-tert-butyl-2-{[(2S)-pentan-2-yl]oxy}phenyl)-1-(2-methoxy-5-methylphenyl)-5-methyl-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.0-7.0, 9-16% (v/v) 2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.238 |
| 8SVP Crystal structure of pregnane X receptor ligand binding domain in complex with SJPYT-278 提交 2023-05-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
链 B
678–710（33 aa）
|
未记录 | WSX (1P)-N-(5-tert-butyl-2-{[(3S)-hexan-3-yl]oxy}phenyl)-1-(2,5-dimethoxyphenyl)-5-methyl-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 2 YGO (1P)-N-(5-tert-butyl-2-{[(3R)-hexan-3-yl]oxy}phenyl)-1-(2,5-dimethoxyphenyl)-5-methyl-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.0-7.0, 9-16% (v/v) 2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 3.32 Å R-free 0.252 |
| 8SVQ Crystal structure of pregnane X receptor ligand binding domain in complex with SJPYT-312 提交 2023-05-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
链 B
678–710（33 aa）
|
未记录 | WSX (1P)-N-(5-tert-butyl-2-{[(3S)-hexan-3-yl]oxy}phenyl)-1-(2,5-dimethoxyphenyl)-5-methyl-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.0-7.0, 9-16% (v/v) 2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.262 |
| 8SVR Crystal structure of pregnane X receptor ligand binding domain in complex with SJPYT-326 提交 2023-05-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
链 B
678–710（33 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 WT1 (1P)-N-(5-tert-butyl-2-{[(3S)-hexan-3-yl]oxy}phenyl)-5-methyl-1-(2,4,5-trimethoxyphenyl)-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.0-7.0, 9-16% (v/v) 2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.258 |
| 8SVS Crystal structure of pregnane X receptor ligand binding domain in complex with SJPYT-328 提交 2023-05-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
链 B
678–710（33 aa）
|
未记录 | WU2 (1P)-N-(5-tert-butyl-2-{[(3S)-hexan-3-yl]oxy}phenyl)-1-(2,4-dimethoxy-5-methylphenyl)-5-methyl-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.0-7.0, 9-16% (v/v) 2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.250 |
| 8SVT Crystal structure of pregnane X receptor ligand binding domain in complex with SJPYT-331 提交 2023-05-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
链 B
678–710（33 aa）
|
未记录 | WU6 methyl 3-{[(1P)-1-(2,5-dimethoxyphenyl)-5-methyl-1H-1,2,3-triazole-4-carbonyl]amino}-4-{[(3S)-hexan-3-yl]oxy}benzoate × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.0-7.0, 9-16% (v/v) 2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.237 |
| 8SVU Crystal structure of the L428V mutant of pregnane X receptor ligand binding domain in apo form 提交 2023-05-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
链 B
678–710（33 aa）
|
突变：L428V 突变：L428V | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.0-7.0, 9-16% (v/v) 2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.244 |
| 8SVX Crystal structure of the L428V mutant of pregnane X receptor ligand binding domain in complex with SJPYT-331 提交 2023-05-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
678–710（33 aa）
链 B
678–710（33 aa）
|
突变：L428V 突变：L428V | WU6 methyl 3-{[(1P)-1-(2,5-dimethoxyphenyl)-5-methyl-1H-1,2,3-triazole-4-carbonyl]amino}-4-{[(3S)-hexan-3-yl]oxy}benzoate × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris pH 6.0-7.0, 9-16% (v/v) 2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.235 |
| 9EYR VDR complex with gemini analog UG-480 提交 2024-04-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | A1H75 (1~{R},3~{S},5~{Z})-5-[(2~{E})-2-[(1~{R},3~{a}~{S},7~{a}~{R})-7~{a}-methyl-1-[(1~{R})-5-methyl-1-[(1~{S},2~{S})-2-(3-methyl-3-oxidanyl-butyl)cyclopropyl]-5-oxidanyl-hexyl]-2,3,3~{a},5,6,7-hexahydro-1~{H}-inden-4-ylidene]ethylidene]-4-methylidene-cyclohexane-1,3-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Li2SO4 1.8M
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.259 |
| 9FBF VDR complex with UG-481 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
|
未记录 | A1IBM (1~{R},3~{S},5~{Z})-5-[(2~{E})-2-[(1~{R},3~{a}~{S},7~{a}~{R})-7~{a}-methyl-1-[(1~{S})-5-methyl-1-[(1~{R},2~{R})-2-(3-methyl-3-oxidanyl-butyl)cyclopropyl]-5-oxidanyl-hexyl]-2,3,3~{a},5,6,7-hexahydro-1~{H}-inden-4-ylidene]ethylidene]-4-methylidene-cyclohexane-1,3-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Li2SO4 1.8M
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.258 |
| 9FZI A new crystal structure of the hPXR-LBD in fusion with an SRC1 co-activator peptide and in complex with SR12813 (P212121 form) 提交 2024-07-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
678–700（23 aa）
|
未记录 | SRL [2-(3,5-DI-TERT-BUTYL-4-HYDROXY-PHENYL)-1-(DIETHOXY-PHOSPHORYL)-VINYL]-PHOSPHONIC ACID DIETHLYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；100 mM Imidazole
25 - 30% MPD
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.237 |
| 9FZI A new crystal structure of the hPXR-LBD in fusion with an SRC1 co-activator peptide and in complex with SR12813 (P212121 form) 提交 2024-07-05 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
678–700（23 aa）
|
未记录 | SRL [2-(3,5-DI-TERT-BUTYL-4-HYDROXY-PHENYL)-1-(DIETHOXY-PHOSPHORYL)-VINYL]-PHOSPHONIC ACID DIETHLYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；100 mM Imidazole
25 - 30% MPD
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.237 |
| 9GC7 Mineralocorticoid receptor in complex with acylurea antagonists. 提交 2024-08-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1430–1441（12 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.9 M AMS 0.1 M CHES pH 9.5 +10% Morpheus G8
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.210 |
| 9O41 Crystal structure of the L411A mutant of pregnane X receptor ligand binding domain (apo form) 提交 2025-04-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
682–710（29 aa）
链 B
682–710（29 aa）
|
突变：L411A 突变：L411A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris (pH 6-7), 9-16% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.222 |
| 9O42 Crystal structure of the L411A mutant of pregnane X receptor ligand binding domain in complex with SJPYT-328 提交 2025-04-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
682–710（29 aa）
链 B
682–710（29 aa）
|
突变：L411A 突变：L411A | WU2 (1P)-N-(5-tert-butyl-2-{[(3S)-hexan-3-yl]oxy}phenyl)-1-(2,4-dimethoxy-5-methylphenyl)-5-methyl-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris (pH 6-7), 9-16% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.219 |
| 9O43 Crystal structure of the L411A mutant of pregnane X receptor ligand binding domain in complex with SJPYT-331 提交 2025-04-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
682–710（29 aa）
链 B
682–710（29 aa）
|
突变：L411A 突变：L411A | WU6 methyl 3-{[(1P)-1-(2,5-dimethoxyphenyl)-5-methyl-1H-1,2,3-triazole-4-carbonyl]amino}-4-{[(3S)-hexan-3-yl]oxy}benzoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris (pH 6-7), 9-16% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.239 |
| 9O44 Crystal structure of the L411W mutant of pregnane X receptor ligand binding domain (apo form) 提交 2025-04-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
682–710（29 aa）
链 B
682–710（29 aa）
|
突变：L411W 突变：L411W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris (pH 6-7), 9-16% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.228 |
| 9O45 Crystal structure of the L411W mutant of pregnane X receptor ligand binding domain in complex with SJPYT-328 提交 2025-04-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
682–710（29 aa）
链 B
682–710（29 aa）
|
突变：L411W 突变：L411W | WU2 (1P)-N-(5-tert-butyl-2-{[(3S)-hexan-3-yl]oxy}phenyl)-1-(2,4-dimethoxy-5-methylphenyl)-5-methyl-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris (pH 6-7), 9-16% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.241 |
| 9O46 Crystal structure of the L411W mutant of pregnane X receptor ligand binding domain in complex with SJPYT-331 提交 2025-04-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
682–710（29 aa）
链 B
682–710（29 aa）
|
突变：L411W 突变：L411W | WU6 methyl 3-{[(1P)-1-(2,5-dimethoxyphenyl)-5-methyl-1H-1,2,3-triazole-4-carbonyl]amino}-4-{[(3S)-hexan-3-yl]oxy}benzoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Bis-Tris (pH 6-7), 9-16% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 3.02 Å R-free 0.232 |
| 9S70 Crystal structure of RXR alpha LBD bound to a partial agonist 21 and a coactivator fragment SRC1 提交 2025-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
680–700（21 aa）
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未记录 | A1JL7 3-[[4-cyclobutyl-6-(3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pyrimidin-2-yl]amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；20% PEG2000, 0.1M Mes pH 6.5
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.221 |
| 9S71 Crystal structure of RXR alpha LBD bound to a partial agonist 35 and a coactivator fragment SRC1 提交 2025-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
680–700（21 aa）
|
未记录 | A1JL8 3-[[4-(4,4-dimethyl-2,3-dihydroquinolin-1-yl)-6-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18% PEG 4000 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 9VBQ Crystal structure of FXR in complex with agonist XJ02862-S2 提交 2025-06-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
744–757（14 aa）
片段：HD3 Peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å R-free 0.244 |
| 9VBR Farnesoid X Receptor Agonists_FXR fused with a HD3 peptide 提交 2025-06-04 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
745–756（12 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.251 |
| 9VBR Farnesoid X Receptor Agonists_FXR fused with a HD3 peptide 提交 2025-06-04 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
745–756（12 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.251 |
| 9VNX Crystal Structure of the mutant ROR gamma LBD With Compound 28 提交 2025-07-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
686–700（15 aa）
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未记录 | A1MAM (2~{R})-~{N}-[5-(5-cyano-6-propan-2-yloxy-pyridin-3-yl)-1-(trifluoromethyl)pyrazol-3-yl]-1-ethanoyl-4-propan-2-ylsulfonyl-piperazine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；297 K；0.1M sodium acetate (pH 7.0), 3.5M ammonium acetate
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分辨率 1.93 Å R-free 0.218 |
| 9VZQ Crystal structure of RORgamma in complex with novel inverse agonist 提交 2025-07-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1429–1441（13 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.18 Å R-free 0.251 |