当前蛋白身份：Q93034
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3DPL Structural Insights into NEDD8 Activation of Cullin-RING Ligases: Conformational Control of Conjugation. 提交 2008-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
401–780（380 aa）
片段：Residues 401-780
|
突变：L407E, L439K, V440K | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；277 K；2% PEG 3350, 0.1M HEPES, 0.2M L-proline, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.277 |
| 3DQV Structural Insights into NEDD8 Activation of Cullin-RING Ligases: Conformational Control of Conjugation 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
401–780（380 aa）
片段：Cullin-5 residues 401-780
|
突变：L407E, L439K, V440K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
277 K；with ~19% PEG3350, 275mM (NH4)2PO4, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.299 |
| 3DQV Structural Insights into NEDD8 Activation of Cullin-RING Ligases: Conformational Control of Conjugation 提交 2008-07-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
401–780（380 aa）
片段：Cullin-5 residues 401-780
|
突变：L407E, L439K, V440K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
277 K；with ~19% PEG3350, 275mM (NH4)2PO4, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.299 |
| 3DQV Structural Insights into NEDD8 Activation of Cullin-RING Ligases: Conformational Control of Conjugation 提交 2008-07-09 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
401–780（380 aa）
片段：Cullin-5 residues 401-780
链 D
401–780（380 aa）
片段：Cullin-5 residues 401-780
|
突变：L407E, L439K, V440K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L407E, L439K, V440K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
277 K；with ~19% PEG3350, 275mM (NH4)2PO4, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.299 |
| 4JGH Structure of the SOCS2-Elongin BC complex bound to an N-terminal fragment of Cullin5 提交 2013-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
10–386（377 aa）
片段：unp residues 10-386
|
突变：V341R, L345D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295.15 K；0.25 M sodium citrate and 18 % (w/v) PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.15K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.248 |
| 4JGH Structure of the SOCS2-Elongin BC complex bound to an N-terminal fragment of Cullin5 提交 2013-03-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
10–386（377 aa）
片段：unp residues 10-386
|
突变：V341R, L345D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295.15 K；0.25 M sodium citrate and 18 % (w/v) PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.15K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.248 |
| 4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 U
12–321（310 aa）
片段：UNP residues 12-321
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.324 |
| 4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 | Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 3
12–321（310 aa）
片段：UNP residues 12-321
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.324 |
| 4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 | Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 9
12–321（310 aa）
片段：UNP residues 12-321
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.324 |
| 4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 | Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 w
12–321（310 aa）
片段：UNP residues 12-321
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.324 |
| 4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
12–321（310 aa）
片段：UNP residues 12-321
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.324 |
| 4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
12–321（310 aa）
片段：UNP residues 12-321
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.324 |
| 4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 O
12–321（310 aa）
片段：UNP residues 12-321
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.324 |
| 4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 V
12–321（310 aa）
片段：UNP residues 12-321
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.324 |
| 4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 f
12–321（310 aa）
片段：UNP residues 12-321
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.324 |
| 4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 l
12–321（310 aa）
片段：UNP residues 12-321
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.324 |
| 4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 r
12–321（310 aa）
片段：UNP residues 12-321
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.324 |
| 4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 x
12–321（310 aa）
片段：UNP residues 12-321
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.324 |
| 6V9I cryo-EM structure of Cullin5 bound to RING-box protein 2 (Cul5-Rbx2) 提交 2019-12-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–780（779 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；4 second blot time, blot force 20
|
分辨率 5.20 Å |
| 7ONI Structure of Neddylated CUL5 C-terminal region-RBX2-ARIH2* 提交 2021-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–780（780 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8EI2 Crystal structure of the N-terminal domain of CUL5 in complex with H314, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–386（386 aa）
片段：N-terminal domain
|
未记录 | WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；30% w/v PEG 8000, 0.1M MES Sodium Salt pH6.5, 0.2M Ammonium Sulfate, 4% v/v 1,3-Propanediol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.357 |
| 8FVJ Dimeric form of HIV-1 Vif in complex with human CBF-beta, ELOB, ELOC, and CUL5 提交 2023-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 2
11–320（310 aa）
链 7
11–320（310 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 9EG1 COP9 signalosome deneddylation complex with cullin-5 提交 2024-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 J
1–780（780 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å |
| 9OMA Cryo-EM structure of PCMTD1-ELOBC-CUL5-RBX2 (CRL5-PCMTD1) 提交 2025-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–780（780 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.14 Å |
| 9OMF Cryo-EM structure of neddylated PCMTD1-ELOBC-CUL5-RBX2 (N8-CRL5-PCMTD1) 提交 2025-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–780（780 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.72 Å |
| 9SDX Structure of RBR binding E2 variant crosslinked with NEDD8-CUL5-RBX2 bound ARIH2 and Ub 提交 2025-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–780（780 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 9SDY Structure of RBR E2 variant binding to CUL5-RBX2 bound ARIH2 提交 2025-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–780（780 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.06 Å |
| 9T7V Structure of LRRC58-EloB/C-CDO1 in complex with NEDD8-CUL5-RBX2-ARIH2-Ub 提交 2025-11-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 C
1–780（780 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |