当前蛋白身份：Q9BZL1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1P0R Solution Structure of UBL5 a human Ubiquitin-Like Protein 提交 2003-04-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–73（73 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM sodium phosphate；压力 ambient
NMR样品组成
.5mM UBL5 U-15N,13C 50mM sodium phosphate (pH 5.7), 2mM Dtt | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0mM UBL5 U-15N,13C 50mM sodium phosphate (pH 5.7), 2mM Dtt | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 4PYU The conserved ubiquitin-like protein hub1 plays a critical role in splicing in human cells 提交 2014-03-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–73（73 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.15 M SODIUM ACETATE, 20% W/V PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4PYU The conserved ubiquitin-like protein hub1 plays a critical role in splicing in human cells 提交 2014-03-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–73（73 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.15 M SODIUM ACETATE, 20% W/V PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4PYU The conserved ubiquitin-like protein hub1 plays a critical role in splicing in human cells 提交 2014-03-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
1–73（73 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.15 M SODIUM ACETATE, 20% W/V PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4PYU The conserved ubiquitin-like protein hub1 plays a critical role in splicing in human cells 提交 2014-03-28 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
1–73（73 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.15 M SODIUM ACETATE, 20% W/V PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4PYU The conserved ubiquitin-like protein hub1 plays a critical role in splicing in human cells 提交 2014-03-28 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 O
1–73（73 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.15 M SODIUM ACETATE, 20% W/V PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4PYU The conserved ubiquitin-like protein hub1 plays a critical role in splicing in human cells 提交 2014-03-28 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 S
1–73（73 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.15 M SODIUM ACETATE, 20% W/V PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric（63） 与全部聚合物一致 |
链 A0
1–73（73 aa）
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未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.80 Å |
| 7AAV Human pre-Bact-2 spliceosome core structure 提交 2020-09-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物一致 |
链 q
1–73（73 aa）
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 KGN D-chiro inositol hexakisphosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 7ABF Human pre-Bact-1 spliceosome core structure 提交 2020-09-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 q
1–73（73 aa）
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未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7ABG Human pre-Bact-1 spliceosome 提交 2020-09-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 q
1–73（73 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.80 Å |
| 7ABI Human pre-Bact-2 spliceosome 提交 2020-09-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 q
1–73（73 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.00 Å |
| 8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric（63） 与全部聚合物一致 |
链 4M
1–73（73 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–73（73 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric（71） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–73（73 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.29 Å |
| 9R3D Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric（17） 与全部聚合物一致 |
链 q
1–73（73 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 9R8V Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：63-meric（63） 与全部聚合物一致 |
链 q
1–73（73 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.50 Å |