1btb

THREE-DIMENSIONAL SOLUTION STRUCTURE AND 13C ASSIGNMENTS OF BARSTAR USING NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY

Method: SOLUTION NMR Dmax: 36.8 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BARSTAR

Bacillus amyloliquefaciens

UniProt P11540

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–89 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 20 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BARS_BACAM
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–89; UniProt 1–89

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1btb

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1btb
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1btb
沉积日期 deposition_date1994-05-09
结构标题 titleTHREE-DIMENSIONAL SOLUTION STRUCTURE AND 13C ASSIGNMENTS OF BARSTAR USING NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY
关键词 keywordsRIBONUCLEASE INHIBITOR; RIBONUCLEASE INHIBITOR
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier12.38
回转半径 Rg (电子) rg_electron11.80
零角强度 I(0) i01233580000.00
分子量 molecular_weight306170.0 kDa
排除体积 excluded_volume385620 ų
包络体积 envelope_volume19054 ų
水化壳体积 shell_volume12088 ų
包络直径 envelope_diameter40.4
壳层 Rg shell_rg19.28
包络 Rg envelope_rg13.49
形状 Rg shape_rg11.79
总 Rg total_rg11.92
总原子数 total_atoms43020
残基数 n_residues2670
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax36.8
Rg (实空间) rg_real12.27
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.17
I(0) (实空间) i0_real1.2340e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1400e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal12.28
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1234000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9034
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary15.9
偏度 Skewness skewness-0.025
峰度 Kurtosis kurtosis-0.452
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha129900.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.931; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.974; Smooth: 0.971

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1btba_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.9 — Barstar-like
超家族 Superfamily superfamilyc.9.1 — Barstar-related
家族 Family familyc.9.1.1 — Barstar-related

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1btbA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology370 — Barnase; Chain D
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Barstar-like

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)