1e79

Bovine F1-ATPase inhibited by DCCD (dicyclohexylcarbodiimide)

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN HEART ISOFORM

物种未注明

UniProt P19483

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	ATP SYNTHASE BETA CHAIN × 3 （P00829） ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN × 1 （P05631） ATP SYNTHASE DELTA CHAIN × 1 （P05630） ATP SYNTHASE EPSILON CHAIN × 1 （P05632） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 5 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 GLYCEROL × 1 DICYCLOHEXYLUREA × 1 SULFATE ION × 1 water × 9	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATP0_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–510； UniProt 44–553 作者链 B； PDB构建体 1–510； UniProt 44–553 作者链 C； PDB构建体 1–510； UniProt 44–553

ATP SYNTHASE BETA CHAIN

物种未注明

UniProt P00829

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN HEART ISOFORM × 3 （P19483） ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN × 1 （P05631） ATP SYNTHASE DELTA CHAIN × 1 （P05630） ATP SYNTHASE EPSILON CHAIN × 1 （P05632） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 5 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 GLYCEROL × 1 DICYCLOHEXYLUREA × 1 SULFATE ION × 1 water × 9	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPB_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–482； UniProt 47–528 作者链 E； PDB构建体 1–482； UniProt 47–528 作者链 F； PDB构建体 1–482； UniProt 47–528

ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN

物种未注明

UniProt P05631

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN HEART ISOFORM × 3 （P19483） ATP SYNTHASE BETA CHAIN × 3 （P00829） ATP SYNTHASE DELTA CHAIN × 1 （P05630） ATP SYNTHASE EPSILON CHAIN × 1 （P05632） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 5 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 GLYCEROL × 1 DICYCLOHEXYLUREA × 1 SULFATE ION × 1 water × 9	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPG_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–272； UniProt 26–297

ATP SYNTHASE DELTA CHAIN

物种未注明

UniProt P05630

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN HEART ISOFORM × 3 （P19483） ATP SYNTHASE BETA CHAIN × 3 （P00829） ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN × 1 （P05631） ATP SYNTHASE EPSILON CHAIN × 1 （P05632） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 5 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 GLYCEROL × 1 DICYCLOHEXYLUREA × 1 SULFATE ION × 1 water × 9	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPD_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–146； UniProt 23–168

ATP SYNTHASE EPSILON CHAIN

物种未注明

UniProt P05632

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN HEART ISOFORM × 3 （P19483） ATP SYNTHASE BETA CHAIN × 3 （P00829） ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN × 1 （P05631） ATP SYNTHASE DELTA CHAIN × 1 （P05630） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 5 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 GLYCEROL × 1 DICYCLOHEXYLUREA × 1 SULFATE ION × 1 water × 9	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATPE_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–50； UniProt 1–50

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1e79
沉积日期 deposition_date	2000-08-25
结构标题 title	Bovine F1-ATPase inhibited by DCCD (dicyclohexylcarbodiimide)
关键词 keywords	ATP PHOSPHORYLASE, ATP PHOSPHORYLASE (H+ TRANSPORTING), F1FO ATP SYNTHASE, CENTRAL STALK, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1e79__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1e79__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1e79__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	45.26 Å
Rg（电子密度）	44.57 Å
总 Rg	44.85 Å
原子数	25407
残基数	3316
排除体积	454440 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1e79__assembly_1__model_1`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN HEART ISOFORM
分子量 formula_weight	55301.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	26318

QKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKARRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAFLSHVISQHQALLGKIRTDGKISEESDAKLKEIVTNFLAGFEA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE BETA CHAIN
分子量 formula_weight	51757.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

AAQASPSPKAGATTGRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN
分子量 formula_weight	30185.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

ATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGVGSLALYEKADIKTPEDKKKHLIIGVSSDRGLCGAIHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSIIFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNASEMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAAL

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE DELTA CHAIN
分子量 formula_weight	15074.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSGSVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE EPSILON CHAIN
分子量 formula_weight	5662.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	DICYCLOHEXYLUREA
分子量 formula_weight	224.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 12 Entity 12 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	911

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 45 domains

SCOP 2.08 (22 domains)

结构域编号 domain_id	d1e79a1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.1 — C-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1e79a2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1e79a3
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d1e79b1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.1 — C-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1e79b2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1e79b3
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d1e79c1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.1 — C-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1e79c2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1e79c3
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d1e79d1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.1 — C-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1e79d2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1e79d3
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d1e79e1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.1 — C-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1e79e2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1e79e3
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d1e79f1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.1 — C-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1e79f2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1e79f3
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d1e79g_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.49 — Pyruvate kinase C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamily	c.49.2 — ATP synthase (F1-ATPase), gamma subunit
家族 Family family	c.49.2.1 — ATP synthase (F1-ATPase), gamma subunit

结构域编号 domain_id	d1e79h1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.2 — Long alpha-hairpin
超家族 Superfamily superfamily	a.2.10 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain
家族 Family family	a.2.10.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1e79h2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.93 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	b.93.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain
家族 Family family	b.93.1.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1e79i_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.137 — Non-globular all-alpha subunits of globular proteins
超家族 Superfamily superfamily	a.137.8 — Epsilon subunit of mitochondrial F1F0-ATP synthase
家族 Family family	a.137.8.1 — Epsilon subunit of mitochondrial F1F0-ATP synthase

CATH v4.4 (23 domains)

结构域编号 domain_id	1e79A01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1e79A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1e79A03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	150 — Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP synthase alpha/beta chain, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	1e79B01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1e79B02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1e79B03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	150 — Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP synthase alpha/beta chain, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	1e79C01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1e79C02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1e79C03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	150 — Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP synthase alpha/beta chain, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	1e79D01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	1e79D02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1e79D03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3

结构域编号 domain_id	1e79E01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	1e79E02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1e79E03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3

结构域编号 domain_id	1e79F01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	1e79F02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1e79F03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3

结构域编号 domain_id	1e79G01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — ATP synthase, gamma subunit, helix hairpin domain

结构域编号 domain_id	1e79G02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1380 — Pyruvate Kinase; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATP synthase, F1 complex, gamma subunit

结构域编号 domain_id	1e79H01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	15 — ATP Synthase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F0F1 ATP synthase delta/epsilon subunit, N-terminal

结构域编号 domain_id	1e79H02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	440 — ATP synthase delta/epsilon subunit, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	1e79I00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1620 — Atp Synthase Epsilon Chain; Chain: I;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP synthase, F1 complex, epsilon subunit superfamily, mitochondrial

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7. 引用文献 (7)

The Structure of the Central Stalk in Bovine F(1)-ATPase at 2.4 A Resolution.

Nat.Struct.Biol. (2000)

PMID: 11062563 · DOI: 10.1038/80981 PRIMARY

Molecular Architecture of the Rotary Motor in ATP Synthase

Science (1999)

PMID: 10576729 · DOI: 10.1126/SCIENCE.286.5445.1700

ATP Synthesis by Rotary Catalysis (Nobel Lecture)

Angew.Chem.Int.Ed.Engl. (1998)

DOI: 10.1002/(SICI)1521-3773(19980918)37:17<2308::AID-ANIE2308>3.0.CO;2-W

Crystal Structure of the Epsilon Subunit of the Proton-Translocating ATP Synthase from Escherichia Coli

Structure (1997)

PMID: 9331422 · DOI: 10.1016/S0969-2126(97)00272-4

Structure at 2.8 A Resolution of F1-ATPase from Bovine Heart Mitochondria

Nature (1994)

PMID: 8065448 · DOI: 10.1038/370621A0

Crystallization of F1-ATPase from Bovine Heart Mitochondria

J.Mol.Biol. (1993)

PMID: 8433373 · DOI: 10.1006/JMBI.1993.1081

;Inactivation of Bovine Mitochondrial F1-ATPase with Dicyclohexyl-Carbodiimide [14C] Leads to the Modification of a Specific Glutamic-Acid Residue in the Beta Subunit ;

J.Biol.Chem. (1981)

PMID: 6114957

晶胞边长 a length_a	267.200 Å
晶胞边长 b length_b	107.200 Å
晶胞边长 c length_c	135.900 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.400 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2250
R_free r_free	0.2810

Bovine F1-ATPase inhibited by DCCD (dicyclohexylcarbodiimide)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN HEART ISOFORM

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE BETA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE DELTA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE EPSILON CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1e79__assembly_1__model_1

1e79__assembly_1__model_1 | I(q)

1e79__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 non-polymer

实体 11 Entity 11 non-polymer

实体 12 Entity 12 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 45 domains

SCOP 2.08 (22 domains)

CATH v4.4 (23 domains)

7. 引用文献 (7)