1unw

Structure Based Engineering of Internal Molecular Surfaces Of Four Helix Bundles

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 55.5 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GENERAL CONTROL PROTEIN GCN4

物种未注明

UniProt P03069

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 249–281 链 B; UniProt 249–281 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7;10% W/V PEG 8K, 100 MM TRIS, 200 MM MGCL2, PH 7.0 分辨率 2.20 Å R-free 0.284

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 162 个其他 PDB 条目、200 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GCN4_YEAST
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–34; UniProt 249–281 作者链 B; PDB构建体 2–34; UniProt 249–281

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1unw

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1unw
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1unw
沉积日期 deposition_date2003-09-15
结构标题 titleStructure Based Engineering of Internal Molecular Surfaces Of Four Helix Bundles
关键词 keywordsFOUR HELIX BUNDLE, CAVITY; FOUR HELIX BUNDLE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier15.59
回转半径 Rg (电子) rg_electron14.94
零角强度 I(0) i01153170.00
分子量 molecular_weight7391.0 kDa
排除体积 excluded_volume9418 ų
包络体积 envelope_volume11571 ų
水化壳体积 shell_volume7594 ų
包络直径 envelope_diameter52.2
壳层 Rg shell_rg18.56
包络 Rg envelope_rg15.43
形状 Rg shape_rg14.82
总 Rg total_rg16.17
总原子数 total_atoms518
残基数 n_residues64
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax55.5
Rg (实空间) rg_real15.78
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.54
I(0) (实空间) i0_real1.1530e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.5610e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal15.76
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1153000.0000
解质量估计 total_estimate0.8111
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary14.1
偏度 Skewness skewness0.547
峰度 Kurtosis kurtosis-0.249
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha125800.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.726; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.467; Smooth: 0.897

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1unwa_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.1.3 — Leucine zipper domain
家族 Family familyh.1.3.1 — Leucine zipper domain
结构域编号 domain_idd1unwb_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.1.3 — Leucine zipper domain
家族 Family familyh.1.3.1 — Leucine zipper domain

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)