Dynein light chain 2A
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 0–95 链 B; UniProt 0–95 | 未记录 | 无其他共同聚合物 | SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 6;298 K;压力 ambient NMR样品组成:1.3mM DYNEIN LIGHT CHAIN 2A, U-15N, 13C, 50 mM MES, 95% H2O, 5% D2O, 0.02% NaN3, pH 6.0 | 95% H2O/5% D2O | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2B95 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1Z09 Solution structure of km23 提交 2005-03-01 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–96(96 aa)
片段:LC7 Dynein Light Chain KM23
链 B
1–96(96 aa)
片段:LC7 Dynein Light Chain KM23
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;315 K;离子强度(mmCIF原始值)0 M NaCl;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM 15N_Km23; 25 mM Sodium Acetate; pH 6.0; 95 % H2O; 5 % D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1 mM 13C,15N_Km23; 25 mM Sodium Acetate; pH 6.0; 95 % H2O; 5 % D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2E8J Solution structure of dynein light chain 2A 提交 2007-01-21 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–96(96 aa)
链 B
1–96(96 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;压力 ambient
NMR样品组成
0.6mM DL2A U-15, 13C; 20mM phosphate buffer NA; 20mM NaCl; 0.1mM EDTA; 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.6mM DL2A U-15, 13C; 20mM phosphate buffer NA; 20mM NaCl; 0.1mM EDTA; 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2HZ5 Crystal structure of human dynein light chain Dnlc2A 提交 2006-08-08 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
0–95(96 aa)
链 B
0–95(96 aa)
|
未记录 | CS CESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;298 K;28% PEG 4000, 0.1M CeCl, 0.1M Tris, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.229 |
| 2HZ5 Crystal structure of human dynein light chain Dnlc2A 提交 2006-08-08 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
0–95(96 aa)
链 B
0–95(96 aa)
|
未记录 | CS CESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;298 K;28% PEG 4000, 0.1M CeCl, 0.1M Tris, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.229 |
| 6F1T Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and BICDR1 提交 2017-11-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 45 PDB 声明:45-meric |
链 k
1–96(96 aa)
链 l
1–96(96 aa)
链 s
1–96(96 aa)
链 t
1–96(96 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6F1Z Roadblock-1 region of the dynein tail/dynactin/BICDR1 complex 提交 2017-11-23 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 s
1–96(96 aa)
链 t
1–96(96 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6F38 Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and HOOK3 提交 2017-11-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 45 PDB 声明:45-meric |
链 k
1–96(96 aa)
链 l
1–96(96 aa)
链 s
1–96(96 aa)
链 t
1–96(96 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.70 Å |
| 6F3A Cryo-EM structure of a single dynein tail domain bound to dynactin and BICD2N 提交 2017-11-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric |
链 k
1–96(96 aa)
链 l
1–96(96 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 6RLB Structure of the dynein-2 complex; tail domain 提交 2019-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 G
1–96(96 aa)
链 H
1–96(96 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6SC2 Structure of the dynein-2 complex; IFT-train bound model 提交 2019-07-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 G
1–96(96 aa)
链 H
1–96(96 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7Z8F Composite structure of dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2022-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 43 PDB 声明:43-meric |
链 k
1–96(96 aa)
链 l
1–96(96 aa)
链 s
1–96(96 aa)
链 t
1–96(96 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ZN ZINC ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 20.00 Å |
| 8J07 96nm repeat of human respiratory doublet microtubule and associated axonemal complexes 提交 2023-04-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 974 PDB 声明:974-meric |
链 k4
1–96(96 aa)
链 m4
1–96(96 aa)
链 o4
1–96(96 aa)
链 q4
1–96(96 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 285 MG MAGNESIUM ION × 285 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 289 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8PR1 Cytoplasmic dynein-B heavy chain bound to IC-LC tower 提交 2023-07-12 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric |
链 s
1–96(96 aa)
链 t
1–96(96 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 8PTK Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1 提交 2023-07-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:53-meric |
链 s
1–96(96 aa)
链 t
1–96(96 aa)
链 w
1–96(96 aa)
链 z
1–96(96 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.00 Å |
| 8RGG Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I2 (WDR34) in complex with dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 G
1–96(96 aa)
链 H
1–96(96 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8RGH Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I1 (WDR60) in complex with the dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 G
1–96(96 aa)
链 H
1–96(96 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9BLY Composite structure of full-length human dynein-1 in phi-particle conformation 提交 2024-05-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric |
链 G
1–96(96 aa)
链 H
1–96(96 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9E12 Full-length human dynein-1 in phi comformation under Lis1 condition 提交 2024-10-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 G
1–96(96 aa)
链 H
1–96(96 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 9E13 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Lis1 condition 提交 2024-10-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 G
1–96(96 aa)
链 H
1–96(96 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 9E14 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Nde1-Lis1 condition 提交 2024-10-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 G
1–96(96 aa)
链 H
1–96(96 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.00 Å |
| 9E23 Cryo-EM structure of Pre-Chi dynein tail 提交 2024-10-21 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:16-meric |
链 E
1–96(96 aa)
链 F
1–96(96 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.20 Å |
| 9E28 Cryo-EM structure of Phi dynein tail 提交 2024-10-21 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:16-meric |
链 E
1–96(96 aa)
链 F
1–96(96 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 9HHL Structure of Dynein-Dynactin-NuMA-LIS1 提交 2024-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 41 PDB 声明:41-meric |
链 s
1–96(96 aa)
链 t
1–96(96 aa)
链 w
1–96(96 aa)
链 z
1–96(96 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.53 Å |
| 9YNH Full-length human cytoplasmic dynein-1 in phi-like state bound to dynactin-p150glued and LIS1 提交 2025-10-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric |
链 G
1–96(96 aa)
链 H
1–96(96 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |
共 23 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | DLC2A_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 11–106; UniProt 0–95 作者链 B; PDB构建体 11–106; UniProt 0–95 |