SAXSdb — 2efs

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

General control protein GCN4 and Tropomyosin 1 alpha chain

Oryctolagus cuniculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GCN4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–29； UniProt 249–277 作者链 B； PDB构建体 1–29； UniProt 249–277 作者链 C； PDB构建体 1–29； UniProt 249–277 作者链 D； PDB构建体 1–29； UniProt 249–277

General control protein GCN4 and Tropomyosin 1 alpha chain

Oryctolagus cuniculus

UniProt P58772

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TPM1_RABIT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 30–127； UniProt 176–273 作者链 B； PDB构建体 30–127； UniProt 176–273 作者链 C； PDB构建体 30–127； UniProt 176–273 作者链 D； PDB构建体 30–127； UniProt 176–273

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2efs
沉积日期 deposition_date	2007-02-23
结构标题 title	Crystal structure of the C-terminal tropomyosin fragment with N- and C-terminal extensions of the leucine zipper at 2.0 angstroms resolution
关键词 keywords	DESTABILIZING CLUSTER, HYDROPHOBIC CORE, CONTRACTILE PROTEIN; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2efs__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2efs__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2efs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	62.03 Å
Rg（电子密度）	66.58 Å
总 Rg	65.45 Å
原子数	2548
残基数	308
排除体积	45451 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2efs__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2efs__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2efsA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	2efsB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	2efsC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	2efsD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

▶

晶胞边长 a length_a	43.199 Å
晶胞边长 b length_b	63.723 Å
晶胞边长 c length_c	73.258 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	66.64 °
晶胞夹角 β angle_beta	89.99 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.30 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	19.920 Å
R 因子 r_factor	0.2490
R_work r_work	0.2490
R_free r_free	0.3040

描述 description	General control protein GCN4 and Tropomyosin 1 alpha chain
分子量 formula_weight	18338.7 kDa
突变 mutation	C190S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	5457

Crystal structure of the C-terminal tropomyosin fragment with N- and C-terminal extensions of the leucine zipper at 2.0 angstroms resolution

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

General control protein GCN4 and Tropomyosin 1 alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

General control protein GCN4 and Tropomyosin 1 alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2efs__assembly_1__model_1

2efs__assembly_1__model_1 | I(q)

2efs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Oryctolagus cuniculus
通用名 common_name	;baker's yeast, rabbit ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9986
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	361

Crystal structure of the C-terminal tropomyosin fragment with N- and C-terminal extensions of the leucine zipper at 2.0 angstroms resolution

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

General control protein GCN4 and Tropomyosin 1 alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General control protein GCN4 and Tropomyosin 1 alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2efs__assembly_1__model_1

2efs__assembly_1__model_1 | I(q)

2efs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)