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2mhp

Solution structure of the major factor VIII binding region on von Willebrand factor

Method: SOLUTION NMR Dmax: 66.8 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

von Willebrand factor

Homo sapiens

UniProt P04275

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 766–864 片段：;domains TIL' and E', UNP residues 766-864 ; 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7.4；298 K；压力 ambient NMR样品组成：300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-1, 20 mM sodium phosphate-2, 100 mM sodium chloride-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：300 mM [U-10% 13C] VWF TIL'E'-4, 20 mM sodium phosphate-5, 100 mM sodium chloride-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：300 mM [U-15N] VWF TIL'E'-7, 20 mM sodium phosphate-8, 100 mM sodium chloride-9, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-10, 20 mM sodium phosphate-11, 100 mM sodium chloride-12, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：300 mM [U-15N] VWF TIL'E'-13, 20 mM sodium phosphate-14, 100 mM sodium chloride-15, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-16, 20 mM sodium phosphate-17, 100 mM sodium chloride-18, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-19, 20 mM sodium phosphate-20, 100 mM sodium chloride-21, 5 mg/mL Pf1 phage-22, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-23, 20 mM sodium phosphate-24, 100 mM sodium chloride-25, 2 % w/v pentaethylene glycol dodecyl ether-26, 50 mM n-hexanol-27, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2MHP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1AO3 A3 DOMAIN OF VON WILLEBRAND FACTOR 提交 1997-07-16 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1686–1872（187 aa） 片段：A3 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；0.1M TRIS PH 8.5, 200MM MGCL2, 24% PEG 8K
分辨率 2.20 Å R-free 0.215
1AO3 A3 DOMAIN OF VON WILLEBRAND FACTOR 提交 1997-07-16 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1686–1872（187 aa） 片段：A3 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；0.1M TRIS PH 8.5, 200MM MGCL2, 24% PEG 8K
分辨率 2.20 Å R-free 0.215
1ATZ HUMAN VON WILLEBRAND FACTOR A3 DOMAIN 提交 1997-08-15 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1685–1873（189 aa） 片段：A3-DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；24% PEG 3000, 200 MM SODIUM ACETATE, 100 MM TRIS/HCL PH 8.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.240
1ATZ HUMAN VON WILLEBRAND FACTOR A3 DOMAIN 提交 1997-08-15 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1685–1873（189 aa） 片段：A3-DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；24% PEG 3000, 200 MM SODIUM ACETATE, 100 MM TRIS/HCL PH 8.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.240
1AUQ A1 DOMAIN OF VON WILLEBRAND FACTOR 提交 1997-09-01 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1261–1468（208 aa） 片段：A1
未记录 CD CADMIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；0.1M TRIS PH 8.5, 5MM CDCL2, 5% PEG 8K
分辨率 2.30 Å R-free 0.248
1FE8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE VON WILLEBRAND FACTOR A3 DOMAIN IN COMPLEX WITH A FAB FRAGMENT OF IGG RU5 THAT INHIBITS COLLAGEN BINDING 提交 2000-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1683–1874（192 aa） 片段：COLLAGEN BINDING DOMAIN A3
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CAC CACODYLATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；iso-propanol, MPD, cacodylate, sodium chloride, Tris , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.03 Å R-free 0.264
1FE8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE VON WILLEBRAND FACTOR A3 DOMAIN IN COMPLEX WITH A FAB FRAGMENT OF IGG RU5 THAT INHIBITS COLLAGEN BINDING 提交 2000-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1683–1874（192 aa） 片段：COLLAGEN BINDING DOMAIN A3
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；iso-propanol, MPD, cacodylate, sodium chloride, Tris , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.03 Å R-free 0.264
1FE8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE VON WILLEBRAND FACTOR A3 DOMAIN IN COMPLEX WITH A FAB FRAGMENT OF IGG RU5 THAT INHIBITS COLLAGEN BINDING 提交 2000-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1683–1874（192 aa） 片段：COLLAGEN BINDING DOMAIN A3
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；iso-propanol, MPD, cacodylate, sodium chloride, Tris , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.03 Å R-free 0.264
1FE8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE VON WILLEBRAND FACTOR A3 DOMAIN IN COMPLEX WITH A FAB FRAGMENT OF IGG RU5 THAT INHIBITS COLLAGEN BINDING 提交 2000-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 1683–1874（192 aa） 片段：COLLAGEN BINDING DOMAIN A3
链 B 1683–1874（192 aa） 片段：COLLAGEN BINDING DOMAIN A3
链 C 1683–1874（192 aa） 片段：COLLAGEN BINDING DOMAIN A3
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CAC CACODYLATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；iso-propanol, MPD, cacodylate, sodium chloride, Tris , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.03 Å R-free 0.264
1FNS CRYSTAL STRUCTURE OF THE VON WILLEBRAND FACTOR (VWF) A1 DOMAIN I546V MUTANT IN COMPLEX WITH THE FUNCTION BLOCKING FAB NMC4 提交 2000-08-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1271–1465（195 aa） 片段：A1 DOMAIN RESIDUES 507 - 702, OR GLYCOPROTEIN IBA (A\:ALPHA) BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.207
1IJB The von Willebrand Factor mutant (I546V) A1 domain 提交 2001-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1263–1464（202 aa） 片段：A1 domain
突变：I546V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；PEG 4000, sodium citrate, ammonium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.208
1IJK The von Willebrand Factor mutant (I546V) A1 domain-botrocetin Complex 提交 2001-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1263–1464（202 aa） 片段：A1 domain
突变：I546V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；PEG 4000, sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.279
1M10 Crystal structure of the complex of Glycoprotein Ib alpha and the von Willebrand Factor A1 Domain 提交 2002-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1261–1468（208 aa） 片段：A1 domain
突变：R543Q 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3000, sodium chloride, MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.296
1OAK CRYSTAL STRUCTURE OF THE VON WILLEBRAND FACTOR (VWF) A1 DOMAIN IN COMPLEX WITH THE FUNCTION BLOCKING NMC-4 FAB 提交 1997-12-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1271–1465（195 aa） 片段：A1 DOMAIN RESIDUES 507 - 702, OR GLYCOPROTEIN IBA (A\:ALPHA) BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；pH 8
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
1SQ0 Crystal Structure of the Complex of the Wild-type Von Willebrand Factor A1 domain and Glycoprotein Ib alpha at 2.6 Angstrom Resolution 提交 2004-03-17 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1259–1472（214 aa） 片段：A1
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG-3350; potassium thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.239
1U0N The ternary von Willebrand Factor A1-glycoprotein Ibalpha-botrocetin complex 提交 2004-07-13 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1261–1468（208 aa） 片段：VWFA 1
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；Sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.95 Å R-free 0.276
1UEX Crystal structure of von Willebrand Factor A1 domain complexed with snake venom bitiscetin 提交 2003-05-22 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1260–1468（209 aa） 片段：A1 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；283 K；10% PEG 6000, 2% PEG-MME 550, 5% MPD, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 2.85 Å R-free 0.276
2ADF Crystal Structure and Paratope Determination of 82D6A3, an Antithrombotic Antibody Directed Against the von Willebrand factor A3-Domain 提交 2005-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1683–1874（192 aa） 片段：A3 domain
未记录 ACY ACETIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；PEG 8000, ammonium sulphate, acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.220
2MHQ Solution structure of the major factor VIII binding region on von Willebrand factor 提交 2013-12-02 构建体不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 766–864（99 aa） 片段：;Domains TIL' and E', UNP residues 766-864 ;
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-1, 20 mM sodium phosphate-2, 100 mM sodium chloride-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 300 mM [U-10% 13C] VWF TIL'E'-4, 20 mM sodium phosphate-5, 100 mM sodium chloride-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 300 mM [U-15N] VWF TIL'E'-7, 20 mM sodium phosphate-8, 100 mM sodium chloride-9, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-10, 20 mM sodium phosphate-11, 100 mM sodium chloride-12, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 300 mM [U-15N] VWF TIL'E'-13, 20 mM sodium phosphate-14, 100 mM sodium chloride-15, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-16, 20 mM sodium phosphate-17, 100 mM sodium chloride-18, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-19, 20 mM sodium phosphate-20, 100 mM sodium chloride-21, 5 mg/mL Pf1 phage-22, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-23, 20 mM sodium phosphate-24, 100 mM sodium chloride-25, 2 % w/v pentaethylene glycol dodecyl ether-26, 50 mM n-hexanol-27, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3GXB Crystal structure of VWF A2 domain 提交 2009-04-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1495–1671（177 aa） 片段：ADAMTS13 cleavage domain, residues 1495-1671
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 7.2, 0.2 M lithium sulfate, 25 % PEG3350, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
3GXB Crystal structure of VWF A2 domain 提交 2009-04-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1495–1671（177 aa） 片段：ADAMTS13 cleavage domain, residues 1495-1671
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 7.2, 0.2 M lithium sulfate, 25 % PEG3350, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
3HXO Crystal Structure of Von Willebrand Factor (VWF) A1 Domain in Complex with DNA Aptamer ARC1172, an Inhibitor of VWF-Platelet Binding 提交 2009-06-21 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1260–1468（209 aa） 片段：von Willebrand factor (VWF) A1 Domain (residues 1260-1468)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1；293 K；25% PEG3350, 0.16 M sodium fluoride, pH 7.1, EVAPORATION, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.274
3HXQ Crystal Structure of Von Willebrand Factor (VWF) A1 Domain in Complex with DNA Aptamer ARC1172, an Inhibitor of VWF-Platelet Binding 提交 2009-06-21 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1260–1468（209 aa） 片段：von Willebrand factor (VWF) A1 Domain (residues 1260-1468)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；293 K；0.2 M NH4Ac, 0.1 M NaAc, 30% PEG4000, pH 4.6, EVAPORATION, temperature 293K
分辨率 2.69 Å R-free 0.279
3PPV Crystal structure of an engineered VWF A2 domain (N1493C and C1670S) 提交 2010-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1488–1674（187 aa） 片段：VWFA 2 domain, UNP residues 1488-1674
突变：N1493C, C1670S SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；0.1M sodium citrate, 1.6M (NH4)2SO4, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.231
3PPW Crystal structure of the D1596A mutant of an engineered VWF A2 domain (N1493C and C1670S) 提交 2010-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1488–1674（187 aa） 片段：VWFA 2 domain, UNP residues 1488-1674
突变：N1493C, D1596A, C1670S NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；0.1M sodium citrate, 1.6M (NH4)2SO4, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.226
3PPX Crystal structure of the N1602A mutant of an engineered VWF A2 domain (N1493C and C1670S) 提交 2010-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1488–1674（187 aa） 片段：VWF A2 domain, UNP residues 1488-1674
突变：N1493C, N1602A, C1670S NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；0.1M sodium citrate, 1.6M (NH4)2SO4, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.91 Å R-free 0.237
3PPY Crystal structure of the D1596A/N1602A double mutant of an engineered VWF A2 domain (N1493C and C1670S) 提交 2010-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1488–1674（187 aa） 片段：VWF A2 domain, UNP residues 1488-1674
突变：N1493, D1596A, N1602A, C1670S NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；0.1M sodium citrate, 1.6M (NH4)2SO4, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.232
3ZQK Von Willebrand Factor A2 domain with calcium 提交 2011-06-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1478–1674（197 aa） 片段：A2 DOMAIN, RESIDUES 1478-1674
未记录 GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 PROTEIN BUFFER: 0.015 M HEPES PH 7.5, 0.02 M NACL, 0.001 M CACL2. RESERVOIR BUFFER: 0.1 M MMT (PH 4.0-5.5), 0.15 M (NH4)2SO4, 18-23% (W/V) PEG2000 MME.
分辨率 1.70 Å R-free 0.200
3ZQK Von Willebrand Factor A2 domain with calcium 提交 2011-06-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1478–1674（197 aa） 片段：A2 DOMAIN, RESIDUES 1478-1674
未记录 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 PROTEIN BUFFER: 0.015 M HEPES PH 7.5, 0.02 M NACL, 0.001 M CACL2. RESERVOIR BUFFER: 0.1 M MMT (PH 4.0-5.5), 0.15 M (NH4)2SO4, 18-23% (W/V) PEG2000 MME.
分辨率 1.70 Å R-free 0.200
3ZQK Von Willebrand Factor A2 domain with calcium 提交 2011-06-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1478–1674（197 aa） 片段：A2 DOMAIN, RESIDUES 1478-1674
未记录 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 PROTEIN BUFFER: 0.015 M HEPES PH 7.5, 0.02 M NACL, 0.001 M CACL2. RESERVOIR BUFFER: 0.1 M MMT (PH 4.0-5.5), 0.15 M (NH4)2SO4, 18-23% (W/V) PEG2000 MME.
分辨率 1.70 Å R-free 0.200
4C29 Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with Disulfide Mutation 提交 2013-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1264–1471（208 aa） 片段：RESIDUES 1264-1471
突变：YES ACT ACETATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS APPEARED IN DROPS CONTAINING 25% PEG3350 AND 0.2 M CALCIUM ACETATE. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING. CRYSTALS GROWN IN 8 MG/ML PROTEIN, 15% PEG3350, AND 0.2 M CALCIUM ACETATE WERE HARVESTED, AND SOAKED IN THE SAME BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL FOR CRYOPROTECTION., pH 4.6
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
4C29 Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with Disulfide Mutation 提交 2013-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1264–1471（208 aa） 片段：RESIDUES 1264-1471
突变：YES PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS APPEARED IN DROPS CONTAINING 25% PEG3350 AND 0.2 M CALCIUM ACETATE. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING. CRYSTALS GROWN IN 8 MG/ML PROTEIN, 15% PEG3350, AND 0.2 M CALCIUM ACETATE WERE HARVESTED, AND SOAKED IN THE SAME BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL FOR CRYOPROTECTION., pH 4.6
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
4C2A Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with R1306Q and I1309V Mutations in Complex with High Affinity GPIb alpha 提交 2013-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1264–1471（208 aa） 片段：RESIDUES 1264-1471
突变：YES CAC CACODYLATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；CRYSTALS OF A1/VWD2-GPIBALPA/VWD2 COMPLEX APPEARED IN 12% PEG 8000, 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 6.5, 0.1 M CALCIUM ACETATE, AND 0.4 MG/ML RISTOCETIN (SIGMA-ALDRICH). THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING. CRYSTALS GREW IN 10 MG/ML COMPLEX, 14% PEG8000, 0.2 M CALCIUM ACETATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, AND 0.4 MG/ML RISTOCETIN. NEXT WE SOAKED THESE CRYSTALS IN 14% PEG8000, 0.2 M CALCIUM ACETATE, 0.1 SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, AND 4 MG/ML RISTOCETIN.
分辨率 2.08 Å R-free 0.189
4C2B Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with Disulfide Mutation in Complex with High Affinity GPIb alpha 提交 2013-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1264–1471（208 aa） 片段：1264-1468
突变：YES SO4 SULFATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS-GPIB/VWD2 COMPLEX APPEARED IN DROPS WITH 20% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING CRYSTAL GROWTH IN 8 MG/ML COMPLEX, 15% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. SINCE THESE CRYSTALS WERE FORMED IN BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL, NO ADDITIONAL CRYOPROTECTION WAS USED.
分辨率 2.80 Å R-free 0.286
4C2B Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with Disulfide Mutation in Complex with High Affinity GPIb alpha 提交 2013-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1264–1471（208 aa） 片段：1264-1468
突变：YES SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS-GPIB/VWD2 COMPLEX APPEARED IN DROPS WITH 20% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING CRYSTAL GROWTH IN 8 MG/ML COMPLEX, 15% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. SINCE THESE CRYSTALS WERE FORMED IN BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL, NO ADDITIONAL CRYOPROTECTION WAS USED.
分辨率 2.80 Å R-free 0.286
4C2B Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with Disulfide Mutation in Complex with High Affinity GPIb alpha 提交 2013-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1264–1471（208 aa） 片段：1264-1468
突变：YES SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS-GPIB/VWD2 COMPLEX APPEARED IN DROPS WITH 20% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING CRYSTAL GROWTH IN 8 MG/ML COMPLEX, 15% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. SINCE THESE CRYSTALS WERE FORMED IN BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL, NO ADDITIONAL CRYOPROTECTION WAS USED.
分辨率 2.80 Å R-free 0.286
4C2B Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with Disulfide Mutation in Complex with High Affinity GPIb alpha 提交 2013-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1264–1471（208 aa） 片段：1264-1468
突变：YES SO4 SULFATE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS-GPIB/VWD2 COMPLEX APPEARED IN DROPS WITH 20% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING CRYSTAL GROWTH IN 8 MG/ML COMPLEX, 15% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. SINCE THESE CRYSTALS WERE FORMED IN BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL, NO ADDITIONAL CRYOPROTECTION WAS USED.
分辨率 2.80 Å R-free 0.286
4DMU Crystal structure of the von Willebrand factor A3 domain in complex with a collagen III derived triple-helical peptide 提交 2012-02-08 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1683–1874（192 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM cacodylate, pH 6.5, 1.20 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4DMU Crystal structure of the von Willebrand factor A3 domain in complex with a collagen III derived triple-helical peptide 提交 2012-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1683–1874（192 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM cacodylate, pH 6.5, 1.20 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4DMU Crystal structure of the von Willebrand factor A3 domain in complex with a collagen III derived triple-helical peptide 提交 2012-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1683–1874（192 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM cacodylate, pH 6.5, 1.20 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4DMU Crystal structure of the von Willebrand factor A3 domain in complex with a collagen III derived triple-helical peptide 提交 2012-02-08 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1683–1874（192 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM cacodylate, pH 6.5, 1.20 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4DMU Crystal structure of the von Willebrand factor A3 domain in complex with a collagen III derived triple-helical peptide 提交 2012-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 1683–1874（192 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM cacodylate, pH 6.5, 1.20 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4DMU Crystal structure of the von Willebrand factor A3 domain in complex with a collagen III derived triple-helical peptide 提交 2012-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 1683–1874（192 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM cacodylate, pH 6.5, 1.20 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4NT5 Crystal structure of human von Willebrand factor CTCK domain 提交 2013-12-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2721–2813（93 aa） 片段：C-terminal cystine knot domain, unp residues 2721-2813
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；293 K；1.3 M Lithium Sulfate, 0.1 M Bicine, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.28 Å R-free 0.248
5BV8 G1324S mutation in von Willebrand Factor A1 domain 提交 2015-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1238–1471（234 aa） 片段：A1 domain (UNP residues 1238-1471)
突变：G1324S EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；298 K；30% PEG 400, 100 mM CAPS/Sodium hydroxide
分辨率 1.59 Å R-free 0.181
6FWN Structure and dynamics of the platelet integrin-binding C4 domain of von Willebrand factor 提交 2018-03-06 构建体不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2497–2577（81 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.04；压力 1
NMR样品组成 500 uM [U-13C; U-15N] von Willebrand Factor C4 domain, 20 mM sodium phosphate, 49.5 M H2O, 5.5 M D2O, 0.02 % w/v sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 500 uM [U-13C; U-15N] von Willebrand Factor C4 domain, 20 mM sodium phosphate, 55 M D2O, 5 mM H2O, 0.02 % w/v sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
6N29 Crystal structure of monomeric von Willebrand Factor D`D3 assembly 提交 2018-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 764–1244（481 aa）
突变：Q852R, C1009A, C1142A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；5.5% (w/v) PEG8000, 10% (w/v) PEG1000, 0.2 M calcium acetate and 0.1 M Tris-acetate, pH 8.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.241
6N29 Crystal structure of monomeric von Willebrand Factor D`D3 assembly 提交 2018-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 764–1244（481 aa）
突变：Q852R, C1009A, C1142A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；5.5% (w/v) PEG8000, 10% (w/v) PEG1000, 0.2 M calcium acetate and 0.1 M Tris-acetate, pH 8.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.241
7EOW High-resolution structure of vWF A1 domain in complex with caplacizumab, the first nanobody-based medicine 提交 2021-04-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1261–1468（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；20 mM Tris-HCl pH 8 150 mM NaCl 10% glycerol 40% glycerol ethoxylate
分辨率 1.60 Å R-free 0.198
7F49 von Willebrand factor (VWF) A1 domain with BT-100 aptamer RNA 提交 2021-06-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1260–1468（209 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Sodium Acetate pH 4.6, 18% w/v PEG 4000
分辨率 2.09 Å R-free 0.239
7P4N NMR solution structure of the C6 domain of von Willebrand Factor 提交 2021-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2647–2720（74 aa）
突变：G2705R 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1.013
NMR样品组成 300 uM [U-13C; U-15N] von Willebrand Factor C6 domain, 20 mM None sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7PMV VWF Tubules of D1D2D'D3 domains 提交 2021-09-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1241（1241 aa）
链 B 1–1241（1241 aa）
链 D 1–1241（1241 aa）
链 E 1–1241（1241 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 CA CALCIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7PNF VWF Tubules of D1D2D'D3 domains 提交 2021-09-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 B 1–1241（1241 aa）
链 D 1–1241（1241 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 144 CA CALCIUM ION × 108 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.35 Å
7WN3 Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer (2M mutant) complexed with D1D2 at 3.29 angstron resolution (2 units) 提交 2022-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 B 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 C 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 D 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 E 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 F 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 G 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 H 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
突变：R1136M,E1143M 突变：R1136M,E1143M 突变：R1136M,E1143M 突变：R1136M,E1143M CA CALCIUM ION × 16 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
7WN4 Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer (wild type) complexed with D1D2 at 3.4 angstron resolution (1 unit) 提交 2022-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 F 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 G 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 H 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
未记录 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WN6 Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer (R1136M/E1143M mutant) complexed with D1D2 at 3.29 angstron resolution (2 units) 提交 2022-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 B 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 C 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 D 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 E 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 F 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 G 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 H 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
突变：R1136M/E1143M 突变：R1136M/E1143M 突变：R1136M/E1143M 突变：R1136M/E1143M CA CALCIUM ION × 16 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
7WPP Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer complexed with D1D2 at 2.85 angstron resolution (1 unit) 提交 2022-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 F 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 G 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 H 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
未记录 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
7WPQ Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer complexed with D1D2 at 3.27 angstron resolution (2 units) 提交 2022-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 B 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 C 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 D 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 E 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 F 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 G 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 H 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 CA CALCIUM ION × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
7WPR VWF D'D3 dimer complexed with D1D2 at 4.39 angstron resolution(VWF tube) 提交 2022-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 A 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 B 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 C 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 D 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 E 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 F 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 G 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 H 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 I 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 J 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 K 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 L 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 M 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 N 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 O 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 P 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 Q 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 R 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 S 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 T 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 U 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 V 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 W 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 X 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 Y 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 Z 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 a 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 b 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 c 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 d 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 e 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 f 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 CA CALCIUM ION × 56 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.39 Å
7WPS Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer complexed with D1D2 at 4.3 angstron resolution (7 units) 提交 2022-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric
链 A 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 B 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 C 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 D 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 E 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 F 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 G 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 H 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 I 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 J 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 K 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 L 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 M 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 N 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 O 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 P 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 Q 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 R 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 S 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 T 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 U 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 V 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 W 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 X 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 Y 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 Z 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 a 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 b 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 CA CALCIUM ION × 56 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.32 Å
7WQT Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer complexed with D1D2 at 4.3 angstron resolution (VWF tube) 提交 2022-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 A 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 B 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 C 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 D 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 E 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 F 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 G 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 H 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 I 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 J 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 K 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 L 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 M 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 N 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 O 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 P 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 Q 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 R 23–763（741 aa） 片段：D1D2 domain
链 S 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 T 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 U 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 V 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 W 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 X 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 Y 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 Z 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 a 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 b 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 c 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 d 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 e 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
链 f 764–1241（478 aa） 片段：;D'D3 domain ;
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 CA CALCIUM ION × 56 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7ZWH VWF Tubules of D1D2 and D'D3A1 domains 提交 2022-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–1197（1197 aa）
链 E 1–1197（1197 aa）
链 G 1265–1463（199 aa）
链 H 1265–1463（199 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8D3C VWF tubule derived from monomeric D1-A1 提交 2022-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–1464（1464 aa）
链 B 1–1464（1464 aa）
链 C 1–1464（1464 aa）
链 D 1–1464（1464 aa）
链 E 1–1464（1464 aa）
链 F 1–1464（1464 aa）
链 G 1–1464（1464 aa）
链 H 1–1464（1464 aa）
链 I 1–1464（1464 aa）
链 J 1–1464（1464 aa）
链 K 1–1464（1464 aa）
链 L 1–1464（1464 aa）
链 M 1–1464（1464 aa）
链 N 1–1464（1464 aa）
链 O 1–1464（1464 aa）
链 P 1–1464（1464 aa）
突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) CA CALCIUM ION × 48 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 80 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.2；100 mM Sodium Cacodylate at pH 5.2, 10 mM CaCl2, and 100 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8D3D VWF tubule derived from dimeric D1-A1 提交 2022-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–1464（1464 aa）
链 B 1–1464（1464 aa）
链 C 1–1464（1464 aa）
链 D 1–1464（1464 aa）
链 E 1–1464（1464 aa）
链 F 1–1464（1464 aa）
链 G 1–1464（1464 aa）
链 H 1–1464（1464 aa）
链 I 1–1464（1464 aa）
链 J 1–1464（1464 aa）
链 K 1–1464（1464 aa）
链 L 1–1464（1464 aa）
链 M 1–1464（1464 aa）
链 N 1–1464（1464 aa）
链 O 1–1464（1464 aa）
链 P 1–1464（1464 aa）
突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) CA CALCIUM ION × 48 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 80 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.2；100 mM Sodium Cacodylate at pH 5.2, 10 mM CaCl2, and 100 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å

共 46 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VWF_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 5–103； UniProt 766–864

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2mhp

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2mhp
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2mhp
沉积日期 deposition_date2013-12-02
结构标题 titleSolution structure of the major factor VIII binding region on von Willebrand factor
关键词 keywordsvon Willebrand factor, factor VIII, BLOOD CLOTTING; BLOOD CLOTTING
实验方法 methodSOLUTION NMR
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier17.14 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron17.26 Å
零角强度 I(0) i0234285000.00
分子量 molecular_weight113360.0 kDa
排除体积 excluded_volume136000 ų
包络体积 envelope_volume27045 ų
水化壳体积 shell_volume13396 ų
包络直径 envelope_diameter71.2 Å
壳层 Rg shell_rg23.43 Å
包络 Rg envelope_rg19.25 Å
形状 Rg shape_rg17.23 Å
总 Rg total_rg17.54 Å
总原子数 total_atoms15070
残基数 n_residues1030
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax66.8 Å
Rg (实空间) rg_real17.44 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.55 Å
I(0) (实空间) i0_real2.3430e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.4870e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal17.40 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal234300000.0000
解质量估计 total_estimate0.7346
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary15.8 Å
偏度 Skewness skewness0.686
峰度 Kurtosis kurtosis-0.002
角度范围 angular_range— – 0.4650 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha262600.0000
实空间数据点数 n_real_points77
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.455; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.182; Smooth: 0.998
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

▶

8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)