2vtu

crystal structure of bacteriophage MS2 covalent coat protein dimer

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MS2 COAT PROTEIN

ENTEROBACTERIO PHAGE MS2

UniProt P03612

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 48 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 COAT_BPMS2
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 J; PDB构建体 130–130; UniProt 2–2 作者链 J; PDB构建体 131–257; UniProt 4–130 作者链 L; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 L; PDB构建体 130–130; UniProt 2–2 作者链 L; PDB构建体 131–257; UniProt 4–130

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2vtu
沉积日期 deposition_date2008-05-15
结构标题 titlecrystal structure of bacteriophage MS2 covalent coat protein dimer
关键词 keywordsMS2, VIRUS, DIMER, VIRION, OCTAHEDRON, RNA-BINDING, COAT PROTEIN, CAPSID PROTEIN; VIRUS
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2vtu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2vtu__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2vtu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)71.44 Å
Rg(电子密度)70.61 Å
总 Rg70.70 Å
原子数92304
残基数12336
排除体积1642700 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2vtu__assembly_1__model_1 48-MERIC (48) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2vtu__assembly_1__model_2 48-MERIC (48) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2vtu__assembly_2__model_1 dimeric (2) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
2 2 2vtu__assembly_2__model_2 dimeric (2) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 2vtu__assembly_3__model_1 dimeric (2) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
3 2 2vtu__assembly_3__model_2 dimeric (2) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2vtuj1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.85 — RNA bacteriophage capsid protein
超家族 Superfamily superfamilyd.85.1 — RNA bacteriophage capsid protein
家族 Family familyd.85.1.1 — RNA bacteriophage capsid protein
结构域编号 domain_idd2vtul1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.85 — RNA bacteriophage capsid protein
超家族 Superfamily superfamilyd.85.1 — RNA bacteriophage capsid protein
家族 Family familyd.85.1.1 — RNA bacteriophage capsid protein
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7. 引用文献 (1)