ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA HEART ISOFORM, MITOCHONDRIAL
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–553 链 B; UniProt 1–553 链 C; UniProt 1–553 | 未记录 | ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00829) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05631) F1-ATPASE DELTA SUBUNIT × 1 (P05630) ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL × 1 (P05632) | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 8.5;50 MM TRIS-HCL PH 8.2, 200 MM NACL, 20 MM MGSO4, 1 MM ADP, 1 MM ALCL3, 6 MM NAF 0.004% (W/V)PHENYLMETHYLSULFONYL FLUORIDE AND 12% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 6000 | 分辨率 3.84 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2W6J | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BMF BOVINE MITOCHONDRIAL F1-ATPASE 提交 1996-03-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;pH 8.2
|
分辨率 2.85 Å |
| 1COW BOVINE MITOCHONDRIAL F1-ATPASE COMPLEXED WITH AUROVERTIN B 提交 1996-05-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
45–553(509 aa)
链 B
45–553(509 aa)
链 C
45–553(509 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AUR AUROVERTIN B × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.10 Å R-free 0.280 |
| 1E1Q BOVINE MITOCHONDRIAL F1-ATPASE AT 100K 提交 2000-05-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;pH 8.00
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.280 |
| 1E1R BOVINE MITOCHONDRIAL F1-ATPASE INHIBITED BY MG2+ADP AND ALUMINIUM FLUORIDE 提交 2000-05-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;pH 8.00
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.282 |
| 1E79 Bovine F1-ATPase inhibited by DCCD (dicyclohexylcarbodiimide) 提交 2000-08-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 GOL GLYCEROL × 1 DCW DICYCLOHEXYLUREA × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.00
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.281 |
| 1EFR BOVINE MITOCHONDRIAL F1-ATPASE COMPLEXED WITH THE PEPTIDE ANTIBIOTIC EFRAPEPTIN 提交 1996-05-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
45–553(509 aa)
链 B
45–553(509 aa)
链 C
45–553(509 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;PH 8.2
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.220 |
| 1H8E (ADP.AlF4)2(ADP.SO4) bovine F1-ATPase (all three catalytic sites occupied) 提交 2001-02-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 4 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;CRYSTALS WERE GROWN IN THE PRESENCE OF AZIDE, A KNOWN INHIBITOR, BUT THIS HAS NOT BEEN LOCATED IN THE STRUCTURE., pH 8.00
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.264 |
| 1H8H Bovine mitochondrial F1-ATPase crystallised in the presence of 5mm AMPPNP 提交 2001-02-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;CRYSTALS WERE GROWN IN THE PRESENCE OF AZIDE, A KNOWN INHIBITOR, BUT THIS HAS NOT BEEN LOCATED IN THE STRUCTURE., pH 8.00
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.292 |
| 1NBM THE STRUCTURE OF BOVINE F1-ATPASE COVALENTLY INHIBITED WITH 4-CHLORO-7-NITROBENZOFURAZAN 提交 1998-04-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;50MM TRIS-HCL, PH7.5, 200MM SODIUM CHLORIDE, 20MM MAGNESIUM SULPHATE, 1MM EDTA, 0.002% (W/V) PHENYL METHYLSULPHONYL FLUORIDE, 0.02%(W/V) SODIUM AZIDE, 10.5% (W/V) PEG MME 5000, 250UM AMP-PNP AND 5UM ADP.
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.297 |
| 1OHH BOVINE MITOCHONDRIAL F1-ATPASE complexed with the inhibitor protein IF1 提交 2003-05-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.6;PROTEIN 20MG/ML IN 100MM PIPES-NAOH PH6.6, 40MM MGSO4, 0.04% NA AZIDE, 10% GLYCEROL, 0.002% PMSF. DROPS EQUAL VOLUME OF PROTEIN AND 10MM AMP-PNP, 300MM NACL, 16% PEG 4000, 5MM SPERMIDINE. BATCH METHOD., pH 6.60
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.280 |
| 1QO1 Molecular Architecture of the Rotary Motor in ATP Synthase from Yeast Mitochondria 提交 1999-11-01 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric |
链 A
67–553(487 aa)
链 B
67–553(487 aa)
链 C
62–553(492 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 8;0.1 M TRIS/CL PH8.0, 12% PEG 6000, 150 MM NACL, 1 MM AMP-PNP, 40 MICROM ADP, 1 MM DTT, 0.02% NAN3, MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION UNDER PARAFFIN OIL IN MICROBATCH PLATE., pH 8.00
|
分辨率 3.90 Å |
| 1W0J Beryllium fluoride inhibited bovine F1-ATPase 提交 2004-06-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 4 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;CRYSTALS WERE GROWN IN THE PRESENCE OF AZIDE, A KNOWN INHIBITOR, BUT THIS HAS NOT BEEN LOCATED IN THE STRUCTURE., pH 8.20
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.236 |
| 1W0K ADP inhibited bovine F1-ATPase 提交 2004-06-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;CRYSTALS WERE GROWN IN THE PRESENCE OF AZIDE, A KNOWN INHIBITOR, BUT THIS HAS NOT BEEN LOCATED IN THE STRUCTURE., pH 8.20
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.278 |
| 2CK3 Azide inhibited bovine F1-ATPase 提交 2006-04-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AZI AZIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;50 MM TRIS-HCL PH 8.2, 200 MM NACL, 20 MM MGSO4, 250 UM AMP-PNP, 5 UM ADP, 3 MM NAN3, 0.004% (W/V) PHENYLMETHYLSULFONYL FLUORIDE AND 9% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 6000.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.226 |
| 2JDI Ground state structure of F1-ATPase from bovine heart mitochondria (Bovine F1-ATPase crystallised in the absence of azide) 提交 2007-01-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
44–553(510 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 B
44–553(510 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 C
44–553(510 aa)
片段:RESIDUES 44-553
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;50 MM TRIS-HCL PH 8.2, 200 MM NACL, 20 MM MGSO4, 250 UM AMP-PNP, 5 UM ADP, 0.004% (W/V) PHENYLMETHYLSULFONYL FLUORIDE AND 12% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 6000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.220 |
| 2JIZ The Structure of F1-ATPase inhibited by resveratrol. 提交 2007-07-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 B
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 C
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AZI AZIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 STL RESVERATROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;pH 8.2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.217 |
| 2JIZ The Structure of F1-ATPase inhibited by resveratrol. 提交 2007-07-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 H
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 I
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 J
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AZI AZIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 STL RESVERATROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;pH 8.2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.217 |
| 2JJ1 The Structure of F1-ATPase inhibited by piceatannol. 提交 2007-07-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 B
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 C
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AZI AZIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PIT PICEATANNOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;pH 8.2
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.269 |
| 2JJ1 The Structure of F1-ATPase inhibited by piceatannol. 提交 2007-07-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 H
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 I
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 J
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AZI AZIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PIT PICEATANNOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;pH 8.2
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.269 |
| 2JJ2 The Structure of F1-ATPase inhibited by quercetin. 提交 2007-07-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 B
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 C
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AZI AZIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 QUE 3,5,7,3',4'-PENTAHYDROXYFLAVONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;pH 8.2
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.238 |
| 2JJ2 The Structure of F1-ATPase inhibited by quercetin. 提交 2007-07-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 H
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 I
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
链 J
45–553(509 aa)
片段:RESIDUES 44-553
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AZI AZIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 QUE 3,5,7,3',4'-PENTAHYDROXYFLAVONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;pH 8.2
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.238 |
| 2JMX OSCP-NT (1-120) in complex with N-terminal (1-25) alpha subunit from F1-ATPase 提交 2006-12-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
44–68(25 aa)
片段:ATP synthase subunit alpha heart isoform, residues 1-25
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;300 K;离子强度(mmCIF原始值)0.5;压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 13C, U-99% 15N] oscp-nt, 1.5 mM alpha-nt, 20 mM sodium phosphate, pH 6.5, 0.5 M NaCl, 0.001% PMSF 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2W6E Low resolution structures of bovine mitochondrial F1-ATPase during controlled dehydration:hydration state 1. 提交 2008-12-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–553(553 aa)
链 B
1–553(553 aa)
链 C
1–553(553 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5;50 MM TRIS-HCL PH 8.2, 200 MM NACL, 20 MM MGSO4, 1 MM ADP, 1 MM ALCL3, 6 MM NAF 0.004% (W/V)PHENYLMETHYLSULFONYL FLUORIDE AND 12% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 6000
|
分辨率 6.50 Å R-free 0.285 |
| 2W6F Low resolution structures of bovine mitochondrial F1-ATPase during controlled dehydration: Hydration State 2. 提交 2008-12-18 | 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–553(553 aa)
链 B
1–553(553 aa)
链 C
1–553(553 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5;50 MM TRIS-HCL PH 8.2, 200 MM NACL, 20 MM MGSO4, 1 MM ADP, 1 MM ALCL3, 6 MM NAF 0.004% (W/V)PHENYLMETHYLSULFONYL FLUORIDE AND 12% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 6000
|
分辨率 6.00 Å R-free 0.343 |
| 2W6G Low resolution structures of bovine mitochondrial F1-ATPase during controlled dehydration: Hydration State 3. 提交 2008-12-18 | 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–553(553 aa)
链 B
1–553(553 aa)
链 C
1–553(553 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5;50 MM TRIS-HCL PH 8.2, 200 MM NACL, 20 MM MGSO4, 1 MM ADP, 1 MM ALCL3, 6 MM NAF 0.004% (W/V)PHENYLMETHYLSULFONYL FLUORIDE AND 12% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 6000
|
分辨率 6.00 Å |
| 2W6H Low resolution structures of bovine mitochondrial F1-ATPase during controlled dehydration: Hydration State 4A. 提交 2008-12-18 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
1–553(553 aa)
链 B
1–553(553 aa)
链 C
1–553(553 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5;50 MM TRIS-HCL PH 8.2, 200 MM NACL, 20 MM MGSO4, 1 MM ADP, 1 MM ALCL3, 6 MM NAF 0.004% (W/V)PHENYLMETHYLSULFONYL FLUORIDE AND 12% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 6000
|
分辨率 5.00 Å |
| 2W6I Low resolution structures of bovine mitochondrial F1-ATPase during controlled dehydration: Hydration State 4B. 提交 2008-12-18 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
1–553(553 aa)
链 B
1–553(553 aa)
链 C
1–553(553 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5;50 MM TRIS-HCL PH 8.2, 200 MM NACL, 20 MM MGSO4, 1 MM ADP, 1 MM ALCL3, 6 MM NAF 0.004% (W/V)PHENYLMETHYLSULFONYL FLUORIDE AND 12% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 6000
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.300 |
| 2WSS The structure of the membrane extrinsic region of bovine ATP synthase 提交 2009-09-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;MICROBATCH UNDER OIL
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.271 |
| 2WSS The structure of the membrane extrinsic region of bovine ATP synthase 提交 2009-09-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 J
44–553(510 aa)
链 K
44–553(510 aa)
链 L
44–553(510 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;MICROBATCH UNDER OIL
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.271 |
| 2XND Crystal structure of bovine F1-c8 sub-complex of ATP Synthase 提交 2010-08-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:heptadecameric |
链 A
62–553(492 aa)
片段:RESIDUES 62-553
链 B
62–553(492 aa)
片段:RESIDUES 62-553
链 C
62–553(492 aa)
片段:RESIDUES 62-553
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;CRYSTALS WERE GROWN UNDER OIL BY MIXING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN (10MG/ML IN 20MM TRIS PH 8.0, 10% GLYCEROL, 1MM ADP, 1MM AMP-PNP, 2MM MGSO4, 0.02% NAN3, 5.7MM TDM) AND PRECIPITANT SOLUTION (50MM HEPES PH 7.0, 14% PEG4600, 50MM K2HPO4)
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.304 |
| 4ASU F1-ATPase in which all three catalytic sites contain bound nucleotide, with magnesium ion released in the Empty site 提交 2012-05-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.289 |
| 4TSF The Pathway of Binding of the Intrinsically Disordered Mitochondrial Inhibitor Protein to F1-ATPase 提交 2014-06-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:Nonameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 8.2;295 K;Tris-HCl, PEG 4000, magnesium chloride, EDTA, NaCl, spermidine
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.272 |
| 4TT3 The Pathway of Binding of the Intrinsically Disordered Mitochondrial Inhibitor Protein to F1-ATPase 提交 2014-06-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:Decameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 8.2;295 K;PEG 4000, Tris-HCl, magnesium chloride, EDTA, ATP, NaCl, spermidine
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.283 |
| 4YXW Bovine heart mitochondrial F1-ATPase inhibited by AMP-PNP and ADP in the presence of thiophosphate. 提交 2015-03-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 1 TS6 Monothiophosphate × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS;pH 8.2;295 K;PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris-HCl, AMP-PNP, ADP, sodium monothiophosphate
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.273 |
| 4Z1M Bovine F1-ATPase inhibited by three copies of the inhibitor protein IF1 crystallised in the presence of thiophosphate. 提交 2015-03-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;295 K;Tris.HCl, MgCl2, EDTA, sodium monothiophosphate, ATP NaCl, spermidine, PEG 4000
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.275 |
| 5ARA Bovine mitochondrial ATP synthase state 1a 提交 2015-09-24 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric |
链 A
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 B
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 C
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 7.40 Å |
| 5ARE Bovine mitochondrial ATP synthase state 1b 提交 2015-09-24 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric |
链 A
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 B
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 C
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 6.70 Å |
| 5ARH Bovine mitochondrial ATP synthase state 2a 提交 2015-09-24 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric |
链 A
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 B
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 C
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 7.20 Å |
| 5ARI Bovine mitochondrial ATP synthase state 2b 提交 2015-09-24 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric |
链 A
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 B
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 C
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 7.40 Å |
| 5FIJ Bovine mitochondrial ATP synthase state 2c 提交 2015-09-28 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric |
链 A
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 B
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 C
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 7.40 Å |
| 5FIK Bovine mitochondrial ATP synthase state 3a 提交 2015-09-28 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric |
链 A
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 B
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 C
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 6.40 Å |
| 5FIL Bovine mitochondrial ATP synthase state 3b 提交 2015-09-28 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric |
链 A
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 B
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
链 C
44–553(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 44-553
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) GLYCEROL, 0.05% (WT/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) GLYCEROL, 0.05% (WT/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 7.10 Å |
| 6YY0 bovine ATP synthase F1-peripheral stalk domain, state 1 提交 2020-05-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.
|
分辨率 3.23 Å |
| 6Z1R bovine ATP synthase F1-peripheral stalk domain, state 2 提交 2020-05-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.
|
分辨率 3.29 Å |
| 6Z1U bovine ATP synthase F1c8-peripheral stalk domain, state 3 提交 2020-05-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.
|
分辨率 3.47 Å |
| 6ZIQ bovine ATP synthase stator domain, state 1 提交 2020-06-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric |
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.
|
分辨率 4.33 Å |
| 6ZIT bovine ATP synthase Stator domain, state 2 提交 2020-06-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric |
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.
|
分辨率 3.49 Å |
| 6ZIU bovine ATP synthase stator domain, state 3 提交 2020-06-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric |
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Th sample was allowed to penetrate through the holey grid support and to distribute to both sides of the grid surface for ~15sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.
|
分辨率 6.02 Å |
| 6ZPO bovine ATP synthase monomer state 1 (combined) 提交 2020-07-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 29 PDB 声明:29-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.
|
分辨率 4.00 Å |
| 6ZQM bovine ATP synthase monomer state 2 (combined) 提交 2020-07-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 29 PDB 声明:29-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.
|
分辨率 3.29 Å |
| 6ZQN bovine ATP synthase monomer state 3 (combined) 提交 2020-07-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 29 PDB 声明:29-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.
|
分辨率 4.00 Å |
| 7AJB bovine ATP synthase dimer state1:state1 提交 2020-09-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:58-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 AA
44–553(510 aa)
链 AB
44–553(510 aa)
链 AC
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.20 Å |
| 7AJC bovine ATP synthase dimer state1:state2 提交 2020-09-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:58-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 AA
44–553(510 aa)
链 AB
44–553(510 aa)
链 AC
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 11.90 Å |
| 7AJD bovine ATP synthase dimer state1:state3 提交 2020-09-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:58-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 AA
44–553(510 aa)
链 AB
44–553(510 aa)
链 AC
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 7AJE bovine ATP synthase dimer state2:state1 提交 2020-09-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:58-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 AA
44–553(510 aa)
链 AB
44–553(510 aa)
链 AC
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.40 Å |
| 7AJF bovine ATP synthase dimer state2:state2 提交 2020-09-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:58-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 AA
44–553(510 aa)
链 AB
44–553(510 aa)
链 AC
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.45 Å |
| 7AJG bovine ATP synthase dimer state2:state3 提交 2020-09-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:58-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 AA
44–553(510 aa)
链 AB
44–553(510 aa)
链 AC
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.70 Å |
| 7AJH bovine ATP synthase dimer state3:state1 提交 2020-09-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:58-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 AA
44–553(510 aa)
链 AB
44–553(510 aa)
链 AC
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.70 Å |
| 7AJI bovine ATP synthase dimer state3:state2 提交 2020-09-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:58-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 AA
44–553(510 aa)
链 AB
44–553(510 aa)
链 AC
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 11.40 Å |
| 7AJJ bovine ATP synthase dimer state3:state3 提交 2020-09-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:58-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 AA
44–553(510 aa)
链 AB
44–553(510 aa)
链 AC
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 13.10 Å |
| 9W2R Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 1 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-1) 提交 2025-07-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 29 PDB 声明:29-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9W2S Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 3 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-2) 提交 2025-07-28 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 29 PDB 声明:29-meric |
链 A
44–553(510 aa)
链 B
44–553(510 aa)
链 C
44–553(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | ATPA1_BOVIN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–553; UniProt 1–553 作者链 B; PDB构建体 1–553; UniProt 1–553 作者链 C; PDB构建体 1–553; UniProt 1–553 |