3mud

Structure of the Tropomyosin Overlap Complex from Chicken Smooth Muscle

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA repair protein XRCC4,Tropomyosin alpha-1 chain

Gallus gallus

UniProt P04268

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 4 Tropomyosin alpha-1 chain,Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 × 2 (P09493,Q15691) 1,2-ETHANEDIOL × 1 SULFATE ION × 1 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TPM1_CHICK
Isoform P04268-2
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 141–175; UniProt 250–284 作者链 B; PDB构建体 141–175; UniProt 250–284

DNA repair protein XRCC4,Tropomyosin alpha-1 chain

Gallus gallus

UniProt Q13426

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 4 Tropomyosin alpha-1 chain,Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 × 2 (P09493,Q15691) 1,2-ETHANEDIOL × 1 SULFATE ION × 1 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 XRCC4_HUMAN
Isoform Q13426-2
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 5–140; UniProt 2–137 作者链 B; PDB构建体 5–140; UniProt 2–137

Tropomyosin alpha-1 chain,Microtubule-associated protein RP/EB family member 1

Homo sapiens

UniProt P09493

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 4 DNA repair protein XRCC4,Tropomyosin alpha-1 chain × 2 (P04268,Q13426) 1,2-ETHANEDIOL × 1 SULFATE ION × 1 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TPM1_HUMAN
Isoform P09493-3
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 4–32; UniProt 1–29 作者链 D; PDB构建体 4–32; UniProt 1–29

Tropomyosin alpha-1 chain,Microtubule-associated protein RP/EB family member 1

Homo sapiens

UniProt Q15691

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 4 DNA repair protein XRCC4,Tropomyosin alpha-1 chain × 2 (P04268,Q13426) 1,2-ETHANEDIOL × 1 SULFATE ION × 1 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MARE1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 33–75; UniProt 215–257 作者链 D; PDB构建体 33–75; UniProt 215–257

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3mud
沉积日期 deposition_date2010-05-02
结构标题 titleStructure of the Tropomyosin Overlap Complex from Chicken Smooth Muscle
关键词 keywordstropomysoin, overlap complex, coiled-coils, Contractile Protein; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3mud__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3mud__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3mud__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)38.25 Å
Rg(电子密度)39.22 Å
总 Rg38.83 Å
原子数3430
残基数434
排除体积60793 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3mud__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id3mudA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology210 — Dna Repair Protein Xrcc4; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — DNA double-strand break repair and VJ recombination XRCC4, N-terminal
结构域编号 domain_id3mudA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily370 —
结构域编号 domain_id3mudB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology210 — Dna Repair Protein Xrcc4; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — DNA double-strand break repair and VJ recombination XRCC4, N-terminal
结构域编号 domain_id3mudB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily370 —
结构域编号 domain_id3mudC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1160 — Vasodilator-stimulated phosphoprotein
结构域编号 domain_id3mudD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1160 — Vasodilator-stimulated phosphoprotein
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7. 引用文献 (1)