4c2b

Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with Disulfide Mutation in Complex with High Affinity GPIb alpha

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 138.9 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

VON WILLEBRAND FACTOR

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1264–1471	片段：1264-1468 突变：YES	PLATELET GLYCOPROTEIN IB ALPHA CHAIN × 1 （P07359） SO4 SULFATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS-GPIB/VWD2 COMPLEX APPEARED IN DROPS WITH 20% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING CRYSTAL GROWTH IN 8 MG/ML COMPLEX, 15% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. SINCE THESE CRYSTALS WERE FORMED IN BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL, NO ADDITIONAL CRYOPROTECTION WAS USED.	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1264–1471	片段：1264-1468 突变：YES	PLATELET GLYCOPROTEIN IB ALPHA CHAIN × 1 （P07359） SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS-GPIB/VWD2 COMPLEX APPEARED IN DROPS WITH 20% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING CRYSTAL GROWTH IN 8 MG/ML COMPLEX, 15% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. SINCE THESE CRYSTALS WERE FORMED IN BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL, NO ADDITIONAL CRYOPROTECTION WAS USED.	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1264–1471	片段：1264-1468 突变：YES	PLATELET GLYCOPROTEIN IB ALPHA CHAIN × 1 （P07359） SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS-GPIB/VWD2 COMPLEX APPEARED IN DROPS WITH 20% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING CRYSTAL GROWTH IN 8 MG/ML COMPLEX, 15% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. SINCE THESE CRYSTALS WERE FORMED IN BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL, NO ADDITIONAL CRYOPROTECTION WAS USED.	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 1264–1471	片段：1264-1468 突变：YES	PLATELET GLYCOPROTEIN IB ALPHA CHAIN × 1 （P07359） SO4 SULFATE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS-GPIB/VWD2 COMPLEX APPEARED IN DROPS WITH 20% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING CRYSTAL GROWTH IN 8 MG/ML COMPLEX, 15% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. SINCE THESE CRYSTALS WERE FORMED IN BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL, NO ADDITIONAL CRYOPROTECTION WAS USED.	分辨率 2.80 Å R-free 0.286

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4C2B	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AO3 A3 DOMAIN OF VON WILLEBRAND FACTOR 提交 1997-07-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1686–1872（187 aa）片段：A3 DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；0.1M TRIS PH 8.5, 200MM MGCL2, 24% PEG 8K	分辨率 2.20 Å R-free 0.215
1AO3 A3 DOMAIN OF VON WILLEBRAND FACTOR 提交 1997-07-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1686–1872（187 aa）片段：A3 DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；0.1M TRIS PH 8.5, 200MM MGCL2, 24% PEG 8K	分辨率 2.20 Å R-free 0.215
1ATZ HUMAN VON WILLEBRAND FACTOR A3 DOMAIN 提交 1997-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1685–1873（189 aa）片段：A3-DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；24% PEG 3000, 200 MM SODIUM ACETATE, 100 MM TRIS/HCL PH 8.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.240
1ATZ HUMAN VON WILLEBRAND FACTOR A3 DOMAIN 提交 1997-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1685–1873（189 aa）片段：A3-DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；24% PEG 3000, 200 MM SODIUM ACETATE, 100 MM TRIS/HCL PH 8.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.240
1AUQ A1 DOMAIN OF VON WILLEBRAND FACTOR 提交 1997-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1261–1468（208 aa）片段：A1	未记录	CD CADMIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；0.1M TRIS PH 8.5, 5MM CDCL2, 5% PEG 8K	分辨率 2.30 Å R-free 0.248
1FE8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE VON WILLEBRAND FACTOR A3 DOMAIN IN COMPLEX WITH A FAB FRAGMENT OF IGG RU5 THAT INHIBITS COLLAGEN BINDING 提交 2000-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1683–1874（192 aa）片段：COLLAGEN BINDING DOMAIN A3	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CAC CACODYLATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；iso-propanol, MPD, cacodylate, sodium chloride, Tris , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.03 Å R-free 0.264
1FE8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE VON WILLEBRAND FACTOR A3 DOMAIN IN COMPLEX WITH A FAB FRAGMENT OF IGG RU5 THAT INHIBITS COLLAGEN BINDING 提交 2000-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1683–1874（192 aa）片段：COLLAGEN BINDING DOMAIN A3	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；iso-propanol, MPD, cacodylate, sodium chloride, Tris , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.03 Å R-free 0.264
1FE8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE VON WILLEBRAND FACTOR A3 DOMAIN IN COMPLEX WITH A FAB FRAGMENT OF IGG RU5 THAT INHIBITS COLLAGEN BINDING 提交 2000-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1683–1874（192 aa）片段：COLLAGEN BINDING DOMAIN A3	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；iso-propanol, MPD, cacodylate, sodium chloride, Tris , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.03 Å R-free 0.264
1FE8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE VON WILLEBRAND FACTOR A3 DOMAIN IN COMPLEX WITH A FAB FRAGMENT OF IGG RU5 THAT INHIBITS COLLAGEN BINDING 提交 2000-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 1683–1874（192 aa）片段：COLLAGEN BINDING DOMAIN A3 链 B 1683–1874（192 aa）片段：COLLAGEN BINDING DOMAIN A3 链 C 1683–1874（192 aa）片段：COLLAGEN BINDING DOMAIN A3	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CAC CACODYLATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；iso-propanol, MPD, cacodylate, sodium chloride, Tris , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.03 Å R-free 0.264
1FNS CRYSTAL STRUCTURE OF THE VON WILLEBRAND FACTOR (VWF) A1 DOMAIN I546V MUTANT IN COMPLEX WITH THE FUNCTION BLOCKING FAB NMC4 提交 2000-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1271–1465（195 aa）片段：A1 DOMAIN RESIDUES 507 - 702, OR GLYCOPROTEIN IBA (A\:ALPHA) BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.207
1IJB The von Willebrand Factor mutant (I546V) A1 domain 提交 2001-04-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1263–1464（202 aa）片段：A1 domain	突变：I546V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；PEG 4000, sodium citrate, ammonium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.208
1IJK The von Willebrand Factor mutant (I546V) A1 domain-botrocetin Complex 提交 2001-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1263–1464（202 aa）片段：A1 domain	突变：I546V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；PEG 4000, sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.279
1M10 Crystal structure of the complex of Glycoprotein Ib alpha and the von Willebrand Factor A1 Domain 提交 2002-06-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1261–1468（208 aa）片段：A1 domain	突变：R543Q	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3000, sodium chloride, MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.10 Å R-free 0.296
1OAK CRYSTAL STRUCTURE OF THE VON WILLEBRAND FACTOR (VWF) A1 DOMAIN IN COMPLEX WITH THE FUNCTION BLOCKING NMC-4 FAB 提交 1997-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1271–1465（195 aa）片段：A1 DOMAIN RESIDUES 507 - 702, OR GLYCOPROTEIN IBA (A\:ALPHA) BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8	分辨率 2.20 Å R-free 0.274
1SQ0 Crystal Structure of the Complex of the Wild-type Von Willebrand Factor A1 domain and Glycoprotein Ib alpha at 2.6 Angstrom Resolution 提交 2004-03-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1259–1472（214 aa）片段：A1	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG-3350; potassium thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.60 Å R-free 0.239
1U0N The ternary von Willebrand Factor A1-glycoprotein Ibalpha-botrocetin complex 提交 2004-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1261–1468（208 aa）片段：VWFA 1	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；Sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.95 Å R-free 0.276
1UEX Crystal structure of von Willebrand Factor A1 domain complexed with snake venom bitiscetin 提交 2003-05-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1260–1468（209 aa）片段：A1 domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；283 K；10% PEG 6000, 2% PEG-MME 550, 5% MPD, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K	分辨率 2.85 Å R-free 0.276
2ADF Crystal Structure and Paratope Determination of 82D6A3, an Antithrombotic Antibody Directed Against the von Willebrand factor A3-Domain 提交 2005-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1683–1874（192 aa）片段：A3 domain	未记录	ACY ACETIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；PEG 8000, ammonium sulphate, acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.220
2MHP Solution structure of the major factor VIII binding region on von Willebrand factor 提交 2013-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 766–864（99 aa）片段：;domains TIL' and E', UNP residues 766-864 ;	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；压力 ambient NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-1, 20 mM sodium phosphate-2, 100 mM sodium chloride-3, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-10% 13C] VWF TIL'E'-4, 20 mM sodium phosphate-5, 100 mM sodium chloride-6, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-15N] VWF TIL'E'-7, 20 mM sodium phosphate-8, 100 mM sodium chloride-9, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-10, 20 mM sodium phosphate-11, 100 mM sodium chloride-12, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-15N] VWF TIL'E'-13, 20 mM sodium phosphate-14, 100 mM sodium chloride-15, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-16, 20 mM sodium phosphate-17, 100 mM sodium chloride-18, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-19, 20 mM sodium phosphate-20, 100 mM sodium chloride-21, 5 mg/mL Pf1 phage-22, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-23, 20 mM sodium phosphate-24, 100 mM sodium chloride-25, 2 % w/v pentaethylene glycol dodecyl ether-26, 50 mM n-hexanol-27, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2MHQ Solution structure of the major factor VIII binding region on von Willebrand factor 提交 2013-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 766–864（99 aa）片段：;Domains TIL' and E', UNP residues 766-864 ;	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；压力 ambient NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-1, 20 mM sodium phosphate-2, 100 mM sodium chloride-3, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-10% 13C] VWF TIL'E'-4, 20 mM sodium phosphate-5, 100 mM sodium chloride-6, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-15N] VWF TIL'E'-7, 20 mM sodium phosphate-8, 100 mM sodium chloride-9, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-10, 20 mM sodium phosphate-11, 100 mM sodium chloride-12, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-15N] VWF TIL'E'-13, 20 mM sodium phosphate-14, 100 mM sodium chloride-15, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-16, 20 mM sodium phosphate-17, 100 mM sodium chloride-18, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-19, 20 mM sodium phosphate-20, 100 mM sodium chloride-21, 5 mg/mL Pf1 phage-22, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 mM [U-13C; U-15N] VWF TIL'E'-23, 20 mM sodium phosphate-24, 100 mM sodium chloride-25, 2 % w/v pentaethylene glycol dodecyl ether-26, 50 mM n-hexanol-27, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3GXB Crystal structure of VWF A2 domain 提交 2009-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1495–1671（177 aa）片段：ADAMTS13 cleavage domain, residues 1495-1671	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 7.2, 0.2 M lithium sulfate, 25 % PEG3350, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K	分辨率 1.90 Å R-free 0.224
3GXB Crystal structure of VWF A2 domain 提交 2009-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1495–1671（177 aa）片段：ADAMTS13 cleavage domain, residues 1495-1671	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 7.2, 0.2 M lithium sulfate, 25 % PEG3350, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K	分辨率 1.90 Å R-free 0.224
3HXO Crystal Structure of Von Willebrand Factor (VWF) A1 Domain in Complex with DNA Aptamer ARC1172, an Inhibitor of VWF-Platelet Binding 提交 2009-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1260–1468（209 aa）片段：von Willebrand factor (VWF) A1 Domain (residues 1260-1468)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.1；293 K；25% PEG3350, 0.16 M sodium fluoride, pH 7.1, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.274
3HXQ Crystal Structure of Von Willebrand Factor (VWF) A1 Domain in Complex with DNA Aptamer ARC1172, an Inhibitor of VWF-Platelet Binding 提交 2009-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1260–1468（209 aa）片段：von Willebrand factor (VWF) A1 Domain (residues 1260-1468)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；293 K；0.2 M NH4Ac, 0.1 M NaAc, 30% PEG4000, pH 4.6, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 2.69 Å R-free 0.279
3PPV Crystal structure of an engineered VWF A2 domain (N1493C and C1670S) 提交 2010-11-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1488–1674（187 aa）片段：VWFA 2 domain, UNP residues 1488-1674	突变：N1493C, C1670S	SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；0.1M sodium citrate, 1.6M (NH4)2SO4, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.231
3PPW Crystal structure of the D1596A mutant of an engineered VWF A2 domain (N1493C and C1670S) 提交 2010-11-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1488–1674（187 aa）片段：VWFA 2 domain, UNP residues 1488-1674	突变：N1493C, D1596A, C1670S	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；0.1M sodium citrate, 1.6M (NH4)2SO4, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.226
3PPX Crystal structure of the N1602A mutant of an engineered VWF A2 domain (N1493C and C1670S) 提交 2010-11-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1488–1674（187 aa）片段：VWF A2 domain, UNP residues 1488-1674	突变：N1493C, N1602A, C1670S	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；0.1M sodium citrate, 1.6M (NH4)2SO4, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.91 Å R-free 0.237
3PPY Crystal structure of the D1596A/N1602A double mutant of an engineered VWF A2 domain (N1493C and C1670S) 提交 2010-11-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1488–1674（187 aa）片段：VWF A2 domain, UNP residues 1488-1674	突变：N1493, D1596A, N1602A, C1670S	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；0.1M sodium citrate, 1.6M (NH4)2SO4, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.232
3ZQK Von Willebrand Factor A2 domain with calcium 提交 2011-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1478–1674（197 aa）片段：A2 DOMAIN, RESIDUES 1478-1674	未记录	GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PROTEIN BUFFER: 0.015 M HEPES PH 7.5, 0.02 M NACL, 0.001 M CACL2. RESERVOIR BUFFER: 0.1 M MMT (PH 4.0-5.5), 0.15 M (NH4)2SO4, 18-23% (W/V) PEG2000 MME.	分辨率 1.70 Å R-free 0.200
3ZQK Von Willebrand Factor A2 domain with calcium 提交 2011-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1478–1674（197 aa）片段：A2 DOMAIN, RESIDUES 1478-1674	未记录	CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PROTEIN BUFFER: 0.015 M HEPES PH 7.5, 0.02 M NACL, 0.001 M CACL2. RESERVOIR BUFFER: 0.1 M MMT (PH 4.0-5.5), 0.15 M (NH4)2SO4, 18-23% (W/V) PEG2000 MME.	分辨率 1.70 Å R-free 0.200
3ZQK Von Willebrand Factor A2 domain with calcium 提交 2011-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1478–1674（197 aa）片段：A2 DOMAIN, RESIDUES 1478-1674	未记录	CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PROTEIN BUFFER: 0.015 M HEPES PH 7.5, 0.02 M NACL, 0.001 M CACL2. RESERVOIR BUFFER: 0.1 M MMT (PH 4.0-5.5), 0.15 M (NH4)2SO4, 18-23% (W/V) PEG2000 MME.	分辨率 1.70 Å R-free 0.200
4C29 Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with Disulfide Mutation 提交 2013-08-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1264–1471（208 aa）片段：RESIDUES 1264-1471	突变：YES	ACT ACETATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS APPEARED IN DROPS CONTAINING 25% PEG3350 AND 0.2 M CALCIUM ACETATE. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING. CRYSTALS GROWN IN 8 MG/ML PROTEIN, 15% PEG3350, AND 0.2 M CALCIUM ACETATE WERE HARVESTED, AND SOAKED IN THE SAME BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL FOR CRYOPROTECTION., pH 4.6	分辨率 2.20 Å R-free 0.235
4C29 Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with Disulfide Mutation 提交 2013-08-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1264–1471（208 aa）片段：RESIDUES 1264-1471	突变：YES	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS APPEARED IN DROPS CONTAINING 25% PEG3350 AND 0.2 M CALCIUM ACETATE. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING. CRYSTALS GROWN IN 8 MG/ML PROTEIN, 15% PEG3350, AND 0.2 M CALCIUM ACETATE WERE HARVESTED, AND SOAKED IN THE SAME BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL FOR CRYOPROTECTION., pH 4.6	分辨率 2.20 Å R-free 0.235
4C2A Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with R1306Q and I1309V Mutations in Complex with High Affinity GPIb alpha 提交 2013-08-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1264–1471（208 aa）片段：RESIDUES 1264-1471	突变：YES	CAC CACODYLATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；CRYSTALS OF A1/VWD2-GPIBALPA/VWD2 COMPLEX APPEARED IN 12% PEG 8000, 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 6.5, 0.1 M CALCIUM ACETATE, AND 0.4 MG/ML RISTOCETIN (SIGMA-ALDRICH). THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING. CRYSTALS GREW IN 10 MG/ML COMPLEX, 14% PEG8000, 0.2 M CALCIUM ACETATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, AND 0.4 MG/ML RISTOCETIN. NEXT WE SOAKED THESE CRYSTALS IN 14% PEG8000, 0.2 M CALCIUM ACETATE, 0.1 SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, AND 4 MG/ML RISTOCETIN.	分辨率 2.08 Å R-free 0.189
4DMU Crystal structure of the von Willebrand factor A3 domain in complex with a collagen III derived triple-helical peptide 提交 2012-02-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1683–1874（192 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM cacodylate, pH 6.5, 1.20 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4DMU Crystal structure of the von Willebrand factor A3 domain in complex with a collagen III derived triple-helical peptide 提交 2012-02-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1683–1874（192 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM cacodylate, pH 6.5, 1.20 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4DMU Crystal structure of the von Willebrand factor A3 domain in complex with a collagen III derived triple-helical peptide 提交 2012-02-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1683–1874（192 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM cacodylate, pH 6.5, 1.20 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4DMU Crystal structure of the von Willebrand factor A3 domain in complex with a collagen III derived triple-helical peptide 提交 2012-02-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1683–1874（192 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM cacodylate, pH 6.5, 1.20 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4DMU Crystal structure of the von Willebrand factor A3 domain in complex with a collagen III derived triple-helical peptide 提交 2012-02-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 1683–1874（192 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM cacodylate, pH 6.5, 1.20 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4DMU Crystal structure of the von Willebrand factor A3 domain in complex with a collagen III derived triple-helical peptide 提交 2012-02-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1683–1874（192 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM cacodylate, pH 6.5, 1.20 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4NT5 Crystal structure of human von Willebrand factor CTCK domain 提交 2013-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2721–2813（93 aa）片段：C-terminal cystine knot domain, unp residues 2721-2813	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；293 K；1.3 M Lithium Sulfate, 0.1 M Bicine, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.28 Å R-free 0.248
5BV8 G1324S mutation in von Willebrand Factor A1 domain 提交 2015-06-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1238–1471（234 aa）片段：A1 domain (UNP residues 1238-1471)	突变：G1324S	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；298 K；30% PEG 400, 100 mM CAPS/Sodium hydroxide	分辨率 1.59 Å R-free 0.181
6FWN Structure and dynamics of the platelet integrin-binding C4 domain of von Willebrand factor 提交 2018-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2497–2577（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.04；压力 1 NMR样品组成 500 uM [U-13C; U-15N] von Willebrand Factor C4 domain, 20 mM sodium phosphate, 49.5 M H2O, 5.5 M D2O, 0.02 % w/v sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 500 uM [U-13C; U-15N] von Willebrand Factor C4 domain, 20 mM sodium phosphate, 55 M D2O, 5 mM H2O, 0.02 % w/v sodium azide, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
6N29 Crystal structure of monomeric von Willebrand Factor D`D3 assembly 提交 2018-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 764–1244（481 aa）	突变：Q852R, C1009A, C1142A	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；5.5% (w/v) PEG8000, 10% (w/v) PEG1000, 0.2 M calcium acetate and 0.1 M Tris-acetate, pH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.241
6N29 Crystal structure of monomeric von Willebrand Factor D`D3 assembly 提交 2018-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 764–1244（481 aa）	突变：Q852R, C1009A, C1142A	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；5.5% (w/v) PEG8000, 10% (w/v) PEG1000, 0.2 M calcium acetate and 0.1 M Tris-acetate, pH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.241
7EOW High-resolution structure of vWF A1 domain in complex with caplacizumab, the first nanobody-based medicine 提交 2021-04-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1261–1468（208 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；20 mM Tris-HCl pH 8 150 mM NaCl 10% glycerol 40% glycerol ethoxylate	分辨率 1.60 Å R-free 0.198
7F49 von Willebrand factor (VWF) A1 domain with BT-100 aptamer RNA 提交 2021-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1260–1468（209 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Sodium Acetate pH 4.6, 18% w/v PEG 4000	分辨率 2.09 Å R-free 0.239
7P4N NMR solution structure of the C6 domain of von Willebrand Factor 提交 2021-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2647–2720（74 aa）	突变：G2705R	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1.013 NMR样品组成 300 uM [U-13C; U-15N] von Willebrand Factor C6 domain, 20 mM None sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
7PMV VWF Tubules of D1D2D'D3 domains 提交 2021-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1241（1241 aa）链 B 1–1241（1241 aa）链 D 1–1241（1241 aa）链 E 1–1241（1241 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 CA CALCIUM ION × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7PNF VWF Tubules of D1D2D'D3 domains 提交 2021-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 B 1–1241（1241 aa）链 D 1–1241（1241 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 144 CA CALCIUM ION × 108	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.35 Å
7WN3 Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer (2M mutant) complexed with D1D2 at 3.29 angstron resolution (2 units) 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 B 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 C 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 D 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 E 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 F 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 G 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 H 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ;	突变：R1136M,E1143M 突变：R1136M,E1143M 突变：R1136M,E1143M 突变：R1136M,E1143M	CA CALCIUM ION × 16 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å
7WN4 Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer (wild type) complexed with D1D2 at 3.4 angstron resolution (1 unit) 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 F 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 G 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 H 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ;	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7WN6 Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer (R1136M/E1143M mutant) complexed with D1D2 at 3.29 angstron resolution (2 units) 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 B 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 C 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 D 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 E 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 F 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 G 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 H 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ;	突变：R1136M/E1143M 突变：R1136M/E1143M 突变：R1136M/E1143M 突变：R1136M/E1143M	CA CALCIUM ION × 16 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å
7WPP Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer complexed with D1D2 at 2.85 angstron resolution (1 unit) 提交 2022-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 F 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 G 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 H 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ;	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
7WPQ Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer complexed with D1D2 at 3.27 angstron resolution (2 units) 提交 2022-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 B 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 C 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 D 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 E 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 F 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 G 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 H 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ;	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 CA CALCIUM ION × 16	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
7WPR VWF D'D3 dimer complexed with D1D2 at 4.39 angstron resolution(VWF tube) 提交 2022-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 A 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 B 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 C 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 D 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 E 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 F 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 G 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 H 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 I 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 J 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 K 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 L 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 M 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 N 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 O 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 P 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 Q 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 R 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 S 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 T 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 U 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 V 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 W 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 X 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 Y 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 Z 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 a 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 b 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 c 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 d 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 e 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 f 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ;	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 CA CALCIUM ION × 56	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.39 Å
7WPS Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer complexed with D1D2 at 4.3 angstron resolution (7 units) 提交 2022-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 B 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 C 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 D 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 E 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 F 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 G 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 H 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 I 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 J 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 K 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 L 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 M 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 N 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 O 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 P 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 Q 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 R 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 S 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 T 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 U 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 V 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 W 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 X 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 Y 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 Z 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 a 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 b 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ;	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 CA CALCIUM ION × 56	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.32 Å
7WQT Cryo-EM structure of VWF D'D3 dimer complexed with D1D2 at 4.3 angstron resolution (VWF tube) 提交 2022-01-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 A 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 B 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 C 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 D 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 E 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 F 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 G 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 H 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 I 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 J 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 K 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 L 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 M 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 N 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 O 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 P 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 Q 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 R 23–763（741 aa）片段：D1D2 domain 链 S 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 T 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 U 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 V 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 W 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 X 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 Y 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 Z 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 a 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 b 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 c 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 d 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 e 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ; 链 f 764–1241（478 aa）片段：;D'D3 domain ;	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 42 CA CALCIUM ION × 56	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7ZWH VWF Tubules of D1D2 and D'D3A1 domains 提交 2022-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–1197（1197 aa）链 E 1–1197（1197 aa）链 G 1265–1463（199 aa）链 H 1265–1463（199 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8D3C VWF tubule derived from monomeric D1-A1 提交 2022-06-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–1464（1464 aa）链 B 1–1464（1464 aa）链 C 1–1464（1464 aa）链 D 1–1464（1464 aa）链 E 1–1464（1464 aa）链 F 1–1464（1464 aa）链 G 1–1464（1464 aa）链 H 1–1464（1464 aa）链 I 1–1464（1464 aa）链 J 1–1464（1464 aa）链 K 1–1464（1464 aa）链 L 1–1464（1464 aa）链 M 1–1464（1464 aa）链 N 1–1464（1464 aa）链 O 1–1464（1464 aa）链 P 1–1464（1464 aa）	突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA) 突变：WT VWF Furin cleavage site mutated (760RSKR763->760ASA)	CA CALCIUM ION × 48 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 80	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5.2；100 mM Sodium Cacodylate at pH 5.2, 10 mM CaCl2, and 100 mM NaCl. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8D3D VWF tubule derived from dimeric D1-A1 提交 2022-06-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–1464（1464 aa）链 B 1–1464（1464 aa）链 C 1–1464（1464 aa）链 D 1–1464（1464 aa）链 E 1–1464（1464 aa）链 F 1–1464（1464 aa）链 G 1–1464（1464 aa）链 H 1–1464（1464 aa）链 I 1–1464（1464 aa）链 J 1–1464（1464 aa）链 K 1–1464（1464 aa）链 L 1–1464（1464 aa）链 M 1–1464（1464 aa）链 N 1–1464（1464 aa）链 O 1–1464（1464 aa）链 P 1–1464（1464 aa）	突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA) 突变：Furin cleavage site mutated (760RSKR->760ASA)	CA CALCIUM ION × 48 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 80	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5.2；100 mM Sodium Cacodylate at pH 5.2, 10 mM CaCl2, and 100 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 46 个其他 PDB 条目、61 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VWF_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–209； UniProt 1264–1471 作者链 C； PDB构建体 2–209； UniProt 1264–1471 作者链 E； PDB构建体 2–209； UniProt 1264–1471 作者链 G； PDB构建体 2–209； UniProt 1264–1471

PLATELET GLYCOPROTEIN IB ALPHA CHAIN

HOMO SAPIENS

UniProt P07359

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 17–306	突变：YES	VON WILLEBRAND FACTOR × 1 （P04275） SO4 SULFATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS-GPIB/VWD2 COMPLEX APPEARED IN DROPS WITH 20% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING CRYSTAL GROWTH IN 8 MG/ML COMPLEX, 15% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. SINCE THESE CRYSTALS WERE FORMED IN BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL, NO ADDITIONAL CRYOPROTECTION WAS USED.	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 17–306	突变：YES	VON WILLEBRAND FACTOR × 1 （P04275） SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS-GPIB/VWD2 COMPLEX APPEARED IN DROPS WITH 20% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING CRYSTAL GROWTH IN 8 MG/ML COMPLEX, 15% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. SINCE THESE CRYSTALS WERE FORMED IN BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL, NO ADDITIONAL CRYOPROTECTION WAS USED.	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 17–306	突变：YES	VON WILLEBRAND FACTOR × 1 （P04275） SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS-GPIB/VWD2 COMPLEX APPEARED IN DROPS WITH 20% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING CRYSTAL GROWTH IN 8 MG/ML COMPLEX, 15% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. SINCE THESE CRYSTALS WERE FORMED IN BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL, NO ADDITIONAL CRYOPROTECTION WAS USED.	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 17–306	突变：YES	VON WILLEBRAND FACTOR × 1 （P04275） SO4 SULFATE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；CRYSTALS OF A1/SS-GPIB/VWD2 COMPLEX APPEARED IN DROPS WITH 20% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING CRYSTAL GROWTH IN 8 MG/ML COMPLEX, 15% PEG 4000, 0.16 M AMMONIUM SULFATE, 0.08 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, AND 20% GLYCEROL. SINCE THESE CRYSTALS WERE FORMED IN BUFFER CONTAINING 20% GLYCEROL, NO ADDITIONAL CRYOPROTECTION WAS USED.	分辨率 2.80 Å R-free 0.286

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 4C2B	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1GWB STRUCTURE OF GLYCOPROTEIN 1B 提交 2002-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 16–296（281 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 16-296	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PT PLATINUM (II) ION × 2 ACY ACETIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50	分辨率 2.80 Å R-free 0.274
1GWB STRUCTURE OF GLYCOPROTEIN 1B 提交 2002-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 16–296（281 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 16-296	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PT PLATINUM (II) ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50	分辨率 2.80 Å R-free 0.274
1M0Z Crystal Structure of the von Willebrand Factor Binding Domain of Glycoprotein Ib alpha 提交 2002-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–306（290 aa）片段：von Willebrand Factor binding domain	突变：N21Q N159Q	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；301 K；ammonium sulfate, lithium sulfate, CAPS, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 301K	分辨率 1.85 Å R-free 0.216
1M0Z Crystal Structure of the von Willebrand Factor Binding Domain of Glycoprotein Ib alpha 提交 2002-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 17–306（290 aa）片段：von Willebrand Factor binding domain	突变：N21Q N159Q	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；301 K；ammonium sulfate, lithium sulfate, CAPS, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 301K	分辨率 1.85 Å R-free 0.216
1M10 Crystal structure of the complex of Glycoprotein Ib alpha and the von Willebrand Factor A1 Domain 提交 2002-06-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 17–306（290 aa）片段：von Willebrand Factor binding domain	突变：N21Q N159Q M239V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3000, sodium chloride, MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.10 Å R-free 0.296
1OOK Crystal Structure of the Complex of Platelet Receptor GPIb-alpha and Human alpha-Thrombin 提交 2003-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 17–306（290 aa）片段：N-terminal domain	突变：C65A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 6000, Ammonium Phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.30 Å R-free 0.260
1P8V CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX OF PLATELET RECEPTOR GPIB-ALPHA AND ALPHA-THROMBIN AT 2.6A 提交 2003-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 17–294（278 aa）片段：Glycoprotein 1B alpha	突变：N21D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 DFP DIISOPROPYL PHOSPHONATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；291 K；14% PEG 400, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.00	分辨率 2.60 Å R-free 0.238
1P9A Crystal Structure of N-Terminal Domain of Human Platelet Receptor Glycoprotein Ib-alpha at 1.7 Angstrom Resolution 提交 2003-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 17–306（290 aa）片段：N-Terminal Domain	突变：C65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG 6000, Sodium Nitrate, Sodium Acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.70 Å R-free 0.224
1QYY Crystal Structure of N-Terminal Domain of Human Platelet Receptor Glycoprotein Ib-alpha at 2.8 Angstrom Resolution 提交 2003-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–306（290 aa）片段：N-Terminal Domain	突变：C65A	PT PLATINUM (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG 6000, SODIUM NITRATE, SODIUM ACETATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1QYY Crystal Structure of N-Terminal Domain of Human Platelet Receptor Glycoprotein Ib-alpha at 2.8 Angstrom Resolution 提交 2003-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 17–306（290 aa）片段：N-Terminal Domain	突变：C65A	PT PLATINUM (II) ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG 6000, SODIUM NITRATE, SODIUM ACETATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1SQ0 Crystal Structure of the Complex of the Wild-type Von Willebrand Factor A1 domain and Glycoprotein Ib alpha at 2.6 Angstrom Resolution 提交 2004-03-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 17–304（288 aa）片段：Glycoprotein Ib-(alpha)	突变：N21D, N159D	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG-3350; potassium thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.60 Å R-free 0.239
1U0N The ternary von Willebrand Factor A1-glycoprotein Ibalpha-botrocetin complex 提交 2004-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 17–281（265 aa）片段：Alpha chain	突变：N21Q,N159Q	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；Sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.95 Å R-free 0.276
2BP3 Crystal structure of Filamin A domain 17 and GPIb alpha cytoplasmic domain complex 提交 2005-04-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 572–593（22 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 572-593	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.2；1.75M AMMONIUM PHOSPHATE, PH 8.2, AFTER MICROSEEDING: 1.25M AMMONIUM SULFATE PH 8.2	分辨率 2.32 Å R-free 0.256
2BP3 Crystal structure of Filamin A domain 17 and GPIb alpha cytoplasmic domain complex 提交 2005-04-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 S 572–593（22 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 572-593	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.2；1.75M AMMONIUM PHOSPHATE, PH 8.2, AFTER MICROSEEDING: 1.25M AMMONIUM SULFATE PH 8.2	分辨率 2.32 Å R-free 0.256
3P72 structure of platelet Glycoprotein 1b alpha with a bound peptide inhibitor 提交 2010-10-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 17–281（265 aa）片段：UNP residues 17-281	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；298 K；1.9M ammonium sulfate, 80mM lithium sulfate, 100mM N-cyclohexyl-3-aminopropanesulfonic acid buffer. 1:1 mix buffer with 4mg/mL protein. lyophilised peptide added directly to crystallised protein drops., pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.286
3PMH Mechanism of Sulfotyrosine-Mediated Glycoprotein Ib Interaction with Two Distinct alpha-Thrombin Sites 提交 2010-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 17–306（290 aa）片段：unp residues 17-306	突变：C65A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	0G7 D-phenylalanyl-N-[(3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-oxohexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；277 K；16% PEG 6000, 0.2M ammonium phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.20 Å R-free 0.263
4C2A Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with R1306Q and I1309V Mutations in Complex with High Affinity GPIb alpha 提交 2013-08-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 17–306（290 aa）片段：RESIDUES 17-306	突变：YES	CAC CACODYLATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；CRYSTALS OF A1/VWD2-GPIBALPA/VWD2 COMPLEX APPEARED IN 12% PEG 8000, 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 6.5, 0.1 M CALCIUM ACETATE, AND 0.4 MG/ML RISTOCETIN (SIGMA-ALDRICH). THESE CRYSTALS WERE CRUSHED AND USED FOR SEEDING. CRYSTALS GREW IN 10 MG/ML COMPLEX, 14% PEG8000, 0.2 M CALCIUM ACETATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, AND 0.4 MG/ML RISTOCETIN. NEXT WE SOAKED THESE CRYSTALS IN 14% PEG8000, 0.2 M CALCIUM ACETATE, 0.1 SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, AND 4 MG/ML RISTOCETIN.	分辨率 2.08 Å R-free 0.189
4CH2 Low-salt crystal structure of a thrombin-GpIbalpha peptide complex 提交 2013-11-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 287–300（14 aa）片段：C-TERMINAL FRAGMENT OF GPIBALPHA, 271-284	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；50 MM SODIUM FORMATE, 16% PEG-3350, pH 7.4	分辨率 1.60 Å R-free 0.187
4CH2 Low-salt crystal structure of a thrombin-GpIbalpha peptide complex 提交 2013-11-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 Q 287–300（14 aa）片段：C-TERMINAL FRAGMENT OF GPIBALPHA, 271-284	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；50 MM SODIUM FORMATE, 16% PEG-3350, pH 7.4	分辨率 1.60 Å R-free 0.187
4CH8 High-salt crystal structure of a thrombin-GpIbalpha peptide complex 提交 2013-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 287–300（14 aa）片段：C-TERMINAL FRAGMENT OF GPIBALPHA, RESIDUES 271-284	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 1 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；100 MM SODIUM FORMATE, 18% PEG-3350, pH 7.4	分辨率 1.75 Å R-free 0.242
4CH8 High-salt crystal structure of a thrombin-GpIbalpha peptide complex 提交 2013-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 Q 287–300（14 aa）片段：C-TERMINAL FRAGMENT OF GPIBALPHA, RESIDUES 271-284	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 1 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；100 MM SODIUM FORMATE, 18% PEG-3350, pH 7.4	分辨率 1.75 Å R-free 0.242
4CH8 High-salt crystal structure of a thrombin-GpIbalpha peptide complex 提交 2013-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 R 287–300（14 aa）片段：C-TERMINAL FRAGMENT OF GPIBALPHA, RESIDUES 271-284	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 1 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；100 MM SODIUM FORMATE, 18% PEG-3350, pH 7.4	分辨率 1.75 Å R-free 0.242
4CH8 High-salt crystal structure of a thrombin-GpIbalpha peptide complex 提交 2013-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 S 287–300（14 aa）片段：C-TERMINAL FRAGMENT OF GPIBALPHA, RESIDUES 271-284	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 1 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；100 MM SODIUM FORMATE, 18% PEG-3350, pH 7.4	分辨率 1.75 Å R-free 0.242
4MGX Crystal structure of human filamin C domains 4-5 and GPIB alpha cytoplasmic domain complex 提交 2013-08-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 577–585（9 aa）片段：cytoplasmic domain (UNP residues 577-585)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 20% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 3.16 Å R-free 0.277
6XFQ Structure of a novel antithrombotic agent Agkisacucetin in complex with the platelet glycoprotein Ib receptor 提交 2020-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 17–321（305 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；15% PEG4000, 0.1M HEPES, pH 7.5	分辨率 3.30 Å R-free 0.311
8WE2 14-3-3 zeta complexed with S609 phosphorylated peptide derived from GPIb alpha cytoplasmic domain 提交 2023-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Q 646–652（7 aa）链 R 646–652（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Sodium Acetate, 20% PEG 3350	分辨率 2.11 Å R-free 0.238
8WF6 14-3-3 zeta complexed with S559 phosphorylated peptide derived from GPIb alpha cytoplasmic domain 提交 2023-09-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Q 596–607（12 aa）链 R 596–607（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；2% Tacsimate pH7.0, 0.1M Hepes pH7.5, 20% PEG 3350	分辨率 2.47 Å R-free 0.238
8WF6 14-3-3 zeta complexed with S559 phosphorylated peptide derived from GPIb alpha cytoplasmic domain 提交 2023-09-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 596–607（12 aa）链 F 596–607（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SIN SUCCINIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；2% Tacsimate pH7.0, 0.1M Hepes pH7.5, 20% PEG 3350	分辨率 2.47 Å R-free 0.238
8WFS Cryo-EM structure of GPIb-IX Complex 提交 2023-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 a 523–652（130 aa）	突变：S559E, S609E	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.36 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	GP1BA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–290； UniProt 17–306 作者链 D； PDB构建体 1–290； UniProt 17–306 作者链 F； PDB构建体 1–290； UniProt 17–306 作者链 H； PDB构建体 1–290； UniProt 17–306

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4c2b
沉积日期 deposition_date	2013-08-16
结构标题 title	Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with Disulfide Mutation in Complex with High Affinity GPIb alpha
关键词 keywords	BLOOD CLOTTING; BLOOD CLOTTING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	43.94 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	43.56 Å
零角强度 I(0) i0	603778000.00
分子量 molecular_weight	209080.0 kDa
排除体积 excluded_volume	264980 Å³
包络体积 envelope_volume	360310 Å³
水化壳体积 shell_volume	68533 Å³
包络直径 envelope_diameter	144.6 Å
壳层 Rg shell_rg	48.50 Å
包络 Rg envelope_rg	42.97 Å
形状 Rg shape_rg	43.54 Å
总 Rg total_rg	43.85 Å
总原子数 total_atoms	14703
残基数 n_residues	1845
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	138.9 Å
Rg (实空间) rg_real	43.82 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.88 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.0380e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0630e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	43.94 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	603900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8677
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	57.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.204
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.446
角度范围 angular_range	— – 0.1800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	107400000.0000
实空间数据点数 n_real_points	37
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.926; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.500

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	VON WILLEBRAND FACTOR
分子量 formula_weight	24706.7 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G
原子数 atom_count	14768

MEPPLHDFCRSRLLDLVFLLDGSSRLSEAEFEVLKAFVVDMMERLRISQKWVRVAVVEYHDGSHAYIGLKDRKRPSELRRIASQVKYAGSQVASTSEVLKYTLFQIFSKIDRPEASRIALLLMASQEPQRMSRNFVRYVQGLKKKKVIVIPVGIGPHANLKQIRLIEKQAPENKAFVLSSVDELEQQRDEIVSYLCDLAPEAPPPTLPPHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PLATELET GLYCOPROTEIN IB ALPHA CHAIN
分子量 formula_weight	32492.1 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H

HPICEVSKVASHLEVNCDKRRLTALPPDLPKDTTILHLSENLLYTFSLATLMPYTRLTQLNLDRCELTKLQVDGTLPVLGTLDLSHNQLQSLPLLGQTLPALTVLDVSFNRLTSLPLGALRGLGELQELYLKGNELKTLPPGLLTPTPKLEKLSLANNRLTELPAGLLNGLENLDTLLLQENSLYTIPKGFFGSHLLPFAFLHGNPWLCNCEILYFRRWLQDNAENVYVWKQVVDVKAVTSNVASVQCDNSDKFPVYKYPGKGCPTLGDEGDTDLYDYYPEEDTEGDKVRG

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	HOMO SAPIENS

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	195.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	65

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d4c2ba_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.62 — vWA-like
超家族 Superfamily superfamily	c.62.1 — vWA-like
家族 Family family	c.62.1.1 — Integrin A (or I) domain

结构域编号 domain_id	d4c2bb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
超家族 Superfamily superfamily	c.10.2 — L domain-like
家族 Family family	c.10.2.7 — Ngr ectodomain-like

结构域编号 domain_id	d4c2bc_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.62 — vWA-like
超家族 Superfamily superfamily	c.62.1 — vWA-like
家族 Family family	c.62.1.1 — Integrin A (or I) domain

结构域编号 domain_id	d4c2bd_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
超家族 Superfamily superfamily	c.10.2 — L domain-like
家族 Family family	c.10.2.7 — Ngr ectodomain-like

结构域编号 domain_id	d4c2be_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.62 — vWA-like
超家族 Superfamily superfamily	c.62.1 — vWA-like
家族 Family family	c.62.1.1 — Integrin A (or I) domain

结构域编号 domain_id	d4c2bf_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
超家族 Superfamily superfamily	c.10.2 — L domain-like
家族 Family family	c.10.2.7 — Ngr ectodomain-like

结构域编号 domain_id	d4c2bg_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.62 — vWA-like
超家族 Superfamily superfamily	c.62.1 — vWA-like
家族 Family family	c.62.1.1 — Integrin A (or I) domain

结构域编号 domain_id	d4c2bh_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
超家族 Superfamily superfamily	c.10.2 — L domain-like
家族 Family family	c.10.2.7 — Ngr ectodomain-like

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	4c2bA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	4c2bB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4c2bC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	4c2bD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4c2bE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	4c2bF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4c2bG00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	4c2bH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	96.530 Å
晶胞边长 b length_b	103.840 Å
晶胞边长 c length_c	119.930 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.05 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	48.265 Å
R 因子 r_factor	0.2566
R_work r_work	0.2527
R_free r_free	0.2859

fit	/app/data/saxs_computation/c2/4c2b/4c2b.fit
pddf	/app/data/pr_computation/c2/4c2b/4c2b.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/c2/4c2b/4c2b.dat

Crystal Structure of High-Affinity von Willebrand Factor A1 domain with Disulfide Mutation in Complex with High Affinity GPIb alpha

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

VON WILLEBRAND FACTOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PLATELET GLYCOPROTEIN IB ALPHA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)