SAXSdb — 4l0y

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Runt-related transcription factor 1

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 2 DNA 2 PDB 声明：tetrameric（4）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 1–242	片段：UNP residues 1-242	Protein C-ets-1 × 1 （P14921） 5'-D(GPGPAPAPGPCPCPAPCPAPTPCPCPTPCPT)-3' × 1 5'-D(CPAPGPAPGPGPAPTPGPTPGPGPCPTPTPC)-3' × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；Plate-shaped crystals grown from 100 mM potassium chloride, 15 mM magnesium chloride hexahydrate, 25 mM MES, pH 5.6, 14% v/v PEG550 MME, 6% v/v glycerol, crystal size improved by macroseeding, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.245

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4L0Y	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1EAN THE RUNX1 Runt domain at 1.70A resolution: A structural switch and specifically bound chloride ions modulate DNA binding 提交 2001-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 46–185（140 aa）片段：RUNT DOMAIN RESIDUES 46-185	突变：YES	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；30% MPEG 350, 5-10% PEG 3350, 70 MM NA CACODYLATE, PH 6.5	分辨率 1.70 Å R-free 0.222
1EAO THE RUNX1 Runt domain at 1.4A resolution: a structural switch and specifically bound chloride ions modulate DNA binding 提交 2001-07-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 46–185（140 aa）片段：RUNT DOMAIN RESIDUES 46-185	突变：YES	BR BROMIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.4；25 % PEG 3350, 16% GLYCEROL, 130 MM NA CACODYLATE, PH 6.4	分辨率 1.40 Å R-free 0.173
1EAO THE RUNX1 Runt domain at 1.4A resolution: a structural switch and specifically bound chloride ions modulate DNA binding 提交 2001-07-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 46–185（140 aa）片段：RUNT DOMAIN RESIDUES 46-185	突变：YES	BR BROMIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.4；25 % PEG 3350, 16% GLYCEROL, 130 MM NA CACODYLATE, PH 6.4	分辨率 1.40 Å R-free 0.173
1EAQ The RUNX1 Runt domain at 1.25A resolution: A structural switch and specifically bound chloride ions modulate DNA binding 提交 2001-07-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 46–185（140 aa）片段：RUNT DOMAIN RESIDUES 36-185	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.4；25 % PEG 3350, 16% GLYCEROL, 130 MM NA CACODYLATE, PH 6.4	分辨率 1.25 Å R-free 0.167
1EAQ The RUNX1 Runt domain at 1.25A resolution: A structural switch and specifically bound chloride ions modulate DNA binding 提交 2001-07-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 46–185（140 aa）片段：RUNT DOMAIN RESIDUES 36-185	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.4；25 % PEG 3350, 16% GLYCEROL, 130 MM NA CACODYLATE, PH 6.4	分辨率 1.25 Å R-free 0.167
1HJB CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN AND C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER 提交 2001-01-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 60–182（123 aa）片段：RESIDUES 60-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；297 K；5 MM MGSO4, 3% W/V PEG 4000, 1% V/V DIOXANE, 50 MM MES BUFFER, PH 5.6 AT 24 DEGREES C	分辨率 3.00 Å R-free 0.313
1HJB CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN AND C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER 提交 2001-01-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 F 60–182（123 aa）片段：RESIDUES 60-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；297 K；5 MM MGSO4, 3% W/V PEG 4000, 1% V/V DIOXANE, 50 MM MES BUFFER, PH 5.6 AT 24 DEGREES C	分辨率 3.00 Å R-free 0.313
1HJC CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER 提交 2001-01-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 60–182（123 aa）片段：RESIDUES 60-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；297 K；0.2 M AMMONIUM ACETATE, 0.15 M MAGNESIUM ACETATE, 5% W/V PEG 4000, 50 MM HEPES BUFFER, PH 7.0 AT 24 DEGREES C	分辨率 2.65 Å R-free 0.263
1HJC CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER 提交 2001-01-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 D 60–182（123 aa）片段：RESIDUES 60-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；297 K；0.2 M AMMONIUM ACETATE, 0.15 M MAGNESIUM ACETATE, 5% W/V PEG 4000, 50 MM HEPES BUFFER, PH 7.0 AT 24 DEGREES C	分辨率 2.65 Å R-free 0.263
1IO4 CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN-CBFBETA CORE DOMAIN HETERODIMER AND C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER 提交 2001-01-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 60–182（123 aa）片段：RUNT DOMAIN	未记录	AU GOLD ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；297 K；0.2 M potassium chloride, 0.01 M magnesium chloride, 0.01 M DTT, 4.5% V/V PEG 8000, 1% V/V glycerol, 1% V/V MPD, 0.05 M MES buffer pH 5.6, pH 5.60, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K	分辨率 3.00 Å R-free 0.299
2J6W R164N mutant of the RUNX1 Runt domain 提交 2006-10-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 46–185（140 aa）片段：RUNT DOMAIN, RESIDUES 46-185	突变：YES	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；22% PEG 8000, 0.1M SODIUM CACODYLATE PH=6.5, 0.2M AMMONIUM SULFATE	分辨率 2.60 Å R-free 0.268
2J6W R164N mutant of the RUNX1 Runt domain 提交 2006-10-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 46–185（140 aa）片段：RUNT DOMAIN, RESIDUES 46-185	突变：YES	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；22% PEG 8000, 0.1M SODIUM CACODYLATE PH=6.5, 0.2M AMMONIUM SULFATE	分辨率 2.60 Å R-free 0.268
3WTS Crystal structure of the complex comprised of ETS1, RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 A 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；10% PEG 4000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.05M TRIS HCL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.279
3WTS Crystal structure of the complex comprised of ETS1, RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 F 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；10% PEG 4000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.05M TRIS HCL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.279
3WTT Crystal structure of the complex comprised of phosphorylated ETS1, RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 A 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；10% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.277
3WTT Crystal structure of the complex comprised of phosphorylated ETS1, RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 F 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；10% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.277
3WTU Crystal structure of the complex comprised of ETS1 (V170A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 A 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K, V170A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4% PEG 8000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.282
3WTU Crystal structure of the complex comprised of ETS1 (V170A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 F 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K, V170A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4% PEG 8000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.282
3WTV Crystal structure of the complex comprised of ETS1(V170G), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 A 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K, V170G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4% PEG 8000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.284
3WTV Crystal structure of the complex comprised of ETS1(V170G), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 F 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K, V170G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4% PEG 8000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.284
3WTW Crystal structure of the complex comprised of ETS1(K167A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 A 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K, K167A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；12% ISOPROPANOL, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å R-free 0.264
3WTW Crystal structure of the complex comprised of ETS1(K167A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 F 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K, K167A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；12% ISOPROPANOL, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å R-free 0.264
3WTX Crystal structure of the complex comprised of ETS1(Y329A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 A 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；10% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE PH5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
3WTX Crystal structure of the complex comprised of ETS1(Y329A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 F 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；10% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE PH5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
3WTY Crystal structure of the complex comprised of ETS1(G333P), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 A 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；4% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.268
3WTY Crystal structure of the complex comprised of ETS1(G333P), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 F 60–263（204 aa）片段：UNP RESIDUES 60-263	突变：L94K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；4% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.268
3WU1 Crystal structure of the ETS1-RUNX1-DNA ternary complex 提交 2014-04-21	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 55–177（123 aa）片段：UNP RESIDUES 55-177	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；11% PEG MME 550, 0.1M KCL, 0.015M MGCL2, 0.05M TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.249
4L0Z Crystal structure of Runx1 and Ets1 bound to TCR alpha promoter (crystal form 2) 提交 2013-06-01	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–242（242 aa）片段：UNP residues 1-242	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；Square bipyramid-shaped crystals grown from 100 mM potassium chloride, 15 mM magnesium chloride hexahydrate, 25 mM MES, pH 5.6, 14% v/v PEG550 MME, 6% v/v glycerol, crystal size improved by macroseeding, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.272
4L18 Crystal structure of Runx1 and Ets1 bound to TCR alpha promoter (crystal form 3) 提交 2013-06-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 48–214（167 aa）片段：UNP residues 48-214	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；2.5% w/v PEG4000, 5 mM magnesium chloride hexahydrate, 25 mM MES, pH 5.6, 5% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.280
4L18 Crystal structure of Runx1 and Ets1 bound to TCR alpha promoter (crystal form 3) 提交 2013-06-02	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 E 48–214（167 aa）片段：UNP residues 48-214	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；2.5% w/v PEG4000, 5 mM magnesium chloride hexahydrate, 25 mM MES, pH 5.6, 5% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.280

共 17 个其他 PDB 条目、30 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RUNX1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–242； UniProt 1–242

Protein C-ets-1

Homo sapiens

UniProt P14921

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 2 DNA 2 PDB 声明：tetrameric（4）与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 296–441	片段：UNP residues 296-441	Runt-related transcription factor 1 × 1 （Q03347） 5'-D(GPGPAPAPGPCPCPAPCPAPTPCPCPTPCPT)-3' × 1 5'-D(CPAPGPAPGPGPAPTPGPTPGPGPCPTPTPC)-3' × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；Plate-shaped crystals grown from 100 mM potassium chloride, 15 mM magnesium chloride hexahydrate, 25 mM MES, pH 5.6, 14% v/v PEG550 MME, 6% v/v glycerol, crystal size improved by macroseeding, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.245

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4L0Y	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1GVJ ETS-1 DNA BINDING AND AUTOINHIBITORY DOMAINS 提交 2002-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 297–441（145 aa）片段：RESIDUES 297-441 链 B 297–441（145 aa）片段：RESIDUES 297-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；297 K；0.2 M AMMONIUM ACETATE, 30% W/V PEG 4000, 0.1 M SODIUM CITRATE PH 5.6, PROTEIN CONCENTRATION 15 MG/ML PLUS 10 MM DTT, TEMPERATURE 297 K, FOR CRYOPROTECTION 10% OF PEG 400 WAS ADDED.	分辨率 1.53 Å R-free 0.235
2NNY Crystal structure of the Ets1 dimer DNA complex. 提交 2006-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 280–441（162 aa）片段：residues 280-441 链 B 280–441（162 aa）片段：residues 280-441	突变：C350S , C416S 突变：C350S , C416S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；0.2 M ammonium acetate 28% PEG 2000 0.1 M sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 100K, temperature 298K	分辨率 2.58 Å R-free 0.271
2STT SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE HUMAN ETS1/DNA COMPLEX, 25 STRUCTURES 提交 1996-08-05	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 320–415（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K	分辨率未提供
2STW SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE HUMAN ETS1/DNA COMPLEX, RESTRAINED REGULARIZED MEAN STRUCTURE 提交 1996-08-05	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 320–415（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K	分辨率未提供
3MFK Ets1 complex with stromelysin-1 promoter DNA 提交 2010-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 280–441（162 aa）片段：UNP residues 280-441 链 B 280–441（162 aa）片段：UNP residues 280-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；15 mM ammonium chloride, 15 mM magnesium chloride, 0.7 M NDSB-195, 40 mM MES buffer (pH 6.5) and 11.5% v/v 2-Propanol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295 K	分辨率 3.00 Å R-free 0.289
3RI4 Ets1 cooperative binding to widely separated sites on promoter DNA 提交 2011-04-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 64–225（162 aa）片段：UNP residues 280-441 链 D 64–225（162 aa）片段：UNP residues 280-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 sitting drop vapor diffusion and macroseeding；pH 8.5；295 K；200 mM ammonium chloride, 10 mM calcium chloride, 50 mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 18.5% v/v PEG MME 2000, 3% v/v glycerol, sitting drop vapor diffusion and macroseeding, temperature 295K	分辨率 3.00 Å R-free 0.284
3WTS Crystal structure of the complex comprised of ETS1, RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；10% PEG 4000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.05M TRIS HCL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.279
3WTS Crystal structure of the complex comprised of ETS1, RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；10% PEG 4000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.05M TRIS HCL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.279
3WTT Crystal structure of the complex comprised of phosphorylated ETS1, RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；10% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.277
3WTT Crystal structure of the complex comprised of phosphorylated ETS1, RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；10% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.277
3WTU Crystal structure of the complex comprised of ETS1 (V170A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4% PEG 8000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.282
3WTU Crystal structure of the complex comprised of ETS1 (V170A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4% PEG 8000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.282
3WTV Crystal structure of the complex comprised of ETS1(V170G), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4% PEG 8000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.284
3WTV Crystal structure of the complex comprised of ETS1(V170G), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4% PEG 8000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.284
3WTW Crystal structure of the complex comprised of ETS1(K167A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；12% ISOPROPANOL, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å R-free 0.264
3WTW Crystal structure of the complex comprised of ETS1(K167A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；12% ISOPROPANOL, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å R-free 0.264
3WTX Crystal structure of the complex comprised of ETS1(Y329A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	突变：Y329A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；10% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE PH5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
3WTX Crystal structure of the complex comprised of ETS1(Y329A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	突变：Y329A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；10% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE PH5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
3WTY Crystal structure of the complex comprised of ETS1(G333P), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	突变：G333P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；4% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.268
3WTY Crystal structure of the complex comprised of ETS1(G333P), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	突变：G333P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；4% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.268
3WTZ Crystal structure of ETS-1 DNA binding and autoinhibitory domains (276-441) 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441 链 B 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；9% MPD, 6% PEG 6000, 0.1M HEPES, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.61 Å R-free 0.252
3WU0 Crystal structure of phosphorylated ETS-1 DNA binding and autoinhibitory domains (276-441) 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441 链 B 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；5% PEG 3000, 25% MPD, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.60 Å R-free 0.277
3WU1 Crystal structure of the ETS1-RUNX1-DNA ternary complex 提交 2014-04-21	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 333–441（109 aa）片段：UNP RESIDUES 333-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；11% PEG MME 550, 0.1M KCL, 0.015M MGCL2, 0.05M TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.249
4L0Z Crystal structure of Runx1 and Ets1 bound to TCR alpha promoter (crystal form 2) 提交 2013-06-01	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 296–441（146 aa）片段：UNP residues 296-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；Square bipyramid-shaped crystals grown from 100 mM potassium chloride, 15 mM magnesium chloride hexahydrate, 25 mM MES, pH 5.6, 14% v/v PEG550 MME, 6% v/v glycerol, crystal size improved by macroseeding, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.272
4L18 Crystal structure of Runx1 and Ets1 bound to TCR alpha promoter (crystal form 3) 提交 2013-06-02	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 296–441（146 aa）片段：UNP residues 296-441	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；2.5% w/v PEG4000, 5 mM magnesium chloride hexahydrate, 25 mM MES, pH 5.6, 5% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.280
4L18 Crystal structure of Runx1 and Ets1 bound to TCR alpha promoter (crystal form 3) 提交 2013-06-02	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 F 296–441（146 aa）片段：UNP residues 296-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；2.5% w/v PEG4000, 5 mM magnesium chloride hexahydrate, 25 mM MES, pH 5.6, 5% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.280
4LG0 Structure of a ternary FOXO1-ETS1 DNA complex 提交 2013-06-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 331–440（110 aa）片段：DNA binding domain, UNP residues 331-440	未记录	CA CALCIUM ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；30% PEG 400, 0.05M 2-Amino-2-hydroxymethyl-propane-1,3-diol, 0.1M potassium chloride, 0.01M magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.19 Å R-free 0.243
5ZMC Structural Basis for Reactivation of -146C>T Mutant TERT Promoter by cooperative binding of p52 and ETS1/2 提交 2018-04-02	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 331–441（111 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.1 M HEPES pH 7.0 and 2.0 M Ammonium sulphate	分辨率 2.99 Å R-free 0.288

共 20 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ETS1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–146； UniProt 296–441

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4l0y
沉积日期 deposition_date	2013-06-01
结构标题 title	Crystal structure of Runx1 and Ets1 bound to TCR alpha promoter (crystal form 1)
关键词 keywords	RUNT domain, ETS domain, TRANSCRIPTION-DNA complex; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	23.83 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	24.18 Å
零角强度 I(0) i0	30133500.00
分子量 molecular_weight	36297.0 kDa
排除体积 excluded_volume	42812 Å³
包络体积 envelope_volume	54956 Å³
水化壳体积 shell_volume	20158 Å³
包络直径 envelope_diameter	88.9 Å
壳层 Rg shell_rg	29.88 Å
包络 Rg envelope_rg	24.31 Å
形状 Rg shape_rg	24.20 Å
总 Rg total_rg	24.76 Å
总原子数 total_atoms	2518
残基数 n_residues	264
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	85.1 Å
Rg (实空间) rg_real	23.97 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.79 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.0130e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.6860e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	23.94 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	30130000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8406
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	23.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.491
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.128
角度范围 angular_range	— – 0.3350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	4578000.0000
实空间数据点数 n_real_points	65
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.737; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.746; Smooth: 0.970

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Runt-related transcription factor 1
分子量 formula_weight	26492.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2584

MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSPHHPAPTPNPRASLNHSTAFNPQPQSQMQD

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein C-ets-1
分子量 formula_weight	16973.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

PNHKPKGTFKDYVRDRADLNKDKPVIPAAALAGYTGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVKPDADE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	5'-D(GPGPAPAPGPCPCPAPCPAPTPCPCPTPCPT)-3'
分子量 formula_weight	4843.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	C

GGAAGCCACATCCTCT

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	5'-D(CPAPGPAPGPGPAPTPGPTPGPGPCPTPTPC)-3'
分子量 formula_weight	4954.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	D

CAGAGGATGTGGCTTC

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	66

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	4l0yA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 —

结构域编号 domain_id	4l0yB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	102.622 Å
晶胞边长 b length_b	138.945 Å
晶胞边长 c length_c	98.439 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	29.670 Å
R 因子 r_factor	0.2250
R_work r_work	0.2250
R_free r_free	0.2450

fit	/app/data/saxs_computation/l0/4l0y/4l0y.fit
pddf	/app/data/pr_computation/l0/4l0y/4l0y.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/l0/4l0y/4l0y.dat

Crystal structure of Runx1 and Ets1 bound to TCR alpha promoter (crystal form 1)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Runt-related transcription factor 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein C-ets-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)