Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Capsid protein p24 × 1 （P12497） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Capsid protein p24 × 1 （P12497） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | RBP2_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 10–177； UniProt 3057–3224 作者链 B； PDB构建体 10–177； UniProt 3057–3224 |
Human immunodeficiency virus type 1
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | E3 SUMO-protein ligase RanBP2 × 1 （P49792） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | E3 SUMO-protein ligase RanBP2 × 1 （P49792） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | POL_HV1N5 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–146； UniProt 133–278 作者链 D； PDB构建体 1–146； UniProt 133–278 |
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| 条目编号 entry_id | 4lqw |
| 沉积日期 deposition_date | 2013-07-19 |
| 结构标题 title | Crystal structure of HIV-1 capsid N-terminal domain in complex with NUP358 cyclophilin |
| 关键词 keywords | cyclophilin, isomerase, capsid; ISOMERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 24.47 Å |
| Rg（电子密度） | 24.40 Å |
| 总 Rg | 25.16 Å |
| 原子数 | 2409 |
| 残基数 | 310 |
| 排除体积 | 42819 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4lqwa1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.62 — Cyclophilin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.62.1 — Cyclophilin-like |
| 家族 Family family | b.62.1.1 — Cyclophilin (peptidylprolyl isomerase) |
| 结构域编号 domain_id | d4lqwa2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d4lqwb1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.62 — Cyclophilin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.62.1 — Cyclophilin-like |
| 家族 Family family | b.62.1.1 — Cyclophilin (peptidylprolyl isomerase) |
| 结构域编号 domain_id | d4lqwb2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d4lqwc_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.73 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.73.1 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain |
| 家族 Family family | a.73.1.1 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain |
| 结构域编号 domain_id | d4lqwd_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.73 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.73.1 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain |
| 家族 Family family | a.73.1.1 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain |
| 结构域编号 domain_id | 4lqwA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 100 — Cyclophilin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Cyclophilin-like |
| 结构域编号 domain_id | 4lqwB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 100 — Cyclophilin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Cyclophilin-like |
| 结构域编号 domain_id | 4lqwC00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 375 — Human Immunodeficiency Virus Type 1 Capsid Protein |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Human Immunodeficiency Virus Type 1 Capsid Protein |
| 结构域编号 domain_id | 4lqwD00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 375 — Human Immunodeficiency Virus Type 1 Capsid Protein |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Human Immunodeficiency Virus Type 1 Capsid Protein |