5jvr

The neck-linker of Mus musculus KIF3A fused to the alpha 7 helix of Drosophila melanogaster Kinesin-1 fused to EB1

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chimera protein of mouse KIF3A,fruit fly Kinesin-1 and human EB1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
3	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
4	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KINH_DROME
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 11–24； UniProt 345–358 作者链 B； PDB构建体 11–24； UniProt 345–358 作者链 C； PDB构建体 11–24； UniProt 345–358 作者链 D； PDB构建体 11–24； UniProt 345–358 作者链 E； PDB构建体 11–24； UniProt 345–358 作者链 F； PDB构建体 11–24； UniProt 345–358 作者链 G； PDB构建体 11–24； UniProt 345–358 作者链 H； PDB构建体 11–24； UniProt 345–358

Chimera protein of mouse KIF3A,fruit fly Kinesin-1 and human EB1

Homo sapiens

UniProt P28741

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
3	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
4	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KIF3A_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–10； UniProt 352–359 作者链 B； PDB构建体 3–10； UniProt 352–359 作者链 C； PDB构建体 3–10； UniProt 352–359 作者链 D； PDB构建体 3–10； UniProt 352–359 作者链 E； PDB构建体 3–10； UniProt 352–359 作者链 F； PDB构建体 3–10； UniProt 352–359 作者链 G； PDB构建体 3–10； UniProt 352–359 作者链 H； PDB构建体 3–10； UniProt 352–359

Chimera protein of mouse KIF3A,fruit fly Kinesin-1 and human EB1

Homo sapiens

UniProt Q15691

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
3	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
4	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MARE1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 25–75； UniProt 207–257 作者链 B； PDB构建体 25–75； UniProt 207–257 作者链 C； PDB构建体 25–75； UniProt 207–257 作者链 D； PDB构建体 25–75； UniProt 207–257 作者链 E； PDB构建体 25–75； UniProt 207–257 作者链 F； PDB构建体 25–75； UniProt 207–257 作者链 G； PDB构建体 25–75； UniProt 207–257 作者链 H； PDB构建体 25–75； UniProt 207–257

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5jvr
沉积日期 deposition_date	2016-05-11
结构标题 title	The neck-linker of Mus musculus KIF3A fused to the alpha 7 helix of Drosophila melanogaster Kinesin-1 fused to EB1
关键词 keywords	kinesin, coiled-coil, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5jvr__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5jvr__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5jvr__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	20.29 Å
Rg（电子密度）	20.01 Å
总 Rg	20.79 Å
原子数	1069
残基数	125
排除体积	18985 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5jvr__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5jvr__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`5jvr__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`5jvr__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 17 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

结构域编号 domain_id	d5jvra_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.245 — EB1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.245.1 — EB1 dimerisation domain-like
家族 Family family	a.245.1.1 — EB1 dimerisation domain-like

结构域编号 domain_id	d5jvrb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.245 — EB1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.245.1 — EB1 dimerisation domain-like
家族 Family family	a.245.1.1 — EB1 dimerisation domain-like

结构域编号 domain_id	d5jvrc_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.245 — EB1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.245.1 — EB1 dimerisation domain-like
家族 Family family	a.245.1.1 — EB1 dimerisation domain-like

结构域编号 domain_id	d5jvrd_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.245 — EB1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.245.1 — EB1 dimerisation domain-like
家族 Family family	a.245.1.1 — EB1 dimerisation domain-like

结构域编号 domain_id	d5jvre_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.245 — EB1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.245.1 — EB1 dimerisation domain-like
家族 Family family	a.245.1.1 — EB1 dimerisation domain-like

结构域编号 domain_id	d5jvrf1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.245 — EB1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.245.1 — EB1 dimerisation domain-like
家族 Family family	a.245.1.1 — EB1 dimerisation domain-like

结构域编号 domain_id	d5jvrf2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d5jvrg_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.245 — EB1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.245.1 — EB1 dimerisation domain-like
家族 Family family	a.245.1.1 — EB1 dimerisation domain-like

结构域编号 domain_id	d5jvrh_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.245 — EB1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.245.1 — EB1 dimerisation domain-like
家族 Family family	a.245.1.1 — EB1 dimerisation domain-like

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	5jvrA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1430 —

结构域编号 domain_id	5jvrB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1430 —

结构域编号 domain_id	5jvrC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1430 —

结构域编号 domain_id	5jvrD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1430 —

结构域编号 domain_id	5jvrE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1430 —

结构域编号 domain_id	5jvrF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1430 —

结构域编号 domain_id	5jvrG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1430 —

结构域编号 domain_id	5jvrH00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1430 —

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晶胞边长 a length_a	53.172 Å
晶胞边长 b length_b	80.189 Å
晶胞边长 c length_c	155.375 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	43.880 Å
R 因子 r_factor	0.1980
R_work r_work	0.1960
R_free r_free	0.2340

描述 description	Chimera protein of mouse KIF3A,fruit fly Kinesin-1 and human EB1
分子量 formula_weight	8987.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H
原子数 atom_count	4801

The neck-linker of Mus musculus KIF3A fused to the alpha 7 helix of Drosophila melanogaster Kinesin-1 fused to EB1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chimera protein of mouse KIF3A,fruit fly Kinesin-1 and human EB1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chimera protein of mouse KIF3A,fruit fly Kinesin-1 and human EB1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chimera protein of mouse KIF3A,fruit fly Kinesin-1 and human EB1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5jvr__assembly_1__model_1

5jvr__assembly_1__model_1 | I(q)

5jvr__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 17 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	401

The neck-linker of Mus musculus KIF3A fused to the alpha 7 helix of Drosophila melanogaster Kinesin-1 fused to EB1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chimera protein of mouse KIF3A,fruit fly Kinesin-1 and human EB1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chimera protein of mouse KIF3A,fruit fly Kinesin-1 and human EB1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chimera protein of mouse KIF3A,fruit fly Kinesin-1 and human EB1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5jvr__assembly_1__model_1

5jvr__assembly_1__model_1 | I(q)

5jvr__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 17 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)