6b2z

Cryo-EM structure of the dimeric FO region of yeast mitochondrial ATP synthase

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase subunit c, mitochondrial

物种未注明

UniProt P61829

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 38 ATP synthase protein 8 × 2 (P00856) ATP synthase subunit a × 2 (P00854) ATP synthase subunit b × 2 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 2 (P30902) ATP synthase subunit e, mitochondrial × 2 ATP synthase subunit f, mitochondrial × 2 (Q06405) ATP synthase subunit g × 2 ATP synthase subunit j, mitochondrial × 2 (P81450) ATP synthase subunit k, mitochondrial × 2 (P81451) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP9_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 0; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 1; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 2; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 3; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 4; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 5; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 6; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 7; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 8; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 9; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 B; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 C; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 D; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 E; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 F; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 G; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 H; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 I; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 J; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 K; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76

ATP synthase protein 8

物种未注明

UniProt P00856

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 38 ATP synthase subunit c, mitochondrial × 20 (P61829) ATP synthase subunit a × 2 (P00854) ATP synthase subunit b × 2 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 2 (P30902) ATP synthase subunit e, mitochondrial × 2 ATP synthase subunit f, mitochondrial × 2 (Q06405) ATP synthase subunit g × 2 ATP synthase subunit j, mitochondrial × 2 (P81450) ATP synthase subunit k, mitochondrial × 2 (P81451) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ATP8_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–48; UniProt 1–48 作者链 L; PDB构建体 1–48; UniProt 1–48

ATP synthase subunit a

物种未注明

UniProt P00854

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 38 ATP synthase subunit c, mitochondrial × 20 (P61829) ATP synthase protein 8 × 2 (P00856) ATP synthase subunit b × 2 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 2 (P30902) ATP synthase subunit e, mitochondrial × 2 ATP synthase subunit f, mitochondrial × 2 (Q06405) ATP synthase subunit g × 2 ATP synthase subunit j, mitochondrial × 2 (P81450) ATP synthase subunit k, mitochondrial × 2 (P81451) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ATP6_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–249; UniProt 11–259 作者链 a; PDB构建体 1–249; UniProt 11–259

ATP synthase subunit b

物种未注明

UniProt P05626

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 38 ATP synthase subunit c, mitochondrial × 20 (P61829) ATP synthase protein 8 × 2 (P00856) ATP synthase subunit a × 2 (P00854) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 2 (P30902) ATP synthase subunit e, mitochondrial × 2 ATP synthase subunit f, mitochondrial × 2 (Q06405) ATP synthase subunit g × 2 ATP synthase subunit j, mitochondrial × 2 (P81450) ATP synthase subunit k, mitochondrial × 2 (P81451) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ATPF_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–209; UniProt 36–244 作者链 b; PDB构建体 1–209; UniProt 36–244

ATP synthase subunit d, mitochondrial

物种未注明

UniProt P30902

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 38 ATP synthase subunit c, mitochondrial × 20 (P61829) ATP synthase protein 8 × 2 (P00856) ATP synthase subunit a × 2 (P00854) ATP synthase subunit b × 2 (P05626) ATP synthase subunit e, mitochondrial × 2 ATP synthase subunit f, mitochondrial × 2 (Q06405) ATP synthase subunit g × 2 ATP synthase subunit j, mitochondrial × 2 (P81450) ATP synthase subunit k, mitochondrial × 2 (P81451) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ATP7_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 O; PDB构建体 1–173; UniProt 2–174 作者链 d; PDB构建体 1–173; UniProt 2–174

ATP synthase subunit f, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q06405

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 38 ATP synthase subunit c, mitochondrial × 20 (P61829) ATP synthase protein 8 × 2 (P00856) ATP synthase subunit a × 2 (P00854) ATP synthase subunit b × 2 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 2 (P30902) ATP synthase subunit e, mitochondrial × 2 ATP synthase subunit g × 2 ATP synthase subunit j, mitochondrial × 2 (P81450) ATP synthase subunit k, mitochondrial × 2 (P81451) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ATPK_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–95; UniProt 7–101 作者链 f; PDB构建体 1–95; UniProt 7–101

ATP synthase subunit j, mitochondrial

物种未注明

UniProt P81450

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 38 ATP synthase subunit c, mitochondrial × 20 (P61829) ATP synthase protein 8 × 2 (P00856) ATP synthase subunit a × 2 (P00854) ATP synthase subunit b × 2 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 2 (P30902) ATP synthase subunit e, mitochondrial × 2 ATP synthase subunit f, mitochondrial × 2 (Q06405) ATP synthase subunit g × 2 ATP synthase subunit k, mitochondrial × 2 (P81451) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ATP18_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 S; PDB构建体 1–59; UniProt 1–59 作者链 i; PDB构建体 1–59; UniProt 1–59

ATP synthase subunit k, mitochondrial

物种未注明

UniProt P81451

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 38 ATP synthase subunit c, mitochondrial × 20 (P61829) ATP synthase protein 8 × 2 (P00856) ATP synthase subunit a × 2 (P00854) ATP synthase subunit b × 2 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 2 (P30902) ATP synthase subunit e, mitochondrial × 2 ATP synthase subunit f, mitochondrial × 2 (Q06405) ATP synthase subunit g × 2 ATP synthase subunit j, mitochondrial × 2 (P81450) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ATP19_YEAST
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 T; PDB构建体 1–68; UniProt 1–68 作者链 k; PDB构建体 1–68; UniProt 1–68

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6b2z
沉积日期 deposition_date2017-09-20
结构标题 titleCryo-EM structure of the dimeric FO region of yeast mitochondrial ATP synthase
关键词 keywordsComplex, Dimer, Mitochondrial inner membrane, Proton translocation, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6b2z__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6b2z__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6b2z__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)54.66 Å
Rg(电子密度)54.49 Å
总 Rg54.74 Å
原子数21436
残基数2996
排除体积392970 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6b2z__assembly_1__model_1 38-meric (38) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

CATH v4.4 (20 domains)

结构域编号 domain_id6b2z000
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2z100
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2z200
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2z300
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2z400
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2z500
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2z600
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2z700
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2z800
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2z900
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2zB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2zC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2zD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2zE00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2zF00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2zG00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2zH00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2zI00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2zJ00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6b2zK00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
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7. 引用文献 (1)