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6bcu

Cryo-EM structure of the activated RHEB-mTORC1 refined to 3.4 angstrom

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 264.6 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase mTOR,Serine/threonine-protein kinase mTOR

Homo sapiens

UniProt P42345

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 579–2549 链 B； UniProt 579–2549 未记录 Target of rapamycin complex subunit LST8 × 2 （Q9BVC4） Regulatory-associated protein of mTOR,Regulatory-associated protein of mTOR × 2 （Q8N122） Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1 × 2 （Q13541） GTP-binding protein Rheb × 2 （Q15382） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6BCU Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1AUE FKBP-RAPAMYCIN BINDING DOMAIN (FRB) OF THE FKBP-RAPAMYCIN ASSOCIATED PROTEIN 提交 1997-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2015–2114（100 aa） 片段：FKBP-RAPAMYCIN BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；HANGING DROPS AT 4 C, pH 8.0, vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.339
1AUE FKBP-RAPAMYCIN BINDING DOMAIN (FRB) OF THE FKBP-RAPAMYCIN ASSOCIATED PROTEIN 提交 1997-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2015–2114（100 aa） 片段：FKBP-RAPAMYCIN BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；HANGING DROPS AT 4 C, pH 8.0, vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.339
1FAP THE STRUCTURE OF THE IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT FKBP12-RAPAMYCIN COMPLEX INTERACTING WITH HUMAN FRAP 提交 1996-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2018–2112（95 aa） 片段：FRB
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å R-free 0.299
1NSG THE STRUCTURE OF THE IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT FKBP12-RAPAMYCIN COMPLEX INTERACTING WITH HUMAN FRAP 提交 1997-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2019–2112（94 aa）
未记录 RAD C49-METHYL RAPAMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å R-free 0.265
2FAP THE STRUCTURE OF THE IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT FKBP12-(C16)-ETHOXY RAPAMYCIN COMPLEX INTERACTING WITH HUMA 提交 1998-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2019–2112（94 aa） 片段：FRB
未记录 RAD C49-METHYL RAPAMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.266
2GAQ NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE FRB DOMAIN OF mTOR 提交 2006-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2015–2114（100 aa） 片段：FRB DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；283 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM PBS 1 mM DTT；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM FRB U-15N | PBS 10% D2O 90% H2O
NMR样品组成 0.5 mM FRB U-15N | PBS 100%D2O
NMR样品组成 0.6 mM FRB U-15N, U-13C | PBS 10% D2O 90% H2O
分辨率未提供
2NPU The solution structure of the rapamycin-binding domain of mTOR (FRB) 提交 2006-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2015–2114（100 aa） 片段：FRB
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM；压力 ambient
NMR样品组成 0.1 mM FRB domain U-15N,13C; '25mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.1 mM FRB domain U-15N; 25mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.1 mM FRB domain U-15N,13C with unlabelled aromatics; 25mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2RSE NMR structure of FKBP12-mTOR FRB domain-rapamycin complex structure determined based on PCS 提交 2012-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2019–2112（94 aa） 片段：UNP RESIDUES 2019-2112
未记录 TB TERBIUM(III) ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR样品组成 0.3 mM FKBP12-1, 0.3 mM [U-98% 15N] FRB-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3FAP ATOMIC STRUCTURES OF THE RAPAMYCIN ANALOGS IN COMPLEX WITH BOTH HUMAN FKBP12 AND FRB DOMAIN OF FRAP 提交 1999-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2019–2112（94 aa） 片段：FRB
未记录 ARD C15-(R)-METHYLTHIENYL RAPAMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；20% PEG8000, 10% MPD, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, pH 8.00
分辨率 1.85 Å R-free 0.273
3JBZ Crystal structure of mTOR docked into EM map of dimeric ATM kinase 提交 2015-11-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1385–2549（1165 aa） 片段：C-terminal domain (UNP RESIDUES 1385-2020, 2119-2549)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 mM Tris pH 8.0, 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, 10% glycerol；pH 8；25 mM Tris, 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, 10% glycerol
分辨率 28.00 Å
4DRH Co-crystal structure of the PPIase domain of FKBP51, Rapamycin and the FRB fragment of mTOR at low pH 提交 2012-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2025–2114（90 aa） 片段：FRB domain, UNP RESIDUES 2025-2114
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 SO4 SULFATE ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 3.5；293 K；0.1M citric acid 2M (NH4)2SO4, pH 3.5, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
4DRH Co-crystal structure of the PPIase domain of FKBP51, Rapamycin and the FRB fragment of mTOR at low pH 提交 2012-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2025–2114（90 aa） 片段：FRB domain, UNP RESIDUES 2025-2114
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 SO4 SULFATE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 3.5；293 K；0.1M citric acid 2M (NH4)2SO4, pH 3.5, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
4DRI Co-crystal structure of the PPIase domain of FKBP51, Rapamycin and the FRB fragment of mTOR 提交 2012-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2025–2114（90 aa） 片段：FRB domain, UNP residues 2025-2114
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；25% PEG3350, 0.1 M NaCl, 0.1M HEPES-NaOH pH 7.5, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 1.45 Å R-free 0.206
4DRJ o-crystal structure of the PPIase domain of FKBP52, Rapamycin and the FRB fragment of mTOR 提交 2012-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2025–2114（90 aa） 片段：FRB domain, UNP residues 2025-2114
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；0.1M BisTris, 1.95M (NH4)2SO4, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4FAP ATOMIC STRUCTURES OF THE RAPAMYCIN ANALOGS IN COMPLEX WITH BOTH HUMAN FKBP12 AND FRB DOMAIN OF FRAP 提交 1999-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2019–2112（94 aa） 片段：FRB
未记录 ARD C15-(R)-METHYLTHIENYL RAPAMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；20% PEG8000, 10% MPD, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, pH 8.0
分辨率 2.80 Å R-free 0.266
4JSN structure of mTORdeltaN-mLST8 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：FAT FRB KINASE
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris, pH 8.5, 6-8% PEG 8000, 500 mM NaCl, 10 % (v/v) Glycerol, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.256
4JSN structure of mTORdeltaN-mLST8 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：FAT FRB KINASE
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris, pH 8.5, 6-8% PEG 8000, 500 mM NaCl, 10 % (v/v) Glycerol, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.256
4JSP structure of mTORDeltaN-mLST8-ATPgammaS-Mg complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.268
4JSP structure of mTORDeltaN-mLST8-ATPgammaS-Mg complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.268
4JSV mTOR kinase structure, mechanism and regulation. 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.251
4JSV mTOR kinase structure, mechanism and regulation. 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.251
4JSX structure of mTORDeltaN-mLST8-Torin2 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 17G 9-(6-aminopyridin-3-yl)-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.257
4JSX structure of mTORDeltaN-mLST8-Torin2 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 17G 9-(6-aminopyridin-3-yl)-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.257
4JT5 mTORdeltaN-mLST8-pp242 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1376–2549（1174 aa）
未记录 P2X 2-[4-amino-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]-1H-indol-5-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.45 Å R-free 0.271
4JT5 mTORdeltaN-mLST8-pp242 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1376–2549（1174 aa）
未记录 P2X 2-[4-amino-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]-1H-indol-5-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.45 Å R-free 0.271
4JT6 structure of mTORDeltaN-mLST8-PI-103 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.275
4JT6 structure of mTORDeltaN-mLST8-PI-103 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：unp residues 1376-2549
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.275
5FLC Architecture of human mTOR Complex 1 - 5.9 Angstrom reconstruction 提交 2015-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 1382–2549（1168 aa） 片段：FAT AND PIKK DOMAINS
链 F 1382–2549（1168 aa） 片段：FAT AND PIKK DOMAINS
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 100 MM NACL, 10 MM NABICINE, 1 MM TCEP；pH 8；100 MM NACL, 10 MM NABICINE, 1 MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK I, METHOD- 4 SECOND BLOTTING,
分辨率 5.90 Å
5GPG Co-crystal structure of the FK506 binding domain of human FKBP25, Rapamycin and the FRB domain of human mTOR 提交 2016-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2021–2112（92 aa） 片段：UNP residues 2021-2112
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；30% polyethyleneglycol 8000, 100mM sodium cacodylate, 200mM sodium acetate, 10mM manganese chloride
分辨率 1.67 Å R-free 0.212
5H64 Cryo-EM structure of mTORC1 提交 2016-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 a 1–2549（2549 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2018–2114（97 aa） 片段：residues 2018-2114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2018–2114（97 aa） 片段：residues 2018-2114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 2018–2114（97 aa） 片段：residues 2018-2114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2018–2114（97 aa） 片段：residues 2018-2114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 2018–2114（97 aa） 片段：residues 2018-2114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBU Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(alpha-helix & beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：residues 1376-2549
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000
分辨率 3.42 Å R-free 0.266
5WBU Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(alpha-helix & beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：residues 1376-2549
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000
分辨率 3.42 Å R-free 0.266
5WBY Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1376–2549（1174 aa） 片段：residues 1376-2549
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 3.10 Å R-free 0.276
5WBY Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1376–2549（1174 aa） 片段：residues 1376-2549
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 3.10 Å R-free 0.276
5ZCS 4.9 Angstrom Cryo-EM structure of human mTOR complex 2 提交 2018-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
6BCX mTORC1 structure refined to 3.0 angstroms 提交 2017-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 579–2549（1971 aa）
链 B 579–2549（1971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
6M4U Crystal structure of FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2021–2113（93 aa）
突变：T2098L RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 ZN ZINC ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM cacodylic acid buffer (pH 6.5), 350 mM zinc acetate and 8% (w/v) isopropanol
分辨率 2.20 Å R-free 0.258
6M4U Crystal structure of FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 2021–2113（93 aa）
突变：T2098L RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 ZN ZINC ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM cacodylic acid buffer (pH 6.5), 350 mM zinc acetate and 8% (w/v) isopropanol
分辨率 2.20 Å R-free 0.258
6M4W Crystal structure of MBP fused split FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 2021–2113（93 aa）
突变：T2098L RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0), 200 mM calcium acetate and 20% (w/v) PEG 3000
分辨率 3.11 Å R-free 0.278
6M4W Crystal structure of MBP fused split FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 2021–2113（93 aa）
突变：T2098L RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0), 200 mM calcium acetate and 20% (w/v) PEG 3000
分辨率 3.11 Å R-free 0.278
6M4W Crystal structure of MBP fused split FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 2021–2113（93 aa）
突变：T2098L RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0), 200 mM calcium acetate and 20% (w/v) PEG 3000
分辨率 3.11 Å R-free 0.278
6SB0 cryo-EM structure of mTORC1 bound to PRAS40-fused active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 60–355（296 aa）
链 A 381–2549（2169 aa）
链 B 60–355（296 aa）
链 B 381–2549（2169 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM HEPES pH 7.0, 100mM NaCl, 2mM MgCl2, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6SB2 cryo-EM structure of mTORC1 bound to active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 60–355（296 aa）
链 A 381–2549（2169 aa）
链 B 60–355（296 aa）
链 B 381–2549（2169 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；100mM Tris-HCl pH7.0, 260mM NaCl, 5mM MgCl2, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
6ZWM cryo-EM structure of human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2020-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6ZWO cryo-EM structure of human mTOR complex 2, focused on one half 提交 2020-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
7OWG human DEPTOR in a complex with mutant human mTORC1 A1459P 提交 2021-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：Octameric
链 B 1–16（16 aa）
链 B 31–36（6 aa）
链 B 54–355（302 aa）
链 B 379–2549（2171 aa）
突变：A1459P 突变：A1459P 突变：A1459P 突变：A1459P 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES, pH 7.5, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, 1 mM MgCl2, 500 uM AMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time of 2 s and a force of -15.
分辨率 4.70 Å
7PE7 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
7PE8 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7PE9 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7PEA cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, overall refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–16（16 aa）
链 A 31–36（6 aa）
链 A 54–355（302 aa）
链 A 381–2549（2169 aa）
链 B 1–16（16 aa）
链 B 31–36（6 aa）
链 B 54–355（302 aa）
链 B 381–2549（2169 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7PEB cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–16（16 aa）
链 A 31–36（6 aa）
链 A 54–355（302 aa）
链 A 381–2549（2169 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.67 Å
7PEC cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–16（16 aa）
链 A 31–36（6 aa）
链 A 54–355（302 aa）
链 A 381–2549（2169 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.24 Å
7TZO The apo structure of human mTORC2 complex 提交 2022-02-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
7UXC cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion 提交 2022-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7UXH cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 C 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8ERA RMC-5552 in complex with mTORC1 and FKBP12 提交 2022-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 XZ9 1-[6-{[(3M)-4-amino-3-(2-amino-1,3-benzoxazol-5-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]methyl}-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-3-hydroxypropan-1-one × 1 XYU (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-5,9,27-trihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-10,21-dimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PPZ Co-crystal structure of FKBP12, compound 7 and the FRB fragment of mTOR 提交 2023-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2025–2114（90 aa）
未记录 0AN (1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-5-[(~{E})-2-(2-chlorophenyl)ethenyl]-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 CA CALCIUM ION × 4 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG8000, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M calcium actetate
分辨率 1.85 Å R-free 0.238
8RCH CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, overall refinement 提交 2023-12-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RCK CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, Focused on one protomer copy. 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8RCN CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, Focused region of mTOR and RAPTOR on one protomer copy. 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8XI9 Crystal structure of FRB-FKBP fusion protein in complex with rapamycin 提交 2023-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2023–2114（92 aa）
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；4.4M Sodium Acetate
分辨率 1.85 Å R-free 0.218
9DBO Crystal structure of a synthetic Fab (R3E9) in complex with the FRB domain of mTOR 提交 2024-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2021–2113（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.2 M Calcium chloride dihydrate 16% PEG 3350
分辨率 1.55 Å R-free 0.217
9DL0 Crystal structure of a synthetic Fab (R3H8) in complex with the FRB domain of mTOR 提交 2024-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 2021–2113（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5 4% PEG 400 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
9DL0 Crystal structure of a synthetic Fab (R3H8) in complex with the FRB domain of mTOR 提交 2024-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 2021–2113（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5 4% PEG 400 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 O 1–2549（2549 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9ED7 Active state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
9ED8 Intermediate state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.61 Å
9F44 cryo-EM structure of LST2 TOS peptide bound to human mTOR complex 1 提交 2024-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
9F45 cryo-EM structure of human LST2 bound to human mTOR complex 1 提交 2024-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
9NGT Crystal structure of CRBN-DDB1 and FPFT-2216 in complex with mTOR 提交 2025-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2018–2114（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1BC8 (3S)-3-[(4M)-4-(4-methoxythiophen-3-yl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl]piperidine-2,6-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；70 mM MES pH 6.0, 1.8-3.2 % (w/v) PEG 3,000, and 13-24 % (w/v) PEG 200
分辨率 2.95 Å R-free 0.260
9T7J cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9T92 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9T93 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9T94 cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9TDS cryo-EM structure of dephosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9TDT cryo-EM structure of dephosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–2549（2549 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9TPW cryo-ET structure of mTOR complex 2 on a PIP2-containing membrane 提交 2025-12-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2549（2549 aa）
链 B 1–2549（2549 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
9ZBJ Cryo-EM structure of human apo mTORC2 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 203–2549（2347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9ZBK mTORC2 in complex with Akt1 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 80–2549（2470 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1AID (1M,9M)-1-{4-[4-(prop-2-enoyl)piperazin-1-yl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-9-(quinolin-3-yl)benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å

共 66 个其他 PDB 条目、84 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MTOR_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 579–2549； UniProt 579–2549 作者链 B； PDB构建体 579–2549； UniProt 579–2549

Target of rapamycin complex subunit LST8

Homo sapiens

UniProt Q9BVC4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–326 链 E； UniProt 1–326 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR,Serine/threonine-protein kinase mTOR × 2 （P42345） Regulatory-associated protein of mTOR,Regulatory-associated protein of mTOR × 2 （Q8N122） Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1 × 2 （Q13541） GTP-binding protein Rheb × 2 （Q15382） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6BCU Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4JSN structure of mTORdeltaN-mLST8 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris, pH 8.5, 6-8% PEG 8000, 500 mM NaCl, 10 % (v/v) Glycerol, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.256
4JSN structure of mTORdeltaN-mLST8 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris, pH 8.5, 6-8% PEG 8000, 500 mM NaCl, 10 % (v/v) Glycerol, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.256
4JSP structure of mTORDeltaN-mLST8-ATPgammaS-Mg complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.268
4JSP structure of mTORDeltaN-mLST8-ATPgammaS-Mg complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.268
4JSV mTOR kinase structure, mechanism and regulation. 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.251
4JSV mTOR kinase structure, mechanism and regulation. 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.251
4JSX structure of mTORDeltaN-mLST8-Torin2 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 17G 9-(6-aminopyridin-3-yl)-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.257
4JSX structure of mTORDeltaN-mLST8-Torin2 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 17G 9-(6-aminopyridin-3-yl)-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.257
4JT5 mTORdeltaN-mLST8-pp242 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–323（323 aa）
未记录 P2X 2-[4-amino-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]-1H-indol-5-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.45 Å R-free 0.271
4JT5 mTORdeltaN-mLST8-pp242 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–323（323 aa）
未记录 P2X 2-[4-amino-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]-1H-indol-5-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.45 Å R-free 0.271
4JT6 structure of mTORDeltaN-mLST8-PI-103 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.275
4JT6 structure of mTORDeltaN-mLST8-PI-103 complex 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.275
5FLC Architecture of human mTOR Complex 1 - 5.9 Angstrom reconstruction 提交 2015-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–326（326 aa）
链 H 1–326（326 aa）
未记录 RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 100 MM NACL, 10 MM NABICINE, 1 MM TCEP；pH 8；100 MM NACL, 10 MM NABICINE, 1 MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK I, METHOD- 4 SECOND BLOTTING,
分辨率 5.90 Å
5H64 Cryo-EM structure of mTORC1 提交 2016-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–326（326 aa）
链 c 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5WBU Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(alpha-helix & beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000
分辨率 3.42 Å R-free 0.266
5WBU Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(alpha-helix & beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000
分辨率 3.42 Å R-free 0.266
5WBY Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 3.10 Å R-free 0.276
5WBY Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(beta-strand) complex 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 3.10 Å R-free 0.276
5ZCS 4.9 Angstrom Cryo-EM structure of human mTOR complex 2 提交 2018-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
6BCX mTORC1 structure refined to 3.0 angstroms 提交 2017-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–326（326 aa） 片段：mLST8
链 E 1–326（326 aa） 片段：mLST8
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
6SB0 cryo-EM structure of mTORC1 bound to PRAS40-fused active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–326（326 aa）
链 H 1–326（326 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM HEPES pH 7.0, 100mM NaCl, 2mM MgCl2, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6SB2 cryo-EM structure of mTORC1 bound to active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–326（326 aa）
链 H 1–326（326 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；100mM Tris-HCl pH7.0, 260mM NaCl, 5mM MgCl2, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
6ZWM cryo-EM structure of human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2020-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6ZWO cryo-EM structure of human mTOR complex 2, focused on one half 提交 2020-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–326（326 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
7OWG human DEPTOR in a complex with mutant human mTORC1 A1459P 提交 2021-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：Octameric
链 E 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES, pH 7.5, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, 1 mM MgCl2, 500 uM AMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time of 2 s and a force of -15.
分辨率 4.70 Å
7PE7 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2021-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
7PE8 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7PE9 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7PEA cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, overall refinement 提交 2021-08-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7PEB cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.67 Å
7PEC cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.24 Å
7TZO The apo structure of human mTORC2 complex 提交 2022-02-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
7UXC cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion 提交 2022-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7UXH cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 B 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8ERA RMC-5552 in complex with mTORC1 and FKBP12 提交 2022-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 XZ9 1-[6-{[(3M)-4-amino-3-(2-amino-1,3-benzoxazol-5-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]methyl}-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-3-hydroxypropan-1-one × 1 XYU (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-5,9,27-trihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-10,21-dimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8RCH CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, overall refinement 提交 2023-12-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–326（326 aa）
链 E 1–326（326 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RCK CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, Focused on one protomer copy. 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–326（326 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 B 1–326（326 aa）
链 M 1–326（326 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9ED6 CryoEM map of the mLST8-Rag-Ragultor subcomplex 提交 2024-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 I 1–326（326 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
9ED7 Active state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–326（326 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
9ED8 Intermediate state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–326（326 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.61 Å
9F44 cryo-EM structure of LST2 TOS peptide bound to human mTOR complex 1 提交 2024-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
9F45 cryo-EM structure of human LST2 bound to human mTOR complex 1 提交 2024-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
9T7J cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9T92 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9T93 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9T94 cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9TDS cryo-EM structure of dephosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9TDT cryo-EM structure of dephosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–326（326 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9TPW cryo-ET structure of mTOR complex 2 on a PIP2-containing membrane 提交 2025-12-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–326（326 aa）
链 D 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
9ZBJ Cryo-EM structure of human apo mTORC2 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 7–323（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9ZBK mTORC2 in complex with Akt1 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 7–324（318 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1AID (1M,9M)-1-{4-[4-(prop-2-enoyl)piperazin-1-yl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-9-(quinolin-3-yl)benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å

共 44 个其他 PDB 条目、52 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LST8_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–326； UniProt 1–326 作者链 E； PDB构建体 1–326； UniProt 1–326

Regulatory-associated protein of mTOR,Regulatory-associated protein of mTOR

Homo sapiens

UniProt Q8N122

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 链 W； UniProt 2–661 链 W； UniProt 504–1177 链 Y； UniProt 2–661 链 Y； UniProt 504–1177 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR,Serine/threonine-protein kinase mTOR × 2 （P42345） Target of rapamycin complex subunit LST8 × 2 （Q9BVC4） Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1 × 2 （Q13541） GTP-binding protein Rheb × 2 （Q15382） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6BCU Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5H64 Cryo-EM structure of mTORC1 提交 2016-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–1335（1335 aa）
链 b 1–1335（1335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6BCX mTORC1 structure refined to 3.0 angstroms 提交 2017-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 W 2–1335（1334 aa）
链 Y 2–1335（1334 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
6SB0 cryo-EM structure of mTORC1 bound to PRAS40-fused active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 N 1–1335（1335 aa）
链 Y 1–1335（1335 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM HEPES pH 7.0, 100mM NaCl, 2mM MgCl2, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6SB2 cryo-EM structure of mTORC1 bound to active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 N 1–1335（1335 aa）
链 Y 1–1335（1335 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；100mM Tris-HCl pH7.0, 260mM NaCl, 5mM MgCl2, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
6U62 Raptor-Rag-Ragulator complex 提交 2019-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–1335（1335 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
7OWG human DEPTOR in a complex with mutant human mTORC1 A1459P 提交 2021-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：Octameric
链 Y 1–1335（1335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES, pH 7.5, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, 1 mM MgCl2, 500 uM AMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotting time of 2 s and a force of -15.
分辨率 4.70 Å
7PEA cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, overall refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–1335（1335 aa）
链 F 1–1335（1335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7PEB cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–1335（1335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.67 Å
7PEC cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–1335（1335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.24 Å
7UX2 cryo-EM structure of the Raptor-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–1335（1335 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UXC cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion 提交 2022-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–1335（1335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7UXH cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 E 1–1335（1335 aa）
链 U 1–1335（1335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8ERA RMC-5552 in complex with mTORC1 and FKBP12 提交 2022-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 Y 1–1335（1335 aa）
未记录 XZ9 1-[6-{[(3M)-4-amino-3-(2-amino-1,3-benzoxazol-5-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]methyl}-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-3-hydroxypropan-1-one × 1 XYU (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-5,9,27-trihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-10,21-dimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8RCH CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, overall refinement 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 W 1–1335（1335 aa）
链 Y 1–1335（1335 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RCK CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, Focused on one protomer copy. 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 Y 1–1335（1335 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8RCN CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, Focused region of mTOR and RAPTOR on one protomer copy. 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Y 1–1335（1335 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 C 1–1335（1335 aa）
链 U 1–1335（1335 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9F42 cryo-EM structure of LST2 TOS peptide bound to human mTOR complex 1, focused on RAPTOR 提交 2024-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–1335（1335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
9F43 cryo-EM structure of human LST2 bound to human mTOR complex 1, focused on RAPTOR 提交 2024-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–1335（1335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
9F44 cryo-EM structure of LST2 TOS peptide bound to human mTOR complex 1 提交 2024-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–1335（1335 aa）
链 F 1–1335（1335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
9F45 cryo-EM structure of human LST2 bound to human mTOR complex 1 提交 2024-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–1335（1335 aa）
链 F 1–1335（1335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å

共 21 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPTOR_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 W； PDB构建体 10–669； UniProt 2–661 作者链 W； PDB构建体 670–1343； UniProt 504–1177 作者链 Y； PDB构建体 10–669； UniProt 2–661 作者链 Y； PDB构建体 670–1343； UniProt 504–1177

Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1

Homo sapiens

UniProt Q13541

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 链 X； UniProt 1–118 链 Z； UniProt 1–118 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR,Serine/threonine-protein kinase mTOR × 2 （P42345） Target of rapamycin complex subunit LST8 × 2 （Q9BVC4） Regulatory-associated protein of mTOR,Regulatory-associated protein of mTOR × 2 （Q8N122） GTP-binding protein Rheb × 2 （Q15382） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6BCU Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1WKW Crystal structure of the ternary complex of eIF4E-m7GpppA-4EBP1 peptide 提交 2004-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 47–66（20 aa） 片段：RESIDUES 47-66
未记录 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 4000, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.270
2JGB Structure of human eIF4E homologous protein 4EHP with m7GTP 提交 2007-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 50–66（17 aa） 片段：RESIDUES 50-66
未记录 MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；20% PEG-3000, 0.1M SODIUM CITRATE PH 5.5 WITH 1MM M7GTP IN THE DROP
分辨率 1.70 Å R-free 0.242
2JGC Structure of the human eIF4E homologous protein, 4EHP without ligand bound 提交 2007-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 50–66（17 aa） 片段：RESIDUES 50-66
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；20% PEG-3000, 0.1M SODIUM CITRATE PH 5.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.249
2V8W Crystallographic and mass spectrometric characterisation of eIF4E with N7-cap derivatives 提交 2007-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 50–63（14 aa） 片段：PHAS-I4E-BP1 BINDING PEPTIDE, RESIDUES 50-63
未记录 MGO [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-3-METHYL-4-OXO-5H-IMIDAZO[4,5-C]PYRIDIN-1-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHOXY-HYDROXY-PHOSPHORYL] PHOSPHONO HYDROGEN PHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 2.30 Å R-free 0.243
2V8W Crystallographic and mass spectrometric characterisation of eIF4E with N7-cap derivatives 提交 2007-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 50–63（14 aa） 片段：PHAS-I4E-BP1 BINDING PEPTIDE, RESIDUES 50-63
未记录 MGO [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-3-METHYL-4-OXO-5H-IMIDAZO[4,5-C]PYRIDIN-1-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHOXY-HYDROXY-PHOSPHORYL] PHOSPHONO HYDROGEN PHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 2.30 Å R-free 0.243
2V8X Crystallographic and mass spectrometric characterisation of eIF4E with N7-cap derivatives 提交 2007-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 50–63（14 aa） 片段：PHAS-I4E-BP1 BINDING PEPTIDE, RESIDUES 50-63
未记录 MGQ 7-BENZYL GUANINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；25% PEG 6000, 7% AMMONIUM SULPHATE, 100MM HEPES-KOH PH 7.0
分辨率 2.30 Å R-free 0.259
2V8X Crystallographic and mass spectrometric characterisation of eIF4E with N7-cap derivatives 提交 2007-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 50–63（14 aa） 片段：PHAS-I4E-BP1 BINDING PEPTIDE, RESIDUES 50-63
未记录 MGQ 7-BENZYL GUANINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；25% PEG 6000, 7% AMMONIUM SULPHATE, 100MM HEPES-KOH PH 7.0
分辨率 2.30 Å R-free 0.259
2V8Y Crystallographic and mass spectrometric characterisation of eIF4E with N7-cap derivatives 提交 2007-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 50–63（14 aa） 片段：PHAS-I4E-BP1 BINDING PEPTIDE, RESIDUES 50-63
未记录 MGV P-FLUORO-7-BENZYL GUANINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；25% PEG 6000, 7% AMMONIUM SULPHATE, 100MM HEPES-KOH PH 7.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.250
2V8Y Crystallographic and mass spectrometric characterisation of eIF4E with N7-cap derivatives 提交 2007-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 50–63（14 aa） 片段：PHAS-I4E-BP1 BINDING PEPTIDE, RESIDUES 50-63
未记录 MGV P-FLUORO-7-BENZYL GUANINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；25% PEG 6000, 7% AMMONIUM SULPHATE, 100MM HEPES-KOH PH 7.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.250
3HXG Crystal structure of Schistsome eIF4E complexed with m7GpppA and 4E-BP 提交 2009-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 51–67（17 aa） 片段：residues 51-67
未记录 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；100mM pH 6.5 Mops, 20% PEG4K, 0.2M MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
分辨率 2.10 Å R-free 0.269
3HXI Crystal structure of Schistosome eIF4E complexed with m7GpppG and 4E-BP 提交 2009-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 51–67（17 aa） 片段：residues 51-67
未记录 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100mM pH 6.5 Mops, 20% PEG4K, 0.2M MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.272
3M93 Complex crystal structure of Ascaris suum eIF4E-3 with m7G cap 提交 2010-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 51–67（17 aa） 片段：UNP residues 51-67
未记录 M7G 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；277 K；20% MMG PEG 2000, 0.2 M (NH4)2SO4, and 100 mM Na-Critate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.294
3M94 Complex crystal structure of Ascaris suum eIF4E-3 with m2,2,7G cap 提交 2010-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 51–67（17 aa） 片段：UNP residues 51-67
未记录 M7M N,N,7-trimethylguanosine 5'-(trihydrogen diphosphate) × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% MMG PEG 2000, 0.2 M (NH4)2SO4 and 100 mM Na-Critate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.244
3U7X Crystal structure of the human eIF4E-4EBP1 peptide complex without cap 提交 2011-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 47–66（20 aa） 片段：UNP residues 46-66
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1:1 of (protein stock: 0.0004 M eif4e, 0.001 M 4epb1, 0.004 M ribavirin, 0.02 HEPES, 0.1 M potassium chloride, 0.001 tcep, ph 7.3):(reservoir: 2 M ammonium sulfate, 2% Peg-400, 0.1 M sodium HEPES), vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.224
3U7X Crystal structure of the human eIF4E-4EBP1 peptide complex without cap 提交 2011-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 47–66（20 aa） 片段：UNP residues 46-66
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 UNX UNKNOWN LIGAND × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1:1 of (protein stock: 0.0004 M eif4e, 0.001 M 4epb1, 0.004 M ribavirin, 0.02 HEPES, 0.1 M potassium chloride, 0.001 tcep, ph 7.3):(reservoir: 2 M ammonium sulfate, 2% Peg-400, 0.1 M sodium HEPES), vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.224
3U7X Crystal structure of the human eIF4E-4EBP1 peptide complex without cap 提交 2011-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 47–66（20 aa） 片段：UNP residues 46-66
链 D 47–66（20 aa） 片段：UNP residues 46-66
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 20 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1:1 of (protein stock: 0.0004 M eif4e, 0.001 M 4epb1, 0.004 M ribavirin, 0.02 HEPES, 0.1 M potassium chloride, 0.001 tcep, ph 7.3):(reservoir: 2 M ammonium sulfate, 2% Peg-400, 0.1 M sodium HEPES), vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.224
4UED Complex of human eIF4E with the 4E binding protein 4E-BP1 提交 2014-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 50–83（34 aa） 片段：RESIDUES 50-83
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；0.03M EACH DIETHYLENE GLYCOL, TRIETHYLENE GLYCOL, TETRAETHYLENE GLYCOL, PENTAETHYLENE GLYCOL, 0.1M BICINE/TRIZMA BASE PH 8.5, 12.5% PEG1000, 12.5% PEG3350, 12.5% MPD
分辨率 1.75 Å R-free 0.237
5BXV eIF4E complex 提交 2015-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 43–84（42 aa） 片段：unp residues 50-84
未记录 MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；298 K；0.1 M Tris-HCl, and 22 % polyethylene glycol 4000
分辨率 2.10 Å R-free 0.195
5BXV eIF4E complex 提交 2015-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 43–84（42 aa） 片段：unp residues 50-84
未记录 MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；298 K；0.1 M Tris-HCl, and 22 % polyethylene glycol 4000
分辨率 2.10 Å R-free 0.195
5EKV Co-crystal structure of eIF4E with nucleotide mimetic inhibitor. 提交 2015-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 51–64（14 aa） 片段：eIF4E binding sequence, UNP residues 51-64
未记录 5PQ 3-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-7-methyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-7-ium-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]-4-oxidanyl-cyclobut-3-ene-1,2-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；21-31% PEG 8000, 1-3% (NH4)2SO4, 100 mM HEPES, pH 7.5, 1 round of seeding
分辨率 3.61 Å R-free 0.342
5EKV Co-crystal structure of eIF4E with nucleotide mimetic inhibitor. 提交 2015-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 51–64（14 aa） 片段：eIF4E binding sequence, UNP residues 51-64
未记录 5PQ 3-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-7-methyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-7-ium-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]-4-oxidanyl-cyclobut-3-ene-1,2-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；21-31% PEG 8000, 1-3% (NH4)2SO4, 100 mM HEPES, pH 7.5, 1 round of seeding
分辨率 3.61 Å R-free 0.342
5NVN Crystal structure of the human 4EHP-4E-BP1 complex 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 50–83（34 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6 1.7 M sodium formate
分辨率 1.90 Å R-free 0.251
5NVN Crystal structure of the human 4EHP-4E-BP1 complex 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 50–83（34 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6 1.7 M sodium formate
分辨率 1.90 Å R-free 0.251
5WBJ Crystal structure of the arabidopsis thaliana Raptor in complex with the TOS peptide of human 4EBP1 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 T 99–118（20 aa） 片段：residues 99-118
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate
分辨率 3.00 Å R-free 0.270
6BCX mTORC1 structure refined to 3.0 angstroms 提交 2017-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 X 1–118（118 aa）
链 Z 1–118（118 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
8RCH CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, overall refinement 提交 2023-12-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 X 1–118（118 aa）
链 Z 1–118（118 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RCK CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, Focused on one protomer copy. 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 X 1–118（118 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8RCN CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, Focused region of mTOR and RAPTOR on one protomer copy. 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 X 1–118（118 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 K 1–118（118 aa）
链 T 1–118（118 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å

共 21 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 4EBP1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 X； PDB构建体 5–122； UniProt 1–118 作者链 Z； PDB构建体 5–122； UniProt 1–118

GTP-binding protein Rheb

Homo sapiens

UniProt Q15382

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 链 R； UniProt 1–184 链 S； UniProt 1–184 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR,Serine/threonine-protein kinase mTOR × 2 （P42345） Target of rapamycin complex subunit LST8 × 2 （Q9BVC4） Regulatory-associated protein of mTOR,Regulatory-associated protein of mTOR × 2 （Q8N122） Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1 × 2 （Q13541） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6BCU Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1XTQ Structure of small GTPase human Rheb in complex with GDP 提交 2004-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；potassium dihydrogenphosphate, PEG 8000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.257
1XTR Structure of small GTPase human Rheb in complex with GppNHp 提交 2004-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；potassium dihydrogenphosphate, PEG 8000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.270
1XTS Structure of small GTPase human Rheb in complex with GTP 提交 2004-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；277 K；ammonium dihydrogenphosphate, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.277
3SEA Structure of Rheb-Y35A mutant in GDP- and GMPPNP-bound forms 提交 2011-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 3–169（167 aa） 片段：G-domain
突变：Y35A MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris hydrochloride, 200 mM Sodium acetate trihydrate, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.214
3SEA Structure of Rheb-Y35A mutant in GDP- and GMPPNP-bound forms 提交 2011-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 3–169（167 aa） 片段：G-domain
突变：Y35A MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris hydrochloride, 200 mM Sodium acetate trihydrate, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.214
3SEA Structure of Rheb-Y35A mutant in GDP- and GMPPNP-bound forms 提交 2011-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–169（167 aa） 片段：G-domain
链 B 3–169（167 aa） 片段：G-domain
突变：Y35A 突变：Y35A MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris hydrochloride, 200 mM Sodium acetate trihydrate, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.214
3T5G Structure of fully modified farnesylated Rheb in complex with PDE6D 提交 2011-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–181（181 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FAR FARNESYL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M Tris 8.5, and 12.5 % PEG8000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.235
5YXH Structure of Rheb-GDP 提交 2017-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–169（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；25% w/v PEG 1500
分辨率 2.04 Å R-free 0.299
5YXH Structure of Rheb-GDP 提交 2017-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–169（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；25% w/v PEG 1500
分辨率 2.04 Å R-free 0.299
5YXH Structure of Rheb-GDP 提交 2017-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 2–169（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；25% w/v PEG 1500
分辨率 2.04 Å R-free 0.299
5YXH Structure of Rheb-GDP 提交 2017-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 2–169（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；25% w/v PEG 1500
分辨率 2.04 Å R-free 0.299
6BSX CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 AT 1.65A RESOLUTION 提交 2017-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：RHEB VCID 10367
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 E7S (5,6-dimethyl-1H-benzimidazol-2-yl)methanol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.8；293 K；28% PEG4000, 0.2M SODIUM ACETATE, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.8, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 1.65 Å R-free 0.244
6BSX CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 AT 1.65A RESOLUTION 提交 2017-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：RHEB VCID 10367
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 E7S (5,6-dimethyl-1H-benzimidazol-2-yl)methanol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.8；293 K；28% PEG4000, 0.2M SODIUM ACETATE, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.8, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 1.65 Å R-free 0.244
6BSX CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 AT 1.65A RESOLUTION 提交 2017-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa） 片段：RHEB VCID 10367
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 E7S (5,6-dimethyl-1H-benzimidazol-2-yl)methanol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.8；293 K；28% PEG4000, 0.2M SODIUM ACETATE, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.8, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 1.65 Å R-free 0.244
6BSX CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 AT 1.65A RESOLUTION 提交 2017-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa） 片段：RHEB VCID 10367
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 E7S (5,6-dimethyl-1H-benzimidazol-2-yl)methanol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.8；293 K；28% PEG4000, 0.2M SODIUM ACETATE, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.8, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 1.65 Å R-free 0.244
6BT0 CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND NR1 提交 2017-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；19% PEG 1500, 0.1M Na acetate pH 5.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.316
6BT0 CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND NR1 提交 2017-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 E7V 4-bromo-6-[(3,4-dichlorophenyl)sulfanyl]-1-{[4-(dimethylcarbamoyl)phenyl]methyl}-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；19% PEG 1500, 0.1M Na acetate pH 5.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.316
6BT0 CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND NR1 提交 2017-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；19% PEG 1500, 0.1M Na acetate pH 5.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.316
6BT0 CRYSTAL STRUCTURE OF RHEB IN COMPLEX WITH COMPOUND NR1 提交 2017-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；19% PEG 1500, 0.1M Na acetate pH 5.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.316
7BTA Crystal structure of Rheb D60K mutant bound to GDP 提交 2020-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
突变：D60K GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；290 K；0.2 M NaH2PO4: 16% PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.256
7BTA Crystal structure of Rheb D60K mutant bound to GDP 提交 2020-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
突变：D60K GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；290 K；0.2 M NaH2PO4: 16% PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.256
7BTC Crystal structure of Rheb Y35N mutant bound to GDP 提交 2020-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
突变：Y35N GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；290 K；0.10% n-Octyl-beta-D-glucoside: 0.1 M Sodium citrate tribasic, pH 5.5: 22% PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.233
7BTC Crystal structure of Rheb Y35N mutant bound to GDP 提交 2020-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
突变：Y35N GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；290 K；0.10% n-Octyl-beta-D-glucoside: 0.1 M Sodium citrate tribasic, pH 5.5: 22% PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.233
7BTC Crystal structure of Rheb Y35N mutant bound to GDP 提交 2020-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
突变：Y35N GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；290 K；0.10% n-Octyl-beta-D-glucoside: 0.1 M Sodium citrate tribasic, pH 5.5: 22% PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.233
7BTC Crystal structure of Rheb Y35N mutant bound to GDP 提交 2020-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
突变：Y35N GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；290 K；0.10% n-Octyl-beta-D-glucoside: 0.1 M Sodium citrate tribasic, pH 5.5: 22% PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.233
7BTD Crystal structure of Rheb Y35N mutant bound to GppNHp 提交 2020-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
突变：Y35N MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；290 K；0.2 M Ammonium acetate: 0.1 M HEPES, pH 7.5: 25% PEG 3350.
分辨率 2.00 Å R-free 0.208
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 L 1–184（184 aa）
链 N 1–184（184 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9ED7 Active state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 1–184（184 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
9ED8 Intermediate state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 1–184（184 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.61 Å

共 14 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RHEB_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 R； PDB构建体 5–188； UniProt 1–184 作者链 S； PDB构建体 5–188； UniProt 1–184

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6bcu

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6bcu
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6bcu
沉积日期 deposition_date2017-10-20
结构标题 titleCryo-EM structure of the activated RHEB-mTORC1 refined to 3.4 angstrom
关键词 keywordsPIKK, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier76.78 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron76.19 Å
零角强度 I(0) i09792750000.00
分子量 molecular_weight849000.0 kDa
排除体积 excluded_volume1066200 ų
包络体积 envelope_volume1719800 ų
水化壳体积 shell_volume189470 ų
包络直径 envelope_diameter280.9 Å
壳层 Rg shell_rg77.24 Å
包络 Rg envelope_rg74.02 Å
形状 Rg shape_rg76.21 Å
总 Rg total_rg76.12 Å
总原子数 total_atoms119740
残基数 n_residues7494
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax264.6 Å
Rg (实空间) rg_real79.44 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.60 Å
I(0) (实空间) i0_real9.7930e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.9810e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal76.92 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal9796000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9104
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary92.6 Å
偏度 Skewness skewness0.475
峰度 Kurtosis kurtosis0.101
角度范围 angular_range— – 0.1000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.9817
最高正则化参数 α highest_alpha435800000.0000
实空间数据点数 n_real_points21
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.850; Stabil: 0.910; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.966; Smooth: 0.745
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)