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6crg

Crystal Structure of Shp2 E76K GOF Mutant in complex with SHP099

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 132.5 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11

Homo sapiens

UniProt Q06124

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–525 突变：E76K 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Tris pH 8.5, 30% PEG 4000, and 0.2 M LiSO4 分辨率 2.75 Å R-free 0.250
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–525 突变：E76K 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Tris pH 8.5, 30% PEG 4000, and 0.2 M LiSO4 分辨率 2.75 Å R-free 0.250

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6CRG Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2SHP TYROSINE PHOSPHATASE SHP-2 提交 1997-12-01 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
突变：T2K, F41L, F513S, DEL(528-593) CAT DODECANE-TRIMETHYLAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.270
2SHP TYROSINE PHOSPHATASE SHP-2 提交 1997-12-01 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
突变：T2K, F41L, F513S, DEL(528-593) CAT DODECANE-TRIMETHYLAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.270
3B7O Crystal structure of the human tyrosine phosphatase SHP2 (PTPN11) with an accessible active site 提交 2007-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 237–529（293 aa） 片段：;'Residues 237-529 (Isoform 2)' ;
未记录 MLT D-MALATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.15 M Na Malate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.209
3MOW Crystal structure of SHP2 in complex with a tautomycetin analog TTN D-1 提交 2010-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 262–532（271 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN (UNP RESIDUES 262-528)
未记录 B2B (2Z)-2-[(1R)-3-{[(1R,2S,3R,6S,7S,10S,12S,15E,17E)-18-carboxy-16-ethyl-3,7-dihydroxy-1,2,6,10,12-pentamethyl-5-oxooctade ca-15,17-dien-1-yl]oxy}-1-hydroxy-3-oxopropyl]-3-methylbut-2-enedioic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；25% w/v polyethylene glycol 3350, 100 mM sodium chloride, and 100 mM HEPES buffer (pH 7.5), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.222
3O5X Crystal structure of the oncogenic tyrosine phosphatase SHP2 complexed with a salicylic acid-based small molecule inhibitor 提交 2010-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 262–532（271 aa） 片段：UNP RESIDUES 262-532, CATALYTIC DOMAIN
未记录 JZG 3-{1-[3-(biphenyl-4-ylamino)-3-oxopropyl]-1H-1,2,3-triazol-4-yl}-6-hydroxy-1-methyl-2-phenyl-1H-indole-5-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20%PEG3350,1%v/v Tacsimate pH7.0, 100mM NaCl, 100 mM HEPES, pH7.5 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.238
3TKZ Structure of the SHP-2 N-SH2 domain in a 1:2 complex with RVIpYFVPLNR peptide 提交 2011-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain (UNP residues 1-106)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；20% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris, 0.2M Li2SO4, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.80 Å R-free 0.216
3TL0 Structure of SHP2 N-SH2 domain in complex with RLNpYAQLWHR peptide 提交 2011-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain, (UNP residues 1-106)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；20% PEG 3350, 0.1 M bis-Tris, 0.2 M Li2SO4, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.05 Å R-free 0.234
3ZM0 Catalytic domain of human SHP2 提交 2013-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 248–527（280 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 248-527
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 16-22 % (W/V) PEG3350, 0.1-0.2 M SODIUM CITRATE
分辨率 1.50 Å R-free 0.213
3ZM1 Catalytic domain of human SHP2 提交 2013-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 248–527（280 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 248-527
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 16-22% (W/V) PEG3350, 0.1-0.2 M SODIUM CITRATE
分辨率 1.40 Å R-free 0.203
3ZM2 Catalytic domain of human SHP2 提交 2013-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 248–527（280 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 248-527
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 16-22% (W/V) PEG3350 0.1-0.2 M SODIUM CITRATE
分辨率 1.50 Å R-free 0.223
3ZM3 Catalytic domain of human SHP2 提交 2013-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 248–531（284 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 248-527
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 16-22% (W/V) PEG3350, 0.1-0.2 M SODIUM CITRATE
分辨率 1.50 Å R-free 0.227
4DGP The wild-type Src homology 2 (SH2)-domain containing protein tyrosine phosphatase-2 (SHP2) 提交 2012-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2, and PTP domains (UNP residues 1-532)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；20% PEG3350, 300 mM potassium formate, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.255
4DGX LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/Y279C mutant 提交 2012-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2, and PTP domains (UNP residues 1-532)
突变：Y279C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；20% PEG3350, 300 mM potassium formate, 10 mM calcium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.266
4GWF Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with Y279C mutation 提交 2012-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–543（543 aa） 片段：UNP residues 22-560
突变：Y279C EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1M Tris buffer pH8.0, 15% PEG4000, 0.02M DDT, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.243
4GWF Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with Y279C mutation 提交 2012-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–543（543 aa） 片段：UNP residues 22-560
突变：Y279C EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1M Tris buffer pH8.0, 15% PEG4000, 0.02M DDT, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.243
4H1O Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with D61G mutation 提交 2012-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–543（543 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 and Phosphatase domain
突变：D61G EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.9；293 K；0.02M DDT, 0.1M Tris pH7.9, 13% PEG4000, 0.1M LiCl , VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.233
4H34 Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with Q506P mutation 提交 2012-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–543（543 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 and Phosphatase domain
突变：Q506P EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.02M DDT, 0.1M Tris pH8.0, 19% PEG4000, 10% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.242
4JE4 Crystal Structure of Monobody NSa1/SHP2 N-SH2 Domain Complex 提交 2013-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–103（103 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl, 0.2M Magnesium Chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.31 Å R-free 0.255
4JEG Crystal Structure of Monobody CS1/SHP2 C-SH2 Domain Complex 提交 2013-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 97–217（121 aa） 片段：C-terminal SH2 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis-tris, 0.2M Sodium Chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.227
4JMG Crystal structure of the synthetic protein in complex with pY peptide 提交 2013-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 579–591（13 aa） 片段：unp residues 579-591
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；30% (w/v) PEG3000, 0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.40 Å R-free 0.206
4NWF Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with N308D mutation 提交 2013-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–543（543 aa） 片段：UNP residues 1-543
突变：N308D EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.6；293 K；13% PEG4000, 0.1M Tris buffer, 10% glycerol, 0.02M DDT, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.309
4NWF Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with N308D mutation 提交 2013-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–543（543 aa） 片段：UNP residues 1-543
突变：N308D EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.6；293 K；13% PEG4000, 0.1M Tris buffer, 10% glycerol, 0.02M DDT, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.309
4NWG Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with E139D mutation 提交 2013-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–543（543 aa） 片段：UNP residues 1-543
突变：E139D EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；14.5% PEG4000, 0.1M Tris buffer, 0.02M DDT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.45 Å R-free 0.326
4NWG Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with E139D mutation 提交 2013-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–543（543 aa） 片段：UNP residues 1-543
突变：E139D EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；14.5% PEG4000, 0.1M Tris buffer, 0.02M DDT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.45 Å R-free 0.326
4OHD LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/A461T mutant 提交 2014-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 AND PTP DOMAIN
突变：A461T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；18% PEG3350, 300 mM KF, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.271
4OHE LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/G464A mutant 提交 2014-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 AND PTP DOMAIN
突变：G464A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；20% PEG3350, 300 mM LiCl, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.51 Å R-free 0.256
4OHH LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/Q506P mutant 提交 2014-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 AND PTP DOMAIN
突变：Q506P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；20% PEG3350, 200 mM KF, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
4OHI LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/Q510E mutant 提交 2014-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 AND PTP DOMAIN
突变：Q510E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；18% PEG3350, 200 mM KF, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.262
4OHL LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/T468M mutant 提交 2014-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 AND PTP DOMAIN
突变：T468M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；20% PEG3350, 300 mM KCOOH, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
4OHL LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/T468M mutant 提交 2014-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 AND PTP DOMAIN
突变：T468M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；20% PEG3350, 300 mM KCOOH, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
4PVG Crystal structure of protein tyrosine phosphatase Shp2 catalytic domain complex with small molecular compound L88N79 提交 2014-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 240–532（293 aa）
未记录 2WT 2-[3-({4-[(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)amino]-4-oxobutanoyl}amino)phenyl]-6-hydroxy-3-iodo-1-methyl-1H-indole-5-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；298 K；30% w/v polyethylene glycol 3350, 100 mM NaCl, 1mM L88N79 and 100mM HEPES (pH 7.7) , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.286
4QSY SHP2 SH2 domain in complex with GAB1 peptide 提交 2014-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：SH2 domain, UNP residues 1-104
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；25% PEG3000, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4RDD Co-crystal structure of SHP2 in complex with a Cefsulodin derivative 提交 2014-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 262–532（271 aa） 片段：SHP2 CATALYTIC DOMAIN
未记录 3LU 1-({(2R)-4-carboxy-2-[(R)-carboxy{[(2R)-2-phenyl-2-sulfoacetyl]amino}methyl]-3,6-dihydro-2H-1,3-thiazin-5-yl}methyl)pyridinium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.4；293 K；20% PEG3350, 33 mM citric acid, 67 mM BIS-TRIS propane, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.201
5BK8 Cancer-associated SHP2/T507K mutant 提交 2019-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
突变：T507K 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG3350, 200 mM LiCl
分辨率 2.25 Å R-free 0.262
5DF6 Crystal structure of PTPN11 tandem SH2 domains in complex with a TXNIP peptide 提交 2015-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–222（222 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；20% PEG-3350, 0.2 M ammonium formate
分辨率 1.78 Å R-free 0.248
5EHP Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP836 提交 2015-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa） 片段：UNP residues 1-525
未记录 5OA 5-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-2-[(3~{R},5~{S})-3,5-dimethylpiperazin-1-yl]pyrimidin-4-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG 3350, 200mM Ammonium Phosphate
分辨率 1.85 Å R-free 0.208
5EHP Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP836 提交 2015-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa） 片段：UNP residues 1-525
未记录 5OA 5-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-2-[(3~{R},5~{S})-3,5-dimethylpiperazin-1-yl]pyrimidin-4-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG 3350, 200mM Ammonium Phosphate
分辨率 1.85 Å R-free 0.208
5EHR Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP099 提交 2015-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa） 片段：UNP residues 1-525
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200mM Ammonium Phosphate
分辨率 1.70 Å R-free 0.221
5EHR Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP099 提交 2015-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa） 片段：UNP residues 1-525
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200mM Ammonium Phosphate
分辨率 1.70 Å R-free 0.221
5I6V Structure of F285S, a Cancer-Associated Mutation of the Oncogenic Phosphatase SHP2 提交 2016-02-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
突变：F285S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；297 K；0.2M Sodium Malonate, pH7.0, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.87 Å R-free 0.232
5I6V Structure of F285S, a Cancer-Associated Mutation of the Oncogenic Phosphatase SHP2 提交 2016-02-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
突变：F285S GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；297 K；0.2M Sodium Malonate, pH7.0, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.87 Å R-free 0.232
5IBM Structure of S502P, a Cancer-Associated Mutation of the Oncogenic Phosphatase SHP2 提交 2016-02-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
突变：S502P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris, 20% PEG 3350 and 1 mM TCEP
分辨率 2.18 Å R-free 0.240
5IBM Structure of S502P, a Cancer-Associated Mutation of the Oncogenic Phosphatase SHP2 提交 2016-02-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
突变：S502P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris, 20% PEG 3350 and 1 mM TCEP
分辨率 2.18 Å R-free 0.240
5IBS Structure of E76Q, a Cancer-Associated Mutation of the Oncogenic Phosphatase SHP2 提交 2016-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa） 片段：UNP residues 1-525
突变：E76Q 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris, 20% PEG 3350 and 1 mM TCEP
分辨率 2.32 Å R-free 0.238
5IBS Structure of E76Q, a Cancer-Associated Mutation of the Oncogenic Phosphatase SHP2 提交 2016-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa） 片段：UNP residues 1-525
突变：E76Q 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris, 20% PEG 3350 and 1 mM TCEP
分辨率 2.32 Å R-free 0.238
5X7B Crystal structure of SHP2_SH2-CagA EPIYA_C peptide complex 提交 2017-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–220（220 aa） 片段：SH2 (UNP RESIDUES 1-220)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；29%(w/v) PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, 0.13 M sodium acetate
分辨率 2.45 Å R-free 0.278
5X94 Crystal structure of SHP2_SH2-CagA EPIYA_D peptide complex 提交 2017-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–220（220 aa） 片段：SH2 domain (UNP RESIDUES 1-220)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；31% PEG 4000, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.60 Å R-free 0.246
5X94 Crystal structure of SHP2_SH2-CagA EPIYA_D peptide complex 提交 2017-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–220（220 aa） 片段：SH2 domain (UNP RESIDUES 1-220)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；31% PEG 4000, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.60 Å R-free 0.246
5XZR The atomic structure of SHP2 E76A mutant in complex with allosteric inhibitor 9b 提交 2017-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–534（534 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-534
未记录 8J6 4-(3-phenylphenyl)-N-(2,2,6,6-tetramethylpiperidin-4-yl)-1,3-thiazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Sodium formate, 0.1 M Bicine pH 8.5, 15% w/v PEG 5000MME
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
6ATD Oxidized SHP2 forms a disulfide bond between Cys367 and Cys459 提交 2017-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–526（526 aa） 片段：residues 1-526
突变：N308D PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.1；277 K；0.2 M sodium phosphate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
6ATD Oxidized SHP2 forms a disulfide bond between Cys367 and Cys459 提交 2017-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–526（526 aa） 片段：residues 1-526
突变：N308D PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.1；277 K；0.2 M sodium phosphate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
6BMR Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP244 提交 2017-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 DZV 4-[(2-chlorophenyl)methyl]-1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-5(4H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.21 Å R-free 0.224
6BMR Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP244 提交 2017-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 DZV 4-[(2-chlorophenyl)methyl]-1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-5(4H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.21 Å R-free 0.224
6BMU Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitors SHP099 and SHP244 提交 2017-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 DZV 4-[(2-chlorophenyl)methyl]-1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-5(4H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.12 Å R-free 0.225
6BMU Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitors SHP099 and SHP244 提交 2017-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 DZV 4-[(2-chlorophenyl)methyl]-1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-5(4H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.12 Å R-free 0.225
6BMV Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP504 提交 2017-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 DZS 3-{4-[(2-chlorophenyl)methyl]-5-oxo-4,5-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-1-yl}-4-hydroxybenzoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.05 Å R-free 0.223
6BMV Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP504 提交 2017-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 DZS 3-{4-[(2-chlorophenyl)methyl]-5-oxo-4,5-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-1-yl}-4-hydroxybenzoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.05 Å R-free 0.223
6BMW Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitors SHP099 and SHP504 提交 2017-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 DZS 3-{4-[(2-chlorophenyl)methyl]-5-oxo-4,5-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-1-yl}-4-hydroxybenzoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6BMW Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitors SHP099 and SHP504 提交 2017-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 DZS 3-{4-[(2-chlorophenyl)methyl]-5-oxo-4,5-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-1-yl}-4-hydroxybenzoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6BMX Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP844 提交 2017-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 DYV 1-(3-chloro-4-{[1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)-5-oxo[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-4(5H)-yl]methyl}benzene-1-carbonyl)-L-proline × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.42 Å R-free 0.252
6BMX Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP844 提交 2017-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 DYV 1-(3-chloro-4-{[1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)-5-oxo[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-4(5H)-yl]methyl}benzene-1-carbonyl)-L-proline × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.42 Å R-free 0.252
6BMY Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitors SHP099 and SHP844 提交 2017-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 DYV 1-(3-chloro-4-{[1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)-5-oxo[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-4(5H)-yl]methyl}benzene-1-carbonyl)-L-proline × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.09 Å R-free 0.228
6BMY Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitors SHP099 and SHP844 提交 2017-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 DYV 1-(3-chloro-4-{[1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)-5-oxo[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-4(5H)-yl]methyl}benzene-1-carbonyl)-L-proline × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.09 Å R-free 0.228
6BN5 Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 F285S in Complex with Allosteric Inhibitor JLR-2 提交 2017-11-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
突变：F285S DZJ 3-benzyl-8-chloro-2-hydroxy-4H-pyrimido[2,1-b][1,3]benzothiazol-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；298.15 K；100 mM Tris pH 8.6, 20% PEG 3350, 1 mM TCEP
分辨率 2.22 Å R-free 0.292
6BN5 Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 F285S in Complex with Allosteric Inhibitor JLR-2 提交 2017-11-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
突变：F285S DZJ 3-benzyl-8-chloro-2-hydroxy-4H-pyrimido[2,1-b][1,3]benzothiazol-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；298.15 K；100 mM Tris pH 8.6, 20% PEG 3350, 1 mM TCEP
分辨率 2.22 Å R-free 0.292
6CMP Closed structure of inactive SHP2 mutant C459E 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–529（529 aa）
突变：C459E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；200 mM lithium nitrate, 20% PEG 3,350
分辨率 1.80 Å R-free 0.231
6CMP Closed structure of inactive SHP2 mutant C459E 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–529（529 aa）
突变：C459E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；200 mM lithium nitrate, 20% PEG 3,350
分辨率 1.80 Å R-free 0.231
6CMQ Structure of human SHP2 without N-SH2 domain 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 106–529（424 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM ammonium formate, 22% PEG 3,350 and 1.5% xylitol
分辨率 2.90 Å R-free 0.276
6CMQ Structure of human SHP2 without N-SH2 domain 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 106–529（424 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM ammonium formate, 22% PEG 3,350 and 1.5% xylitol
分辨率 2.90 Å R-free 0.276
6CMQ Structure of human SHP2 without N-SH2 domain 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 106–529（424 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM ammonium formate, 22% PEG 3,350 and 1.5% xylitol
分辨率 2.90 Å R-free 0.276
6CMQ Structure of human SHP2 without N-SH2 domain 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 106–529（424 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM ammonium formate, 22% PEG 3,350 and 1.5% xylitol
分辨率 2.90 Å R-free 0.276
6CMR Closed structure of active SHP2 mutant E76D bound to SHP099 inhibitor 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–529（529 aa）
突变：E76D 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；15% PEG 20,000 and 10 mM potassium hydrogen tartrate
分辨率 2.21 Å R-free 0.261
6CMS Closed structure of active SHP2 mutant E76K bound to SHP099 inhibitor 提交 2018-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–529（529 aa）
突变：E76K 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；291 K；100 mM bicine pH 9, 100 mM NaCl, 19 % PEG MME 550
分辨率 2.68 Å R-free 0.265
6CRF Crystal Structure of Shp2 E76K GOF Mutant in the Open Conformation 提交 2018-03-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
突变：E76K 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M MES pH 6.5, 12% PEG 20,000, and 5% Sucrose
分辨率 2.62 Å R-free 0.237
6CRF Crystal Structure of Shp2 E76K GOF Mutant in the Open Conformation 提交 2018-03-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
突变：E76K GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M MES pH 6.5, 12% PEG 20,000, and 5% Sucrose
分辨率 2.62 Å R-free 0.237
6MD7 Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrimidinone 7 提交 2018-09-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 JE1 2-[4-(aminomethyl)-4-methylpiperidin-1-yl]-5-{[2-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]sulfanyl}pyrimidin-4(3H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 1.96 Å R-free 0.209
6MD7 Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrimidinone 7 提交 2018-09-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 JE1 2-[4-(aminomethyl)-4-methylpiperidin-1-yl]-5-{[2-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]sulfanyl}pyrimidin-4(3H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 1.96 Å R-free 0.209
6MD9 NON-RECEPTOR PROTEIN TYROSINE PHOSPHATASE SHP2 IN COMPLEX WITH ALLOSTERIC INHIBITOR Isoxazolo-pyridinone 3 提交 2018-09-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 JEJ 3-(2-chlorophenyl)-6-{4-[(dimethylamino)methyl]phenyl}-5-methyl[1,2]oxazolo[4,5-c]pyridin-4(5H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.12 Å R-free 0.272
6MD9 NON-RECEPTOR PROTEIN TYROSINE PHOSPHATASE SHP2 IN COMPLEX WITH ALLOSTERIC INHIBITOR Isoxazolo-pyridinone 3 提交 2018-09-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 JEJ 3-(2-chlorophenyl)-6-{4-[(dimethylamino)methyl]phenyl}-5-methyl[1,2]oxazolo[4,5-c]pyridin-4(5H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.12 Å R-free 0.272
6MDA Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrazolo-pyridine 4 提交 2018-09-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 JED 3-(4-bromophenyl)-6-(4-methylphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carboxylic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.21 Å R-free 0.251
6MDA Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrazolo-pyridine 4 提交 2018-09-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 JED 3-(4-bromophenyl)-6-(4-methylphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carboxylic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.21 Å R-free 0.251
6MDB Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrazolo-pyrimidinone 5 提交 2018-09-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 JE4 6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-3-(2,3-dichlorophenyl)-5-methyl-1,5-dihydro-4H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.34 Å R-free 0.236
6MDB Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrazolo-pyrimidinone 5 提交 2018-09-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 JE4 6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-3-(2,3-dichlorophenyl)-5-methyl-1,5-dihydro-4H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.34 Å R-free 0.236
6MDC Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrazolo-pyrimidinone 1 SHP389 提交 2018-09-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 JEA 6-[(3S,4S)-4-amino-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-3-[3-chloro-2-(cyclopropylamino)pyridin-4-yl]-5-methyl-2,5-dihydro-4H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.14 Å R-free 0.239
6MDC Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrazolo-pyrimidinone 1 SHP389 提交 2018-09-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 JEA 6-[(3S,4S)-4-amino-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-3-[3-chloro-2-(cyclopropylamino)pyridin-4-yl]-5-methyl-2,5-dihydro-4H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.14 Å R-free 0.239
6MDD Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Imidazo-pyridine 24 提交 2018-09-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 JE7 5-[(2,3-dichlorophenyl)sulfanyl]-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.05 Å R-free 0.251
6MDD Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Imidazo-pyridine 24 提交 2018-09-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 JE7 5-[(2,3-dichlorophenyl)sulfanyl]-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.05 Å R-free 0.251
6R5G C-SH2 domain of SHP-2 in complex with phospho-ITSM of PD-1 提交 2019-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–220（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 800 uM [U-13C; U-15N] C-SH2 domain of SHP-2, 1000 uM ITSM, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 800 uM [U-13C; U-15N] C-SH2 domain of SHP-2, 640 uM ITSM, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6ROY Structure of the N-SH2 domain of the human tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 in complex with the phosphorylated immune receptor tyrosine-based inhibitory motif 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 3–104（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；291 K；31.7% (w/v) PEG3350, 0.1 M HEPES, 0.233 M MgSO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.279
6ROY Structure of the N-SH2 domain of the human tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 in complex with the phosphorylated immune receptor tyrosine-based inhibitory motif 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–104（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；291 K；31.7% (w/v) PEG3350, 0.1 M HEPES, 0.233 M MgSO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.279
6ROZ Structure of the N-SH2 domain of the human tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 in complex with the phosphorylated immune receptor tyrosine-based switch motif 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 3–104（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；293 K；31.7% (w/v) PEG 3350, 0.1 M HEPES, 0.233 M MgSO4
分辨率 2.89 Å R-free 0.285
6ROZ Structure of the N-SH2 domain of the human tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 in complex with the phosphorylated immune receptor tyrosine-based switch motif 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 3–104（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；293 K；31.7% (w/v) PEG 3350, 0.1 M HEPES, 0.233 M MgSO4
分辨率 2.89 Å R-free 0.285
6WU8 Structure of human SHP2 in complex with inhibitor IACS-13909 提交 2020-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–530（530 aa）
未记录 U9Y 1-[3-(2,3-dichlorophenyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.270
6WU8 Structure of human SHP2 in complex with inhibitor IACS-13909 提交 2020-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–530（530 aa）
未记录 U9Y 1-[3-(2,3-dichlorophenyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.270
7EMN The atomic structure of SHP2 E76A mutant 提交 2021-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–534（534 aa）
突变：E76A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M sodium formate, 0.1 M Bicine ph 8.5, 15% w/v PEG 5000MME
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
7EMN The atomic structure of SHP2 E76A mutant 提交 2021-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–534（534 aa）
突变：E76A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M sodium formate, 0.1 M Bicine ph 8.5, 15% w/v PEG 5000MME
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
7JVM Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor TNO155 提交 2020-08-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 VKS (3S,4S)-8-{6-amino-5-[(2-amino-3-chloropyridin-4-yl)sulfanyl]pyrazin-2-yl}-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-4-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；17% PEG 3350 and 200 mM ammonium phosphate
分辨率 2.17 Å R-free 0.236
7JVM Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor TNO155 提交 2020-08-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 VKS (3S,4S)-8-{6-amino-5-[(2-amino-3-chloropyridin-4-yl)sulfanyl]pyrazin-2-yl}-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-4-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；17% PEG 3350 and 200 mM ammonium phosphate
分辨率 2.17 Å R-free 0.236
7JVN Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Compound 24 提交 2020-08-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 VKP 6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-3-[(2,3-dichlorophenyl)sulfanyl]pyrazin-2-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；17% PEG 3350 and 200 mM ammonium phosphate
分辨率 1.92 Å R-free 0.214
7JVN Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Compound 24 提交 2020-08-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 VKP 6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-3-[(2,3-dichlorophenyl)sulfanyl]pyrazin-2-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；17% PEG 3350 and 200 mM ammonium phosphate
分辨率 1.92 Å R-free 0.214
7PPL SHP2 catalytic domain in complex with IRS1 (625-639) phosphopeptide (pTyr-632, pSer-636) 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 246–314（69 aa）
链 A 324–528（205 aa）
突变：catalytic inactivation: C213S 突变：catalytic inactivation: C213S GOL GLYCEROL × 5 EOH ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 100mM HEPES buffer pH 7.5, 50mM EDTA
分辨率 1.53 Å R-free 0.197
7PPM SHP2 catalytic domain in complex with IRS1 (889-901) phosphopeptide (pSer-892, pTyr-896) 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 246–314（69 aa）
链 A 324–528（205 aa）
突变：catalytic inactivation: C213S 突变：catalytic inactivation: C213S GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；10% PEG 20000, 100mM Citrate buffer pH 5.5, EDTA 50mM
分辨率 1.48 Å R-free 0.196
7PPN SHP2 catalytic domain in complex with CD28 (183-198) phosphopeptide (pTyr-191, p-Thr-195) 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 246–314（69 aa）
链 A 324–528（205 aa）
突变：catalytic inactivation: C213S 突变：catalytic inactivation: C213S GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；10% PEG 20000, 100 mM Citrate buffer pH 5.5, 50 mM EDTA
分辨率 1.90 Å R-free 0.207
7R75 Structure of human SHP2 in complex with compound 16 提交 2021-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–530（530 aa）
未记录 33I 6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-3-(3-chlorophenyl)-1,5-dihydro-4H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.289
7R7D Structure of human SHP2 in complex with compound 22 提交 2021-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–530（530 aa）
未记录 37I 4-[6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-3-yl]-3-chloro-N-methylpyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.260
7R7D Structure of human SHP2 in complex with compound 22 提交 2021-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–530（530 aa）
未记录 37I 4-[6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-3-yl]-3-chloro-N-methylpyridin-2-amine × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.260
7R7I Structure of human SHP2 in complex with compound 27 提交 2021-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–530（530 aa）
未记录 3CW [3-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-6-(2,3-dichlorophenyl)-5-methylpyrazin-2-yl]methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.292
7R7I Structure of human SHP2 in complex with compound 27 提交 2021-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–530（530 aa）
未记录 3CW [3-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-6-(2,3-dichlorophenyl)-5-methylpyrazin-2-yl]methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.292
7R7L Structure of human SHP2 in complex with compound 30 提交 2021-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–530（530 aa）
未记录 3ED 6-[(3S,4S)-4-amino-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-3-(2,3-dichlorophenyl)-2-methylpyrimidin-4(3H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.286
7R7L Structure of human SHP2 in complex with compound 30 提交 2021-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–530（530 aa）
未记录 3ED 6-[(3S,4S)-4-amino-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-3-(2,3-dichlorophenyl)-2-methylpyrimidin-4(3H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.286
7RCT Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor RMC-4550 提交 2021-07-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 4Q4 {3-[(3S,4S)-4-amino-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-6-(2,3-dichlorophenyl)-5-methylpyrazin-2-yl}methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Sodium Chloride 0.1 M BIS-TRIS propane pH 8.5 11% PEG 1500
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
7RCT Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor RMC-4550 提交 2021-07-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 4Q4 {3-[(3S,4S)-4-amino-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-6-(2,3-dichlorophenyl)-5-methylpyrazin-2-yl}methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Sodium Chloride 0.1 M BIS-TRIS propane pH 8.5 11% PEG 1500
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
7TVJ Crystal Structure of Monobody Mb(SHP2PTP_13)/SHP2 PTP Domain Complex 提交 2022-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 224–525（302 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；292 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 2% Tascimate, 16% PEG3350
分辨率 2.39 Å R-free 0.259
7TVJ Crystal Structure of Monobody Mb(SHP2PTP_13)/SHP2 PTP Domain Complex 提交 2022-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 224–525（302 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；292 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 2% Tascimate, 16% PEG3350
分辨率 2.39 Å R-free 0.259
7VXG Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor TK-453 提交 2021-11-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 83Q 6-[4-(aminomethyl)-4-methyl-piperidin-1-yl]-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]sulfanyl-pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；295 K；100mM Tris-HCl pH 8.2, 12% (vol/vol) PEG 4000, 20mM DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.325
7VXG Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor TK-453 提交 2021-11-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 83Q 6-[4-(aminomethyl)-4-methyl-piperidin-1-yl]-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]sulfanyl-pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；295 K；100mM Tris-HCl pH 8.2, 12% (vol/vol) PEG 4000, 20mM DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.325
7VXG Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor TK-453 提交 2021-11-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–525（525 aa）
未记录 83Q 6-[4-(aminomethyl)-4-methyl-piperidin-1-yl]-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]sulfanyl-pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；295 K；100mM Tris-HCl pH 8.2, 12% (vol/vol) PEG 4000, 20mM DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.325
7VXG Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor TK-453 提交 2021-11-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–525（525 aa）
未记录 83Q 6-[4-(aminomethyl)-4-methyl-piperidin-1-yl]-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]sulfanyl-pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；295 K；100mM Tris-HCl pH 8.2, 12% (vol/vol) PEG 4000, 20mM DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.325
7XHQ Small-molecule Allosteric Regulation Mechanism of SHP2 提交 2022-04-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 FIZ 2-[(3S,4R)-4-azanyl-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-5-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-3-methyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 13%-18% PEG 4000
分辨率 2.20 Å R-free 0.275
7XHQ Small-molecule Allosteric Regulation Mechanism of SHP2 提交 2022-04-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 FIZ 2-[(3S,4R)-4-azanyl-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-5-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-3-methyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 13%-18% PEG 4000
分辨率 2.20 Å R-free 0.275
8B5Y SHP2 in complex with allosteric imidazopyrazine inhibitor 提交 2022-09-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 P8O (1~{S})-1'-[5-[2-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]sulfanyl-3~{H}-imidazo[4,5-b]pyrazin-2-yl]spiro[1,3-dihydroindene-2,4'-piperidine]-1-amine × 1 FMT FORMIC ACID × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.15 K；21.00 %w/v PEG 3350, 0.30 M K Form
分辨率 1.83 Å R-free 0.218
8B5Y SHP2 in complex with allosteric imidazopyrazine inhibitor 提交 2022-09-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 P8O (1~{S})-1'-[5-[2-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]sulfanyl-3~{H}-imidazo[4,5-b]pyrazin-2-yl]spiro[1,3-dihydroindene-2,4'-piperidine]-1-amine × 1 FMT FORMIC ACID × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.15 K；21.00 %w/v PEG 3350, 0.30 M K Form
分辨率 1.83 Å R-free 0.218
8CBH SHP2 in complex with a novel allosteric inhibitor 提交 2023-01-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 U70 [(1~{S},6~{R},7~{S})-3-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-2~{H}-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-7-(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)-3-azabicyclo[4.1.0]heptan-7-yl]methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293.15 K；14.00 %w/v PEG 3350, 0.20 M NH4 Acetate, 0.10 M Tris pH=9.00
分辨率 2.24 Å R-free 0.264
8CBH SHP2 in complex with a novel allosteric inhibitor 提交 2023-01-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 U70 [(1~{S},6~{R},7~{S})-3-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-2~{H}-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-7-(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)-3-azabicyclo[4.1.0]heptan-7-yl]methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293.15 K；14.00 %w/v PEG 3350, 0.20 M NH4 Acetate, 0.10 M Tris pH=9.00
分辨率 2.24 Å R-free 0.264
8GWW Small-molecule Allosteric Regulation Mechanism of SHP2 提交 2022-09-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 KID 2-[4-(aminomethyl)-4-methyl-piperidin-1-yl]-5-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-3-methyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 13%-18% PEG 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.288
8GWW Small-molecule Allosteric Regulation Mechanism of SHP2 提交 2022-09-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 KID 2-[4-(aminomethyl)-4-methyl-piperidin-1-yl]-5-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-3-methyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 13%-18% PEG 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.288
8RZW A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4N 3,5-bis(chloranyl)pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.02 Å R-free 0.272
8RZW A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4N 3,5-bis(chloranyl)pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.02 Å R-free 0.272
8RZY A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4L 1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-5-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.91 Å R-free 0.220
8RZY A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4L 1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-5-amine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.91 Å R-free 0.220
8S01 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4J 3-(4-chlorophenyl)-1H-pyrazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.17 Å R-free 0.231
8S01 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4J 3-(4-chlorophenyl)-1H-pyrazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.17 Å R-free 0.231
8S04 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4I N-(1H-indol-7-yl)methanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.89 Å R-free 0.223
8S04 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4I N-(1H-indol-7-yl)methanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.89 Å R-free 0.223
8S06 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4M 1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-7-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.19 Å R-free 0.238
8S06 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4M 1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-7-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.19 Å R-free 0.238
8S07 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 4 A1H4K 7-azanyl-N-pyridin-3-yl-3H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.83 Å R-free 0.212
8S07 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4K 7-azanyl-N-pyridin-3-yl-3H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.83 Å R-free 0.212
8S0H A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4Q 5-(aminomethyl)-N-(3-chloranyl-1-methyl-indol-7-yl)-1,3-dihydroisoindole-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.99 Å R-free 0.254
8S0H A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4Q 5-(aminomethyl)-N-(3-chloranyl-1-methyl-indol-7-yl)-1,3-dihydroisoindole-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.99 Å R-free 0.254
8S0I A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4P 3-phenyl-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.93 Å R-free 0.224
8S0I A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4P 3-phenyl-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.93 Å R-free 0.224
8S0J A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4R 3-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-6-yl]propan-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.89 Å R-free 0.242
8S0J A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4R 3-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-6-yl]propan-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.89 Å R-free 0.242
8S0K A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4S 3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-5-methyl-6-(piperazin-1-ylmethyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.84 Å R-free 0.228
8S0K A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4S 3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-5-methyl-6-(piperazin-1-ylmethyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.84 Å R-free 0.228
8S0O A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 A1H4G 3-[4-chloranyl-2-(1H-pyrazol-4-ylmethyl)indazol-5-yl]-5-methyl-6-(piperazin-1-ylmethyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.83 Å R-free 0.236
8S0O A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 A1H4G 3-[4-chloranyl-2-(1H-pyrazol-4-ylmethyl)indazol-5-yl]-5-methyl-6-(piperazin-1-ylmethyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.83 Å R-free 0.236
8S0P A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4O 1-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-6-yl]-4-methyl-piperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
8S0P A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4O 1-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-6-yl]-4-methyl-piperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
8S0Q A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4T (1S,5R)-8-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-6-yl]-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.87 Å R-free 0.236
8S0Q A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4T (1S,5R)-8-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-6-yl]-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.87 Å R-free 0.236
8S0S A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4H (1R,5S)-8-[7-(4-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazin-3-yl]-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.94 Å R-free 0.258
8S0S A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4H (1R,5S)-8-[7-(4-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazin-3-yl]-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.94 Å R-free 0.258
8T6D Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 YR2 (3R)-1'-[3-(3,4-dihydro-1,5-naphthyridin-1(2H)-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-3H-spiro[[1]benzofuran-2,4'-piperidin]-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；19% PEG 3350,100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 300 mM Ammonium Sulfate
分辨率 2.40 Å R-free 0.296
8T6D Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 YR2 (3R)-1'-[3-(3,4-dihydro-1,5-naphthyridin-1(2H)-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-3H-spiro[[1]benzofuran-2,4'-piperidin]-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；19% PEG 3350,100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 300 mM Ammonium Sulfate
分辨率 2.40 Å R-free 0.296
8T6G Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 YT2 (1S)-1-{6-[(1S)-1-amino-1,3-dihydrospiro[indene-2,4'-piperidin]-1'-yl]-3-(3,4-dihydro-1,5-naphthyridin-1(2H)-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-5-yl}ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19% PEG 3350,100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 300 mM Ammonium Sulfate
分辨率 1.84 Å R-free 0.245
8T6G Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 7 YT2 (1S)-1-{6-[(1S)-1-amino-1,3-dihydrospiro[indene-2,4'-piperidin]-1'-yl]-3-(3,4-dihydro-1,5-naphthyridin-1(2H)-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-5-yl}ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19% PEG 3350,100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 300 mM Ammonium Sulfate
分辨率 1.84 Å R-free 0.245
8T7Q Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 ZH5 1-{3-[(2-chlorophenyl)sulfanyl]-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl}-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19% PEG 3350,100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 300 mM Ammonium Sulfate
分辨率 2.10 Å R-free 0.262
8T7Q Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 ZH5 1-{3-[(2-chlorophenyl)sulfanyl]-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl}-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19% PEG 3350,100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 300 mM Ammonium Sulfate
分辨率 2.10 Å R-free 0.262
8T8Q Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-23 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 ZJX 1-[(3P)-3-(3-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19% PEG3350, 0.3 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris (pH 8.5)
分辨率 2.27 Å R-free 0.249
8T8Q Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-23 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 ZJX 1-[(3P)-3-(3-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19% PEG3350, 0.3 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris (pH 8.5)
分辨率 2.27 Å R-free 0.249
8U7W Crystal structure of non-receptor protein tyrosine phosphatase SHP2 in complex with inhibitor compound 7 提交 2023-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa） 片段：residues 1-525
未记录 W8I 1-{6-[(2,3-dichlorophenyl)sulfanyl]pyrido[2,3-b]pyrazin-2-yl}-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.2；293 K；17% PEG3350, 0.1M Bicine, pH9.2, 30 mM Ammonium Acetate, 4% Tacsimate
分辨率 2.05 Å R-free 0.178
8U7W Crystal structure of non-receptor protein tyrosine phosphatase SHP2 in complex with inhibitor compound 7 提交 2023-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa） 片段：residues 1-525
未记录 W8I 1-{6-[(2,3-dichlorophenyl)sulfanyl]pyrido[2,3-b]pyrazin-2-yl}-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.2；293 K；17% PEG3350, 0.1M Bicine, pH9.2, 30 mM Ammonium Acetate, 4% Tacsimate
分辨率 2.05 Å R-free 0.178
8U7X Crystal structure of non-receptor protein tyrosine phosphatase SHP2 in complex with inhibitor compound 24 提交 2023-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa） 片段：residues 1-525
未记录 WAB (3S,4S)-8-{6-[(2-amino-3-chloropyridin-4-yl)sulfanyl]pyrido[2,3-b]pyrazin-2-yl}-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；13% PEG3350, 0.1M Bicine, pH7.6, 30mM Ammonium Acetate, 5% Tacsimate
分辨率 2.06 Å R-free 0.175
8U7X Crystal structure of non-receptor protein tyrosine phosphatase SHP2 in complex with inhibitor compound 24 提交 2023-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa） 片段：residues 1-525
未记录 WAB (3S,4S)-8-{6-[(2-amino-3-chloropyridin-4-yl)sulfanyl]pyrido[2,3-b]pyrazin-2-yl}-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；13% PEG3350, 0.1M Bicine, pH7.6, 30mM Ammonium Acetate, 5% Tacsimate
分辨率 2.06 Å R-free 0.175
8WFY The Crystal Structure of SHP2 from Biortus. 提交 2023-09-20 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1% Tryptone, 0.001M NaN3, 0.05M HEPEs-Na pH 7.0, 20% PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.317
8WFY The Crystal Structure of SHP2 from Biortus. 提交 2023-09-20 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1% Tryptone, 0.001M NaN3, 0.05M HEPEs-Na pH 7.0, 20% PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.317
8WX7 Crystal structure of SHP2 in complex with JAB-3186 提交 2023-10-27 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 XD8 (5~{S})-1'-[6-azanyl-5-(2-azanyl-3-chloranyl-pyridin-4-yl)sulfanyl-pyrazin-2-yl]spiro[5,7-dihydrocyclopenta[b]pyridine-6,4'-piperidine]-5-amine × 1 SO4 SULFATE ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M ammonium sulphate, 28 % w/v PEG3350
分辨率 2.02 Å R-free 0.246
8WX7 Crystal structure of SHP2 in complex with JAB-3186 提交 2023-10-27 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 XD8 (5~{S})-1'-[6-azanyl-5-(2-azanyl-3-chloranyl-pyridin-4-yl)sulfanyl-pyrazin-2-yl]spiro[5,7-dihydrocyclopenta[b]pyridine-6,4'-piperidine]-5-amine × 1 SO4 SULFATE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M ammonium sulphate, 28 % w/v PEG3350
分辨率 2.02 Å R-free 0.246
9BLG Crystal structure of non-receptor protein tyrosine phosphatase SHP2 in complex with PF-07284892 提交 2024-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa） 片段：residues 1-525
未记录 A1AQ1 (1S)-1'-{6-[(2-amino-3-chloropyridin-4-yl)sulfanyl]-1,2,4-triazin-3-yl}-1,3-dihydrospiro[indene-2,4'-piperidin]-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.2；293 K；9%PEG3350, 0.1M Bicine, pH9.2, 30mM Ammonium Acetate, 5% Tacsimate
分辨率 2.06 Å R-free 0.238
9BLG Crystal structure of non-receptor protein tyrosine phosphatase SHP2 in complex with PF-07284892 提交 2024-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa） 片段：residues 1-525
未记录 A1AQ1 (1S)-1'-{6-[(2-amino-3-chloropyridin-4-yl)sulfanyl]-1,2,4-triazin-3-yl}-1,3-dihydrospiro[indene-2,4'-piperidin]-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.2；293 K；9%PEG3350, 0.1M Bicine, pH9.2, 30mM Ammonium Acetate, 5% Tacsimate
分辨率 2.06 Å R-free 0.238
9EH9 Crystal structure of unbound N-SH2 domain of SHP2 提交 2024-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
未记录 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；500 nL of 10 mg/mL SHP2 N-SH2 in 50 mM Bis-Tris pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP; 500 nL of 1.0 M sodium malonate pH 5.0, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.5, and 2% w/v polyethylene glycol 20,000
分辨率 1.83 Å R-free 0.255
9EHA Crystal structure of N-SH2 domain of SHP2 bound to phosphotyrosine 提交 2024-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
未记录 PTR O-PHOSPHOTYROSINE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；10 mg/mL WT N-SH2 with 20 mM O-phospho-L-tyrosine in 0.5 M Tris pH 9.0, 100 mM sodium acetate pH 4.6, and 2 M ammonium sulfate
分辨率 1.71 Å R-free 0.246
9EHD Crystal structure of N-SH2 domain of SHP2 bound to GAB1 tyrosine phosphorylated peptide (624-633) QVEpYLDLDLD 提交 2024-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；500 nL of 10 mg/mL SHP2 N-SH2 in 50 mM Bis-Tris pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP, with GAB1 (QVEpYLDLDLD) 1:1.05 molar ratio; 500 nL of 6% v/v Tacsimate pH 6.0, 0.1 M MES monohydrate pH 6.0, and 25% w/v polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.59 Å R-free 0.240
9EIC Crystal structure of unbound N-SH2 domain of SHP2 with T42A mutation 提交 2024-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
突变：T42A PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；500 nL of 10 mg/mL SHP2 N-SH2 in 50 mM Bis-Tris pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP with 500 nL of 0.1 M Tris hydrochloride pH 8.5, 2.0 M Ammonium phosphate monobasic
分辨率 1.58 Å R-free 0.218
9EIK Crystal structure of N-SH2 domain of SHP2 with T42A mutation bound to GAB1 tyrosine phosphorylated peptide (624-633) QVEpYLDLDLD 提交 2024-11-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
突变：T42A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；500 nL 10 mg/mL SHP2 N-SH2 with GAB1 peptide QVEpYLDLDLD (1:1.05 molar ratio) with 500 nL 0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, and 2.0 M Ammonium sulfate
分辨率 1.25 Å R-free 0.225
9MQ5 Crystal structure SHP2 tandem SH2 domains in complex with PZR doubly tyrosine phosphorylated ITIM peptide 提交 2025-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–220（220 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1 M Lithium Acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
分辨率 1.70 Å R-free 0.229
9MUQ Crystal structure of unbound N-SH2 domain of SHP2 (1AYD conditions) 提交 2025-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；500 nL 20 mg/mL N-SH2 in 10 mM MES pH 5.5, 50 mM KCl; 500 nL 100 mM MES pH 6.0, 2.05 M ammonium sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.266
9QA5 Structure of the N-SH2 domain of SHP2 in complex with the phosphoY627-Gab1 (613-651) peptide 提交 2025-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5 % PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M BisTris, pH 5.5
分辨率 2.08 Å R-free 0.273
9QCD Micro-ED structure of the NSH2-CSH2 tandem domain of SHP2 in complex with the bis-phosphorylated pY627-pY659-Gab1 (613-694) peptide 提交 2025-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–222（222 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液 pH 8.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å R-free 0.353
9R16 Structure of mutant SHP2 提交 2025-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
突变：Y62D 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M BICINE pH 8.5 and 17% w/v PEG 4000
分辨率 2.63 Å R-free 0.304
9R16 Structure of mutant SHP2 提交 2025-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
突变：Y62D 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M BICINE pH 8.5 and 17% w/v PEG 4000
分辨率 2.63 Å R-free 0.304
9TKT Mapping the SHP2 allosteric pocket with target-biased covalent fragments 提交 2025-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–525（524 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M NaF, 0.1M Bis-Tris Propane pH 8.5
分辨率 2.35 Å R-free 0.283
9TKT Mapping the SHP2 allosteric pocket with target-biased covalent fragments 提交 2025-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–525（524 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 A1JWN 3-[(1S)-1-azanylspiro[1,3-dihydroindene-2,4'-piperidine]-1'-yl]carbonylbenzenesulfonic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M NaF, 0.1M Bis-Tris Propane pH 8.5
分辨率 2.35 Å R-free 0.283
9Y5X Crystal structure of shorter construct of SHP2 unbound N-SH2 domain 提交 2025-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 4–103（100 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M MES pH 6.0, 2.05 M ammonium sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.250
9Z70 Crystal structure of shorter construct of SHP2 unbound N-SH2 domain (Y66 in blocking conformation) 提交 2025-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 4–103（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 6.5
分辨率 1.73 Å R-free 0.233

共 114 个其他 PDB 条目、187 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PTN11_HUMAN
Isoform Q06124-2
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–526； UniProt 1–525 作者链 B； PDB构建体 2–526； UniProt 1–525

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6crg

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6crg
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6crg
沉积日期 deposition_date2018-03-17
结构标题 titleCrystal Structure of Shp2 E76K GOF Mutant in complex with SHP099
关键词 keywords;SHP2, PTPN11, PROTEIN TYROSINE PHOSPHATASE, E76K, Gain of Function Mutant, ALLOSTERIC INHIBITOR, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMPLEX, PHOSPHATASE ;; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier37.61 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron37.44 Å
零角强度 I(0) i0192016000.00
分子量 molecular_weight109600.0 kDa
排除体积 excluded_volume136180 ų
包络体积 envelope_volume181530 ų
水化壳体积 shell_volume41850 ų
包络直径 envelope_diameter135.3 Å
壳层 Rg shell_rg41.32 Å
包络 Rg envelope_rg37.83 Å
形状 Rg shape_rg37.40 Å
总 Rg total_rg37.83 Å
总原子数 total_atoms7701
残基数 n_residues939
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax132.5 Å
Rg (实空间) rg_real37.90 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.71 Å
I(0) (实空间) i0_real1.9200e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.4010e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal37.73 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal192000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8522
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary37.9 Å
偏度 Skewness skewness0.497
峰度 Kurtosis kurtosis-0.288
角度范围 angular_range— – 0.2100 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha30280000.0000
实空间数据点数 n_real_points43
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.775; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.884; Smooth: 0.866
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd6crga1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.93 — SH2-like
超家族 Superfamily superfamilyd.93.1 — SH2 domain
家族 Family familyd.93.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6crga2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.93 — SH2-like
超家族 Superfamily superfamilyd.93.1 — SH2 domain
家族 Family familyd.93.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6crga3
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.45 — (Phosphotyrosine protein) phosphatases II
超家族 Superfamily superfamilyc.45.1 — (Phosphotyrosine protein) phosphatases II
家族 Family familyc.45.1.2 — Higher-molecular-weight phosphotyrosine protein phosphatases
结构域编号 domain_idd6crgb1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.93 — SH2-like
超家族 Superfamily superfamilyd.93.1 — SH2 domain
家族 Family familyd.93.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6crgb2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.93 — SH2-like
超家族 Superfamily superfamilyd.93.1 — SH2 domain
家族 Family familyd.93.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6crgb3
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.45 — (Phosphotyrosine protein) phosphatases II
超家族 Superfamily superfamilyc.45.1 — (Phosphotyrosine protein) phosphatases II
家族 Family familyc.45.1.2 — Higher-molecular-weight phosphotyrosine protein phosphatases

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id6crgA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology505 — SHC Adaptor Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — SH2 domain
结构域编号 domain_id6crgA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology505 — SHC Adaptor Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — SH2 domain
结构域编号 domain_id6crgA03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology190 — Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Protein tyrosine phosphatase superfamily
结构域编号 domain_id6crgB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology505 — SHC Adaptor Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — SH2 domain
结构域编号 domain_id6crgB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology505 — SHC Adaptor Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — SH2 domain
结构域编号 domain_id6crgB03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology190 — Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Protein tyrosine phosphatase superfamily
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)