6hoj

Structure of Beclin1 LIR motif bound to GABARAP

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 74.6 Å Quality: EXCELLENT

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beclin-1,Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足同源多聚体蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–112 链 B； UniProt 1–112 链 C； UniProt 1–112	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15% PEG 4000, 50 mM Bicine pH 8.8	分辨率 1.51 Å R-free 0.211

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6HOJ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1GNU GABA(A) receptor associated protein GABARAP 提交 2001-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；18MG/ML GABARAP, 50MM TRIS PH8.5, 0.25M NACL,10%(W/V) PEGMONO, pH 8.50	分辨率 1.75 Å R-free 0.230
1KLV Solution Structure and Backbone Dynamics of GABARAP, GABAA Receptor associated protein 提交 2001-12-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）340；压力 1 NMR样品组成 1mM GABARAP, 20mM phosphate buffer NA, 50mM NaCl, 0.02mM NaN3, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM GABARAP, 20mM phosphate buffer NA, 50mM NaCl, 0.02mM NaN3, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
1KM7 Solution Structure and Backbone Dynamics of GABARAP, GABAA Receptor Associated Protein 提交 2001-12-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）340；压力 1 NMR样品组成 1mM GABARAP, 20mM phosphate buffer NA, 50mM NaCl, 0.02mM NaN3, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM GABARAP, 20mM phosphate buffer NA, 50mM NaCl, 0.02mM NaN3, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
1KOT Solution Structure of Human GABA Receptor Associated Protein GABARAP 提交 2001-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl 100mM KCl；压力 ambient NMR样品组成 0.8mM GABARAP U-15N,13C; 25mM sodium oxalate, pH 6.9 100mM NaCl 100mM KCl 100uM PMSF 0.02% sodium azide 50uM EDTA 5% D2O, 95% H2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.8mM GABARAP U-15N,13C; 25mM sodium phosphate, pH 6.9 100mM NaCl 100mM KCl 100uM PMSF 0.02% sodium azide 50uM EDTA 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
3D32 Complex of GABA(A) receptor-associated protein (GABARAP) with a synthetic peptide 提交 2008-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.9；285 K；30 % (w/v) PEG3350 800 mM NaCl 50 mM MES, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, temperature 285K	分辨率 1.30 Å R-free 0.195
3D32 Complex of GABA(A) receptor-associated protein (GABARAP) with a synthetic peptide 提交 2008-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–117（117 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.9；285 K；30 % (w/v) PEG3350 800 mM NaCl 50 mM MES, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, temperature 285K	分辨率 1.30 Å R-free 0.195
3DOW Complex structure of GABA type A receptor associated protein and its binding epitope on calreticulin 提交 2008-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290 K；0.1 M MES, 27% v/v PEG MME 550, 10 mM ZnSO4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.30 Å R-free 0.270
3WIM GABARAP-LIR peptide complex 提交 2013-09-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；293 K；2M ammonium sulfate, 0.1M sodium citrate, 0.2M potassium sodium tartrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.296
5DPS Crystal structure of PLEKHM1 LIR-fused human GABARAP_2-117 提交 2015-09-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–117（116 aa）片段：UNP Q9Y4G2 residues 627-638, UNP O95166 residues 2-117	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；278 K；4% v/v Tacsimate pH 8.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.00 Å R-free 0.223
5DPS Crystal structure of PLEKHM1 LIR-fused human GABARAP_2-117 提交 2015-09-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–117（116 aa）片段：UNP Q9Y4G2 residues 627-638, UNP O95166 residues 2-117	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；278 K；4% v/v Tacsimate pH 8.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.00 Å R-free 0.223
5DPS Crystal structure of PLEKHM1 LIR-fused human GABARAP_2-117 提交 2015-09-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 2–117（116 aa）片段：UNP Q9Y4G2 residues 627-638, UNP O95166 residues 2-117	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；278 K；4% v/v Tacsimate pH 8.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.00 Å R-free 0.223
6HB9 Crystal structure of the GABARAP in complex with the UBA5 LIR motif 提交 2018-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–116（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6 M sodium phosphate, 0.1 M HEPES, pH7.5	分辨率 1.30 Å R-free 0.213
6HOG Structure of VPS34 LIR motif bound to GABARAP 提交 2018-09-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–112（112 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM HEPES pH 7.1, 40% PEG 600	分辨率 1.26 Å R-free 0.181
6HOH Structure of VPS34 LIR motif (S249E) bound to GABARAP 提交 2018-09-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–112（112 aa）	未记录	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 200 mM magnesium formate	分辨率 2.25 Å R-free 0.250
6HOH Structure of VPS34 LIR motif (S249E) bound to GABARAP 提交 2018-09-17	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–112（112 aa）链 C 1–112（112 aa）链 D 1–112（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 200 mM magnesium formate	分辨率 2.25 Å R-free 0.250
6HOK Structure of Beclin1 LIR (S96E) motif bound to GABARAP 提交 2018-09-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–112（112 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6 M ammonium sulfate, 100 mM TRIS pH 8.5, 10 % Glycerol	分辨率 1.61 Å R-free 0.198
6HYL Structure of PCM1 LIR motif bound to GABARAP 提交 2018-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M CaCl2, 0.1 M HEPES pH 7, 20% w/v PEG 6000	分辨率 1.56 Å R-free 0.247
6HYL Structure of PCM1 LIR motif bound to GABARAP 提交 2018-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M CaCl2, 0.1 M HEPES pH 7, 20% w/v PEG 6000	分辨率 1.56 Å R-free 0.247
6HYM Structure of PCM1 LIR motif bound to GABARAP 提交 2018-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% w/v PEG 1500, 0.1 M SPG pH 8.5	分辨率 1.86 Å R-free 0.217
6HYM Structure of PCM1 LIR motif bound to GABARAP 提交 2018-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–117（117 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% w/v PEG 1500, 0.1 M SPG pH 8.5	分辨率 1.86 Å R-free 0.217
6HYN Structure of ATG13 LIR motif bound to GABARAP 提交 2018-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M NaCl, 10% PEG 8000, 0.1M Na K phosphate 6.2	分辨率 1.14 Å R-free 0.185
6HYO Structure of ULK1 LIR motif bound to GABARAP 提交 2018-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M MgCl2. 0.1 M Na cacodylate pH 6.5, 20% PEG1000	分辨率 1.07 Å R-free 0.161
6YOP Structure of SAMM50 LIR bound to GABARAP 提交 2020-04-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% v/v isopropanol, 0.1 M Na Acetate pH 5.5	分辨率 1.10 Å R-free 0.159
7AA8 Structure of SCOC LIR bound to GABARAP 提交 2020-09-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.4；293 K；2.9% PEG 550 MME, 50 mM Bicine pH 8.4, 30% PEG 1500	分辨率 1.25 Å R-free 0.194
7BRQ Crystal structure of human FAM134B LIR fused to human GABARAP 提交 2020-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–116（116 aa）	突变：F3S,V4T	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；1.91 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate pH 5.5, 0.18 M potassium sodium tartrate	分辨率 1.40 Å R-free 0.206
7BRT Crystal structure of Sec62 LIR fused to GABARAP 提交 2020-03-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–116（116 aa）链 B 1–116（116 aa）	突变：T367D,F3S,V4T 突变：T367D,F3S,V4T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.184
7BRU Crystal structure of human RTN3 LIR fused to human GABARAP 提交 2020-03-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–116（116 aa）链 B 1–116（116 aa）链 C 1–116（116 aa）	突变：F3S,V4T 突变：F3S,V4T 突变：F3S,V4T	PO4 PHOSPHATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.8 M potassium phosphate monobasic, 0.8 M sodium phosphate monobasic, 0.1 M HEPES pH 7.5	分辨率 2.15 Å R-free 0.230
7BV4 Crystal structure of STX17 LIR region in complex with GABARAP 提交 2020-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.12M Alcohols, 50% (v/v) Precipitant Mix 4, Buffer System 3 at pH 8.5 in Morpheus screen kit from Molecular Dimension	分辨率 2.00 Å R-free 0.225
7BV4 Crystal structure of STX17 LIR region in complex with GABARAP 提交 2020-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.12M Alcohols, 50% (v/v) Precipitant Mix 4, Buffer System 3 at pH 8.5 in Morpheus screen kit from Molecular Dimension	分辨率 2.00 Å R-free 0.225
7BV4 Crystal structure of STX17 LIR region in complex with GABARAP 提交 2020-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–117（117 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.12M Alcohols, 50% (v/v) Precipitant Mix 4, Buffer System 3 at pH 8.5 in Morpheus screen kit from Molecular Dimension	分辨率 2.00 Å R-free 0.225
7BV4 Crystal structure of STX17 LIR region in complex with GABARAP 提交 2020-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–117（117 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.12M Alcohols, 50% (v/v) Precipitant Mix 4, Buffer System 3 at pH 8.5 in Morpheus screen kit from Molecular Dimension	分辨率 2.00 Å R-free 0.225
7EA7 crystal structure of NAP1 LIR in complex with GABARAP 提交 2021-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.3 M sodium nitrate, 0.3 M sodium phosphate dibasic, 0.3 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine-tris pH 8.5, 25% v/v MPD, 25% PEG1000, 25% w/v PEG3350	分辨率 2.69 Å R-free 0.271
7EA7 crystal structure of NAP1 LIR in complex with GABARAP 提交 2021-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.3 M sodium nitrate, 0.3 M sodium phosphate dibasic, 0.3 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine-tris pH 8.5, 25% v/v MPD, 25% PEG1000, 25% w/v PEG3350	分辨率 2.69 Å R-free 0.271
7LSW Structure of Full Beta-Hairpin LIR from FNIP2 Bound to GABARAP 提交 2021-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）链 C 1–117（117 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, and 2% v/v PEG 550 MME	分辨率 3.05 Å R-free 0.247
7LSW Structure of Full Beta-Hairpin LIR from FNIP2 Bound to GABARAP 提交 2021-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–117（117 aa）链 D 1–117（117 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, and 2% v/v PEG 550 MME	分辨率 3.05 Å R-free 0.247
7LSW Structure of Full Beta-Hairpin LIR from FNIP2 Bound to GABARAP 提交 2021-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–117（117 aa）链 E 1–117（117 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, and 2% v/v PEG 550 MME	分辨率 3.05 Å R-free 0.247
7LSW Structure of Full Beta-Hairpin LIR from FNIP2 Bound to GABARAP 提交 2021-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–117（117 aa）链 F 1–117（117 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, and 2% v/v PEG 550 MME	分辨率 3.05 Å R-free 0.247
7LT6 Structure of Partial Beta-Hairpin LIR from FNIP2 Bound to GABARAP 提交 2021-02-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–117（117 aa）链 B 1–117（117 aa）链 C 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M magnesium acetate, 0.1 M MOPS pH 7.5, and 12% v/v PEG 8000	分辨率 1.80 Å R-free 0.273
7VEC Crystal structure of GABARAP complexed with the TEX264 LIR phosphorylated at Ser271 and Ser272 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-Tris pH 5.6	分辨率 3.00 Å R-free 0.301
7VEC Crystal structure of GABARAP complexed with the TEX264 LIR phosphorylated at Ser271 and Ser272 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-Tris pH 5.6	分辨率 3.00 Å R-free 0.301
7VEC Crystal structure of GABARAP complexed with the TEX264 LIR phosphorylated at Ser271 and Ser272 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-Tris pH 5.6	分辨率 3.00 Å R-free 0.301
7VEC Crystal structure of GABARAP complexed with the TEX264 LIR phosphorylated at Ser271 and Ser272 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-Tris pH 5.6	分辨率 3.00 Å R-free 0.301
7VEC Crystal structure of GABARAP complexed with the TEX264 LIR phosphorylated at Ser271 and Ser272 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-Tris pH 5.6	分辨率 3.00 Å R-free 0.301
7VEC Crystal structure of GABARAP complexed with the TEX264 LIR phosphorylated at Ser271 and Ser272 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-Tris pH 5.6	分辨率 3.00 Å R-free 0.301
7VEC Crystal structure of GABARAP complexed with the TEX264 LIR phosphorylated at Ser271 and Ser272 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-Tris pH 5.6	分辨率 3.00 Å R-free 0.301
7VEC Crystal structure of GABARAP complexed with the TEX264 LIR phosphorylated at Ser271 and Ser272 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-Tris pH 5.6	分辨率 3.00 Å R-free 0.301
7VEC Crystal structure of GABARAP complexed with the TEX264 LIR phosphorylated at Ser271 and Ser272 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-Tris pH 5.6	分辨率 3.00 Å R-free 0.301
7VEC Crystal structure of GABARAP complexed with the TEX264 LIR phosphorylated at Ser271 and Ser272 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-Tris pH 5.6	分辨率 3.00 Å R-free 0.301
7VEC Crystal structure of GABARAP complexed with the TEX264 LIR phosphorylated at Ser271 and Ser272 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-Tris pH 5.6	分辨率 3.00 Å R-free 0.301
7VEC Crystal structure of GABARAP complexed with the TEX264 LIR phosphorylated at Ser271 and Ser272 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-Tris pH 5.6	分辨率 3.00 Å R-free 0.301
7VED Crystal structure of GABARAP fused to TEX264 LIR with S272D mutation 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–116（116 aa）	突变：S272D,F3S,V4T	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M potassium sodium tartrate, 0.1M sodium citrate pH 5.6, 2.0M ammonium sulfate	分辨率 2.02 Å R-free 0.225
7VED Crystal structure of GABARAP fused to TEX264 LIR with S272D mutation 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–116（116 aa）	突变：S272D,F3S,V4T	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M potassium sodium tartrate, 0.1M sodium citrate pH 5.6, 2.0M ammonium sulfate	分辨率 2.02 Å R-free 0.225
7YO9 Crystal structure of fusion protein of human TP53INP2 LIR and human GABARAP 提交 2022-08-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–116（116 aa）片段：Tumor protein p53-inducible nuclear protein 2(1-15), Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein(16-131)	突变：F18S,V19T	IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；293 K；10% 2-propanol, 0.1 M sodium phosphate/citric acid pH 4.2, 0.2 M lithium sulfate	分辨率 1.75 Å R-free 0.216
7ZKR Human GABARAP in complex with stapled peptide Pen3-ortho 提交 2022-04-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 OXE ORTHO-XYLENE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；magnesium acetate, sodium cacodylate, PEG 8000	分辨率 1.10 Å R-free 0.167
7ZL7 Human GABARAP in complex with stapled peptide Pen8-ortho 提交 2022-04-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 1 OXE ORTHO-XYLENE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；sodium chloride, Tris-HCl, PEG 3000	分辨率 1.55 Å R-free 0.220
7ZL7 Human GABARAP in complex with stapled peptide Pen8-ortho 提交 2022-04-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–117（117 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 OXE ORTHO-XYLENE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；sodium chloride, Tris-HCl, PEG 3000	分辨率 1.55 Å R-free 0.220
8AFI GABARAP in complex with LIR motif of HsATG3 提交 2022-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–116（115 aa）	未记录	ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium acetate, sodium cacodylate, PEG 8,000	分辨率 2.66 Å R-free 0.262
8AFI GABARAP in complex with LIR motif of HsATG3 提交 2022-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–116（115 aa）	未记录	ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium acetate, sodium cacodylate, PEG 8,000	分辨率 2.66 Å R-free 0.262
8AFI GABARAP in complex with LIR motif of HsATG3 提交 2022-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2–116（115 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium acetate, sodium cacodylate, PEG 8,000	分辨率 2.66 Å R-free 0.262
8AFI GABARAP in complex with LIR motif of HsATG3 提交 2022-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 2–116（115 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium acetate, sodium cacodylate, PEG 8,000	分辨率 2.66 Å R-free 0.262
8AFI GABARAP in complex with LIR motif of HsATG3 提交 2022-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 2–116（115 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium acetate, sodium cacodylate, PEG 8,000	分辨率 2.66 Å R-free 0.262
8AFI GABARAP in complex with LIR motif of HsATG3 提交 2022-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 2–116（115 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium acetate, sodium cacodylate, PEG 8,000	分辨率 2.66 Å R-free 0.262
8AFI GABARAP in complex with LIR motif of HsATG3 提交 2022-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 2–116（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium acetate, sodium cacodylate, PEG 8,000	分辨率 2.66 Å R-free 0.262
8AFI GABARAP in complex with LIR motif of HsATG3 提交 2022-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 2–116（115 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium acetate, sodium cacodylate, PEG 8,000	分辨率 2.66 Å R-free 0.262
8S1M Crystal structure of human GABARAP fused to EGFR (1076-1099) 提交 2024-02-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.17 M ammonium acetate 0.085 M sodium citrate 25.5% PEG 4000 15% Glycerol	分辨率 2.05 Å R-free 0.230
8T2M Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of NSs4 提交 2023-06-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–117（117 aa）片段：;GS is the remain of the removed expression tag. The C terminus of Nss 257-265 has been fused with Q9H492 to facilitate the crystalization. The GG is a spacer between Nss and GABARAP protein. ;	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate:HCl, pH 4.6, 8% PEG 4000	分辨率 1.27 Å R-free 0.178
8T2N Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of NSs3 提交 2023-06-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M Potassium acetate, 20% PEG 3350	分辨率 1.88 Å R-free 0.264
8T2N Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of NSs3 提交 2023-06-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M Potassium acetate, 20% PEG 3350	分辨率 1.88 Å R-free 0.264
8T31 Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.1M Na-citrate, 5% isopropanol	分辨率 2.10 Å R-free 0.264
8T31 Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.1M Na-citrate, 5% isopropanol	分辨率 2.10 Å R-free 0.264
8T31 Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.1M Na-citrate, 5% isopropanol	分辨率 2.10 Å R-free 0.264
8T31 Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.1M Na-citrate, 5% isopropanol	分辨率 2.10 Å R-free 0.264
8T31 Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.1M Na-citrate, 5% isopropanol	分辨率 2.10 Å R-free 0.264
8T32 Crystal structure of K48 acetylated GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；28 % (w/v) PEG 2000 MME, 0.1 M Bis-Tris: HCl, pH 6.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.271
8T33 Crystal structure of K46 acetylated GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 9 ACT ACETATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10 % w/v PEG 3000, 0.2 M Zinc acetate dihydrate, 0.1 M Sodium acetate PH 4.5	分辨率 1.60 Å R-free 0.212
8W6A Crystal structure of TAX1BP1 LIR region in complex with GABARAP 提交 2023-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.8 M Sodium acetate trihydrate and 0.1 M BIS-TRIS propane at pH 7.0	分辨率 1.53 Å R-free 0.187
8W6A Crystal structure of TAX1BP1 LIR region in complex with GABARAP 提交 2023-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.8 M Sodium acetate trihydrate and 0.1 M BIS-TRIS propane at pH 7.0	分辨率 1.53 Å R-free 0.187
8W6A Crystal structure of TAX1BP1 LIR region in complex with GABARAP 提交 2023-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.8 M Sodium acetate trihydrate and 0.1 M BIS-TRIS propane at pH 7.0	分辨率 1.53 Å R-free 0.187
8W6A Crystal structure of TAX1BP1 LIR region in complex with GABARAP 提交 2023-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–117（117 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.8 M Sodium acetate trihydrate and 0.1 M BIS-TRIS propane at pH 7.0	分辨率 1.53 Å R-free 0.187
9E8P Crystal Structure of GABARAP-ATG3 conjugate 提交 2024-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–116（116 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；0.1 mM Tris pH8.5, 25%(w/v) PEG3550	分辨率 2.70 Å R-free 0.249
9E8P Crystal Structure of GABARAP-ATG3 conjugate 提交 2024-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–116（116 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；0.1 mM Tris pH8.5, 25%(w/v) PEG3550	分辨率 2.70 Å R-free 0.249
9HGD Crystal structure of human GABARAP in complex with cyclic peptide GAB_D23 提交 2024-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M MES pH 5, 30% PEG 6000	分辨率 1.50 Å R-free 0.222
9HGD Crystal structure of human GABARAP in complex with cyclic peptide GAB_D23 提交 2024-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–117（117 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M MES pH 5, 30% PEG 6000	分辨率 1.50 Å R-free 0.222
9I9X Human GABARAP in complex with artificial peptide IM-2 提交 2025-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–117（117 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；ammonium sulfate, sodium cacodylate trihydrate, PEG 8000, DMSO, Tris-HCl, NaCl	分辨率 1.42 Å R-free 0.197

共 41 个其他 PDB 条目、84 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GBRAP_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 16–127； UniProt 1–112 作者链 B； PDB构建体 16–127； UniProt 1–112 作者链 C； PDB构建体 16–127； UniProt 1–112

Beclin-1,Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein

Homo sapiens

UniProt Q14457

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足同源多聚体蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 93–105 链 B； UniProt 93–105 链 C； UniProt 93–105	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15% PEG 4000, 50 mM Bicine pH 8.8	分辨率 1.51 Å R-free 0.211

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6HOJ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
13BV Cryo-EM structure of human PI3KC3-C1 complex 提交 2026-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–450（450 aa）	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.77 Å
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 107–135（29 aa）片段：Beclin 1	突变：BH3 domain (residues 107-135)	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 107–135（29 aa）片段：Beclin 1	突变：BH3 domain (residues 107-135)	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 107–135（29 aa）片段：Beclin 1	突变：BH3 domain (residues 107-135)	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 107–135（29 aa）片段：Beclin 1	突变：BH3 domain (residues 107-135)	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 B 107–135（29 aa）片段：Beclin 1 链 D 107–135（29 aa）片段：Beclin 1 链 F 107–135（29 aa）片段：Beclin 1 链 H 107–135（29 aa）片段：Beclin 1	突变：BH3 domain (residues 107-135) 突变：BH3 domain (residues 107-135) 突变：BH3 domain (residues 107-135) 突变：BH3 domain (residues 107-135)	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 107–135（29 aa）片段：Beclin 1 链 H 107–135（29 aa）片段：Beclin 1	突变：BH3 domain (residues 107-135) 突变：BH3 domain (residues 107-135)	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 107–135（29 aa）片段：Beclin 1 链 D 107–135（29 aa）片段：Beclin 1	突变：BH3 domain (residues 107-135) 突变：BH3 domain (residues 107-135)	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2PON Solution structure of the Bcl-xL/Beclin-1 complex 提交 2007-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–23（23 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM potassium phosphate；压力 1 NMR样品组成 1.5mM unlabelled Bcl-xL/Beclin-1 complex in 99.9% D2O; 50mM potassium phosphate \| 99.9% D2O NMR样品组成 1.5mM uniformly 15N labelled Bcl-xL/Beclin-1 complex in 90% H2O/10% D2O; 50mM potassium phosphate \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.5mM uniformly 15N/13C labelled Bcl-xL/Beclin-1 complex in 99.9% D2O; 50mM potassium phosphate \| 99.9% D2O NMR样品组成 1.5mM 80% deuterated, uniformly 15N/13C labelled Bcl-xL/Beclin-1 complex in 90% H2O/10% D2O; 50mM potassium phosphate \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.5mM 100% deuterated, uniformly 15N labelled Bcl-xL/Beclin-1 complex in 90% H2O/10% D2O; 50mM potassium phosphate \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3DVU Crystal structure of the complex of murine gamma-herpesvirus 68 Bcl-2 homolog M11 and the Beclin 1 BH3 domain 提交 2008-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 105–130（26 aa）片段：BH3 domain, residues 105-130	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；20% PEG 3350, 0.1M sodium acetate, pH 4.5, 10mM magnesium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.261
3DVU Crystal structure of the complex of murine gamma-herpesvirus 68 Bcl-2 homolog M11 and the Beclin 1 BH3 domain 提交 2008-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 105–130（26 aa）片段：BH3 domain, residues 105-130	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；20% PEG 3350, 0.1M sodium acetate, pH 4.5, 10mM magnesium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.261
4DDP crystal structure of Beclin 1 evolutionarily conserved domain(ECD) 提交 2012-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 241–450（210 aa）片段：UNP residues 241-450	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；30% PEG 3350, 0.3M NaCl, 0.1M Tris pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.55 Å R-free 0.203
4MI8 Crystal structure of the complex of murine gamma-herpesvirus 68 Bcl-2 homolog M11 and a Beclin 1 BH3 domain-derived peptide 提交 2013-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 107–130（24 aa）片段：UNP residues 107-130	突变：G120E, D121A	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 8% 2-propanol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.224
4MI8 Crystal structure of the complex of murine gamma-herpesvirus 68 Bcl-2 homolog M11 and a Beclin 1 BH3 domain-derived peptide 提交 2013-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 107–130（24 aa）片段：UNP residues 107-130	突变：G120E, D121A	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 8% 2-propanol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.224
4MI8 Crystal structure of the complex of murine gamma-herpesvirus 68 Bcl-2 homolog M11 and a Beclin 1 BH3 domain-derived peptide 提交 2013-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 107–130（24 aa）片段：UNP residues 107-130 链 D 107–130（24 aa）片段：UNP residues 107-130	突变：G120E, D121A 突变：G120E, D121A	SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 8% 2-propanol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.224
5EFM Beclin 1 Flexible-helical Domian (FHD) (141-171) 提交 2015-10-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 141–171（31 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；293 K；250mM potassium sodium tartrate tetrahydrate, 2.2 M ammonium sulfate, 100mM sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.6)	分辨率 1.95 Å R-free 0.216
5HHE Human Beclin 1 coiled-coil domain 提交 2016-01-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 175–265（91 aa）片段：UNP entries 175-265	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；39% 2-methyl-2, 4-pentadiol, 9% PEG400 and 100 mM Tris buffer, pH 7.5.	分辨率 1.46 Å R-free 0.208
5HHE Human Beclin 1 coiled-coil domain 提交 2016-01-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 175–265（91 aa）片段：UNP entries 175-265	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；39% 2-methyl-2, 4-pentadiol, 9% PEG400 and 100 mM Tris buffer, pH 7.5.	分辨率 1.46 Å R-free 0.208
5VAU Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 105–130（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bis-tris chloride, pH 5.5, ).2M ammonium acetate, 25% PEG 3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.215
5VAU Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 105–130（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bis-tris chloride, pH 5.5, ).2M ammonium acetate, 25% PEG 3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.215
5VAU Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 105–130（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bis-tris chloride, pH 5.5, ).2M ammonium acetate, 25% PEG 3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.215
5VAU Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 105–130（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bis-tris chloride, pH 5.5, ).2M ammonium acetate, 25% PEG 3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.215
5VAX Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 105–130（26 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；bis-tris chloride, pH 4.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.243
5VAX Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 105–130（26 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；bis-tris chloride, pH 4.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.243
5VAX Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 105–130（26 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；bis-tris chloride, pH 4.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.243
5VAX Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 105–130（26 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；bis-tris chloride, pH 4.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.243
5VAY Bcl-2 complex with Beclin 1 T108D BH3 domain 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 105–130（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Tris, pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.228
5VAY Bcl-2 complex with Beclin 1 T108D BH3 domain 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 105–130（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Tris, pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.228
5VAY Bcl-2 complex with Beclin 1 T108D BH3 domain 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 105–130（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Tris, pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.228
5VAY Bcl-2 complex with Beclin 1 T108D BH3 domain 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 105–130（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Tris, pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.228
6DCN Bcl-xL complex with Beclin 1 BH3 domain T108pThr 提交 2018-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 105–130（26 aa）链 D 105–130（26 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2M NaCl, 10% glycerol	分辨率 2.44 Å R-free 0.229
6DCN Bcl-xL complex with Beclin 1 BH3 domain T108pThr 提交 2018-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 105–130（26 aa）链 D 105–130（26 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2M NaCl, 10% glycerol	分辨率 2.44 Å R-free 0.229
6DCO Bcl-xL complex with Beclin 1 BH3 domain T108D 提交 2018-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 105–130（26 aa）链 D 105–130（26 aa）	突变：T108D 突变：T108D	CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M Tris pH 7.0, 0.2M MgCl2, 2.5M NaCl	分辨率 2.20 Å R-free 0.231
6HOI Structure of Beclin1 LIR motif bound to GABARAPL1 提交 2018-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 93–102（10 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M sodium acetate, 0.1M Hepes pH 7.5, 12% PEG 4000	分辨率 1.14 Å R-free 0.166
6HOI Structure of Beclin1 LIR motif bound to GABARAPL1 提交 2018-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 93–102（10 aa）	未记录	ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M sodium acetate, 0.1M Hepes pH 7.5, 12% PEG 4000	分辨率 1.14 Å R-free 0.166
6HOK Structure of Beclin1 LIR (S96E) motif bound to GABARAP 提交 2018-09-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 93–105（13 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6 M ammonium sulfate, 100 mM TRIS pH 8.5, 10 % Glycerol	分辨率 1.61 Å R-free 0.198
7BL1 human complex II-BATS bound to membrane-attached Rab5a-GTP 提交 2021-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 EEE 1–450（450 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot force 20, blot time 6 s	分辨率 9.80 Å
9C82 Structure of human ULK1C:PI3KC3-C1 supercomplex 提交 2024-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–450（450 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；added 0.05% (w/v) octylglucopyranoside as surfactant	分辨率 6.84 Å
9MHF Cryo-EM reconstruction of PI3KC3-C1 in complex with Human RAB1A(Q70L) 提交 2024-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–450（450 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 MYR MYRISTIC ACID × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.73 Å
9MHG Cryo EM reconstruction of PI3KC3-C1 in complex with Human RAB1A(Q70L), VPS34 kinase domain in the inactive conformation 提交 2024-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–450（450 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 MYR MYRISTIC ACID × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；OG supplemented at time of grid preparation 0.05% cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；100% humidity, 3 s wait time, blot force -15	分辨率 3.20 Å
9MHH PI3KC3-C1 in complex with RAB1A. VPS34 kinase domain active conformation 提交 2024-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–450（450 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；OG supplemented at time of grid preparation 0.05% cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9RX5 VPS34-CII (VPS34 199-REIE-202 to 199-AAAA-202 mutant) bound to RAB5A (Q79L) 提交 2025-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–450（450 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.15 Å
9RX6 VPS34-CII (VPS34 199-REIE-202 to 199-ERIR-202 mutant) bound to RAB5A (Q79L) on the VPS15 subunit 提交 2025-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–450（450 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.52 Å
9RX8 Apo VPS34-CII (VPS34/VPS15/BECLIN1/UVRAG) 提交 2025-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–450（450 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.87 Å
9RX9 VPS34-CII bound to RAB5A-GTP 1-212 (C19S, C63S, Q79L) on the VPS34 subunit 提交 2025-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–450（450 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.99 Å
9RXA VPS34-CII bound to RAB5A-GTP 1-212 (C19S, C63S, Q79L) on the VPS15 subunit 提交 2025-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–450（450 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.00 Å
9RXB VPS34-CII (VPS34/VPS15/BECLIN1/UVRAG) bound to RAB5A (Q79L) on the VPS34 and VPS15 subunits 提交 2025-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–450（450 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.03 Å
9S47 Human complex II-BATS bound to membrane-attached Rab5a-GTP 提交 2025-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–450（450 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 9.88 Å
9ZPC Cryo-EM structure of human PI3KC3-C2 提交 2025-12-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–450（450 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.83 Å
9ZPD Cryo-EM structure of human PI3KC3-C2 in complex with Rubicon Middle Region of C terminus 提交 2025-12-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–450（450 aa）链 E 1–450（450 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å

共 29 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BECN1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–13； UniProt 93–105 作者链 B； PDB构建体 1–13； UniProt 93–105 作者链 C； PDB构建体 1–13； UniProt 93–105

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6hoj
沉积日期 deposition_date	2018-09-17
结构标题 title	Structure of Beclin1 LIR motif bound to GABARAP
关键词 keywords	Autophagy, ATG8, LIR, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	24.07 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	23.06 Å
零角强度 I(0) i0	28105300.00
分子量 molecular_weight	42530.0 kDa
排除体积 excluded_volume	54064 Å³
包络体积 envelope_volume	65274 Å³
水化壳体积 shell_volume	24116 Å³
包络直径 envelope_diameter	76.7 Å
壳层 Rg shell_rg	29.75 Å
包络 Rg envelope_rg	23.13 Å
形状 Rg shape_rg	23.06 Å
总 Rg total_rg	23.96 Å
总原子数 total_atoms	3017
残基数 n_residues	371
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	74.6 Å
Rg (实空间) rg_real	23.99 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.47 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.8110e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.6660e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	24.01 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	28110000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9128
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	25.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.192
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.605
角度范围 angular_range	— – 0.3300 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7673000.0000
实空间数据点数 n_real_points	65
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.955; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.997

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Beclin-1,Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein
分子量 formula_weight	14859.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	3474

SANSFTLIGEASDGSMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	356

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d6hoja_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family family	d.15.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6hojb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family family	d.15.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6hojc_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family family	d.15.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	6hojA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	6hojB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	6hojC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	76.670 Å
晶胞边长 b length_b	150.490 Å
晶胞边长 c length_c	35.540 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.510 Å
最低分辨率 resolution_low	53.703 Å
R 因子 r_factor	0.1706
R_work r_work	0.1685
R_free r_free	0.2112

fit	/app/data/saxs_computation/ho/6hoj/6hoj.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ho/6hoj/6hoj.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ho/6hoj/6hoj.dat

Structure of Beclin1 LIR motif bound to GABARAP

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beclin-1,Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Beclin-1,Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)