SAXSdb — 6kag

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 （Q8TAQ2） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SNF5_HUMAN
Isoform	Q12824-2
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–217； UniProt 160–376

SWI/SNF complex subunit SMARCC2

Homo sapiens

UniProt Q8TAQ2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 （Q12824） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SMRC2_HUMAN
Isoform	Q8TAQ2-3
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–194； UniProt 325–518 作者链 C； PDB构建体 1–194； UniProt 325–518

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6kag
沉积日期 deposition_date	2019-06-22
结构标题 title	Crystal structure of the SMARCB1/SMARCC2 subcomplex
关键词 keywords	;Chromatin remodeling complex, SWI-SNF complex, BAF complex, SMARCB1and SMARCC2 subcomplex, Atypical Teratoid/Rhabdoid tumor, CELL CYCLE ;; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6kag__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6kag__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6kag__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	29.06 Å
Rg（电子密度）	28.98 Å
总 Rg	29.20 Å
原子数	2862
残基数	350
排除体积	51017 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6kag__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1
分子量 formula_weight	24872.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2977

DDHDPAVIHENASQPEVLVPIRLDMEIDGQKLRDAFTWNMNEKLMTPEMFSEILCDDLDLNPLTFVPAIASAIRQQIESYPTDSILEDQSDQRVIIKLNIHVGNISLVDQFEWDMSEKENSPEKFALKLCSELGLGGEFVTTIAYSIRGQLSWHQKTYAFSENPLPTVEIAIRNTGDADQWCPLLETLTDAEMEKKIRDQDRNTRRMRRLANTAPAW

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	SWI/SNF complex subunit SMARCC2
分子量 formula_weight	22214.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,C

TKSKRGHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESMETTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGLINYQVDAES

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	115

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d6kagb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family family	a.4.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6kagc_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family family	a.4.1.0 — automated matches

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晶胞边长 a length_a	170.390 Å
晶胞边长 b length_b	170.390 Å
晶胞边长 c length_c	170.390 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	P 41 3 2
空间群编号 int_tables_number	213
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.601 Å
最低分辨率 resolution_low	49.187 Å
R 因子 r_factor	0.2083
R_work r_work	0.2066
R_free r_free	0.2402

Crystal structure of the SMARCB1/SMARCC2 subcomplex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SWI/SNF complex subunit SMARCC2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6kag__assembly_1__model_1

6kag__assembly_1__model_1 | I(q)

6kag__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the SMARCB1/SMARCC2 subcomplex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SWI/SNF complex subunit SMARCC2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6kag__assembly_1__model_1

6kag__assembly_1__model_1 | I(q)

6kag__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

7. 引用文献 (1)