SAXSdb — 6v9i

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Immunoglobulin G-binding protein G,Cullin-5

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2	RING-box protein 2 × 1 （Q9WTZ1） ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SPG1_STRSG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 17–70； UniProt 229–282

Immunoglobulin G-binding protein G,Cullin-5

Homo sapiens

UniProt Q93034

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2	RING-box protein 2 × 1 （Q9WTZ1） ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CUL5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 85–863； UniProt 2–780

RING-box protein 2

Mus musculus

UniProt Q9WTZ1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Immunoglobulin G-binding protein G,Cullin-5 × 1 （P06654,Q93034） ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RBX2_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–113； UniProt 1–113

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6v9i
沉积日期 deposition_date	2019-12-13
结构标题 title	cryo-EM structure of Cullin5 bound to RING-box protein 2 (Cul5-Rbx2)
关键词 keywords	E3 Ubiquitin Ligase, RING-box protein, LIGASE; LIGASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6v9i__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6v9i__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6v9i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	45.38 Å
Rg（电子密度）	46.60 Å
总 Rg	46.37 Å
原子数	4066
残基数	814
排除体积	65885 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6v9i__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Immunoglobulin G-binding protein G,Cullin-5
分子量 formula_weight	100456.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C
原子数 atom_count	4066

MGSSHHHHHHSQDPMEYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTEIPTTENLYFQGEFMATSNLLKNKGSLQFEDKWDFMRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDVHAVCLWDDKGPAKIHQALKEDILEFIKQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPFCQLEITLMGKQGSNKKSNVEDSIVRKLMLDTWNESIFSNIKNRLQDSAMKLVHAERLGEAFDSQLVIGVRESYVNLCSNPEDKLQIYRDNFEKAYLDSTERFYRTQAPSYLQQNGVQNYMKYADAKLKEEEKRALRYLETRRECNSVEALMECCVNALVTSFKETILAECQGMIKRNETEKLHLMFSLMDKVPNGIEPMLKDLEEHIISAGLADMVAAAETITTDSEKYVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQDDPRFLTARDKAYKAVVNDATIFKLELPLKQKGVGLKTQPESKCPELLANYCDMLLRKTPLSKKLTSEEIEAKLKEVLLVLKYVQNKDVFMRYHKAHLTRRLILDISADSEIEENMVEWLREVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQAFKEMHKNNKLALPADSVNIKILNAGAWSRSSEKVFVSLPTELEDLIPEVEEFYKKNHSGRKLHWHHLMSNGIITFKNEVGQYDLEVTTFQLAVLFAWNQRPREKISFENLKLATELPDAELRRTLWSLVAFPKLKRQVLLYEPQVNSPKDFTEGTLFSVNQEFSLIKNAKVQKRGKINLIGRLQLTTERMREEENEGIVQLRILRTQEAIIQIMKMRKKISNAQLQTELVEILKNMFLPQKKMIKEQIEWLIEHKYIRRDESDINTFIYMA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	RING-box protein 2
分子量 formula_weight	12721.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MADVEDGEEPCVLSSHSGSAGSKSGGDKMFSLKKWNAVAMWSWDVECDTCAICRVQVMDACLRCQAENKQEDCVVVWGECNHSFHNCCMSLWVKQNNRCPLCQQDWVVQRIGK

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

▶

分辨率 resolution	5.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	46877

cryo-EM structure of Cullin5 bound to RING-box protein 2 (Cul5-Rbx2)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Immunoglobulin G-binding protein G,Cullin-5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Immunoglobulin G-binding protein G,Cullin-5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

RING-box protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6v9i__assembly_1__model_1

6v9i__assembly_1__model_1 | I(q)

6v9i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)

cryo-EM structure of Cullin5 bound to RING-box protein 2 (Cul5-Rbx2)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Immunoglobulin G-binding protein G,Cullin-5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Immunoglobulin G-binding protein G,Cullin-5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RING-box protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6v9i__assembly_1__model_1

6v9i__assembly_1__model_1 | I(q)

6v9i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)